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文檔簡介
1、1. 氨基酸(ami no acid ):是含有一個(gè)堿性氨基(-Nf )和一個(gè)酸性羧基(-COOH)的有機(jī)化合 物,氨基一般連在 a -碳上。氨基酸是蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子。2. 必需氨基酸( essential amino acid ): 指人(或其它脊椎動物)自己不能合成,需要從 食物中獲得的氨基酸。3. 非必需氨基酸( nonessential amino acid ): 指人(或其它脊椎動物)自己能由簡單的 前體合成 , 不需要從食物中獲得的氨基酸。4. 等電點(diǎn)( pI, isoelectric point):使氨基酸處于兼性離子狀態(tài),分子的靜電荷為零,在電場中不遷移的 pH 值。5. 肽鍵
2、( peptide bond ) : 一個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)的氨基酸的氨基縮合,除去一分子水 形成的酰氨鍵。6. 肽( peptide ) : 兩個(gè)或兩個(gè)以上氨基酸通過肽鍵共價(jià)連接形成的聚合物。7. 茚三酮反應(yīng)( ninhydrin reaction ): 在加熱條件下, a 氨基酸或肽與茚三酮反應(yīng)生成 紫色(與脯氨酸及羥脯氨酸反應(yīng)生成黃色)化合物的反應(yīng)。8. 層析( chromatography ) : 按照在移動相和固定相 (可以是氣體或液體)之間的分配比 例將混合成分分開的技術(shù)。9. 離子交換層析( ion-exchange column ): 使用帶有固定的帶電基團(tuán)的聚合樹脂或凝膠層
3、 析柱。一種用離子交換樹脂作支持劑的層析技術(shù)。10. 透析( dialysis ):利用蛋白質(zhì)分子不能通過半透膜的性質(zhì),使蛋白質(zhì)和其他小分子物 質(zhì)如無機(jī)鹽、單糖等分開的一種分離純化技術(shù)。11. 凝膠過濾層析(gel filtration chromatography, GPC:也叫做分子排阻層析/凝膠滲透層析。 一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì), 按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。12. 親合層析( affinity chromatograph ): 利用共價(jià)連接有特異配體的層析介質(zhì),分離蛋 白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白質(zhì)或其它分子的層析技術(shù)。13. 高壓液相層析( HPLC)
4、: 使用顆粒極細(xì)的介質(zhì),在高壓下分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物 的層析技術(shù)。14. 凝膠電泳( gel electrophoresis ): 以凝膠為介質(zhì),在電場作用下分離蛋白質(zhì)或核酸的 分離純化技術(shù)。15.SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE:在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰胺 凝膠電泳。SDS-PAGE跟分子的大小有關(guān),跟分子所帶的電荷大小、多少無關(guān)。16. 等電聚焦電泳( IEF): 利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質(zhì))在聚丙烯酰胺凝膠制造一個(gè)pH梯度,電泳時(shí),每種蛋白質(zhì)遷移到它的等電點(diǎn)( pl )處,即梯度中為某一 pH時(shí),就不 再帶有凈的正或負(fù)電荷了。17. 雙向電泳(two
5、-dimensional electrophoresis):等電聚焦電泳和 SDS-PAGE的組合,即在同一塊膠上先進(jìn)行等電聚焦電泳(按照pI )分離,然后再進(jìn)行 SDS-PAGE(按照分子大小分離)。經(jīng)染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質(zhì)圖。18. Edman降解(Edman degradation ):從多肽鏈游離的 N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯(PITC)修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個(gè)殘基)被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。19. 同源蛋白質(zhì)( homologous protein ): 在不同生物體內(nèi)行使相同或相似功
6、能的蛋白質(zhì), 例如血紅蛋白。20. 構(gòu)型( configuration ) : 有機(jī)分子中各個(gè)原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過共價(jià)鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。21. 構(gòu)象( conformation ) : 指一個(gè)分子中,不改變共價(jià)鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子放置所 產(chǎn)生的空間排布。 一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時(shí), 不要求共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。 構(gòu)象改 變不會改變分子的光學(xué)活性。22. 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)( primary structure ): 指多肽鏈的氨基酸序列。23. 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu) (protein secondary structure
7、) : 指肽鏈主鏈不同肽段通過自身的相 互作用,形成氫鍵, 沿某一主軸盤旋折疊而形成的局部空間結(jié)構(gòu), 是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的構(gòu)象單元, 通過骨架上的羰基和酰胺基團(tuán)之間形成的氫鍵維持。常見的有a -螺旋、3 -折疊、3 -轉(zhuǎn)角、Q環(huán)和無規(guī)則卷曲等。24. 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)( protein tertiary structure) : 多肽鏈借助各種非共價(jià)鍵彎曲、折疊成具特定走向的緊密球狀構(gòu)象。 它包括一級結(jié)構(gòu)中相距較遠(yuǎn)的肽段之間的幾何相互關(guān)系和 側(cè)鏈在三維空間中彼此間的相互關(guān)系。三級結(jié)構(gòu)主要是靠氨基酸側(cè)鏈之間的疏水相互作用、 氫鍵、范德華力和鹽鍵 (離子鍵 )維持的。25. 蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)( protei
8、n quaternary structure) : 寡聚蛋白質(zhì)所有, eg: 血紅蛋白,寡聚蛋白質(zhì)中各亞基之間在空間上的相互關(guān)系和結(jié)合方式。26. .a -螺旋( a -helix ): 蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個(gè)氨基酸殘基(第n 個(gè))的羰基與多肽鏈C端方向的第4個(gè)殘基(第4+n個(gè))的酰胺氮形成氫鍵。在古典的右手 a -螺旋 結(jié)構(gòu)中,螺距為 0.54nm,每一圈含有3.6個(gè)氨基酸殘基,每個(gè)殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm.27. 3 - 折疊( 3 -pleated sheet ) : 蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu)
9、 , 是由伸展的多肽鏈組成的。 折疊片的構(gòu)象是通過一個(gè)肽鍵的羰基氧和位于同一個(gè)肽鏈的另一個(gè)酰氨氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列(肽鏈反向排列) 。28. 3 - 轉(zhuǎn)角( 3 -turn ):也是多肽鏈中常見的二級結(jié)構(gòu) , 是連接蛋白質(zhì)分子中的二級結(jié)構(gòu)(a -螺旋和3 -折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū),一般含有216個(gè)氨基酸殘基。含有5個(gè)以上的氨基酸殘基的轉(zhuǎn)角又常稱為環(huán)( loop )。常見的轉(zhuǎn)角含有 4個(gè)氨基酸殘 基有兩種類型: 轉(zhuǎn)角 I 的特點(diǎn)是: 第一個(gè)氨基酸殘基羰基氧與第四個(gè)殘基的酰氨氮之間形成 氫鍵;轉(zhuǎn)角
10、H的第三個(gè)殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第二個(gè)殘基大都是脯氨酸。29. 無規(guī)卷曲 ( random coil )直鏈多聚體的一種比較不規(guī)則的構(gòu)象,其側(cè)鏈間的相互作用比較小。 無規(guī)卷曲對圍繞單鍵轉(zhuǎn)動阻力極小, 并且由于溶劑分子的碰撞而不斷扭曲, 因此不具 獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu)和最適構(gòu)象。 無規(guī)卷曲可因環(huán)境而改變, 有其生物學(xué)意義, 這類有序的非重 復(fù)性結(jié)構(gòu)經(jīng)常構(gòu)成酶活性部位和其他蛋白質(zhì)特異的功能部位。30. 超二級結(jié)構(gòu)( super-secondary structure ) : 在蛋白質(zhì)中,特別是球蛋白中,經(jīng)常可以看到由若干相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元組合在一起, 彼此相互作用, 形成有規(guī)則的, 種類不多的
11、二 級結(jié)構(gòu)組合或二級結(jié)構(gòu)串,在各種蛋白質(zhì)中充當(dāng)三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)件。分為a a , 3 a 3 , 33三種31. 結(jié)構(gòu)域( domain) : 多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)或超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成三級結(jié)構(gòu)的局部折疊 區(qū),它是相對獨(dú)立的緊密球狀實(shí)體。32. 纖維蛋白( fibrous protein ):一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有呈現(xiàn)相同二 級結(jié)構(gòu)的多肽鏈許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為 單個(gè)細(xì)胞或整個(gè)生物體提供機(jī)械強(qiáng)度,起著 保護(hù)或結(jié)構(gòu)上的作用。33. 球蛋白 (globular protein) :緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白 質(zhì),許多都溶于水。典形的球蛋白含有能特異的識別其它化
12、合物的凹陷或裂隙部位。34. 角蛋白(keratin ):由處于a -螺旋或3 -折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成不溶于水的起 著保護(hù)或結(jié)構(gòu)作用蛋白質(zhì)。35. 膠原(蛋白) ( collagen ):是動物結(jié)締組織最豐富的一種蛋白質(zhì),它是由原膠原蛋白分 子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。 每個(gè)原膠原分子都是由 3條特殊的 左手螺旋(螺距 0.95nm, 每一圈含有 3.3 個(gè)殘基)的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。36. 疏水相互作用 (hydrophobic interaction):水介質(zhì)中球狀蛋白質(zhì)的折疊總是傾向于把疏水殘基埋藏在分子的內(nèi)部的現(xiàn)象。37. 蛋白質(zhì)變性( denaturat
13、ion ) : 天然蛋白質(zhì)受到某些物理因素如加熱、紫外線照射、高 溫和表面張力等或化學(xué)因素如有機(jī)溶劑、脲、胍、酸、堿等的影響時(shí),生物活性喪失,溶解 度降低, 不對稱程度增高以及其他的物理化學(xué)常數(shù)發(fā)生改變, 這種過程稱蛋白質(zhì)變性。 其實(shí) 質(zhì)是次級鍵被破壞,但一級結(jié)構(gòu)仍完好。38. 蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu): 蛋白質(zhì)分子所有原子和基團(tuán)在三維空間結(jié)構(gòu)的構(gòu)象及走向。39. 肌紅蛋白( myoglobin ) : 是由一條肽鏈和一個(gè)血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,是肌肉內(nèi)儲 存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。40. 復(fù)性( renaturation ) : 當(dāng)變性因素除去后,變性的生物大分子恢復(fù)成具有生物活性的
14、 天然構(gòu)象的現(xiàn)象。41. 波爾效應(yīng)(Bohr effect ):增加CO濃度和降低pH都能提高血紅蛋白亞基的協(xié)同效應(yīng), 引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白氧親和力下降, 促進(jìn)血紅蛋白釋放氧, 反之, 增加氧氣的濃度, 使血 紅蛋白釋放 及CO,這種現(xiàn)象稱波爾效應(yīng)。42. 血紅蛋白( hemoglobin ) : 存在于脊椎動物、某些無脊椎動物血液和豆科植物根瘤中。血紅蛋白是使血液呈紅色的蛋白,它由四條鏈組成, 兩條 a 鏈和兩條 3 鏈,每一條鏈有一個(gè)包含一個(gè)鐵原子的環(huán)狀血紅素。氧氣結(jié)合在鐵原子上, 被血液運(yùn)輸。 血紅蛋白的氧解離曲線呈 S 形,提示亞基之間存在正協(xié)同作用。43. 別構(gòu)效應(yīng)( alloste
15、ric effect ) : 又稱為變構(gòu)效應(yīng),寡聚蛋白質(zhì)一般具多個(gè)結(jié)合部位, 結(jié)合在蛋白質(zhì)分子的特定部位上的配體對該分子的其他部位所產(chǎn)生的影響。44. 伴娘蛋白( chaperone ): 又稱分子伴侶,是一種與新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它 正確折疊成具有生物功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)。 伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有 組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。45. 二硫鍵( disulfide bond ): 通過兩個(gè)(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價(jià)鍵。二硫鍵 在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。46. 范德華力( van der Waa
16、ls force ): 中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一弱的 分子之間的力。 當(dāng)兩個(gè)原子之間的距離為它們范德華力半徑之和時(shí), 范德華力最強(qiáng)。 強(qiáng)的范 德華力的排斥作用可防止原子相互靠近。47. 鐮刀型細(xì)胞貧血病( sickle-cell anemia ) : 血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點(diǎn)是病人的血紅蛋白3 亞基 N 端的第六個(gè)氨基酸殘缺是纈氨酸( Val ),而不是下正常的谷氨酸殘基 (Glu) 。48. 二面角: 兩個(gè)肽鍵平面之間的 a -碳原子,可以作為一個(gè)旋轉(zhuǎn)點(diǎn)形成二面角 (dihedral angle)。繞Ca -N鍵軸旋轉(zhuǎn)的二面角(C
17、-N-C a -C)稱為 $ ,繞 Ca -C鍵軸旋轉(zhuǎn)的二面角(N-C a -C-N)稱為2,原則上$和2可以取-180° +180°之間的任一值,這樣多肽鏈 主鏈的各種可能構(gòu)象都可用$和2這兩個(gè)二面角或扭角來描述。49. 蛋白質(zhì)特定構(gòu)象形成的驅(qū)動力: (1)R- 側(cè)鏈基團(tuán)間的相互作用 (2) 肽鏈與環(huán)境水分子的 相互作用 (3) 天然構(gòu)象的形成過程是一個(gè)自發(fā)的過程 (?G<0)50. 兩性離子( ampholyte ):又稱兼性離子,偶極離子,即在同一分子中含有等量的正負(fù)兩種電荷。51. 氫鍵(hydrogen bond ):氫原子與電負(fù)性的原子 X共價(jià)結(jié)合時(shí),共用
18、的電子對強(qiáng)烈地偏向 X 的一邊,使氫原子帶有部分正電荷,能再與另一個(gè)電負(fù)性高而半徑較小的原子Y 結(jié)合,形成的x H- Y型的鍵。52. 肽平面( peptide plane ):也叫酰胺平面,指肽鏈主鏈上的肽鍵因具有部分雙鍵性質(zhì), 不能自由旋轉(zhuǎn),使連接在肽鍵上的 6 個(gè)原子共處的同一平面。53. 谷胱甘肽(glutathione, GSH :由谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸組成的短肽,主要生理作用是做為體內(nèi)一種重要的抗氧化劑, 它能夠清除掉人體內(nèi)的自由基, 清潔和凈化人體內(nèi)環(huán) 境污染,從而增進(jìn)了人的身心健康。谷胱甘肽有還原型(G-SH和氧化型(G-S-S-G)兩種形式, 在生理?xiàng)l件下以還原型谷胱甘肽
19、占絕大多數(shù)。 谷胱甘肽還原酶催化兩型間的互變。 該 酶的輔酶為磷酸糖旁路代謝提供的NADPH。54. 亞基( subunit )又稱亞單位, 組成蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)最小的共價(jià)單位, 是指四級結(jié)構(gòu)的蛋 白質(zhì)中具有三級結(jié)構(gòu)的球蛋白。55. 分子病(molecular disease ):由于基因或 DNA分子的缺陷,致使細(xì)胞內(nèi)RNA及蛋白質(zhì)合成出現(xiàn)異常、人體結(jié)構(gòu)與功能隨之發(fā)生變異的疾病。DNA分子的此種異常,有些可隨個(gè)體繁殖而傳給后代。如鐮狀細(xì)胞性貧血,是合成血紅蛋白的基因異常所致的貧血疾患。56. 模序( Motif ): 也稱模體,在許多蛋白質(zhì)分子中,可以發(fā)現(xiàn) 2到 3個(gè)具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間
20、上互相接近, 形成一個(gè)具有特殊功能的空間結(jié)構(gòu), 稱為蛋白質(zhì)的“模序”。 一個(gè) 模序總有其特異的氨基酸序列,發(fā)揮特殊的功能,例如“鋅指結(jié)構(gòu)”(zinc finger ),此模體由一個(gè)a -螺旋和兩個(gè)反平行的3 -折疊三個(gè)肽段組成,形似手指,具有結(jié)合鋅離子的功能。模體的特征性空間結(jié)構(gòu)使其特殊功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。57. 抗原決定簇( antigenic determinant ): 又稱表位,是決定抗原性的特殊化學(xué)基團(tuán), 大多存在于抗原物質(zhì)的表面, 有些存在于抗原物質(zhì)的內(nèi)部, 須經(jīng)酶或其他方式處理后才暴露 出來。58. 抗體( antibody;Ab ):機(jī)體的免疫系統(tǒng)在抗原刺激下,由 B 淋巴細(xì)胞或記
21、憶細(xì)胞增殖分 化成的漿細(xì)胞所產(chǎn)生的、可與相應(yīng)抗原發(fā)生特異性結(jié)合的免疫球蛋白。主要分布在血清中, 也分布于組織液及外分泌液中。59. 抗原( antigen;Ag ):是指能夠刺激機(jī)體產(chǎn)生(特異性)免疫應(yīng)答,并能與免疫應(yīng)答產(chǎn) 物抗體和致敏淋巴細(xì)胞在體外結(jié)合, 發(fā)生免疫效應(yīng) (特異性反應(yīng))的物質(zhì)。 抗原的基本特性 有兩種: 一是誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的能力, 也就是免疫原性; 二是與免疫應(yīng)答的產(chǎn)物發(fā)生反應(yīng), 也 就是抗原性。60. 半抗原( hapten ):能與對應(yīng)抗體結(jié)合出現(xiàn)抗原 -抗體反應(yīng)、又不能單獨(dú)激發(fā)人或動物體產(chǎn)生抗體的抗原。 它只有反應(yīng)原性, 不具免疫原性, 又稱不完全抗原。 大多數(shù)多糖和所有的
22、 類脂都屬于半抗原。 如果用化學(xué)方法把半抗原與某種純蛋白的分子 (載體) 結(jié)合, 純蛋白會 獲得新的免疫原性, 并能刺激動物產(chǎn)生相應(yīng)的抗體。 半抗原一旦與純蛋白結(jié)合, 就構(gòu)成該蛋 白質(zhì)的一個(gè)抗原簇。一些比一般半抗原分子量小,但有特異結(jié)構(gòu)的化學(xué)活性基團(tuán)物質(zhì)(如青霉素、 磺胺劑等 ),稱為簡單半抗原。 當(dāng)簡單半抗原進(jìn)入過敏體質(zhì)的機(jī)體時(shí), 能與體內(nèi)組 織蛋白結(jié)合,成為完全抗原,這種完全抗原可引起超敏反應(yīng)。一般來說,B淋巴細(xì)胞識別半抗原決定簇, T 淋巴細(xì)胞識別載體抗原決定簇。61. 單克隆抗體( monoclonal antibody;McAb;mAb ):高度均質(zhì)性的特異性抗體,由一個(gè)識 別單一抗原表位的 B 細(xì)胞克隆所分泌。一般來自雜交瘤細(xì)胞。62. 多克隆抗體( polyclonal ant
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