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文檔簡介
1、1. 氨基酸(ami no acid ):是含有一個堿性氨基(-Nf )和一個酸性羧基(-COOH)的有機化合 物,氨基一般連在 a -碳上。氨基酸是蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子。2. 必需氨基酸( essential amino acid ): 指人(或其它脊椎動物)自己不能合成,需要從 食物中獲得的氨基酸。3. 非必需氨基酸( nonessential amino acid ): 指人(或其它脊椎動物)自己能由簡單的 前體合成 , 不需要從食物中獲得的氨基酸。4. 等電點( pI, isoelectric point):使氨基酸處于兼性離子狀態(tài),分子的靜電荷為零,在電場中不遷移的 pH 值。5. 肽鍵
2、( peptide bond ) : 一個氨基酸的羧基與另一個的氨基酸的氨基縮合,除去一分子水 形成的酰氨鍵。6. 肽( peptide ) : 兩個或兩個以上氨基酸通過肽鍵共價連接形成的聚合物。7. 茚三酮反應(yīng)( ninhydrin reaction ): 在加熱條件下, a 氨基酸或肽與茚三酮反應(yīng)生成 紫色(與脯氨酸及羥脯氨酸反應(yīng)生成黃色)化合物的反應(yīng)。8. 層析( chromatography ) : 按照在移動相和固定相 (可以是氣體或液體)之間的分配比 例將混合成分分開的技術(shù)。9. 離子交換層析( ion-exchange column ): 使用帶有固定的帶電基團的聚合樹脂或凝膠層
3、 析柱。一種用離子交換樹脂作支持劑的層析技術(shù)。10. 透析( dialysis ):利用蛋白質(zhì)分子不能通過半透膜的性質(zhì),使蛋白質(zhì)和其他小分子物 質(zhì)如無機鹽、單糖等分開的一種分離純化技術(shù)。11. 凝膠過濾層析(gel filtration chromatography, GPC:也叫做分子排阻層析/凝膠滲透層析。 一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì), 按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。12. 親合層析( affinity chromatograph ): 利用共價連接有特異配體的層析介質(zhì),分離蛋 白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白質(zhì)或其它分子的層析技術(shù)。13. 高壓液相層析( HPLC)
4、: 使用顆粒極細(xì)的介質(zhì),在高壓下分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物 的層析技術(shù)。14. 凝膠電泳( gel electrophoresis ): 以凝膠為介質(zhì),在電場作用下分離蛋白質(zhì)或核酸的 分離純化技術(shù)。15.SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE:在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰胺 凝膠電泳。SDS-PAGE跟分子的大小有關(guān),跟分子所帶的電荷大小、多少無關(guān)。16. 等電聚焦電泳( IEF): 利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質(zhì))在聚丙烯酰胺凝膠制造一個pH梯度,電泳時,每種蛋白質(zhì)遷移到它的等電點( pl )處,即梯度中為某一 pH時,就不 再帶有凈的正或負(fù)電荷了。17. 雙向電泳(two
5、-dimensional electrophoresis):等電聚焦電泳和 SDS-PAGE的組合,即在同一塊膠上先進(jìn)行等電聚焦電泳(按照pI )分離,然后再進(jìn)行 SDS-PAGE(按照分子大小分離)。經(jīng)染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質(zhì)圖。18. Edman降解(Edman degradation ):從多肽鏈游離的 N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯(PITC)修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。19. 同源蛋白質(zhì)( homologous protein ): 在不同生物體內(nèi)行使相同或相似功
6、能的蛋白質(zhì), 例如血紅蛋白。20. 構(gòu)型( configuration ) : 有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。21. 構(gòu)象( conformation ) : 指一個分子中,不改變共價鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子放置所 產(chǎn)生的空間排布。 一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時, 不要求共價鍵的斷裂和重新形成。 構(gòu)象改 變不會改變分子的光學(xué)活性。22. 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)( primary structure ): 指多肽鏈的氨基酸序列。23. 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu) (protein secondary structure
7、) : 指肽鏈主鏈不同肽段通過自身的相 互作用,形成氫鍵, 沿某一主軸盤旋折疊而形成的局部空間結(jié)構(gòu), 是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的構(gòu)象單元, 通過骨架上的羰基和酰胺基團之間形成的氫鍵維持。常見的有a -螺旋、3 -折疊、3 -轉(zhuǎn)角、Q環(huán)和無規(guī)則卷曲等。24. 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)( protein tertiary structure) : 多肽鏈借助各種非共價鍵彎曲、折疊成具特定走向的緊密球狀構(gòu)象。 它包括一級結(jié)構(gòu)中相距較遠(yuǎn)的肽段之間的幾何相互關(guān)系和 側(cè)鏈在三維空間中彼此間的相互關(guān)系。三級結(jié)構(gòu)主要是靠氨基酸側(cè)鏈之間的疏水相互作用、 氫鍵、范德華力和鹽鍵 (離子鍵 )維持的。25. 蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)( protei
8、n quaternary structure) : 寡聚蛋白質(zhì)所有, eg: 血紅蛋白,寡聚蛋白質(zhì)中各亞基之間在空間上的相互關(guān)系和結(jié)合方式。26. .a -螺旋( a -helix ): 蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n 個)的羰基與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第4+n個)的酰胺氮形成氫鍵。在古典的右手 a -螺旋 結(jié)構(gòu)中,螺距為 0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm.27. 3 - 折疊( 3 -pleated sheet ) : 蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu)
9、 , 是由伸展的多肽鏈組成的。 折疊片的構(gòu)象是通過一個肽鍵的羰基氧和位于同一個肽鏈的另一個酰氨氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列(肽鏈反向排列) 。28. 3 - 轉(zhuǎn)角( 3 -turn ):也是多肽鏈中常見的二級結(jié)構(gòu) , 是連接蛋白質(zhì)分子中的二級結(jié)構(gòu)(a -螺旋和3 -折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū),一般含有216個氨基酸殘基。含有5個以上的氨基酸殘基的轉(zhuǎn)角又常稱為環(huán)( loop )。常見的轉(zhuǎn)角含有 4個氨基酸殘 基有兩種類型: 轉(zhuǎn)角 I 的特點是: 第一個氨基酸殘基羰基氧與第四個殘基的酰氨氮之間形成 氫鍵;轉(zhuǎn)角
10、H的第三個殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第二個殘基大都是脯氨酸。29. 無規(guī)卷曲 ( random coil )直鏈多聚體的一種比較不規(guī)則的構(gòu)象,其側(cè)鏈間的相互作用比較小。 無規(guī)卷曲對圍繞單鍵轉(zhuǎn)動阻力極小, 并且由于溶劑分子的碰撞而不斷扭曲, 因此不具 獨特的三維結(jié)構(gòu)和最適構(gòu)象。 無規(guī)卷曲可因環(huán)境而改變, 有其生物學(xué)意義, 這類有序的非重 復(fù)性結(jié)構(gòu)經(jīng)常構(gòu)成酶活性部位和其他蛋白質(zhì)特異的功能部位。30. 超二級結(jié)構(gòu)( super-secondary structure ) : 在蛋白質(zhì)中,特別是球蛋白中,經(jīng)??梢钥吹接扇舾上噜彽亩壗Y(jié)構(gòu)單元組合在一起, 彼此相互作用, 形成有規(guī)則的, 種類不多的
11、二 級結(jié)構(gòu)組合或二級結(jié)構(gòu)串,在各種蛋白質(zhì)中充當(dāng)三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)件。分為a a , 3 a 3 , 33三種31. 結(jié)構(gòu)域( domain) : 多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)或超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成三級結(jié)構(gòu)的局部折疊 區(qū),它是相對獨立的緊密球狀實體。32. 纖維蛋白( fibrous protein ):一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有呈現(xiàn)相同二 級結(jié)構(gòu)的多肽鏈許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為 單個細(xì)胞或整個生物體提供機械強度,起著 保護或結(jié)構(gòu)上的作用。33. 球蛋白 (globular protein) :緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白 質(zhì),許多都溶于水。典形的球蛋白含有能特異的識別其它化
12、合物的凹陷或裂隙部位。34. 角蛋白(keratin ):由處于a -螺旋或3 -折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成不溶于水的起 著保護或結(jié)構(gòu)作用蛋白質(zhì)。35. 膠原(蛋白) ( collagen ):是動物結(jié)締組織最豐富的一種蛋白質(zhì),它是由原膠原蛋白分 子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。 每個原膠原分子都是由 3條特殊的 左手螺旋(螺距 0.95nm, 每一圈含有 3.3 個殘基)的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。36. 疏水相互作用 (hydrophobic interaction):水介質(zhì)中球狀蛋白質(zhì)的折疊總是傾向于把疏水殘基埋藏在分子的內(nèi)部的現(xiàn)象。37. 蛋白質(zhì)變性( denaturat
13、ion ) : 天然蛋白質(zhì)受到某些物理因素如加熱、紫外線照射、高 溫和表面張力等或化學(xué)因素如有機溶劑、脲、胍、酸、堿等的影響時,生物活性喪失,溶解 度降低, 不對稱程度增高以及其他的物理化學(xué)常數(shù)發(fā)生改變, 這種過程稱蛋白質(zhì)變性。 其實 質(zhì)是次級鍵被破壞,但一級結(jié)構(gòu)仍完好。38. 蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu): 蛋白質(zhì)分子所有原子和基團在三維空間結(jié)構(gòu)的構(gòu)象及走向。39. 肌紅蛋白( myoglobin ) : 是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,是肌肉內(nèi)儲 存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。40. 復(fù)性( renaturation ) : 當(dāng)變性因素除去后,變性的生物大分子恢復(fù)成具有生物活性的
14、 天然構(gòu)象的現(xiàn)象。41. 波爾效應(yīng)(Bohr effect ):增加CO濃度和降低pH都能提高血紅蛋白亞基的協(xié)同效應(yīng), 引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白氧親和力下降, 促進(jìn)血紅蛋白釋放氧, 反之, 增加氧氣的濃度, 使血 紅蛋白釋放 及CO,這種現(xiàn)象稱波爾效應(yīng)。42. 血紅蛋白( hemoglobin ) : 存在于脊椎動物、某些無脊椎動物血液和豆科植物根瘤中。血紅蛋白是使血液呈紅色的蛋白,它由四條鏈組成, 兩條 a 鏈和兩條 3 鏈,每一條鏈有一個包含一個鐵原子的環(huán)狀血紅素。氧氣結(jié)合在鐵原子上, 被血液運輸。 血紅蛋白的氧解離曲線呈 S 形,提示亞基之間存在正協(xié)同作用。43. 別構(gòu)效應(yīng)( alloste
15、ric effect ) : 又稱為變構(gòu)效應(yīng),寡聚蛋白質(zhì)一般具多個結(jié)合部位, 結(jié)合在蛋白質(zhì)分子的特定部位上的配體對該分子的其他部位所產(chǎn)生的影響。44. 伴娘蛋白( chaperone ): 又稱分子伴侶,是一種與新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它 正確折疊成具有生物功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)。 伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有 組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。45. 二硫鍵( disulfide bond ): 通過兩個(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價鍵。二硫鍵 在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。46. 范德華力( van der Waa
16、ls force ): 中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一弱的 分子之間的力。 當(dāng)兩個原子之間的距離為它們范德華力半徑之和時, 范德華力最強。 強的范 德華力的排斥作用可防止原子相互靠近。47. 鐮刀型細(xì)胞貧血病( sickle-cell anemia ) : 血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白3 亞基 N 端的第六個氨基酸殘缺是纈氨酸( Val ),而不是下正常的谷氨酸殘基 (Glu) 。48. 二面角: 兩個肽鍵平面之間的 a -碳原子,可以作為一個旋轉(zhuǎn)點形成二面角 (dihedral angle)。繞Ca -N鍵軸旋轉(zhuǎn)的二面角(C
17、-N-C a -C)稱為 $ ,繞 Ca -C鍵軸旋轉(zhuǎn)的二面角(N-C a -C-N)稱為2,原則上$和2可以取-180° +180°之間的任一值,這樣多肽鏈 主鏈的各種可能構(gòu)象都可用$和2這兩個二面角或扭角來描述。49. 蛋白質(zhì)特定構(gòu)象形成的驅(qū)動力: (1)R- 側(cè)鏈基團間的相互作用 (2) 肽鏈與環(huán)境水分子的 相互作用 (3) 天然構(gòu)象的形成過程是一個自發(fā)的過程 (?G<0)50. 兩性離子( ampholyte ):又稱兼性離子,偶極離子,即在同一分子中含有等量的正負(fù)兩種電荷。51. 氫鍵(hydrogen bond ):氫原子與電負(fù)性的原子 X共價結(jié)合時,共用
18、的電子對強烈地偏向 X 的一邊,使氫原子帶有部分正電荷,能再與另一個電負(fù)性高而半徑較小的原子Y 結(jié)合,形成的x H- Y型的鍵。52. 肽平面( peptide plane ):也叫酰胺平面,指肽鏈主鏈上的肽鍵因具有部分雙鍵性質(zhì), 不能自由旋轉(zhuǎn),使連接在肽鍵上的 6 個原子共處的同一平面。53. 谷胱甘肽(glutathione, GSH :由谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸組成的短肽,主要生理作用是做為體內(nèi)一種重要的抗氧化劑, 它能夠清除掉人體內(nèi)的自由基, 清潔和凈化人體內(nèi)環(huán) 境污染,從而增進(jìn)了人的身心健康。谷胱甘肽有還原型(G-SH和氧化型(G-S-S-G)兩種形式, 在生理條件下以還原型谷胱甘肽
19、占絕大多數(shù)。 谷胱甘肽還原酶催化兩型間的互變。 該 酶的輔酶為磷酸糖旁路代謝提供的NADPH。54. 亞基( subunit )又稱亞單位, 組成蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)最小的共價單位, 是指四級結(jié)構(gòu)的蛋 白質(zhì)中具有三級結(jié)構(gòu)的球蛋白。55. 分子病(molecular disease ):由于基因或 DNA分子的缺陷,致使細(xì)胞內(nèi)RNA及蛋白質(zhì)合成出現(xiàn)異常、人體結(jié)構(gòu)與功能隨之發(fā)生變異的疾病。DNA分子的此種異常,有些可隨個體繁殖而傳給后代。如鐮狀細(xì)胞性貧血,是合成血紅蛋白的基因異常所致的貧血疾患。56. 模序( Motif ): 也稱模體,在許多蛋白質(zhì)分子中,可以發(fā)現(xiàn) 2到 3個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間
20、上互相接近, 形成一個具有特殊功能的空間結(jié)構(gòu), 稱為蛋白質(zhì)的“模序”。 一個 模序總有其特異的氨基酸序列,發(fā)揮特殊的功能,例如“鋅指結(jié)構(gòu)”(zinc finger ),此模體由一個a -螺旋和兩個反平行的3 -折疊三個肽段組成,形似手指,具有結(jié)合鋅離子的功能。模體的特征性空間結(jié)構(gòu)使其特殊功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。57. 抗原決定簇( antigenic determinant ): 又稱表位,是決定抗原性的特殊化學(xué)基團, 大多存在于抗原物質(zhì)的表面, 有些存在于抗原物質(zhì)的內(nèi)部, 須經(jīng)酶或其他方式處理后才暴露 出來。58. 抗體( antibody;Ab ):機體的免疫系統(tǒng)在抗原刺激下,由 B 淋巴細(xì)胞或記
21、憶細(xì)胞增殖分 化成的漿細(xì)胞所產(chǎn)生的、可與相應(yīng)抗原發(fā)生特異性結(jié)合的免疫球蛋白。主要分布在血清中, 也分布于組織液及外分泌液中。59. 抗原( antigen;Ag ):是指能夠刺激機體產(chǎn)生(特異性)免疫應(yīng)答,并能與免疫應(yīng)答產(chǎn) 物抗體和致敏淋巴細(xì)胞在體外結(jié)合, 發(fā)生免疫效應(yīng) (特異性反應(yīng))的物質(zhì)。 抗原的基本特性 有兩種: 一是誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的能力, 也就是免疫原性; 二是與免疫應(yīng)答的產(chǎn)物發(fā)生反應(yīng), 也 就是抗原性。60. 半抗原( hapten ):能與對應(yīng)抗體結(jié)合出現(xiàn)抗原 -抗體反應(yīng)、又不能單獨激發(fā)人或動物體產(chǎn)生抗體的抗原。 它只有反應(yīng)原性, 不具免疫原性, 又稱不完全抗原。 大多數(shù)多糖和所有的
22、 類脂都屬于半抗原。 如果用化學(xué)方法把半抗原與某種純蛋白的分子 (載體) 結(jié)合, 純蛋白會 獲得新的免疫原性, 并能刺激動物產(chǎn)生相應(yīng)的抗體。 半抗原一旦與純蛋白結(jié)合, 就構(gòu)成該蛋 白質(zhì)的一個抗原簇。一些比一般半抗原分子量小,但有特異結(jié)構(gòu)的化學(xué)活性基團物質(zhì)(如青霉素、 磺胺劑等 ),稱為簡單半抗原。 當(dāng)簡單半抗原進(jìn)入過敏體質(zhì)的機體時, 能與體內(nèi)組 織蛋白結(jié)合,成為完全抗原,這種完全抗原可引起超敏反應(yīng)。一般來說,B淋巴細(xì)胞識別半抗原決定簇, T 淋巴細(xì)胞識別載體抗原決定簇。61. 單克隆抗體( monoclonal antibody;McAb;mAb ):高度均質(zhì)性的特異性抗體,由一個識 別單一抗原表位的 B 細(xì)胞克隆所分泌。一般來自雜交瘤細(xì)胞。62. 多克隆抗體( polyclonal ant
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