生物化學(xué)總結(jié)(5000字)

1、第一章 氨基酸 1 、主要元素：碳、氫、氧、氮和硫，有些蛋白質(zhì)還含有少量磷和金屬元素。2、特點(diǎn)：各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近，平均含氮量為16% 。3、定氮法測(cè)定蛋白質(zhì)含量：蛋白質(zhì)含量=6.25群品含氮量4. 蛋白質(zhì)基本結(jié)構(gòu)單位：L氨基酸-氨基酸：脯氨酸(亞氨基酸)除外 L -氨基酸：甘氨酸(無不對(duì)稱C)除外氨基酸結(jié)構(gòu)通式：RCH(NH2)COOH 常見氨基酸種類：20 種。含硫氨基酸：Met、 Cys 芳香族氨基酸：Phe、 Tyr、 Trp5. 等電點(diǎn)(isoelectric point, pI ) ：在某一pH 環(huán)境中，氨基酸解離成陽(yáng)性離子及陰性離子的趨勢(shì)相等，所帶凈電荷為零，在電場(chǎng)中不泳動(dòng)

2、。此時(shí)，氨基酸所處環(huán)境的pH 值稱為該種氨基酸的等電點(diǎn)(pI) 。等電點(diǎn)計(jì)算：兩性離子兩邊的pK 值的算術(shù)平均值。帶電狀態(tài)判定：pI-pH (正數(shù)帶正電，負(fù)數(shù)帶負(fù)電)紫外吸收：Trp 、 Tyr 和 Phe 在 280nm 波長(zhǎng)附近具有最大吸收峰，其中Trp 的最大吸收最接近 280nm6、連接方式：肽鍵肽鍵 (peptide bond) ：一個(gè)氨基酸的羧基與另一氨基酸的氨基縮水而成的酰胺鍵稱為肽鍵。(CONH-)肽平面(peptide unit):由肽鍵中的四個(gè)原子(-CO-NH-)和與之相鄰的兩個(gè)碳原子共同構(gòu)成的剛性平面(CQONHC。7、生物活性肽：谷胱甘肽：Glu-Cys-Gly, G

3、lu以丫竣基形成肽鍵8、蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)形式：多肽鏈多肽鏈(NHCHCONHCHCO-)多肽鏈的方向性：從 N末端指向C末端。9 、 蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)是指多肽鏈骨架中原子的局部空間排列，不涉及側(cè)鏈的構(gòu)象，也就是該肽段主鏈骨架原子的相對(duì)空間位置，主要有“-螺旋、伊折疊、伊轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲。維持二級(jí)結(jié)構(gòu)的力量為氫鍵。10 、 結(jié)構(gòu)域(domain ) 是在較大的蛋白質(zhì)分子中所形成的兩個(gè)或多個(gè)在空間上可明顯區(qū)別的局部區(qū)域。結(jié)構(gòu)域具有獨(dú)特的空間構(gòu)象，與分子整體以共價(jià)鍵相連，并承擔(dān)特定的生物學(xué)功能。11 、 蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)是指在一條多肽鏈中所有原子的整體空間排布，包括主鏈和側(cè)鏈。三級(jí)結(jié)構(gòu)的形成使得在序

4、列中相隔較遠(yuǎn)的氨基酸側(cè)鏈相互靠近。12 、 分子伴侶(chaperone )： 在蛋白質(zhì)加工、折疊形成特定空間構(gòu)象及穿膜進(jìn)入細(xì)胞器的轉(zhuǎn)位過程中起關(guān)鍵作用的一類蛋白質(zhì)。13 、 蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)是指由多條各自具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的肽鏈通過非共價(jià)鍵連接起來的空間排列方式及亞基之間的相互作用關(guān)系。其中每一條多肽鏈叫做一個(gè)亞基或亞單位。14 、亞基之間以非共價(jià) 鍵聯(lián)系，包括疏水鍵(主要)、鹽鍵、氫鍵、范德華力15 、 亞基 (subunit) ： 寡聚蛋白中的單條獨(dú)立的多肽鏈，具有獨(dú)立的一、二、三級(jí)結(jié)構(gòu)，單獨(dú)存在時(shí)一般無生物學(xué)活性。亞基之間以非共價(jià)鍵聯(lián)系，亞基可以相同或不同。16 、 分子病(molecula

5、r disease ) ：由于基因結(jié)構(gòu)改變，蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)中的關(guān)鍵氨基酸發(fā)生改變，從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)功能障礙，出現(xiàn)相應(yīng)的臨床癥狀，這類遺傳性疾病稱為分子病。17 、 別構(gòu)效應(yīng)(變位效應(yīng)，allosteric effect )： 蛋白質(zhì)分子的特定部位與小分子化合物結(jié)合后，引起空間構(gòu)象改變，從而促使生物學(xué)活性變化的現(xiàn)象。18 、一個(gè)寡聚體蛋白質(zhì)的一個(gè)亞基與其配體結(jié)合后，能影響此寡聚體中另一個(gè)亞基與配體結(jié)合能力的現(xiàn)象，稱為協(xié)同效應(yīng)(cooperativity) 。19 、 蛋白質(zhì)的變性與復(fù)性：【經(jīng)典舉例】Rnase20 、 變性 (denaturation) ： 在某些理化因素作用下，蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)被

6、破壞，從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變、生物活性喪失的現(xiàn)象稱為變性。變性不涉及一級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。21 、雙縮脲反應(yīng)可檢測(cè)蛋白質(zhì)的水解程度22 、 鹽析 (salt precipitation)是將硫酸銨、硫酸鈉或氯化鈉等加入蛋白質(zhì)溶液，使蛋白質(zhì)表面電荷被中和以及水化膜被破壞，導(dǎo)致蛋白質(zhì)沉淀。23 、 電泳 (elctrophoresis) ： 蛋白質(zhì)在高于或低于其pI 的溶液中為帶電的顆粒，在電場(chǎng)中能向正極或負(fù)極移動(dòng)。這種通過蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中泳動(dòng)而達(dá)到分離各種蛋白質(zhì)的技術(shù)。重要名詞：isoelectric point ； motifs ； domain; subunit ； allosteric effec

7、t;protein denaturation; molecular disease第二章 核酸1 、核酸的基本結(jié)構(gòu)單位：核苷酸(nucleotide)1 )核苷酸的組成：堿基、戊糖和磷酸。2)核苷酸的其他形式多磷酸核苷(NDP、 NTP)環(huán)化核甘酸(cAMP、cGMP等)輔酶或輔基(NAD、 NADP、 FAD、 CoA等)2 、 DNA 的一級(jí)結(jié)構(gòu)：概念： DNA 分子中核苷酸的排列順序和連接方式。又可指堿基的排列順序，即DNA序列( sequence)3、超螺旋結(jié)構(gòu)(superhelix 或supercoil) : DNA雙螺旋鏈進(jìn)一步盤曲所形成的構(gòu)象即超螺旋結(jié)構(gòu)。右手超螺旋：盤繞方向與左

8、手超螺旋：盤繞方向與： 在某些理化因素作用下，稱為熱變性。DNA雙螺旋方同相同DNA雙螺旋方向相反DNA 雙鏈解開成兩條單鏈正超螺旋(positive supercoil)-負(fù)超螺旋(negative supercoil)-4、 DNA 的變性 (denaturation) 的過程。加熱引起的DNA 變性，稱為熱變性。5、 融解溫度Tm ，見輕松學(xué)習(xí)。6、 DNA 復(fù)性 (renaturation) ：在適當(dāng)條件下，變性DNA 的兩條互補(bǔ)鏈可恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象，這一現(xiàn)象稱為復(fù)性。熱變性的DNA 經(jīng)緩慢冷卻后即可復(fù)性，這一過程稱為退火(annealing) 。第三章 酶1、 同工酶(isoen

9、zyme )： 具有相同的催化功能，但酶的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)和免疫學(xué)性質(zhì)都不同的一組酶稱同工酶。一級(jí)結(jié)構(gòu)不同, 但三級(jí)結(jié)構(gòu)相同或相似2、 酶的抑制劑(inhibitor) ：凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白變性的物質(zhì)稱為酶的抑制劑。3、 不可逆性抑制(irreversible inhibition ) ：抑制劑與酶的必需基團(tuán)以牢固的共價(jià)鍵結(jié)合 , 使酶喪失活性, 不能用透析超濾等物理方法除去抑制劑使酶恢復(fù)活性可逆性抑制reversible inhibition ： 這類抑制劑以非共價(jià)鍵與酶結(jié)合，使酶活性降低或喪失。采用透析或超濾等方法可以去除，由它引起的抑制作用稱可逆抑制作用。4、 激活劑

10、 （activator） ：使酶由無活性變?yōu)橛谢钚曰蚴姑富钚栽黾拥奈镔|(zhì)。5、 別構(gòu)酶（變構(gòu)酶-allosteric enzyme ）： 一些小分子物質(zhì)能夠與酶的調(diào)節(jié)部位或亞基以非共價(jià)鍵形式結(jié)合，使酶的構(gòu)象發(fā)生改變，使酶的活性增強(qiáng)或減弱，從而調(diào)控代謝反應(yīng)，這種現(xiàn)象稱為變構(gòu)調(diào)節(jié)，受變構(gòu)調(diào)節(jié)的酶稱為別構(gòu)酶。6、 核酶 （ribozyme） ： 具有生物催化功能的RNA1 、名詞 prosthetic group ； coenzyme ； apoenzyme ； active site ； isoenzyme ； Km ； allosteric enzyme ； zymogen/proenzyme2

11、、適應(yīng)功能的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)組成：全酶；輔酶/ 輔基結(jié)構(gòu)特點(diǎn)：活性中心調(diào)節(jié)酶的特點(diǎn)：變構(gòu)酶；同工酶；酶原激活3 、重要性質(zhì)： 米氏方程與Km 可逆性抑制劑的動(dòng)力學(xué)特點(diǎn)第四章 糖代謝糖酵解 （glycolysis） ： 在缺氧條件下，葡萄糖分解生成乳酸并釋放能量的過程。酵解途徑（glycolytic pathway） ： 葡萄糖轉(zhuǎn)變成丙酮酸的過程。1 、基本過程：二個(gè)階段，共10 步反應(yīng)（ 1 ）耗能階段：前五步反應(yīng)（ 2）產(chǎn)能階段：后五步反應(yīng)2 、特點(diǎn)（ 1 ）亞細(xì)胞定位：胞液（ 2 ）二步耗能、二步產(chǎn)能（ 底物水平磷酸化） ；一步脫氫，生成1 分子 NADH高能化合物：1,3-二磷酸甘油酸，磷酸烯醇

12、式丙酮酸。NADH 的利用：無氧時(shí)，用于還原丙酮酸生成乳酸；產(chǎn)能量：1分子葡萄糖無氧酵解時(shí)凈生成2分子ATP,有氧酵角1凈生成5或7分子ATP（ 3 ）三步單向反應(yīng)、三種關(guān)鍵酶不受 ATP/AMP 的調(diào)節(jié)磷酸果糖激酶1 （限速酶）激活劑：2,6-二磷酸果糖，1,6-二磷酸果糖（正反饋）AMP 抑制劑：檸檬酸，ATP+/-丙酮酸激酶：受 ATP/AMP 的抑制3 、糖酵解的生理意義（ 1 ）緊急供能：肌肉劇烈運(yùn)動(dòng)時(shí)。（ 2 ）生理供能：紅細(xì)胞、視網(wǎng)膜、睪丸、腦和骨髓等（ 3 ）病理供能：嚴(yán)重貧血、呼吸障礙和循環(huán)功能障礙。4 、底物水平磷酸化（substrate level phosphoryla

13、tion）： 見課本Krebs 循環(huán)（ 1 ）部位：線粒體（基質(zhì)、內(nèi)膜）（ 2 ） 4 步脫氫（3 個(gè) NADH 1 個(gè) FADH 2）、1 步底物水平磷酸化（GTP）? 1 個(gè)乙酰輔酶A 經(jīng)過 TAC 生成 10 個(gè) ATP? 1個(gè)丙酮酸徹底氧化生成 CO2和水時(shí)生成12.5個(gè)ATP? 1個(gè)葡萄糖徹底氧化生成 CO2和水時(shí)生成30或32個(gè)ATP（3）投入1個(gè)乙?；a(chǎn)出2個(gè)CO2；中間物凈含量不變（4） 1種酶復(fù)合體（a酮戊二酸脫氫酶系），1種呼吸鏈組成成分（琥珀酸脫氫酶）（ 5 ） 3 種關(guān)鍵酶：后2 種酶為主要調(diào)節(jié)酶? 檸檬酸合酶? 異檸檬酸脫氫酶（限速酶）? 酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體（由3

14、 種酶 5 種輔酶組成）（ 6 ）主要生理意義：高效供能；代謝樞紐重要內(nèi)容：1 、重要名詞：glycolysis ； Tricarboxylic acid Cycle ； Pastuer effect ； lactosecycle （Cori cycle） ； Gluconeogenesis2 、酵解途徑的代謝特點(diǎn)3 、丙酮酸有氧氧化的代謝特點(diǎn)4 、三羧酸循環(huán)的代謝特點(diǎn)5 、磷酸戊糖途徑的生理意義6 、糖異生的代謝特點(diǎn)7 、血糖的正常范圍、來源與去路，血糖的激素調(diào)節(jié)8 、糖代謝的基本過程第五章 脂類代謝? 脂肪動(dòng)員：概念、限速酶? 脂酸的- 氧化：概念、氧化部位、限速酶、生成ATP 數(shù)；? 酮

15、體：組成成分、酮體生成的限速酶、生成部位、意義；? 脂酸的合成：合成部位、原料、限速酶；? 甘油磷脂代謝：種類、合成途徑；? 膽固醇代謝：合成部位、原料、限速酶、轉(zhuǎn)化；? 血漿脂蛋白：分類、代謝。第六章 生物氧化1 、 ATP 的生成方式：底物水平磷酸化、呼吸鏈水平磷酸化（氧化磷酸化）作用物 / 底物水平的磷酸化（substrate level phoaphorylation） ：高能化合物在反應(yīng)的過程中，直接將能量轉(zhuǎn)給ADP ，生成 ATP 。氧化磷酸化（oxidative phosphorylation） ：是指代謝物氧化脫氫經(jīng)呼吸鏈傳遞給氧生成水的同時(shí)，偶聯(lián)有ADP 磷酸化生成ATP 的

16、過程。又稱為呼吸鏈水平的磷酸化。它是體內(nèi)生成ATP 的主要方式。2 、 呼吸鏈分類：2 條主要呼吸鏈（ 1 ） NADH 氧化呼吸鏈? SH 2（底物）NAD FMN CoQcyt b CifCfaa3O2? NADH f復(fù)合體I-Q 復(fù)合體 田Cyt c f復(fù)合體ZVO2（ 2 ） FADH2 氧化呼吸鏈? SH2（底物）FAD CoQ cyt b fcicfaa3 O2? 琥珀酸 復(fù)合體II Q 復(fù)合體田Cyt c f復(fù)合體IVO2重要內(nèi)容：? 1 、重要名詞：respiratory chain; oxidative phosphorylation? 2 、呼吸鏈的主要成分? 3 、體內(nèi)

17、2 條主要呼吸鏈的組成及排序? 4、 ATP 在能量代謝中的作用? 5 、氧化磷酸化的主要抑制劑? 6 、胞液中NADH 的氧化途徑第七章 氨基酸的代謝重要內(nèi)容：重要內(nèi)容：1 、重要名詞：essential amino acid ； one carbon unit2 、氨基酸脫氨基的主要方式；聯(lián)合脫氨基作用的特點(diǎn)3 、氨的代謝去路及尿素合成的特點(diǎn)4 、氨基酸的來源與去路；丙氨酸、天冬氨酸與谷氨酸與糖代謝、脂代謝的關(guān)系及基本 過程5 、個(gè)別氨基酸脫羧基作用轉(zhuǎn)變生成的活性物質(zhì)6 、一碳單位代謝的特點(diǎn)7 、芳香族氨基酸代謝轉(zhuǎn)變生成的活性物質(zhì)，該代謝異常時(shí)可能出現(xiàn)的遺傳病的生化特 點(diǎn)8 、含硫氨基酸在

18、體內(nèi)代謝轉(zhuǎn)變生成的活性物質(zhì)第八章 核苷酸代謝【重要內(nèi)容】1 核苷酸的生理功能。2 核苷酸從頭合成途徑中嘌呤、嘧啶環(huán)各元素或組件的材料來源。核糖核苷酸、脫氧核糖核苷酸的生成方式。3 . 核苷酸補(bǔ)救合成有關(guān)的酶名稱、功能、酶缺陷相關(guān)的疾病。4 核苷酸抗代謝藥物的作用機(jī)理及臨床意義。5 核苷酸體內(nèi)分解代謝終產(chǎn)物。6 . 別嘌呤醇治療痛風(fēng)的原理。7 重要概念：從頭合成(de novo synthesis) 、補(bǔ)救合成(或重新利用，salvagepathway)第九章 代謝調(diào)節(jié)重要內(nèi)容：1 、重要名詞：key enzyme; allosteric regulation; covalent/ chemic

19、almodification2 、重要的代謝樞紐物質(zhì)：G6P; 丙酮酸 ; 磷酸二羥丙酮; 乙酰輔酶A3 、氨基酸(Ala/Asp/Glu) 與糖、脂之間的代謝轉(zhuǎn)變4 、代謝調(diào)節(jié)的類型5 、變構(gòu)調(diào)節(jié)的特點(diǎn)6 、共價(jià)調(diào)節(jié)的主要形式及其與變構(gòu)調(diào)節(jié)的區(qū)別7 、線粒體/ 細(xì)胞液中進(jìn)行的代謝途徑8 、饑餓引起的整體代謝變化第十章DNA合成PPT無重點(diǎn)第十一章RNA生物合成本章重點(diǎn)轉(zhuǎn)錄體系： 模板、原料、方向、方式、RNA 聚合酶(原核、真核)真核與原核的異同轉(zhuǎn)錄過程： 原核：起始、延長(zhǎng)、終止轉(zhuǎn)錄后加工： mRNA ， tRNA ， rRNA 加工核酶： 概念基本概念不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄asymmetric transcription模板鏈 template strand編碼鏈 coding strand 啟動(dòng)子 promoter 外顯子 exon 內(nèi)含子 intron轉(zhuǎn)錄泡 transcription bubble 單順反子monocistronic mRNA多順反子polycistronic mRNA第十二章蛋白質(zhì)的合成三類 RNA 在蛋白質(zhì)合成中的作用遺傳密碼 ： 概念、特點(diǎn)蛋白質(zhì)合成過