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文檔簡介
1、SDSPAGE電泳過程中常見問題以及解決方法幾乎所有蛋白質(zhì)電泳分析都在聚丙烯酰胺凝膠上進(jìn)行,而所有條件總要確保蛋白質(zhì)解離成單個(gè)多肽亞基并進(jìn)可能減少其相互間的聚集,最常用的就是SDSPAGE電泳技術(shù),關(guān)于大家在此過程中經(jīng)常遇到的問題進(jìn)行一些討論:Q:SDSPAGE電泳的基本原理?A:SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,是在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中引進(jìn)SDS(十二烷基硫酸鈉), SDS會(huì)與變性的多肽,并使蛋白帶負(fù)電荷,由于多肽結(jié)合SDS的量幾乎總是與多肽的分子量成正比而與其序列無關(guān),因此SDS多肽復(fù)合物在丙稀酰胺凝膠電泳中的遷移率只與多肽的大小有關(guān),在達(dá)到飽和的狀態(tài)下,每克多肽可與1.4g去污劑結(jié)合。當(dāng)分子量
2、在15KD到200KD之間時(shí),蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關(guān)系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW為分子量,X為遷移率,k、b均為常數(shù),若將已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的遷移率對分子量對數(shù)作圖,可獲得一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進(jìn)行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求得分子量。Q:配膠緩沖液系統(tǒng)對電泳的影響?A:在SDSPAGE不連續(xù)電泳中,制膠緩沖液使用的是TrisHCL緩沖系統(tǒng),濃縮膠是pH6.7,分離膠pH8.9;而電泳緩沖液使用的Tris甘氨酸緩沖系統(tǒng)。在濃縮膠中,其pH環(huán)境呈弱酸性,因此甘氨酸解離很少,其在電場的作用下,泳動(dòng)效率低;而CL離子卻很高,兩者之間形成
3、導(dǎo)電性較低的區(qū)帶,蛋白分子就介于二者之間泳動(dòng)。由于導(dǎo)電性與電場強(qiáng)度成反比,這一區(qū)帶便形成了較高的電壓剃度,壓著蛋白質(zhì)分子聚集到一起,濃縮為一狹窄的區(qū)帶。當(dāng)樣品進(jìn)入分離膠后,由于膠中pH的增加,呈堿性,甘氨酸大量解離,泳動(dòng)速率增加,直接緊隨氯離子之后,同時(shí)由于分離膠孔徑的縮小,在電場的作用下,蛋白分子根據(jù)其固有的帶電性和分子大小進(jìn)行分離。所以,pH對整個(gè)反應(yīng)體系的影響是至關(guān)重要的,實(shí)驗(yàn)中在排除其他因素之后仍不能很好解決問題的情況,應(yīng)首要考慮該因素。Q:樣品如何處理?A:根據(jù)樣品分離目的不同,主要有三種處理方法:還原SDS處理、非還原SDS處理、帶有烷基化作用的還原SDS處理。1、還原SDS處理:
4、在上樣buffer中加入SDS和DTT(或Beta巰基乙醇)后,蛋白質(zhì)構(gòu)象被解離,電荷被中和,形成SDS與蛋白相結(jié)合的分子,在電泳中,只根據(jù)分子量來分離。一般電泳均按這種方式處理,樣品稀釋適當(dāng)濃度,加入上樣Buffer,離心,沸水煮5min,再離心加樣。2、帶有烷基化作用的還原SDS處理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并經(jīng)久牢固的保護(hù)SH基團(tuán),得到較窄的譜帶;另碘乙酸胺可捕集過量的DTT,而防止銀染時(shí)的紋理現(xiàn)象。100ul樣品緩沖液中10ul 20的碘乙酸胺,并在室溫保溫30min。3、非還原SDS處理:生理體液、血清、尿素等樣品,一般只用1SDS沸水中煮3min,未加還原劑,因而蛋白折疊未被
5、破壞,不可作為測定分子量來使用。Q:SDS-PAGE電泳凝膠中各主要成分的作用?A:聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺為蛋白質(zhì)電泳提供載體,其凝固的好壞直接關(guān)系到電泳成功與否,與促凝劑及環(huán)境密切相關(guān);制膠緩沖液:濃縮膠選擇pH6.7,分離膠選擇pH8.9,選擇trisHCL系統(tǒng),具體作用后面介紹;TEMED與AP:促凝作用,加速聚丙烯酰胺的凝固;十二烷基硫酸鈉(SDS):陽離子去污劑,作用有四:去蛋白質(zhì)電荷、解離蛋白質(zhì)之間的氫鍵、取消蛋白分子內(nèi)的疏水作用、去多肽折疊。Q:提高SDS-PAGE電泳分辨率的途徑?A:1、聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝膠的分辨率。建議做法:待凝膠在室溫凝固后,可在室溫下放置
6、一段時(shí)間使用。忌即配即用或4度冰箱放置,前者易導(dǎo)致凝固不充分,后者可導(dǎo)致SDS結(jié)晶。一般凝膠可在室溫下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。2、一般常用的有氨基黑、考馬斯亮藍(lán)、銀染色三種染料,不同染料又各自不同的染色方法,具體可參照郭堯君編著的蛋白質(zhì)電泳技術(shù)手冊P82-103。Q:“微笑”(兩邊翹起中間凹下)形帶原因?A:主要是由于凝膠的中間部分凝固不均勻所致,多出現(xiàn)于較厚的凝膠中。處理辦法:待其充分凝固再作后續(xù)實(shí)驗(yàn)。Q:“皺眉”(兩邊向下中間鼓起)形帶原因?A:主要出現(xiàn)在蛋白質(zhì)垂直電泳槽中,一般是兩板之間的底部間隙氣泡未排除干凈。處理辦法:可在兩板間加入適量緩沖液,以排除氣泡。Q:為什么帶出現(xiàn)拖
7、尾現(xiàn)象?A:主要是樣品融解效果不佳或分離膠濃度過大引起的。處理辦法:加樣前離心;選擇適當(dāng)?shù)臉悠肪彌_液,加適量樣品促溶劑;電泳緩沖液時(shí)間過長,重新配制;降低凝膠濃度。Q:為什么帶出現(xiàn)紋理現(xiàn)象?A:主要是樣品不溶性顆粒引起的。處理辦法:加樣前離心;加適量樣品促溶劑。Q:什么是“鬼帶”,如何處理?A:“鬼帶”就是在跑大分子構(gòu)象復(fù)雜的蛋白質(zhì)分子時(shí),常會(huì)出現(xiàn)在泳道頂端(有時(shí)在濃縮膠中)的一些大分子未知條帶或加樣孔底部有沉淀,主要由于還原劑在加熱的過程中被氧化而失去活性,致使原來被解離的蛋白質(zhì)分子重新折疊結(jié)合和亞基重新締合,聚合成大分子,其分子量要比目標(biāo)條帶大,有時(shí)不能進(jìn)入分離膠。但它卻于目標(biāo)條帶有相同的
8、免疫學(xué)活性,在WB反應(yīng)中可見其能與目標(biāo)條帶對應(yīng)的抗體作用。處理辦法:在加熱煮沸后,再添加適量的DTT或Beta巰基乙醇,以補(bǔ)充不足的還原劑;或可加適量EDTA來阻止還原劑的氧化。Q:為什么溴酚藍(lán)不能起到指示作用?A:我們在實(shí)驗(yàn)中常會(huì)遇到溴酚藍(lán)已跑出板底,但蛋白質(zhì)卻還未跑下來的現(xiàn)象。主要與緩沖液和分離膠的濃度有關(guān)。處理辦法:更換正確pH值的Buffer;降低分離膠的濃度。Q:為什么電泳的條帶很粗?A:電泳中條帶很粗是常見的事,主要是未濃縮好的原因。處理辦法:適當(dāng)增加濃縮膠的長度;保證濃縮膠貯液的pH正確(6.7);適當(dāng)降低電壓;Q:為什么電泳電壓很高而電流卻很低呢?A:這種現(xiàn)象一般初學(xué)者易出現(xiàn)。
9、比如電壓50v以上,可電流卻在5mA以下。主要是由于電泳槽沒有正確裝配,電流未形成通路。包括:a.內(nèi)外槽裝反;b.外槽液過少;c.電泳槽底部的絕緣體未去掉(比如倒膠用的橡膠皮)。處理辦法:電泳槽正確裝配即可。Q:濃縮膠與分離膠斷裂、板間有氣泡對電泳有影響嗎?A:這主要出現(xiàn)在初學(xué)者中,一般對電泳不會(huì)有太大的影響。前者主要原因是拔梳子用力不均勻或過猛所致;后者是由于在解除制膠的夾子后,板未壓緊而致空氣進(jìn)入引起的。簡介聚丙烯酰胺凝膠電泳作用:用于分離蛋白質(zhì)和寡糖核苷酸。 作用原理聚丙烯酰胺凝膠電泳是網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),具有分子篩效應(yīng)。它有兩種形式:(1)非變性
10、聚丙烯酰胺凝膠,在電泳的過程中,蛋白質(zhì)能夠保持完整狀態(tài),并依據(jù)蛋白質(zhì)的分子量大小、蛋白質(zhì)的形狀及其所附帶的電荷量而逐漸呈梯度分開。 而SDS-PAGE僅根據(jù)蛋白質(zhì)亞基分子量的不同就可以分開蛋白質(zhì)。該技術(shù)最初由Shapiro于1967年建立,他們發(fā)現(xiàn)在樣品介質(zhì)和丙烯酰胺凝膠中加入離子去污劑和強(qiáng)還原劑后,蛋白質(zhì)亞基的電泳遷移率主要取決于亞基分子量的大?。梢院雎噪姾梢蛩兀?。 作用SDS是陰離子去污劑,作為變性劑和助溶試劑,它能斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使分子去折疊,破壞蛋白分子的二、三級(jí)結(jié)構(gòu)。而強(qiáng)還原劑如巰基乙醇,二硫蘇糖醇能使半胱氨酸殘基間的二硫鍵斷裂。在樣品和凝膠中加入還原劑和SDS后,分子被
11、解聚成多肽鏈,解聚后的氨基酸側(cè)鏈和SDS結(jié)合成蛋白- SDS膠束,所帶的負(fù)電荷大大超過了蛋白原有的電荷量,這樣就消除了不同分子間的電荷差異和結(jié)構(gòu)差異。 SDS-PAGE一般采用的是不連續(xù)緩沖系統(tǒng),于連續(xù)緩沖系統(tǒng)相比,能夠有較高的分辨率。 濃縮膠的作用是有堆積作用,凝膠濃度較小,孔徑較大,把較稀的樣品加在濃縮膠上,經(jīng)過大孔徑凝膠的遷移作用而被濃縮至一個(gè)狹窄的區(qū)帶。當(dāng)樣品液和濃縮膠選TRIS/HCL緩沖液,電極液選TRIS/甘氨酸。電泳開始后,HCL解離成氯離子,甘氨酸解離出少量的甘氨酸根離子。蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷,因此一起向正極移動(dòng),其中氯離子最快,甘氨酸根離子最慢,蛋白居中。電泳開始時(shí)氯離子泳動(dòng)率最
12、大,超過蛋白,因此在后面形成低電導(dǎo)區(qū),而電場強(qiáng)度與低電導(dǎo)區(qū)成反比,因而產(chǎn)生較高的電場強(qiáng)度,使蛋白和甘氨酸根離子迅速移動(dòng),形成以穩(wěn)定的界面,使蛋白聚集在移動(dòng)界面附近,濃縮成一中間層。 此鑒定方法中,蛋白質(zhì)的遷移率主要取決于它的相對分子質(zhì)量,而與所帶電荷和分子形狀無關(guān)。 補(bǔ)充信息聚丙烯酰胺凝膠電泳簡稱為PAGE(Polyacrylamde gel electrophoresis) 聚丙烯酰氨凝膠電泳,是以聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì)的一種常用電泳技術(shù)。聚丙烯酰胺凝膠由單體丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺聚合而成,聚合過程由自由基催化完成。催化聚合的常用方法有兩種:化學(xué)聚合法和光聚合
13、法?;瘜W(xué)聚合以過硫酸銨(AP)為催化劑,以四甲基乙二胺(TEMED)為加速劑。在聚合過程中,TEMED催化過硫酸銨產(chǎn)生自由基,后者引發(fā)丙烯酰胺單體聚合,同時(shí)甲叉雙丙烯酰胺與丙烯酰胺鏈間產(chǎn)生甲叉鍵交聯(lián),從而形成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。 PAGE根據(jù)其有無濃縮效應(yīng),分為連續(xù)系統(tǒng)和不連續(xù)系統(tǒng)兩大類,連續(xù)系統(tǒng)電泳體系中緩沖液pH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電場作用下,主要靠電荷和分子篩效應(yīng)。不連續(xù)系統(tǒng)中由于緩沖液離子成分,pH,凝膠濃度及電位梯度的不連續(xù)性,帶電顆粒在電場中泳動(dòng)不僅有電荷效應(yīng),分子篩效應(yīng),還具有濃縮效應(yīng),因而其分離條帶清晰度及分辨率均較前者佳。不連續(xù)體系由電極緩沖液、濃縮膠及分離膠所組成。濃縮膠
14、是由AP催化聚合而成的大孔膠,凝膠緩沖液為pH6.7的Tris-HC1。分離膠是由AP催化聚合而成的小孔膠,凝膠緩沖液為pH8.9 Tris-HC1。電極緩沖液是pH8.3 Tris-甘氨酸緩沖液。2種孔徑的凝膠、2種緩沖體系、3種pH值使不連續(xù)體系形成了凝膠孔徑、pH值、緩沖液離子成分的不連續(xù)性,這是樣品濃縮的主要因素。 過程蛋白質(zhì)在聚丙烯酰胺凝膠中電泳時(shí),它的遷移率取決于它所帶凈電荷以及分子的大小 和形狀等因素。如果加入一種試劑使電荷因素消除,那電泳遷移率就取決于分子的大小,就可以用電泳技術(shù)測定蛋白質(zhì)的分子量。1967年,Shapiro等發(fā)現(xiàn)陰離子去污劑十二烷基硫酸鈉(SDS)具有這種作用
15、。當(dāng)向蛋白質(zhì)溶液中加入足夠量SDS和巰基乙醇,SDS可使蛋白質(zhì)分子中的二硫鍵還原。由于十二烷基硫酸根帶負(fù)電,使各種蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物都帶上相同密度的負(fù)電荷,它的量大大超過了蛋白質(zhì)分子原的電荷量, 因而掩蓋了不同種蛋白質(zhì)間原有的電荷差別,SDS與蛋白質(zhì)結(jié)合后,還可引起構(gòu)象改 變,蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物形成近似“雪茄煙”形的長橢圓棒,不同蛋白質(zhì)的SDS復(fù)合物的短軸長度都一樣,約為18A,這樣的蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物,在凝膠中的遷移率,不 再受蛋白質(zhì)原的電荷和形狀的影響,而取決于分子量的大小由于蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物在單位長度上帶有相等的電荷,所以它們以相等的遷移速度從濃縮膠進(jìn)入分離膠,進(jìn)入分離膠后,由于聚丙烯
16、酰胺的分子篩作用,小分子的蛋白質(zhì)可以容易的通過凝膠孔徑,阻力小,遷移速度快;大分子蛋白質(zhì)則受到較大的阻力而被滯后,這樣蛋白質(zhì)在電泳過程中就會(huì)根據(jù)其各自分子量的大小而被分離。因而SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳可以用于測定蛋白質(zhì)的分子量。當(dāng)分子量在15KD到200KD之間時(shí),蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關(guān)系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW為分子量,X為遷移率,k、b均為常數(shù),若將已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的遷移率對分子量對數(shù)作圖,可獲得一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進(jìn)行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求得分子量。 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳經(jīng)常應(yīng)用于提純過程中純度的檢測,純化的
17、蛋白質(zhì)通常在SDS電泳上應(yīng)只有一條帶,但如果蛋白質(zhì)是由不同的亞基組成的,它在電泳中可能會(huì)形成分別對應(yīng)于各個(gè)亞基的幾條帶。SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳具有較高的靈敏度,一般只需要不到微克量級(jí)的蛋白質(zhì),而且通過電泳還可以同時(shí)得到關(guān)于分子量的情況,這些信息對于了解未知蛋白及設(shè)計(jì)提純過程都是非常重要的。 常見問題及分析1. 配膠緩沖液系統(tǒng)對電泳的影響? 在SDSPAGE不連續(xù)電泳中,制膠緩沖液使用的是TrisHCL緩沖系統(tǒng),濃縮膠是pH6.7,分離膠pH8.9;而電泳緩沖液使用的Tris甘氨酸緩沖系統(tǒng)。在濃縮膠中,其pH環(huán)境呈弱酸性,因此甘氨酸解離很少,其在電場的作用下,泳動(dòng)效率低;而CL離子卻很高,兩者
18、之間形成導(dǎo)電性較低的區(qū)帶,蛋白分子就介于二者之間泳動(dòng)。由于導(dǎo)電性與電場強(qiáng)度成反比,這一區(qū)帶便形成了較高的電壓梯度,壓著蛋白質(zhì)分子聚集到一起,濃縮為一狹窄的區(qū)帶。當(dāng)樣品進(jìn)入分離膠后,由于膠中pH的增加,呈堿性,甘氨酸大量解離,泳動(dòng)速率增加,直接緊隨氯離子之后,同時(shí)由于分離膠孔徑的縮小,在電場的作用下,蛋白分子根據(jù)其固有的帶電性和分子大小進(jìn)行分離。 所以,pH對整個(gè)反應(yīng)體系的影響是至關(guān)重要的,實(shí)驗(yàn)中在排除其他因素之后仍不能很好解決問題的情況,應(yīng)首要考慮該因素。 2. 樣品如何處理? 根據(jù)樣品分離目的不同,主要有三種處理方法:還原SDS處理、非還原SDS處理、帶有烷基化作用的還原SDS處理。 1)還
19、原SDS處理:在上樣buffer中加入SDS和DTT(或Beta巰基乙醇)后,蛋白質(zhì)構(gòu)象被解離,電荷被中和,形成SDS與蛋白相結(jié)合的分子,在電泳中,只根據(jù)分子量來分離。一般電泳均按這種方式處理,樣品稀釋適當(dāng)濃度,加入上樣Buffer,離心,沸水煮5min,再離心加樣。 2)帶有烷基化作用的還原SDS處理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并經(jīng)久牢固的保護(hù)SH基團(tuán),得到較窄的譜帶;另碘乙酸胺可捕集過量的DTT,而防止銀染時(shí)的紋理現(xiàn)象。100ul樣品緩沖液中10ul 20的碘乙酸胺,并在室溫保溫30min。 3)非還原SDS處理:生理體液、血清、尿素等樣品,一般只用1SDS沸水中煮3min,未加還原劑
20、,因而蛋白折疊未被破壞,不可作為測定分子量來使用。 3. SDS-PAGE電泳凝膠中各主要成分的作用? 聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺與為蛋白質(zhì)電泳提供載體,其凝固的好壞直接關(guān)系到電泳成功與否,與促凝劑及環(huán)境密切相關(guān); 制膠緩沖液:濃縮膠選擇pH6.7,分離膠選擇pH8.9,選擇trisHCL系統(tǒng),TEMED與AP:AP提供自由基,TEMED是催化劑,催化自由基引起的聚合反應(yīng)進(jìn)行;十二烷基硫酸鈉(SDS):陽離子去污劑,作用有四:去蛋白質(zhì)電荷、解離蛋白質(zhì)之間的氫鍵、取消蛋白分子內(nèi)的疏水作用、去多肽折疊。 4. 提高SDS-PAGE電泳分辨率的途徑? 聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝膠的分辨率。建議做
21、法:待凝膠在室溫凝固后,可在室溫下放置一段時(shí)間使用。忌即配即用或4度冰箱放置,前者易導(dǎo)致凝固不充分,后者可導(dǎo)致SDS結(jié)晶。一般凝膠可在室溫下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。 一般常用的有氨基黑、考馬斯亮藍(lán)、銀染色三種染料,不同染料又各自不同的染色方法,具體可參照郭堯君編著的蛋白質(zhì)電泳技術(shù)手冊P82-103。 5.“ 微笑”(兩邊翹起中間凹下)形帶原因? 主要是由于凝膠的中間部分凝固不均勻所致,多出現(xiàn)于較厚的凝膠中。 處理辦法:待其充分凝固再作后續(xù)實(shí)驗(yàn)。 6. “皺眉”(兩邊向下中間鼓起)形帶原因? 主要出現(xiàn)在蛋白質(zhì)垂直電泳槽中,一般是兩板之間的底部間隙氣泡未排除干凈。 處理辦法:可在兩板間加
22、入適量緩沖液,以排除氣泡。 7. 為什么帶出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象? 主要是樣品融解效果不佳或分離膠濃度過大引起的。 處理辦法:加樣前離心;選擇適當(dāng)?shù)臉悠肪彌_液,加適量樣品促溶劑;電泳緩沖液時(shí)間過長,重新配制;降低凝膠濃度。 8. 為什么帶出現(xiàn)紋理現(xiàn)象? 主要是樣品不溶性顆粒引起的。 處理辦法:加樣前離心;加適量樣品促溶劑。 9. 什么是“鬼帶”,如何處理? “鬼帶”就是在跑大分子構(gòu)象復(fù)雜的蛋白質(zhì)分子時(shí),常會(huì)出現(xiàn)在泳道頂端(有時(shí)在濃縮膠中)的一些大分子未知條帶或加樣孔底部有沉淀,主要由于還原劑在加熱的過程中被氧化而失去活性,致使原來被解離的蛋白質(zhì)分子重新折疊結(jié)合和亞基重新締合,聚合成大分子,其分子量要比目
23、標(biāo)條帶大,有時(shí)不能進(jìn)入分離膠。但它卻于目標(biāo)條帶有相同的免疫學(xué)活性,在WB反應(yīng)中可見其能與目標(biāo)條帶對應(yīng)的抗體作用。 處理辦法:在加熱煮沸后,再添加適量的DTT或Beta巰基乙醇,以補(bǔ)充不足的還原劑;或可加適量EDTA來阻止還原劑的氧化。 10. 為什么溴酚藍(lán)不能起到指示作用? 我們在實(shí)驗(yàn)中常會(huì)遇到溴酚藍(lán)已跑出板底,但蛋白質(zhì)卻還未跑下來的現(xiàn)象。主要與緩沖液和分離膠的濃度有關(guān)。 處理辦法:更換正確pH值的Buffer;降低分離膠的濃度。 11. 為什么電泳的條帶很粗? 電泳中條帶很粗是常見的事,主要是未濃縮好的原因。 處理辦法:適當(dāng)增加濃縮膠的長度;保證濃縮膠貯液的pH正確(6.7);適當(dāng)降低電壓;
24、 12. 為什么電泳電壓很高而電流卻很低呢? 這種現(xiàn)象一般初學(xué)者易出現(xiàn)。比如電壓50v以上,可電流卻在5mA以下。主要是由于電泳槽沒有正確裝配,電流未形成通路。包括:a.內(nèi)外槽裝反;b.外槽液過少;c.電泳槽底部的絕緣體未去掉(比如倒膠用的橡膠皮)。 處理辦法:電泳槽正確裝配即可。 13. 濃縮膠與分離膠斷裂、板間有氣泡對電泳有影響嗎? 這主要出現(xiàn)在初學(xué)者中,一般對電泳不會(huì)有太大的影響。前者主要原因是拔梳子用力不均勻或過猛所致;后者是由于在解除制膠的夾子后,板未壓緊而致空氣進(jìn)入引起的。 14. 凝膠時(shí)間不對,或慢或快,怎么回事? 通常膠在30MIN-1H內(nèi)凝。如果凝的太慢,可能是TEMED,A
25、PS劑量不夠或者失效。APS應(yīng)該現(xiàn)配現(xiàn)用,TEMED不穩(wěn)定,易被氧化成黃色。 如果凝的太快,可能是APS和TEMED用量過多,此時(shí)膠太硬易裂,電泳時(shí)易燒膠。 15. 電泳時(shí)間比正常要長? 可能由于凝膠緩沖系統(tǒng)和電級(jí)緩沖系統(tǒng)地PH選擇錯(cuò)誤,即緩沖系統(tǒng)地PH和被分離物質(zhì)的等電點(diǎn)差別太小,或緩沖系統(tǒng)的離子強(qiáng)度太高。電泳相關(guān)溶液的配置:1、30%丙稀酰胺混合溶液(100ml):稱取29g丙稀酰胺和1g bis丙稀酰胺,用水溶解定容到100ml,過濾,4攝氏度保存一個(gè)月。2、 5×SDS電極緩沖液:稱取Tris base15.1g,甘氨酸94.g,SDS 5.g加dH2O定容至1000ml。3、2×樣品緩沖液(10ml):甘油2ml,溴酚藍(lán)0.0202g,1MTris·Cl(pH6.8)1ml巰基乙醇0.14ml,10%SDS 4ml。4、染色液的配制(1000ml): 用量筒分別量取250ml甲醇或者乙醇、80ml乙酸;在電子天平上稱取0.125%考馬斯亮藍(lán)R250 1.25g,再將其一一加到1000ml錐形瓶中,用蒸餾水加以補(bǔ)足至1000ml。加入的先后順序?yàn)椋嚎捡R斯亮藍(lán)R250,甲醇或者乙醇,蒸餾水,乙酸。充分混勻后進(jìn)行過濾,收集濾液備用。當(dāng)過濾速度變慢時(shí)要更換濾紙,快速過濾完,不可隔夜以免影響染色效果。5、脫色液(1000ml
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