分子生物學(xué)習(xí)題集

1、第一章一，先翻譯成中文，再名詞解釋：Molecular biology; Central dogma; prion; holism; reductionism; genome; transcriptome; proteome ; metabolome二 填空、選擇與問答：1.按照人們的意愿，改變基因中堿基的組成，以達(dá)到 的技術(shù)稱為 。2. 因研究重組 DNA技術(shù)而獲得諾貝爾獎(jiǎng)的科學(xué)家是( ) (a) A. Kkornberg (b)W. Gilbert (c) P.Berg (d) B.McClintock3.重組 DNA的含義是什么?第二章一 先翻譯成中文，再名詞解釋：Hypothesis

2、of the inherited factor; gene; epigenetics; allele; pseudo alleles; cistron; muton; recon; Lactose operon;Deoxynucleotide acid; Z DNA; Trible Helix DNA; quadruplex DNA; denaturation; renaturation; negative superhelix; C value paradox; overlapping gene; repetitive gene; interrupted gene;splitting gen

3、e; Intron; exon; intron early; intron late; jumping gene; transposon; insertion sequence (IS ); pseudo gene; Retro-transposon; transposition burst;二 問答題1什么是細(xì)菌的限制修飾系統(tǒng)(restriction-modificaton system, R-M system)，細(xì)菌的限制修飾系統(tǒng)有什么意義?2. 某一生物DNA的chemicai complexity=8.82108bp，復(fù)性動(dòng)力學(xué)研究表明約有40%的DNA其Cot(1/2)=5, 請(qǐng)較詳

4、細(xì)地說明這部分DNA的特點(diǎn)。（E. coli DNA kinetic complexity=chemical complexity=4.2108bp，Cot(1/2)=4）3何謂斷裂基因( split gene)?何謂重疊基因( overlapping gene)?它們?cè)谏镞M(jìn)化與適應(yīng)上有何意義?4什么是順反子?用“互補(bǔ)”和“等位基因”說明“基因”這個(gè)概念。5細(xì)菌促旋酶突變通常是致死的，但是促旋酶拓?fù)洚悩?gòu)酶突變卻可以成活，其原何在?6你如何證明 Ty元件在轉(zhuǎn)座時(shí)經(jīng)歷了一個(gè)RNA中間體?7IS元件整合到靶位點(diǎn)時(shí)會(huì)發(fā)生什么，IS元件整合到靶位點(diǎn)時(shí)會(huì)發(fā)生什么?8列出一個(gè)轉(zhuǎn)座子插入到一個(gè)新位點(diǎn)所要求的

5、步驟。9比較基因組的大小和基因組復(fù)雜性的不同： 個(gè)基因組有兩個(gè)序列，一個(gè)是 A，另個(gè)是 B，各將2000bP長(zhǎng)。其中個(gè)是由400bp的序列重復(fù)5次而成，另一個(gè)則由50bp的序列重復(fù)40次而成，問： (1)這個(gè)基因組的大小怎樣? (2)這個(gè)基因組的復(fù)雜性如何?10被加工的假基因與其他假基因有哪些不同?它是如何產(chǎn)生的？11. 請(qǐng)描述 C值矛盾，并舉一個(gè)例說明。12跳躍復(fù)制的結(jié)果是什么?13為什么衛(wèi)星 DNA在密度梯度離心時(shí)會(huì)形成一個(gè)清晰的峰?14. 為什么基因組 DNA在用限制性內(nèi)切核酸酶消化時(shí)，哺乳類的衛(wèi)星 DNA會(huì)產(chǎn)生特異的帶?15. 列舉一個(gè)已知的 DNA序列編碼一種以上蛋白質(zhì)的三種方法。三

6、 填空1.Cot12實(shí)驗(yàn)測(cè)定的是 。2.酵母的 Tyl元件是一種 ，它的轉(zhuǎn)座需一段完整RNA轉(zhuǎn)錄物的合成，這個(gè)轉(zhuǎn)錄物又被復(fù)制成一個(gè)雙螺旋 DNA，隨后被整合到一個(gè)新的染色體位置。3.嚴(yán)格地說限制性內(nèi)切核酸酶(restriction endonuclease)是指已被證明是 的酶。基因工程中把那些具有識(shí)別內(nèi)切核酸酶統(tǒng)稱為限制性內(nèi)切核酸酶。4.類限制性內(nèi)切核酸酶分子量較小一般在2040kDa，通常由 亞基所組成。它們的作用底物為雙鏈 DNA，極少數(shù)類酶也可作用于單鏈 DNA，或DNARNA雜合雙鏈。這類酶的專一性強(qiáng)，它不僅對(duì)酶切點(diǎn)鄰近的兩個(gè)堿基有嚴(yán)格要求，而且對(duì)更遠(yuǎn)的堿基也有要求，因此，類酶既具有

7、專一性，也具有 專一性，一般在識(shí)別序列內(nèi)切割。切割的方式有 ，產(chǎn)生末端的 DNA片段或 的 DNA片段。作用時(shí)需要作輔助因子，但不需要 和 。5.完全的回文序列具有兩個(gè)基本的特點(diǎn)，就是：(1) (2)。6由于不同構(gòu)型的 DNA插入 EB的量不同，它們?cè)诃傊悄z電泳中的遷移率也不 同， SC DNA的泳動(dòng)速度 ，OC DNA泳動(dòng)速度 ， LDNA居中，通過凝膠電泳和 EB染色的方法可將不同構(gòu)型的 DNA分別開來。7轉(zhuǎn)座子主要由下列部分組成：(l) （2） (3) 。8.第一個(gè)報(bào)道的全測(cè)序的單鏈 DNA噬菌體是X174，DNA長(zhǎng)5386個(gè)堿基對(duì)，共 個(gè)基因，為一環(huán)狀 DNA分子，基因組的最大特點(diǎn)

8、是 。9分子遺傳學(xué)認(rèn)為，生物體的第I類遺傳信息是指 。第II類遺傳信息是指 。10衛(wèi)星DNA形成的理論主要有 、 、 。11 檢測(cè)某DNA分子具有呼吸作用，這意味著，該DNA分子的序列具有 特點(diǎn).12 對(duì)T.噬菌體區(qū)的突變研究提出了順反子假說。 對(duì)玉米胚乳色斑不穩(wěn)定遺傳現(xiàn)象進(jìn)行研究提出了基因跳躍的概念. 對(duì)E. coli半乳糖代謝操縱子突變型研究重新發(fā)現(xiàn)了基因跳躍現(xiàn)象。 對(duì)人工合成的3（dGdC）核苷酸研究提出DNA存在ZDNA構(gòu)象。四 判斷1 真核生物中，mRNADNA出現(xiàn)RLoop的電鏡圖象。2.將提取的某種DNA分別置于含有與不含EB（溴化乙錠）的瓊脂糖凝膠中電泳，發(fā)現(xiàn)其遷移率不同。3原

9、核生物中具有Direct Repeats的Tn9復(fù)合因子較具Inverted Repeats的Tn10復(fù)合因子的穩(wěn)定性差。4. Z-DNA在活體細(xì)胞內(nèi)能穩(wěn)定存在。5.兩種GC%含量相同的DNA分子，分別在pH=12和pH=7的變性緩沖液中進(jìn)行的變性反應(yīng)，測(cè)得的Tm值不同6.進(jìn)行DNA復(fù)性動(dòng)力學(xué)研究時(shí)，應(yīng)保持緩沖液的Na+濃度為0.180.2M，復(fù)性反應(yīng)的溫度一般控制在低于Tm值25左右。7.各種類型的轉(zhuǎn)座因子均具有“限制轉(zhuǎn)座頻率的負(fù)控制”機(jī)制。8.同相重疊基因可以產(chǎn)生長(zhǎng)度不同，序列相似的isoform protein，而異相重疊基因僅能產(chǎn)生結(jié)構(gòu)與功能完全不同的蛋白質(zhì)。9. Cot12與基因組大

10、小相關(guān)。10C0C1/2與基因組復(fù)雜性相關(guān)11拓?fù)洚悩?gòu)酶 和可以使 DNA產(chǎn)生正向超螺旋。12拓?fù)洚悩?gòu)酶 解旋需要ATP酶。五 選擇題1證明 DNA是遺傳物質(zhì)的兩個(gè)關(guān)鍵性實(shí)驗(yàn)是：肺炎球菌在老鼠體內(nèi)的毒性和 T2噬菌體感染大腸桿菌。這兩個(gè)實(shí)驗(yàn)中主要的論點(diǎn)證據(jù)是：( ) (a)從被感染的生物體內(nèi)重新分離得到DNA，作為疾病的致病劑 (b) DNA突變導(dǎo)致毒性喪失 (c)生物體吸收的外源 DNA(而并非蛋白質(zhì))改變了其遺傳潛能 (d) DNA是不能在生物體間轉(zhuǎn)移的，因此它一定是一種非常保守的分子 (e)真核生物、原核生物、病毒的DNA能相互混合并彼此替代21953年Watson和 Crick提出：(

11、 ) (a)多核苷酸 DNA鏈通過氫鍵連接成一個(gè)雙螺旋 (b)DNA的復(fù)制是半保留的，常常形成親本子代雙螺旋雜合鏈 (c)三個(gè)連續(xù)的核苷酸代表一個(gè)遺傳密碼 (d)遺傳物質(zhì)通常是 DNA而非RNA (e)分離到回復(fù)突變體證明這一突變并非是一個(gè)缺失突變3雙鏈DNA中的堿基對(duì)有：( ) (a) A-U (b) G-T (c) C-G (d) T-A (e) C-A4組成轉(zhuǎn)座子的旁側(cè) IS元件可以：( ) (a)同向 (b)反向 (c)兩個(gè)都有功能 (d)兩個(gè)都沒有功能5復(fù)制轉(zhuǎn)座：( ) (a)復(fù)制轉(zhuǎn)座子，即在老位點(diǎn)上留有一個(gè)拷貝 (b)移動(dòng)元件轉(zhuǎn)到一個(gè)新的位點(diǎn)，在原位點(diǎn)上不留元件 (c)要求有轉(zhuǎn)座酶

12、 (d)要求解離酶 (e)涉及保守的復(fù)制，在這個(gè)過程中轉(zhuǎn)座子序列不發(fā)生改變6非復(fù)制轉(zhuǎn)座：( ) (a)復(fù)制轉(zhuǎn)座子，即在原位點(diǎn)上留有一個(gè)拷貝 (b)移動(dòng)元件到一個(gè)新的位點(diǎn)，在原位點(diǎn)上不留元件 (c)要求有轉(zhuǎn)座酶 (d)要求解離酶 (e)涉及保守的復(fù)制，在這個(gè)過程中轉(zhuǎn)座子序列不發(fā)生改變7一個(gè)轉(zhuǎn)座子的準(zhǔn)確切離：( ) (a)切除轉(zhuǎn)座子和兩個(gè)靶序列 (b)恢復(fù)靶 DNA到它插入前的序列 (c)比不準(zhǔn)確切離更經(jīng)常發(fā)生8下面哪個(gè)(些)是在非復(fù)制轉(zhuǎn)座中轉(zhuǎn)座酶所起的作用?( ) (a)切除轉(zhuǎn)座子 (b)在靶位點(diǎn)產(chǎn)生一個(gè)交錯(cuò)切口 (c)將轉(zhuǎn)座子移到新位點(diǎn) (d)將轉(zhuǎn)座子連到靶位點(diǎn)的交錯(cuò)切口上9 Alu因子：(

13、) (a)是病毒反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子超家族的成員 (b)每個(gè)哺乳動(dòng)物基因組中有20 000到500 000個(gè)拷貝里被發(fā)現(xiàn) (C)大約長(zhǎng)30Obp (d)包括一個(gè)與反轉(zhuǎn)錄酶基因有同源的可讀框 (e)被轉(zhuǎn)錄 (0有LTR10. 下面哪些關(guān)于Alu序列的描述是正確的?( ) (a)所有Alu序列都是相同的 (b)Alu序列來源于有翻譯功能的7SL RNA (C)Alu序列是靠RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄的 (d)Alu序列永遠(yuǎn)不會(huì)存在于結(jié)構(gòu)基因中 (e)這些序列有一個(gè)區(qū)段與病毒的 DNA復(fù)制起點(diǎn)同源11基因組是：( ) (a)一個(gè)生物體內(nèi)所有基因的分子總量 (b)一個(gè)二倍體細(xì)胞中的染色體數(shù) (c)遺傳單位 (d)生物體

14、的個(gè)特定細(xì)胞內(nèi)所有基因的分子的總量12下列哪些基因組特性隨生物的復(fù)雜程度增加而上升?( ) (a)基因組大小 (b)基因數(shù)量 (c)基因組中基因的密度 (d)單個(gè)基因的平均大小13以下關(guān)于假基因的陳述哪些是正確的?( ) (a)它們含有終止子 (b)它們不被轉(zhuǎn)錄 (c)它們不被翻譯 (d)它們可能因上述任一種原因而失活 (e)它們會(huì)由于缺失或其他機(jī)理最終從基因組中消失 (f)它們能進(jìn)化為具有不同功能的新基因14. 關(guān)于回文序列，下列各項(xiàng)中，( )是不正確的 (a)是限制性內(nèi)切核酸酶的識(shí)別序列 (b)是某些蛋白的識(shí)別序列 (c)是基因的旁側(cè)序列 (d)是高度重復(fù)序列15關(guān)于宿主控制的限制修飾現(xiàn)象

15、的本質(zhì)，下列描述中只有( )不太恰當(dāng) (a)由作用于同一 DNA序列的兩種酶構(gòu)成 (b)這一系統(tǒng)中的核酸酶都是類限制性內(nèi)切核酸酶(c)這一系統(tǒng)中的修飾酶主要是通過甲基化作用對(duì) DNA進(jìn)行修飾(d)不同的宿主系統(tǒng)具有不同的限制修飾系統(tǒng)第三章一，先翻譯成中文，再名詞解釋：Replicon; semiconservative replication; semi-discontinuous replication;leading strand; lagging strand ; dUMP fragment ; replisome ; telomerase;二 問答題:1. 設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)克隆大腸桿菌的復(fù)制子

16、2將mtDNA放在含52Ci/mmol的H3一T條件下開始進(jìn)行體外復(fù)制，中途轉(zhuǎn)入5Ci/mmol H3T條件下復(fù)制，接近未期時(shí)又轉(zhuǎn)入52ci/mmol H3T條件下復(fù)制，完成一個(gè)周期，如果兩個(gè)子代DNA分子還未分離，它的放射自顯影圖象是 。3試證明一個(gè)基因中只有一條 DNA鏈作為模扳被轉(zhuǎn)錄。4.描述 Meselson-Stahl試驗(yàn)，說明這一實(shí)驗(yàn)加深我們對(duì)遺傳理解的重要性。5.描述 Matthew和Franklin所做的證明 DNA半保留復(fù)制的實(shí)驗(yàn)。6什么是質(zhì)粒的相容性?什么是不相容群?機(jī)制是什么?7Co1El衍生質(zhì)?？截悢?shù)調(diào)節(jié)機(jī)理的機(jī)理是什么?8.解釋在DNA復(fù)制過程中，后隨鏈?zhǔn)窃鯓雍铣傻摹?/p>

17、9描述滾環(huán)復(fù)制過程及其特征。10. 研究表明小麥成熟胚，未成熟幼胚，幼嫩花序，葉片細(xì)胞中端粒DNA的長(zhǎng)度分別為30 kb，80kb, 45kb, 23kb。請(qǐng)討論這一研究結(jié)果的分子生物學(xué)機(jī)理。（8分）11. 某一質(zhì)粒載體具有 Tetr和 Kanr的表型，在 Kan抗性基因內(nèi)有一Bgl 的切點(diǎn)?，F(xiàn)用Bgl 切割該載體進(jìn)行基因克隆，問：(1)轉(zhuǎn)化后涂皿時(shí)應(yīng)加什么樣的抗生素?(2)培養(yǎng)后長(zhǎng)出的菌落具有什么樣的抗性基因型?(3)如何利用抗性變化篩選到含有插人片段的重組體?三 填空1.在 DNA合成中負(fù)責(zé)復(fù)制和修復(fù)的酶是 。2.染色體中參與復(fù)制的活性區(qū)呈Y型結(jié)構(gòu)，稱為 。3.合成前導(dǎo)鏈的RNA引物是 催

18、化的，合成后隨鏈岡崎片段的RNA引物是 催化的4. 在 DNA復(fù)制過程中，連續(xù)合成的子鏈稱 ，另一條非連續(xù)合成的子鏈稱為 。5.DNA后隨鏈合成的起始要一段短的 ，它是由 以核糖核苷酸為底物合成的 。6. DNA后隨鏈合成的起始要一段短的 ，它是由 以核糖核苷酸為底物合成的 。7. 復(fù)制叉上DNA雙螺旋的解旋作用由 催化的，它利用來源于ATP水解產(chǎn)生的能量沿 DNA鏈單向移動(dòng)。在 DNA復(fù)制和修復(fù)過程中修補(bǔ) DNA螺旋上缺口的酶稱為 。8.幫助 DNA解旋的 與單鏈DNA結(jié)合，使堿基仍可參與模板反應(yīng)。9. DNA引發(fā)酶分子與 DNA解旋酶直接結(jié)合形成一個(gè) 單位，它可在復(fù)制叉上沿后隨鏈下移，隨著

19、后隨鏈的延伸合成 RNA引物。10. 如果 DNA聚合酶出現(xiàn)錯(cuò)誤，會(huì)產(chǎn)生一對(duì)錯(cuò)配堿基，這種錯(cuò)誤可以被一個(gè)通過甲基化作用來區(qū)別新鏈和舊鏈的特別系統(tǒng)進(jìn)行校正。11. 在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)了 種 DNA聚合酶。 DNA修復(fù)時(shí)需要 DNA聚合酶 。12.真核生物中有5種DNA聚合酶。它們是(l) (2) (3) (4) (5) 。13. 在 DNA修復(fù)過程中，需要第二種酶， ，作用是將 DNA中相鄰的堿基 起來。 DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性。有兩種外切核酸酶的活性，它們分別從 和 降解 DNA。DNA聚合酶 只有 外切核酸酶活性。14DNA聚合酶 的Klenow大片段是用 切割 DNA聚合酶得到的分

20、子量為76KDa的大片段，具有兩種酶活性：(1) (2) 的活性。第四章 一， 先翻譯成中文，再名詞解釋：transcription; sense strand; coding strand; antisense strand; promoter; terminator; transcriptional unit； promoter clearance; RNA polymerase; general transcription factor; gene-specific transcription factor; cis action element; trans action factor

21、; sense strand; S.D. sequence; hnRNA(heterogenuous nuclear RNA); hn RNP; enhancer; silencer; Insulater; Rho-independent terminator; Rho-dependent terminator; Zinc finger; lucine zipper; primary transcript; RNA processing; cap site; capping; CPSFcleavage and poly(A) specificity factor;CSF(cleavage st

22、imulation factor); RNA splicing；spliceosome; cis-splicing; trans-splicing; constitutive splicing; alternative splicing; RNA editing二 問答題:1 概括典型原核生物啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)和功能，并解釋什么是保守序列。2 簡(jiǎn)述原核生物RNA聚合酶全梅的組成以及各個(gè)亞基的功能3 比較 Ecoli rRNA和 tRNA的轉(zhuǎn)錄和加工。4 闡述原核生物的轉(zhuǎn)錄終止。 (1)轉(zhuǎn)錄終止的兩種主要的機(jī)制是什么? (2)為什么在細(xì)菌轉(zhuǎn)錄終止中很少涉及到Pho因子? (3)怎樣能阻止轉(zhuǎn)錄的終止?5

23、 原核生物與真核生物的mRNA的各有什么特點(diǎn)?6，-地中海貧血癥患者不能合成-球蛋白。將患者與正常人-球蛋白基因的DNA序列進(jìn)行比較分析發(fā)現(xiàn)，除第一個(gè)intron中有一個(gè)堿基發(fā)生了改變外，所有序列相同，但其mRNA分子比正常人多出約100多個(gè)核苷酸。根據(jù)這一結(jié)果，說明患者缺失-球蛋白的原因。7 說明研究?jī)蓚€(gè)已知蛋白質(zhì)間相互作用關(guān)系的酵母雙雜交技術(shù)的分子生物學(xué)原理。8 舉三例RNA的研究成就并說明其在推動(dòng)分子生物學(xué)發(fā)展中的重要意義。9 說明constitutive splicing與alternative splicing, cis-splicing與trans-splicing之間在概念及機(jī)制

24、上的區(qū)別。10 簡(jiǎn)述前體mRNA經(jīng)過剪接形成mRNA的過程。11 核內(nèi)mRNA前體是按 GUAG規(guī)則進(jìn)行剪接的，還有什么機(jī)制可以從RNA初級(jí)轉(zhuǎn)錄物中剪接內(nèi)含子?12 哪三個(gè)序列對(duì)原核生物mRNA的精確轉(zhuǎn)錄是必不可少的?13 什么是可變剪接？它是怎樣造成： (1)在不同的組織中基因活性不同？(2)單個(gè)基因翻譯產(chǎn)生兩個(gè)不同的多肽？14 什么是增強(qiáng)子? 它們與其他調(diào)控序列有何不同? 增強(qiáng)子具有哪些特點(diǎn)?15 在酵母中，上游激活序列是如何調(diào)控半乳糖基因的表達(dá)?16 說明真核生物前體 RNA加工的類別及機(jī)理。17 說明原核生物與真核生物轉(zhuǎn)錄元件(cis and trans)的特點(diǎn)。18 在DNA分離過程

25、中，酚通常與氯仿聯(lián)合使用，即使不聯(lián)合使用也要在苯酚抽提后用氯仿再抽提一次，為什么?19 比較真核生物與原核生物轉(zhuǎn)錄起始的第一步有什么個(gè)同。20概括說明因子對(duì)啟動(dòng)子調(diào)節(jié)的輔助功能。21什么是增效與減效突變?22解釋因子是怎樣選擇專一性啟動(dòng)子共有序列而啟動(dòng)不同基因表達(dá)的(考慮對(duì)環(huán)境壓力的應(yīng)答)。23 rpoN基因編碼因子:54，它具有不同于已知原核生物的因子的特征。請(qǐng)與E. coli的因子：70(RpoD)作比較討論這些特征。24 區(qū)別(1)啟動(dòng)子增效突變與啟動(dòng)子減效突變；(2)上游序列和下游序列。說明因 RNA聚合酶啟動(dòng)子不同的相互作用如何導(dǎo)致不同基因的轉(zhuǎn)錄。25. 一個(gè)基因如何產(chǎn)生兩種不同類型

26、的mRNA分子?26. 在一個(gè)克隆基因的分析中發(fā)現(xiàn)：個(gè)含有轉(zhuǎn)錄位點(diǎn)上游3.8kb DNA的克隆，其mRNA直接轉(zhuǎn)錄活性比僅含有3.1kb上游 DNA的克隆的轉(zhuǎn)錄活性大50倍。這表明了什么?27哪些轉(zhuǎn)錄因子含有 TBP?為什么它們被稱為定位因子?請(qǐng)用一個(gè)模型解釋為什么所 有三種RNA聚合酶都能與 TBP發(fā)生作用?28什么是轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合體?29RNA聚合酶起始轉(zhuǎn)錄后，起始復(fù)合物必須轉(zhuǎn)變?yōu)檠由鞆?fù)合物。因此聚合酶復(fù)合物必須解旋一小段 DNA。在線性 DNA上，解旋需要ATP， TFE， TFH和解旋酶活性。然而，超螺旋 DNA的轉(zhuǎn)錄并不需要這些因子。請(qǐng)解釋這一現(xiàn)象。30RNA聚合酶特異性地轉(zhuǎn)錄小分子

27、RNA，但為什么不轉(zhuǎn)錄5.8S rRNA?31請(qǐng)列舉剪接體組裝過程中的各個(gè)步驟，其中哪一個(gè)復(fù)合物是具有活性的剪接體?32列舉前體mRNA剪接過程中發(fā)生的6種RNA-RNA相互作用?33通過遺傳篩選，在酵母中分離得到許多與前體mRNA剪接有關(guān)的基因。其中幾個(gè)基因編碼RNA解旋酶。如何解釋前體mRNA的剪接需要多個(gè)RNA解旋酶?這些酶可能在哪一步反應(yīng)中起作用?34前體mRNA剪接體的催化中心是什么?它是如何形成的?有什么證據(jù)可以證明這個(gè)模型?35據(jù)說前體mRNA的剪接是從型剪接進(jìn)化而來的。有什么證據(jù)可以證明這一點(diǎn)?是如何發(fā)生的?這種進(jìn)化為什么對(duì)生物體有利?36比較RNA聚合酶 、催化的轉(zhuǎn)錄終止過程

28、和轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物3端的形成。37組蛋白mRNA3端的加工需要什么樣的RNA結(jié)構(gòu)?如何證明所涉及的是RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)而不是初級(jí)結(jié)構(gòu)?在其他反應(yīng)中會(huì)形成類似的結(jié)構(gòu)嗎?38為什么把同樣的第一外顯子(SL外顯子)加在所有mRNA上對(duì)錐蟲是有利的?39如何確定在一個(gè)多內(nèi)含子基因的剪接過程中，內(nèi)含子被切除的順序?40將帶有啟動(dòng)子和終止子在內(nèi)的玉米Adh完整基因?qū)隕. coli細(xì)胞內(nèi)沒有得到表達(dá)，其主要原因是什么？41.有一個(gè)被認(rèn)為是 mRNA的核苷酸序列，長(zhǎng)300個(gè)堿基，你怎樣才能： (1)證明此RNA是mRNA而不是 tRNA或rRNA。 (2)確定它是真核還是原核mRNA。42. 最初科學(xué)家是如何證明內(nèi)含

29、子兩端的保守序列對(duì)正確剪接的重要性？43, 包含s 70 的E.coli RNA聚合酶全酶識(shí)別的一個(gè)的E.coli啟動(dòng)子-10 框的非模板序列為5-CATAGT-3，（a）在第一個(gè)位置發(fā)生的CT突變是Up-mutantion還是Down-mutation？為什么？ （b）在最后位置發(fā)生的TA突變，是Up-mutantion還是Down-mutation？為什么？44，根據(jù)提供的（a）mouse total DNA mouse globin pre-mRNA ，（b）mouse total DNA mature mouse globin mRNA 雜交的電鏡圖像，說明你得到的信息。三 填空1真核

30、生物基因啟動(dòng)子包括 ， ， Box，原核生物基因啟動(dòng)子包括 ， ， box。2原核生物的啟動(dòng)子包括有 個(gè)site，它們分別是 以RNA的第一個(gè)Nt是 或 。3真核生物成熟mRNA的Cap結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是 ，加尾識(shí)別序列是 。4 寫出兩種合成后不被切割或拼接的RNA： 和 。5 真核生物的mRNA加工過程中，5端加上 ，在3端加上 ，后者由 催化。如果被轉(zhuǎn)錄基因是不連續(xù)的，那么， 一定要被切除，并通過 過程將 連接在一起。這個(gè)過程涉及許多RNA分子，如Ul和U2等，它們被統(tǒng)稱為 。它們分別與一組蛋白質(zhì)結(jié)合形成 ，并進(jìn)一步地組成40S或60S的結(jié)構(gòu),叫 。6 真核生物mRNA的加尾識(shí)別序列是 。核基因組

31、mRNA內(nèi)含子剪接的Chambon rule是 。snRNA的作用是 。切除內(nèi)含子不需能量，僅由內(nèi)含子中的A發(fā)生 反應(yīng)來完成。7 Enhancer存在于 序列中，其調(diào)控機(jī)理是 。四 選擇 1.型內(nèi)含子能利用多種形式的鳥嘌呤，如：( ) (a)GMP (b)GDP (c)GTP (d) dGDP (e)ddGMP(2，3-雙脫氧GMP)2.型剪接需要( ) (a)單價(jià)陽離子 (b)二價(jià)陽離子 (c)四價(jià)陽離子 (d) Ul snRNP (e)一個(gè)腺苷酸分支點(diǎn) (f)一個(gè)鳥膘呤核苷酸作為輔助因子3.在型剪接的過程中，( ) (a)游離的G被共價(jià)加到內(nèi)含子的5端 (b)GTP被水解 (c)內(nèi)含子形成

32、套馬索結(jié)構(gòu) (d)在第一步，G的結(jié)合位點(diǎn)被外來的 G占據(jù)，而在第二步時(shí)，被3剪接位點(diǎn)的G所取代 (e)被切除的內(nèi)含子繼續(xù)發(fā)生反應(yīng)，包括兩個(gè)環(huán)化反應(yīng)4因子的結(jié)合依靠( ) (a)對(duì)啟動(dòng)子共有序列的長(zhǎng)度和間隔的識(shí)別(b)與核心酶的相互作用 (c)彌補(bǔ)啟動(dòng)子與共有序列部分偏差的反式作用因子的存在 (d)轉(zhuǎn)錄單位的長(zhǎng)度(e)翻譯起始密碼子的距離5 DNA依賴的RNA聚合酶的通讀可以靠( ) (a)因子蛋白與核心酶的結(jié)合 (b)抗終止蛋白與一個(gè)內(nèi)在的因子終止位點(diǎn)結(jié)合，因而封閉了終止信號(hào) (c)抗終止蛋白以它的作用位點(diǎn)與核心酶結(jié)合，因而改變其構(gòu)象，使終止信號(hào)不能被核心酶識(shí)別 (d)NusA蛋白與核心酶的結(jié)

33、合 (e)聚合酶跨越抗終止子蛋白終止子復(fù)合物6因子專一性表現(xiàn)在：( )(a)因子修飾酶(SME)催化因子變構(gòu)，使其成為可識(shí)別應(yīng)激啟動(dòng)子的因子 (b)不同基因編碼識(shí)別不同啟動(dòng)子的因子 (c)不同細(xì)菌產(chǎn)生可以互換的因子 (d)因子參與起始依靠特定的核心酶 (e)因子是一種非專一性蛋白，作為所有RNA聚合酶的輔助因子起作用第五章一 ，先翻譯成中文，再名詞解釋：Translation, messenger RNA, transfer RNA, ribosomal RNA, ORF(open reading frame); GGC (general genetic codon) , codon in c

34、odon, paracodon, wobble hypothesis, Super wobble; isoaccepting tRNA; polycistron, monocistron; AARS; peptidyl site; aminoacyl sitge; exit site; S.D. sequence; Kozak sequence; codon usage; IRES 二， 問答1(1)如何區(qū)分由啟動(dòng)子起始轉(zhuǎn)錄的RNA片段與5端被加工過的RNA片段; (2)證明多肽是從氨基端到羧基端方向合成的2. 什么是搖擺假說?3. 簡(jiǎn)述真核與原核細(xì)胞中翻譯起始的主要區(qū)別。4. 如果你發(fā)現(xiàn)了一

35、種新蛋白質(zhì)，你將如何進(jìn)行下一步研究?請(qǐng)按先后順序列出基本方案。5.起始tRNA具有哪兩種與其他 tRNA不同的特性?6.氨基酸分子如何與正確的tRNA分子連接?7談?wù)劚ＷC蛋白質(zhì)翻譯準(zhǔn)確率的主要機(jī)制有哪些？8氨酰tRNA合成酶的功能是什么?9. 經(jīng)過測(cè)序分析，欲克隆的一段 DNA序列如下: GAATTCCGGCGGCGGGGTTTTCATTATTATGATCGTTGACATGGGACAAGGGGCTCCTATAATAGGTGCATTTGTAGGGGATGTGGCCACATGATAGCGCGTCGAGGCATTCAGGACCGATATTGTCATATTGCCAGCATGCTGCAGCGCGCCAA

36、CTTAGTTACAACTTATACGATGATTTTAAAAAAGAATATCAAATAGCCATCCACCCGAAAGACCACCGCAAGTATCGGTACGATCGTACCAGCACACACCACAGTCGCCAGTCTGTTACCAAATAATAAAGTTGATAATTAATTCACATCTACCTGGGTAACCCAGGTAGATGTGAATTTTAGAATTC 這段序列被克隆到某多拷貝質(zhì)粒的一個(gè)EcoR限制性位點(diǎn)，并表達(dá)了一個(gè)小肽，請(qǐng)找出這段序列中所含有的以下幾個(gè)功能位點(diǎn)： (l)兩個(gè)EcoR位點(diǎn) (2)一個(gè)啟動(dòng)子 (3)一個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) (4)一個(gè)轉(zhuǎn)錄終止子 (5)一個(gè)核糖體結(jié)

37、合位點(diǎn) (6)一個(gè)翻譯起始密碼子 (7)一個(gè)翻譯終止子 另請(qǐng)標(biāo)出相應(yīng)的調(diào)控序列及編碼區(qū)的氨基酸。10許多自發(fā)突變涉及 DNA中單堿基的置換，而且當(dāng)它們發(fā)生在編碼序列之內(nèi)時(shí)可能引起多肽中單個(gè)氨基酸的置換。當(dāng) Try被其他氨基酸替代時(shí)可能是由于哪些單堿基的置換?11一種野生型E.coli，菌株的一種蛋白質(zhì)的108位為Val殘基，分離出三種突變體(A，B 和 C)發(fā)現(xiàn)它們?cè)谶@個(gè)位置分別是 Gly,Glu和 Leu。A和 B的回復(fù)突變株中這個(gè)位置上的氨基酸分別是Trp和 Lys，突變 C沒有做進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)，解釋上述結(jié)果并推測(cè)六種菌株中該位置上的密碼。三 填空1 可使每個(gè)氨基酸和它相對(duì)應(yīng)的tRNA分子相

38、偶聯(lián)形成一個(gè) 分子。2 包括兩個(gè)tRNA分子的結(jié)合位點(diǎn)： ，即 P位點(diǎn)，緊密結(jié)合與多肽鏈延伸尾端連接的 tRNA分子，和 ，即 A位點(diǎn)，結(jié)合帶有一個(gè)氨基酸的tRNA分子。3 催化肽鍵的形成，一般認(rèn)為這個(gè)催化反應(yīng)是由核糖體大亞基上的 分子介導(dǎo)的。4釋放因子蛋白與核糖體上 A位點(diǎn)的 密碼結(jié)合，導(dǎo)致肽基轉(zhuǎn)移酶水解連接新生多肽與tRNA分子的化學(xué)鍵。5任何mRNA序列能以三種 的形式被翻譯，而且每一種都對(duì)應(yīng)一種完全不同的多肽鏈。6在所有細(xì)胞中，都有一種特別的 識(shí)別 密碼子 AUG，它攜帶一種特別的氨基酸，即 ，作為蛋白質(zhì)合成的起始氨基酸。7核糖體沿著 mRNA前進(jìn)，它需要另一個(gè)延伸因子 ，這一步需要

39、的水解。當(dāng)核糖體遇到終止密碼( 、 、 )的時(shí)候，延長(zhǎng)作用結(jié)束，核糖體和新合成的多肽被釋放出來。翻譯的最后一步被稱為 ，并且需要套 因子。8. tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)是 ， 三級(jí)結(jié)構(gòu)是 。第六章一，先翻譯成中文，再名詞解釋：cis-acting element; trans-acting factor; structural gene; regulatory gene; operon;RBS (Ribosome binding site); repressive protein; operator gene; UCE(upstream control element); activating protein; effector; inducer; corepressor; repressor; regulon; attenuator; RNAi; si RNA; antisense RNA; molecular chaperon; parental imprinting, imprinted gene; P