微生物進(jìn)化與分類(lèi)學(xué)

1、第十章 微生物進(jìn)化與分類(lèi)學(xué)一、名詞解釋1. 菌株； 2.GC比 3.種 4.模式菌株 5.亞種或變種 6.型 7.菌株或品系8培養(yǎng)物 9. 群 10. 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 11.分類(lèi)單元 12. 數(shù)值分類(lèi) 二、填空1、微生物分類(lèi)學(xué)的三個(gè)具體任務(wù)為 、 、 。2、大量資料表明：功能重要的分子或功能重要的分子區(qū)域比功能不重要的大分子或大分子區(qū)域進(jìn)化變化的 。3、微量多項(xiàng)試驗(yàn)鑒定系統(tǒng)，實(shí)際上是一類(lèi)專(zhuān)門(mén)設(shè)計(jì)制作的 特征檢測(cè)卡。4、微生物種的學(xué)名由 和 兩部分構(gòu)成。5、伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)第一版分 卷出版，它將原核生物分成 組。6、分類(lèi)學(xué)的內(nèi)容涉及3個(gè)互相依存又有區(qū)別的組成部分，即 、命名和 。7、如果相似性系

2、數(shù)（SAB）等于1，說(shuō)明所比較的兩菌株rRNA序列 ，若SAB值小于0.1，則表明兩菌株親緣關(guān)系 。8、API/ATB是微量多項(xiàng)試驗(yàn)鑒定系統(tǒng)，它包括眾多的 ，共計(jì)有幾百種生理生化反應(yīng)，可鑒定幾乎所有常見(jiàn)的 。9、微孔濾膜菌落計(jì)數(shù)板是一種可攜帶的檢測(cè)水中大腸菌數(shù)的大腸菌測(cè)試卡，適于 工作和 使用，因可以放在人體內(nèi)衣口袋中培養(yǎng)。10、伍斯用寡核苷酸序列編目分析法對(duì)微生物的16SrRNA序列進(jìn)行比較后，提出將生物分成三界（域）： 、 、和 。11、伍斯為了避免把古細(xì)菌也看作是細(xì)菌的一類(lèi)，他又把三界（域）改稱(chēng)為： 、 、 和 。并構(gòu)建了三界（域）生物的系統(tǒng)樹(shù)。7、根據(jù)在分類(lèi)過(guò)程中采用特征的種類(lèi)，通常把

3、微生物分類(lèi)分成4個(gè)不同的水平： 、 、 和 。8、 簡(jiǎn)單來(lái)講，數(shù)值分類(lèi)過(guò)程主要可分為五步，即 、 、 、 和 。9、 自20世紀(jì)60年代以來(lái)，核酸分析已經(jīng)成為微生物、尤其是原核微生物分類(lèi)不可缺少的指標(biāo)，主要包括 、 和 。10、 1987年國(guó)際系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)委員會(huì)規(guī)定，DNA同源性( )%，雜交分子的熱解鏈溫度相差（ Tm） 為細(xì)菌種的界限。11、 關(guān)系密切的生物應(yīng)該具有相似的細(xì)胞蛋白質(zhì)。蛋白圖譜的比較可以采用 或 ，常用的方法是 。12、微生物種以上的分類(lèi)單位從小到大依次為: 、 、 、 、 、 和 。13、 亞種以下具有相同或相似特性的一個(gè)或一組菌株稱(chēng)為“型”,如：具有特殊的生物化學(xué)或生理特性

4、的菌株群，被稱(chēng)為 型；能產(chǎn)生特殊化學(xué)物質(zhì)的菌株群,被稱(chēng)為 型；具有特殊培養(yǎng)性狀的菌株群,被稱(chēng)為 ；具有特殊抗原特征的菌株群，被稱(chēng)為 。14、 縮寫(xiě)的單數(shù)或復(fù)數(shù)，例如Pseudomonas sp.表示 ，Micrococcus spp.表示 。15、按照“國(guó)際命名法規(guī)”，新的微生物分類(lèi)單元必須在國(guó)際公認(rèn)的刊物發(fā)表才能有效，如細(xì)菌新分類(lèi)單元必須在 雜志發(fā)表，才被學(xué)術(shù)界承認(rèn)。新的分類(lèi)單元在發(fā)表時(shí)要指定新分類(lèi)單元的 ，分類(lèi)單元的模式培養(yǎng)物要存放在國(guó)際供認(rèn)的菌種保藏機(jī)構(gòu)，以便科學(xué)界的交流使用。16 、原核生物包括 域與 域，前者目前已記載 種，后者截止2000年已記載 種。三、選擇1、伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手

5、冊(cè)第二版把葡萄球菌屬和微球菌屬分別放在不同的門(mén)中，最可能的原因是（ ）。（1）生理生化特征不同 （2）DNADNA雜交同源性不同（3）革蘭氏染色反應(yīng)不同 （4）G+C含量和rRNA序列不同2、如果需要查閱枯草芽孢桿菌及相關(guān)種的分類(lèi)學(xué)資料，并假定伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌手冊(cè)第二版已經(jīng)全部出版，你將選擇該書(shū)的（）。（1）第一卷 （2）第三卷 （3）第四卷 （4）第五卷3、血清學(xué)試驗(yàn)，尤其在醫(yī)學(xué)細(xì)菌的分類(lèi)鑒定中的重要意義，但它主要用于劃分（ ）。（1）種內(nèi)血清型 （2）種間血清型 （3）屬間血清型 （4）屬以上血清型4、根據(jù)你所掌握的知識(shí)，認(rèn)為形態(tài)學(xué)特征學(xué)特征在以下幾類(lèi)微生物中的哪嚴(yán)分類(lèi)鑒定中顯得更加重要？（

6、 ）（1）病毒 （2）細(xì)菌 （3）酵母菌 （4）霉菌5、在下列4種細(xì)菌中，哪一種最有可能屬于伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)第一版第5組“兼性厭氧的革蘭氏陰性桿菌”？（ ）（1）梅毒密螺旋體 （2）枯草芽孢桿菌 （3）大腸埃希氏菌 （4）金黃色葡萄球菌6、如果你在實(shí)驗(yàn)室用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基和常規(guī)平板法分離到一株不產(chǎn)芽孢、始終呈桿狀的細(xì)菌，只要進(jìn)行以下哪一組試驗(yàn)就可以確定它屬于33組中的某一組？（ ）（1）革蘭氏染色和厭氧生長(zhǎng)試驗(yàn) （2）革蘭氏染色、光能和化能自養(yǎng)生長(zhǎng)試驗(yàn)（3）革蘭氏染色和運(yùn)動(dòng)性試驗(yàn) （4）革蘭氏染色、好氧、厭氧和兼性厭生長(zhǎng)試驗(yàn)7、現(xiàn)在自動(dòng)化程度最高、功能最多的微生物專(zhuān)用檢測(cè)儀是（ ）（1）

7、氣相色譜儀 （2）高壓液相色譜儀（3）自動(dòng)微生物檢測(cè)儀 （4）激光拉曼光譜儀8、目前微生物的快速檢測(cè)和自動(dòng)化分析中，廣泛地采用的免疫學(xué)技術(shù)是（ ）。（1）DNA探針 （2）聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)（3）DNA芯片 （4）酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定法四、是非題1、“大腸埃希氏菌”才是俗稱(chēng)“大腸桿菌”的學(xué)名。2、所謂“模式菌株”通常是指一個(gè)細(xì)菌的種內(nèi)了具代表的菌株。3、兩種細(xì)菌的G+C含量相近，說(shuō)明它們親緣關(guān)系近，反之，G+C含量差別大說(shuō)明它們親緣關(guān)系遠(yuǎn)。4、DNADNA雜交主要用于種、屬水平上的分類(lèi)研究，而進(jìn)行親緣關(guān)系更遠(yuǎn)（屬以上等級(jí)）分類(lèi)單元的比較，則需進(jìn)行DNArRNA雜交。5、數(shù)值分類(lèi)由于采用了先進(jìn)的計(jì)算想

8、技術(shù)，減少了大量的特征測(cè)定的實(shí)驗(yàn)操作，所以它是比較科學(xué)的現(xiàn)代微生物系統(tǒng)分類(lèi)方法。6、物理、化學(xué)、材料、電子信息等科學(xué)和技術(shù)領(lǐng)域通常使用的分析、測(cè)量物質(zhì)成分、結(jié)構(gòu)、性能和各種信息的自動(dòng)化的精密儀器和設(shè)備，幾乎都能用于微生物的快速鑒定和自動(dòng)化分析。7、“吹口氣查胃病”的原理是：幽門(mén)螺桿菌具有人體不具有的尿素酶，受檢者口服13C標(biāo)記的尿素，如有該菌感染，則尿素被尿素酶分解生成NH3和13CO2，用質(zhì)譜儀能快速靈敏地測(cè)出受檢者呼氣中13CO2的量，準(zhǔn)確地鑒定是否被幽門(mén)螺桿菌感染。8、亞種名為三元式組合，即由科名、屬名加詞和亞種名加詞構(gòu)成。9、現(xiàn)代微生物生理生化特征的比較也是對(duì)微生物基因組的間接比較，加

9、上測(cè)定生理生化特征比直接分析基因組要容易得多，因此生理生化特征對(duì)于微生物的系統(tǒng)仍然是有意義的。10、蛋白質(zhì)氨基酸順序的進(jìn)化速率大體上是恒定的，但功能不同的蛋白質(zhì)常以不同的速率進(jìn)化。功能重要的分子序列或序列區(qū)域往往進(jìn)化變化速率高。五、簡(jiǎn)答題1、分類(lèi)學(xué)有哪些組成部分？2、微生物有哪些常用的分類(lèi)鑒定依據(jù)和方法？3、蛋白質(zhì)和核酸分子被用作微生物進(jìn)化譜系分析所依據(jù)的原理是什么？4、為什么16S（18）rRNA目前被挑選作為研究微生物進(jìn)化的主要對(duì)象？5、試述古生菌和細(xì)菌的主要區(qū)別。6、為什么在從事微生物的工作中不僅要注意種名還要注意菌株名稱(chēng)？7、 為什么真核生物進(jìn)化成功后，并不能取代原核生物？8、作為衡量生物物種間真正進(jìn)化關(guān)系的生物進(jìn)化時(shí)鐘的生物大分子必須滿(mǎn)足哪些條件？六、論述題1、外單位送來(lái)一個(gè)細(xì)菌培養(yǎng)物要求鑒定，你如何將其鑒定到種？2、現(xiàn)代微生物分類(lèi)主要根據(jù)基因型特征來(lái)建立分類(lèi)單元，基因型特征的測(cè)定通常都需要高新的復(fù)雜技術(shù)，而以實(shí)用為目的菌種鑒定卻希望采用更易于測(cè)定的表型特征，你認(rèn)為如何解決這一矛盾？3、為什么人們推測(cè)在生物進(jìn)化過(guò)程中有一個(gè)RNA生命時(shí)代