功能基因組學(xué)

1、功能基因組學(xué)課程教學(xué)大綱Course Outline課程基本信息（ Course Information ）課程代碼學(xué)時32學(xué)分（ Course Code）BI3832（Credit Hours）（ Credits）課程名稱（中文）功能基因組學(xué)（Course Name）Introduction of functional genomics課程性質(zhì)培養(yǎng)計劃課程(Course Type)授課對象（ TargetAudience）授課語言(Language of中文或英文Instruction)開課院系（ School）先修課程（ Prerequisite ）授課教師（ Teacher）* 課程簡介

2、（Description）* 課程簡介（Description）無課程網(wǎng)址（自動生成）(Course Webpage)從“功能基因組學(xué)”視角探討現(xiàn)代分子生物學(xué)進(jìn)展。介紹在基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)背景下，涌現(xiàn)的新方法和新思路。本課程將豐富以生物學(xué)為主要背景學(xué)生的組學(xué)知識體系，幫助學(xué)生掌握獲取和分析海量數(shù)據(jù)的基本方法。介紹若干微生物組學(xué)的前沿課題，以期引發(fā)學(xué)生對生命科學(xué)的研究興趣，啟發(fā)學(xué)生的獨(dú)立思考能力。This Course offers a timely summary of the principles, approaches, and applications of fu

3、nctional genomics. It presents a comprehensive review of microbial functional genomics, covering next-generation sequencing, microbial genome sequencing, applied bioinformatics analysis, RNA-seq transcriptome. With the small projects about microbial functional omics, it provides interesting homework

4、 for the undergraduate students with a major or minor in the field of Microbiology, Bioengineering, Molecular Biology and Bioinformatics.課程教學(xué)大綱（course syllabus）* 學(xué)習(xí)目標(biāo)(LearningOutcomes)* 教學(xué)內(nèi)容、進(jìn)度安排及要求(Class Schedule& Requirements)* 考核方式(Grading)* 教材或參考資料(Textbooks &Other Materials)(1) 功能基因組學(xué)的概

5、述，了解分子生物學(xué)的中心法則及、人類基因組計劃、人類微生物組學(xué)計劃等國際重要項(xiàng)目，了解功能基因組學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展。(2) 了解基因組結(jié)構(gòu)與測序，掌握原核及真核基因組結(jié)構(gòu)特征，新一代DNA 測序技術(shù)及細(xì)菌基因組測序方法。(3) 了解組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘方法，掌握常用分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫，核酸及蛋白質(zhì)序列分析工具，細(xì)菌基因識別及功能注釋方法及細(xì)菌基因組的比較分析方法。(4) 了解功能組學(xué)常用技術(shù)，了解基于新一代測序的染色質(zhì)構(gòu)象分析，RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序方法及蛋白質(zhì)組方法。教學(xué)內(nèi)容學(xué)時教學(xué)方式作業(yè)及要求基本要求考查方式緒論2書面作業(yè)面授習(xí)題完成要求或課堂匯報基因組結(jié)10完成要求書面作業(yè)構(gòu)與測序面授習(xí)題或課堂匯

6、報組學(xué)數(shù)據(jù)12完成要求書面作業(yè)挖掘方法面授習(xí)題或課堂匯報功能組學(xué)8面授習(xí)題完成要求書面作業(yè)技術(shù)簡介或課堂匯報本課程的考試，注重對學(xué)生綜合運(yùn)用所學(xué)知識解決問題能力的考核，考試成績包括三個方面：（1）考試，占總成績的 50。（2）作業(yè)成績（課程作業(yè) +課堂報告出勤），占50。Homework+oral presentation50%Final Exam50%（4）作業(yè)成績（課堂報告出勤），占15。參考書目：1. 周集中等著 , 張洪勛和趙立平等譯 . 微生物功能基因組學(xué) ,ISBN：9787502599218, 化學(xué)工業(yè)出版社 20072. Genomes 3. By T. A. Brown. 2006. John Wiley and Sons. This is a useful molecular biology text that has a genome-level orientation. It is a good reference book inmolecular genetics. An earlier edition, Genomes 2 (2002), is available onli