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文檔簡介
1、;實(shí)驗(yàn)二聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)一、實(shí)驗(yàn)原理聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)( PCR)是利用 DNA片段旁側(cè)兩個短的單鏈引物,在體外快速擴(kuò)增特異 DNA片段的技術(shù)。它應(yīng)用熱穩(wěn)定的聚合酶,通過雙鏈 DNA模板的熱變性、引物退火和引物延伸的重復(fù)循環(huán), DNA片段以指數(shù)方式增加了百萬倍。從非常微量的 DNA甚至單個細(xì)胞所含有的 DNA起始,可產(chǎn)生 ug 量的 PCR產(chǎn)物。二、器材與試劑1. 器材:移液器, EP 管,熱蓋 PCR儀,電泳儀,量筒,錐形瓶,微波爐,電子天平,紫外照色儀2. 試劑:引物,模板,Taq DNA聚合酶,原料(dNTPs),緩沖液與 Mg2+,H2O, 2*PCRmix溶液, DNA染料三、實(shí)
2、驗(yàn)步驟PCR反應(yīng)體系的建立取離心管,依次加入試劑混勻1H2O12l2模板1l3引物 T71 l4引物 sp61l52*PCRmix15 lPCR儀的熱循環(huán)反應(yīng)把離心管放入 PCR儀中,由變性 - 退火 - 延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成1. 模板 DNA的變性:模板 DNA經(jīng)加熱至 94左右一定時間后,使模板 DNA雙鏈或經(jīng) PCR擴(kuò)增形成的雙鏈 DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;2. 模板 DNA與引物的退火 ( 復(fù)性 ) :模板 DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至 56 左右,引物與模板 DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對結(jié)合;3. 引物的延伸:經(jīng)加熱至 72左右 DNA模板
3、- 引物結(jié)合物在 TaqDNA聚合酶的作用下,以 dNTP為反應(yīng)原料, 靶序列為模板, 按堿基互補(bǔ)配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板 DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)該循環(huán) 30 次,每次需要 2-3 分鐘。電泳檢測結(jié)果擴(kuò)增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠電泳中, 電泳結(jié)束后, 放到紫外照射儀中進(jìn)行透射, 電泳明膠顯示清晰的條帶,如下圖所示 加入的為 1 號樣,出現(xiàn)在 500bp 左右條帶,而預(yù)算結(jié)果為擴(kuò)增出 492bp 條帶,故實(shí)驗(yàn)成功。.;四、討論1. Mg2+離子濃度對 PCR擴(kuò)增效率影響很大,濃度過高可降低 PCR擴(kuò)增的特 異性濃度過低則影響 PCR擴(kuò)增產(chǎn)量甚至使 PCR擴(kuò)增失敗而不出擴(kuò)增條帶。
4、2. 變性溫度低, 變性時間短, 極有可能出現(xiàn)假陰性 ; 退火溫度過低, 可致非特異性擴(kuò)增而降低特異性擴(kuò)增效率退火溫度過高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴(kuò)增效率。3. EB:溴化乙錠是一種高度靈敏的熒光染色劑,用于觀察瓊脂糖中的 DNA,可與 DNA結(jié)合,用標(biāo)準(zhǔn) 302nm 紫外光透射儀激發(fā)并放射出橙紅色信號。4. 溴酚藍(lán):電泳指示劑,相當(dāng)于 300bp 的 DNA的電泳速度。5.100bp DNA Marker是由單獨(dú)的 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物混合而成,已含有 1xLoading Buffer, 可以直接電泳。包括 11 條雙鏈 DNA片斷:100bp、200bp、300bp、400bp、500bp、600bp、700bp、800bp、900bp、1000bp 和 1500bp。特異性加強(qiáng) 500bp。每次上樣 4 5 L。6. 模板一般采用 50ng-1ug 或 102-105 拷貝,濃度過高反而會抑制反應(yīng)的進(jìn)行。7. 引物的與模板的互補(bǔ)程度決定了 PCR的特異性,常用 0.1 0.5uM,濃
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