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1、第六章 病毒與原核生物的遺傳學(xué)分析優(yōu)點:生活周期短單倍體,無顯隱性關(guān)系研討方法簡單靈敏度高第一節(jié) 噬菌體病毒的遺傳學(xué)分析一、噬菌體的根本特征溫暖噬菌體烈性噬菌體二、噬菌體雜交與基因定位噬菌體的雜交方法:混合感染復(fù)感染、雙重感染 重組合重組頻率= x 100% 重組合+親組合例: 1955年 Kaiser 的噬菌體實驗 + + + x s mi co1 雜交 s:小噬菌斑,mi:微小噬菌斑,co1:中央渾濁小點的噬菌斑。 類型數(shù)目合計百分比 s-co1co1-mi s-mi+ + +s co1 mi975724189990.8s + + co1 mi3032622.9 s co1 + + mi6
2、1511125.3 s + mi+ co1 +513180.86 合計2091 3.76 6.16 8.2作圖: 3.76 6.16 s co1 mi 8.2 + 2 x 0.86=9.92 第二節(jié) 細菌雜交與基因定位一、E. coli 的性因子F因子性因子、致育因子:1946年J. Lederberg 在大腸桿菌中有雜交景象,并進一步發(fā)現(xiàn)了性因子F。F因子共有15個基因,3 .5 x 106道爾頓, 6 x 104bpF+:含有F因子的細胞菌株,具有性傘毛接合管F-:不含F(xiàn)因子的細胞菌株2、F因子與性導(dǎo)附加體:具能游離于染色體外而獨立存在,又可重組于染色體上的遺傳因子稱為附加體。 F因子是一
3、種附加體。當F因子從染色體上切離時,能夠發(fā)生不準確切離而帶有宿主的部分基因,這種游離的F因子稱為F因子。 F因子的轉(zhuǎn)移可以導(dǎo)致F因子上宿主基因的轉(zhuǎn)移。3、Hfr菌株當F因子重組在宿主細胞染色體上時,F(xiàn)因子依然可以發(fā)生轉(zhuǎn)移,此時的轉(zhuǎn)移可推進宿主基因的轉(zhuǎn)移,因此這種菌株稱為高頻重組菌株high frequence of recombination, Hfr)F因子推進染色體的轉(zhuǎn)移是以F因子的一端開場,沿F因子所處位置的相反方向進展轉(zhuǎn)移,F(xiàn)因子最后才轉(zhuǎn)移。所以染色體在F因子的推進下發(fā)生的轉(zhuǎn)移具有一定的方向和順序。二、中斷雜交與基因定位1954年利用Hfr菌株的染色體轉(zhuǎn)移特征方向性和順序性,進展了E.
4、coli染色體的基因定位。Hfr: thr+ leu+ Azs T1s lac+ gal+ strs供體F-: thr- leu- Azr T1r lac- gal- strr 受體讓兩種細胞混合,37水浴一定時間后取樣,組織搗碎機中斷雜交,而后涂布在含Str的根本培育基上,調(diào)查供體基因在受體細胞出現(xiàn)的時間及順序基因轉(zhuǎn)移的時間及順序。概念:選擇性標志與反選擇性標志8 8.5 9 11 18 25 thr leu Az T1 lac gal三、非中斷雜交與基因定位重組作圖 利用F因子可以推進染色體到受體細胞中的特點,將要調(diào)查的基因全部轉(zhuǎn)移到受體細胞中,然后調(diào)查各種基因型出現(xiàn)的頻率,根據(jù)重組值計算
5、公式計算重組值,進展作圖。為保證要調(diào)查的基因全部轉(zhuǎn)移到受體細胞中,選擇性標志必需處于轉(zhuǎn)移的末斷。細菌基因重組的特征:與真核生物相比,原核生物的基因重組有兩個特征,一是必需發(fā)生偶數(shù)次交換,細菌細胞才可存活;二是由于染色體不完好或選擇培育的關(guān)系,野生的重組子才可存活,所以相反的重組子不出現(xiàn)。四、E.coli的染色體圖E.coli的基因定位主要以中斷雜交的方法進展的,所以E.coli的染色體圖是以分鐘作單位的。第三節(jié) 細菌轉(zhuǎn)化與基因定位一、細菌的遺傳轉(zhuǎn)化1928年Griffith發(fā)現(xiàn)肺炎雙球菌的轉(zhuǎn)化現(xiàn)象。1944年Avery證實轉(zhuǎn)化因子是DNA。轉(zhuǎn)化(transformation):外源DNA通過細
6、胞吸收過程進入細胞,并使其發(fā)生遺傳改變的過程。感受態(tài)(competence):細胞具有吸收外源DNA能力的生理狀態(tài)。有些細菌在生長過程中會自發(fā)地產(chǎn)生感受態(tài),如肺炎雙球菌,枯草桿菌等;有些細菌不會自發(fā)地產(chǎn)生感受態(tài),必需經(jīng)特殊處理才可產(chǎn)生感受態(tài),如大腸桿菌。1928年Griffith 的實驗遺傳轉(zhuǎn)化的機理二、基因定位 遺傳轉(zhuǎn)化的轉(zhuǎn)化因子普通在1000020000bp之間,因此當兩個基因連鎖留意:這里的連鎖與真核生物的連鎖不完全一樣,他們被同時轉(zhuǎn)化共轉(zhuǎn)化的頻率要遠高于不連鎖的基因。利用共轉(zhuǎn)化的特點,可以對連鎖的基因進展基因定位。例:Nester利用枯草桿菌trp2+ his2+ tyr1+ DNA為
7、供體,對trp2- his2- tyr1- 進展轉(zhuǎn)化。第三節(jié)細菌轉(zhuǎn)導(dǎo)與基因定位年,Lederberg & Zinder在進展型管實驗時發(fā)現(xiàn)。轉(zhuǎn)導(dǎo)transduction):利用噬菌體病毒為媒介,將一個細胞供體的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到另一個細胞受體中去的過程。一、普通性普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)指供體細胞一切基因具有同等時機被進展轉(zhuǎn)導(dǎo)的過程。通常可以進展普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的噬菌體是烈性噬菌體,他們感染細菌細胞后,在細胞內(nèi)復(fù)制,最后導(dǎo)致細胞裂解。在裂解過程中,供體細胞降解。噬菌體包裝時能夠以很低的頻率發(fā)生錯誤而將供體細胞誤為噬菌體本身進展包裝。當這個噬菌體感染另一個細胞受體,從而將供體轉(zhuǎn)移到受體細胞中,完成轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。利用
8、轉(zhuǎn)導(dǎo)景象可以進展基因定位。噬菌體包裝供體時,要求片段的大小必需與噬菌體大小相當,才可進展包裝。因此當兩個基因連鎖時,這兩個基因被同時轉(zhuǎn)導(dǎo)共轉(zhuǎn)導(dǎo)、并發(fā)轉(zhuǎn)導(dǎo)的能夠性比不連鎖基因大得多。因此利用共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率的大小可以進展基因定位。 x=(1-d/L)3 或d=L(1-3 x)x:兩基因的共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率;d:兩基因間的物理間隔,單位與一樣。L:轉(zhuǎn)導(dǎo)的平均長度,即轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體大小。例:轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體P1,基因組大小為kb。供體:E. coli supC+ trpA+ pyrF+受體:E.coli supC- trpA- pyrF-以supC為選擇性標志結(jié)果: 1.supC+ trpA+ pyrF+ 2.supC+ trpA+ pyrF- 3.supC+ trpA- pyrF+ 4.supC+ trpA- pyrF- 453 順序:根據(jù)3知基因的順序為supCtrpApyrF間隔:supCtrpA共轉(zhuǎn)導(dǎo)類型是和,頻率是.,間隔為.6kb。supCpyrF共轉(zhuǎn)導(dǎo)類型是和3,頻率是.,間隔為.7kb。 根據(jù)E. coli染色體全長.xbp推算,每分鐘長度約kb。因此上述間隔分別為分
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