2分鐘學(xué)會(huì)UVP的凝膠電泳分析軟件(labwork及gel-pro)

1、2分鐘學(xué)會(huì)uvp的凝膠電泳分析軟件(labwork及gel-pro)如果你購買了 uvp的凝膠電泳拍攝及分析系統(tǒng)，上面就會(huì)帶一個(gè)labwork分析軟件。打開 這個(gè)軟件你就可以發(fā)現(xiàn)其界面非常熟悉，原來這就是media cybernetics公司利用 imageproplus程序的內(nèi)核專門應(yīng)用于分析凝膠電泳圖片的軟件。上面還冇許多 imageproplus 的功能呢。分析電泳圖片還是很簡(jiǎn)單的，兩分鐘就能學(xué)會(huì)，只要在那個(gè)1 d-gel i具條從上往下一個(gè)一 個(gè)點(diǎn)開來設(shè)置一下就0k。打開一個(gè)圖片后，先要把圖片上的電泳條帶擺得橫平豎直，加樣孔處于圖片上方。這一步只 要點(diǎn)第一個(gè)菜單rotate,然后用鼠標(biāo)

2、轉(zhuǎn)圖片就是。第二步是指定泳道。點(diǎn)lanes.利用彈出的菜單可以刪掉或添加泳道，用鼠標(biāo)可以拖動(dòng)泳道 位置，還可以在泳道上下邊拖來延長或縮短泳道長度。泳道寬度設(shè)置吋，先勾上uniform lanes width,然丿匸在最上血的lanes width上把數(shù)值加大或減小些。讓選擇泳道寬度框全部覆蓋住條帶。labw5?.77?l >pc (1/bc © 0 a喘 o q ；" q考憂忱w靈!h ：寫ag牛冏婦左rot «t«tell urjcidibodebackp*ocmi* stuidtfdsliatbenltstidtlr (jlxci41ibord

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4、泳道，再設(shè)置條帶。占 bands 菜單，在 dark bands bright background 與 bright band dard background z間選 一個(gè)，（dna凝膠是白帶黑背景，蛋白質(zhì)凝膠是黑帶白背景）min band height設(shè)一個(gè)稍人的 值，（別太小，否則自動(dòng)找到一大堆條帶還得一個(gè)個(gè)刪。）點(diǎn)一下find bando就自動(dòng)找到一些明顯的條帶了，用add和delete band按紐加上未找到 的條帶，刪掉誤識(shí)別的條帶。這個(gè)操作也很簡(jiǎn)單，點(diǎn)add band按紐，出來一個(gè)新對(duì)話框， 不理它，可以在電泳照片上認(rèn)為該有條帶的地方點(diǎn)一下，就強(qiáng)迫加上了一個(gè)條帶。還可以在 lan

5、e frofile窗門的曲線上準(zhǔn)確找到峰頂位置點(diǎn)一下加上條帶。加完后點(diǎn)0k回到band窗【丨。 注意每個(gè)條帶也有一個(gè)計(jì)算范圍，可在曲線上拖它的上下邊界。這個(gè)邊界的選擇要仔細(xì)。一 力面盡量讓各條帶的范圍-致，另-力血?jiǎng)t是選擇條帶光密度峰的山腳處作為邊界。這兩者 很難同時(shí)滿足。經(jīng)常得犧牲一方面。| 2 85667721.jpe (i/l)it*一曲其 ii)匚叵區(qū)1st設(shè)置完泳道與條帶，下一條是設(shè)置背景。前面還有個(gè)加樣孔位置要設(shè)置，因?yàn)槲覀円呀?jīng)把加 樣孔放到上方了，就不必設(shè)置它了。背景的較正方法有許多選擇，但只有一個(gè)實(shí)用。就是joining valleys.±一帖圖中峰下而有一 根斜線，

6、那就是背景扣除的界限。下面的面積被扣除。只計(jì)算背景線上方的區(qū)域作為條帶定 暈的依據(jù)。最麻煩的是設(shè)置marker參數(shù)。點(diǎn)marker菜單，彈出設(shè)置窗口，上面是指定markei*泳道位置的按紐。系統(tǒng)默認(rèn)第一泳道為 markero但我們經(jīng)常把marker放到另的泳道上去。這塊膠上有兩個(gè)markeis分別在第一與 笫十三泳道上，設(shè)定方法是：點(diǎn)reset清除掉窗口，再點(diǎn)select/unsel.按紐。在第一與第十二泳道上分別點(diǎn)一下，窗口中 會(huì)出現(xiàn)lane 1和lane 13字樣，說明這兩個(gè)泳道被指定為marker.until lfldv(14 (i/d；：x:®寫ag »岡婦層lif

7、it 1! uij.iuixjm u/llkoo 二g12to-1000-j_ o c o> e ? er我的電向l<n<alum 1l«m itbileeultfstia.lard / lulecular ¥«?icht s，敦teoj-6009060o ttidkt in bfkxtovweiti e vli.t rcrr*rta o®gl、耐m*<yx xhwi " stuidtt12 24下一步要指定marker屮各條帶的分子量。1. 點(diǎn)new按紐，出來一個(gè)新的窗口，最上面要起個(gè)名字(test)o2在下面的數(shù)字窗

8、口中輸入第一個(gè)分子量數(shù)字(2000)。點(diǎn)一下旁邊的勾。3. 再點(diǎn)add按紐。4. 可見第一個(gè)分子量數(shù)據(jù)c經(jīng)顯示到窗口里了。5. 重復(fù)2、3輸入全部的分子量數(shù)值。6. 點(diǎn)0k回到上一個(gè)窗口，可以看見marker的分子量已經(jīng)輸入。labvorkr(】小q p三s c © 0空臨 o q m q考i” ix出孑牛冏礪尼nrot «t«<n ttell utjcidibodesi and" dsliatbenlts歩理baptricktlaniai1020tomrf-icular女】少4事d& fluxionuhud«dod4 (fmiz

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10、注意，如果是六個(gè)marker條帶，則marker泳道里一定得有 正好不多不少六個(gè)選定的條帶。否則就亂套了。有時(shí)候電泳跑得歪，兩個(gè)marker的對(duì)應(yīng)條帶并不在同一水平面上，這時(shí)要作校正。把上面 那個(gè) automatic slant correction 選項(xiàng)給勾上。lmbfrrkr unlit lfldcn-l (1/dq r三0 c © 0仝瑞 o q q考川ix出31 £門 豈ag(3冏剛眉tuzkdit |gyhr alwaysoptions8«nd v bphr loleculsr feicht s廠 aulclrtke tlaat carrecti >

11、;a<l/l)tsoin bp lwnp prof iln - iml 11 lmll)(m (1/ i)luit it 7 unt 1"1711 ip.x1c4k-udo1200 lmms eqtunim .1 丫。曲 gz i 出：v<>!«<:ultr ttithl s<ltad«rd fi 2 3 s 6!&!suik 萬一 °1zzb 2zzbdch(= r ；f'礁亠匕山 £ f 0£ uniork?我的電ib詁 y«lcoc«我k名j廠蟲u£二八

12、對(duì)于泳道條帶跑得歪，又作了兩個(gè)marker時(shí)，可以用slanl進(jìn)一步校正。點(diǎn)slant按紐調(diào)出窗口。1. 點(diǎn)add slant line按紐,出來一個(gè)新對(duì)話框。2. 在兩個(gè)marker的相同分子量條帶上各點(diǎn)一下，回來點(diǎn)next m.w.按紐，再去找下一對(duì)等分 子量markei條帶，或者點(diǎn)ok結(jié)束。3. 冋到上一個(gè)窗i 1還是點(diǎn)0k。好啦?？梢钥吹浇Y(jié)果了。點(diǎn)resulto結(jié)果窗口就出來了。在show菜單耍選show both,這樣每個(gè)泳道有兩列數(shù)據(jù)，分別顯示分子量與測(cè)定值。測(cè)定值則要顯示iod（積分光密度）。這個(gè)最不會(huì)出錯(cuò)。選其他的都有可能出一些計(jì)算錯(cuò)誤的。 各條帶量的比較，就是比較它們之間的i

13、od數(shù)值。圖象分析方法屬于半定量分析。誤差很大的。雖然軟件也帶有強(qiáng)度校正的功能，但實(shí)際上用 起來麻煩還不準(zhǔn)確。一般不用它。還是各條帶之間互相比較iod更實(shí)用一些。iod數(shù)值都比較大，所以會(huì)顯示成3.5e6的格式，這是3.5乘10的6次方的意思。c 0 a繪 o q q右1h lx ih圣焉:寫腿子冏的公rot tielwms"mbhod)|!x1 islifiitr4b*pvrt*如卿：$ aaianril x：/lpl- fr |,ghl x 一 nn1 b 1 |r(jnn<1 (l/l) id cel .x qxbch(= r ；:我的電is12 se冬盤名jw -lur

14、aroh8垃上 d options . dmli/xang l4<1、(absl /acw! ir idd；“ olytdtr aod.ibackp*otmin、 si and* dveil or“gb«v4«fctl/biauds rf* hl. tb :ds bo/ri graphr2l" 3 |r«* « i (lodj3.21e5653hqdiizzb szzbd這張圖片沒有marker,當(dāng)然就只剩下iod數(shù)值了。分析結(jié)果也可以送到excel里去。在文件-dde to excel命令上點(diǎn)一下就把數(shù)據(jù)送過去了。要注意數(shù)據(jù)最下面的兩行，倒數(shù)第二行的sum指的是木泳道所有選屮條帶的i0d總和。而 in line的總和是這個(gè)泳道屮所有條帶，不論你是否選屮它作為計(jì)算條帶，它們的累加值。因 此往往這兩行的數(shù)值會(huì)不一樣。6坯£皿9吹91q0dfimpujj i 1| 和 ? w2 3<3zl丄十心i“gi w2>ai*3w i