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MEGA軟件系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建方法（圖文講解）2012年12月02日 Evolution 字號(hào) 小 中 大 評(píng)論 3 條 閱讀 3,872 次 點(diǎn)擊加入在線收藏夾 一、序列文本的準(zhǔn)備構(gòu)樹(shù)之前先將目標(biāo)基因序列都分別保存為txt文本文件中（或者把所有序列保存在同一個(gè)txt文本中,可以用“>基因名稱”作為第一行，然后重起一行 編輯基因序列），序列只包含序列字母（ATCG或氨基酸簡(jiǎn)寫(xiě)字母）。文件名名稱可以已經(jīng)您的想法隨意編輯。二、序列導(dǎo)入到Mega 5軟件（1）打開(kāi)Mega 5軟件，界面如下（2）導(dǎo)入需要構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的目的序列OK選擇分析序列類(lèi)型（如果是DNA序列，點(diǎn)擊DNA，如果是蛋白序列，點(diǎn)擊Protein）出現(xiàn)新的對(duì)話框，創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)文件選擇序列類(lèi)型導(dǎo)入序列導(dǎo)入序列成功。（3）序列比對(duì)分析點(diǎn)擊工具欄中“W”工具，進(jìn)行比對(duì)分析，比對(duì)結(jié)束后刪除兩端不能夠完全對(duì)齊堿基（4）系統(tǒng)發(fā)育分析關(guān)閉窗口，選擇保存文件路徑，自定義文件名稱三、系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建根據(jù)不同分析目的，選擇相應(yīng)的分析算法，本例子以NJ算法為例Bootstrap 選擇1000，點(diǎn)擊Compute，開(kāi)始計(jì)算計(jì)算完畢后，生成系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。根據(jù)不同目的，導(dǎo)出分析結(jié)果，進(jìn)行簡(jiǎn)單的修飾，保存本方法來(lái)自網(wǎng)絡(luò)，經(jīng)小編mi

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