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文檔簡(jiǎn)介
1、PCA的基本原理 PCA的計(jì)算步驟 PCA應(yīng)用實(shí)例 主成分分析(PCA)具體例子秦楠1;.一、主成分分析的基本原理 v假定有n個(gè)樣本,每個(gè)樣本共有p個(gè)變量,構(gòu)成一個(gè)np階的數(shù)據(jù)矩陣npnnppxxxxxxxxxX212222111211(1) 2;.v降維處理!當(dāng)p較大時(shí),在p維空間中考察問(wèn)題比較麻煩。降維是用較少的幾個(gè)綜合指標(biāo)代替原來(lái)較多的變量指標(biāo),而且使這些較少的綜合指標(biāo)既能盡量多地反映原來(lái)較多變量指標(biāo)所反映的信息,同時(shí)它們之間又是彼此獨(dú)立的。3;.定義:記x1,x2,xP為原變量指標(biāo),z1,z2,zm(mp)為新變量指標(biāo)pmpmmmppppxlxlxlzxlxlxlzxlxlxlz221
2、12222121212121111(2) 4;.v系數(shù)lij的確定原則: zi與zj( ij;i,j=1,2,m )相互無(wú)關(guān); z1是x1,x2,xP的一切線性組合中方差最大者,z2是與z1不相關(guān)的x1,x2,xP的所有線性組合中方差最大者; zm是與z1,z2,zm1都不相關(guān)的x1,x2,xP, 的所有線性組合中方差最大者。 則新變量指標(biāo)z1,z2,zm分別稱為原變量指標(biāo)x1,x2,xP的第一,第二,第m主成分。 5;. 從以上的分析可以看出,主成分分析的實(shí)質(zhì)就是確定原來(lái)變量xj(j=1,2 , p)在諸主成分zi(i=1,2,m)上的載荷 lij( i=1,2,m; j=1,2 ,p)。
3、從數(shù)學(xué)上可以證明,載荷lij分別是相關(guān)矩陣的m個(gè)較大的特征值所對(duì)應(yīng)的特征向量。 6;.二、計(jì)算步驟 (一)計(jì)算相關(guān)系數(shù)矩陣(一)計(jì)算相關(guān)系數(shù)矩陣 rij(i,j=1,2,p)為原變量xi與xj的相關(guān)系數(shù), rij=rji,其計(jì)算公式為:pppppprrrrrrrrrR212222111211(3) nknkjkjikinkjkjikiijxxxxxxxxr11221)()()((4) 7;. (二)計(jì)算特征值與特征向量:(二)計(jì)算特征值與特征向量: 解特征方程,求出特征值,并使其按大小順序排列 ; 0RI0,21p 分別求出對(duì)應(yīng)于特征值的特征向量 ,要求 =1,即,其中表示向量 的第j個(gè)分量。
4、i), 2 , 1(piliil112pjijlijlil8;. 計(jì)算主成分貢獻(xiàn)率及累計(jì)貢獻(xiàn)率 貢獻(xiàn)率:),2, 1(1pipkki累計(jì)貢獻(xiàn)率: ),2, 1(11pipkkikk一般取累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)8595%的特征值所對(duì)應(yīng)的第一、第二、第m(mp)個(gè)主成分。 m,219;.pnpnnppxxxlllllllllZ.21212222111211(6) 各主成分的得分10;.三、 主成分分析方法應(yīng)用實(shí)例表表1 1 某農(nóng)業(yè)生態(tài)經(jīng)濟(jì)系統(tǒng)各區(qū)域單元的有關(guān)數(shù)據(jù)某農(nóng)業(yè)生態(tài)經(jīng)濟(jì)系統(tǒng)各區(qū)域單元的有關(guān)數(shù)據(jù) 11;.668.3372.03276.2041540.29216.398.1284.0650.0114.86
5、1795.4160.80171.106926.35291.528.1354.0630.0124.862862.9011.65273.3071501.24225.2518.3522.6450.0343.201986.6240.84168.904897.36196.3716.8615.1760.0556.1671091.3940.81266.502911.24226.5118.2795.6430.0764.4771176.9120.85850.302103.52217.0919.7934.8810.0016.1651251.2741.04164.609968.33181.384.0054.0660
6、.0155.4021368.8310.83662.804957.14194.049.114.4840.0025.791477.3010.62360.102824.37188.0919.4095.7215.0558.4131576.9481.02268.0011255.42211.5511.1023.1330.013.4251699.2650.65460.7021251.03220.914.3834.6150.0115.59317118.5050.66163.3041246.47242.1610.7066.0530.1548.70118141.4730.73754.206814.21193.46
7、11.4196.4420.01212.94519137.7610.59855.9011124.05228.449.5217.8810.06912.65420117.6121.24554.503805.67175.2318.1065.7890.0488.46121122.7810.73149.1021313.11236.2926.7247.1620.09210.07812;.步驟如下:(1)將表1中的數(shù)據(jù)作標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化處理,然后將它們代入公式(4)計(jì)算相關(guān)系數(shù)矩陣(見(jiàn)表2)。x1x2x3x4x5x6x7x8x9x11-0.327 -0.714 -0.3360.3090.4080.790.1560
8、.744x2-0.331-0.0350.6440.420.2550.009-0.0780.094x3-0.71-0.03510.07-0.74-0.755-0.93-0.109-0.924x4-0.340.6440.0710.3830.069-0.05-0.0310.073x50.3090.42-0.740.38310.7340.6720.0980.747x60.4080.255-0.7550.0690.73410.6580.2220.707x70.790.009-0.93-0.0460.6720.6581-0.030.89x80.156-0.078 -0.109 -0.0310.0980.2
9、22-0.0310.29x90.7440.094-0.9240.0730.7470.7070.890.291表表2 2相關(guān)系數(shù)矩陣相關(guān)系數(shù)矩陣 13;. (2)由相關(guān)系數(shù)矩陣計(jì)算特征值,以及各個(gè)主成分的貢獻(xiàn)率與累計(jì)貢獻(xiàn)率(見(jiàn)表3)。由表3可知,第一,第二,第三主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率已高達(dá)86.596%(大于85%),故只需要求出第一、第二、第三主成分z1,z2,z3即可。 14;.表表3 3特征值及主成分貢獻(xiàn)率特征值及主成分貢獻(xiàn)率 15;. (3)對(duì)于特征值=4.6610,=2.0890,=1.0430分別求出其特征向量l1,l2,l3。16;.表表4 4 主成分載荷主成分載荷 z1z2z3占方差
10、的百分?jǐn)?shù)(%)x10.739-0.532-0.006182.918x20.1230.887-0.002880.191x3-0.9640.00960.009592.948x40.00420.8680.003775.346x50.8130.444-0.001185.811x60.8190.1790.12571.843x70.933-0.133-0.25195.118x80.197-0.10.9798.971x90.964-0.00250.009292.93917;. 第一主成分z1與x1,x5,x6,x7,x9呈顯出較強(qiáng)的正相關(guān),與x3呈顯出較強(qiáng)的負(fù)相關(guān),而這幾個(gè)變量則綜合反映了生態(tài)經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)狀況,因此可以認(rèn)為第一主成分z1是生態(tài)經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)的代表。 第二主成分z2與x2,x4,x5呈顯出較強(qiáng)的正相關(guān),與x1呈顯出較強(qiáng)的負(fù)相關(guān),其中,除了x1為人口總數(shù)外,x2,x4,x5都反映了人均占有資源量的情況,因此可以認(rèn)為
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