生物化學(xué)名詞解釋

1、蛋白質(zhì)1.等電點（pI）:當(dāng)氨基酸溶液在某一定pH值時，使某特定氨基酸分子上所帶正負(fù)電荷相等，成為兩性離子，在電場中既不向陽極也不向陰極移動，此時溶液的pH值即為該氨基酸的等電點(isoelectric point，pI)。 2.肽鍵和肽鏈:肽是由一個氨基酸的羧基和另一個氨基酸的氨基脫水縮合而形成的化合物，氨基酸之間脫水縮合后形成的共價鍵成為肽鍵。 3.肽平面及二面角：兩相鄰酰胺平面之間，能以共同的C為定點而旋轉(zhuǎn)，繞C-N鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱角，繞C-C鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱角。和稱作二面角，亦稱構(gòu)象角。 4.一級結(jié)構(gòu)：多肽鏈中氨基酸的排列順序，包括二硫鍵的位置稱為蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)(primary stru

2、cture)。這是蛋白質(zhì)最基本的結(jié)構(gòu)，它內(nèi)寓著決定蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)和生物功能的信息。 5.二級結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)（secondary structure）指肽鏈主鏈不同區(qū)段通過自身的相互作用，形成氫鍵，沿某一主軸盤旋折疊而形成的局部空間結(jié)構(gòu)，是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的構(gòu)象單元主要有以下類型：() 螺旋（helix）() 折疊（-pleated sheet）() 轉(zhuǎn)角（-turn）() 無規(guī)則卷曲（nonregular coil） 6.三級結(jié)構(gòu)：多肽鍵在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，通過側(cè)鏈基團(tuán)的相互作用進(jìn)一步卷曲折疊，借助次級鍵維系使螺旋、折疊片、轉(zhuǎn)角等二級結(jié)構(gòu)相互配置而形成特定的構(gòu)象。 7.四級結(jié)構(gòu)：四級結(jié)構(gòu)是指

3、由相同或不同的稱作亞基（subunit）的亞單位按照一定排布方式聚合而成的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，維持四級結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的作用力是疏水鍵、離子鍵、氫鍵、范得華力。亞基本身都具有球狀三級結(jié)構(gòu)，一般只包含一條多肽鏈，也有的由二條或二條以上由二硫鍵連接的肽鏈組成。 8.超二級結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)中相鄰的二級結(jié)構(gòu)單位（即單個螺旋或折疊或轉(zhuǎn)角）組合在一起，形成有規(guī)則的、在空間上能辯認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體稱為蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu) 9.結(jié)構(gòu)域：在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，多肽進(jìn)一步卷曲折疊成幾個相對獨立、近似球形的三維實體，再由兩個或兩個以上這樣的三維實體締合成三級結(jié)構(gòu)，這種相對獨立的三維實體稱為結(jié)構(gòu)域。 10.蛋白質(zhì)變性與復(fù)性：蛋白質(zhì)各自所特有

4、的高級結(jié)構(gòu)，是表現(xiàn)其物理性質(zhì)和化學(xué)特性以及生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。當(dāng)天然蛋白質(zhì)受到某些物理因素和化學(xué)因素的影響，使其分子內(nèi)部原有的高級構(gòu)象發(fā)生變化時，蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和生物學(xué)功能都隨之改變或喪失，但并未導(dǎo)致其一級結(jié)構(gòu)的變化，這種現(xiàn)象稱為變性作用（denaturation） 蛋白質(zhì)的變性作用如果不過于劇烈，則是一種可逆過程，變性蛋白質(zhì)通常在除去變性因素后，可緩慢地重新自發(fā)折疊成原來的構(gòu)象，恢復(fù)原有的理化性質(zhì)和生物活性，這種現(xiàn)象成為復(fù)性（renaturation）。 11.分子?。褐赣捎谶z傳基因突變導(dǎo)致蛋白質(zhì)分子中某些氨基酸序列的改變，從而造成蛋白質(zhì)功能發(fā)生變化的一種遺傳病。 12.肽：肽是由一個氨基酸

5、的羧基和另一個氨基酸的氨基脫水縮合而形成的化合物 13.3.613螺旋：蛋白質(zhì)的螺旋，每圈螺旋包括3.6個氨基酸殘基，螺距為0.54nm，相當(dāng)于每個氨基酸殘基繞螺旋軸旋轉(zhuǎn)100°，沿軸上升0.15nm，其中3.6指每圈螺旋包括3.6個氨基酸殘基，3.6的右下角13表示氫鍵密閉的環(huán)內(nèi)含有13個原子。 1、試比較核酸、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的異同，寫出各自基本結(jié)構(gòu)單位的通式 相同:雖然二者在組成上差異很大,但在構(gòu)成方式上卻很相似,主要表現(xiàn)在都是由基本結(jié)構(gòu)單位通過特定的共價鍵連接而成的大分子，各自的主鏈都是不變成分，可變成分在側(cè)鏈上。2、簡述研究核酸、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的意義。生物的遺傳信息儲存于DN

6、A的核苷酸序列中，蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是由相應(yīng)的DNA序列決定的，每一種蛋白質(zhì)分子所具有的特定的一級結(jié)構(gòu)又決定了其高級結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能，也就表現(xiàn)出特定的生命現(xiàn)象。因此，研究核酸、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)可破譯生命的密碼，是在分子水平認(rèn)識生命的突破口。核酸1.變性和復(fù)姓：變性：在物理、化學(xué)因素影響下， DNA堿基對間的氫鍵斷裂，雙螺旋解開，這是一個是躍變過程，伴有A260增加（增色效應(yīng)）,DNA的功能喪失。 復(fù)性：在一定條件下，變性DNA 單鏈間堿基重新配對恢復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu)，伴有A260減?。p色效應(yīng)）,DNA的功能恢復(fù)。2.分子雜交：不同來源的DNA單鏈間或單鏈DNA與RNA之間只要有堿基配對的區(qū)域，在復(fù)性

7、時可形成局部雙螺旋區(qū)，稱核酸分子雜交（hybridization） 3.增色效應(yīng)和減色效應(yīng)：由于DNA在260nm處的最大吸收值與其堿基有關(guān)，當(dāng)DNA處于雙螺旋結(jié)構(gòu)時其堿基藏于內(nèi)側(cè)，但它變性時由于雙螺旋解開，堿基外露，導(dǎo)致260nm紫外吸收值增加，這一現(xiàn)象成為增色效應(yīng)。 減色效應(yīng)：通常指變性的DNA在重新形成雙螺旋結(jié)構(gòu)時，其在260nm處的吸收值不斷降低的現(xiàn)象。4.回文結(jié)構(gòu)：雙鏈DNA中含有的兩個結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列，也稱為回文結(jié)構(gòu)。 5.Tm：DNA的變性發(fā)生在一個很窄的溫度范圍內(nèi)，通常把熱變性過程中A260達(dá)到最大值一半時的溫度稱為該DNA的熔解溫度，用Tm表示。 6.

8、cAMP:3',5'-環(huán)腺苷酸，其結(jié)構(gòu)為： 7.Chargaff定律：1.以摩爾含量表示，不同來源的DNA都存在著這種關(guān)系，即A=T和C=G；2.不同生物的DNA的堿基組成有很大的差異，可用不對稱比率：（A+T)/(C+G)表示。親緣關(guān)系相近的生物，其DNA的堿基組成相近，即不對稱比率相近；3.嘌呤堿基的總和與嘧啶堿基的總和相等。酶1.活性中心：酶分子中直接與底物結(jié)合，并和酶催化作用直接有關(guān)的區(qū)域叫酶的活性中心（active center）或活性部位（active site），參與構(gòu)成酶的活性中心和維持酶的特定構(gòu)象所必需的基團(tuán)為酶分子的必需基團(tuán)。2.全酶：由蛋白質(zhì)和非蛋白質(zhì)分子

9、組成，其中蛋白質(zhì)部分稱為脫輔基酶蛋白，簡稱酶蛋白；非蛋白質(zhì)部分稱為輔（助）因子，二者結(jié)合稱為全酶。即全酶=脫輔基酶蛋白+輔助因子。3.酶原：在體內(nèi)處于無活性狀態(tài)的酶前身物4.活力單位：酶的活力是指酶催化一定化學(xué)反應(yīng)的能力。通常用最適條件下酶所催化的某一化學(xué)反應(yīng)的速率來衡量酶活力的大小。酶單位一umit（U）或katal（Kat）來表示。U的定義是一定時間內(nèi)將一定量的底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的量（IU: 1moL變化量 / 分鐘）；Kat表示在最適反應(yīng)條件（25，最適離子強(qiáng)度和pH，最適底物濃度等），每秒鐘催化1mol底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的量。5.比活力：酶的比活力為每毫克總蛋白質(zhì)所含有的酶活力單位數(shù)。以酶的活

10、力單位/mg蛋白質(zhì)表示。6.米氏方程：7.Km：Km是米氏常數(shù)，Km是當(dāng)酶促反應(yīng)達(dá)到最大反應(yīng)速率一半是所對應(yīng)的底物濃度。單位一般用mol/L或mmol/L表示。Km可以近似地反應(yīng)酶對底物的親和力，Km越小，則對底物的親和力越大；Km值是酶的特征性常數(shù)之一。8.誘導(dǎo)契合：1.酶的構(gòu)象和底物的分子構(gòu)象并不匹配。2.當(dāng)?shù)孜锓肿雍兔阜肿酉嗫拷鼤r，酶分子會誘導(dǎo)底物分子發(fā)生改變使其成為與酶分子相適應(yīng)的構(gòu)象，同時底物分子也會誘導(dǎo)酶分子改變?yōu)檫m合底物分子的構(gòu)象。3.當(dāng)產(chǎn)生產(chǎn)物后產(chǎn)物脫落，酶分子構(gòu)象又恢復(fù)原樣。9.變構(gòu)效應(yīng)：有些酶分子表面除了具有活性中心外，還存在被稱為調(diào)節(jié)位點（或變構(gòu)位點）的調(diào)節(jié)物特異結(jié)合位點

11、，調(diào)節(jié)物結(jié)合到調(diào)節(jié)位點上引起酶的構(gòu)象發(fā)生變化，導(dǎo)致酶的活性提高或下降，這種現(xiàn)象稱為別構(gòu)效應(yīng)（allosteric effect）,具有上述特點的酶稱別構(gòu)酶（allosteric enzyme）。10.ribozyme：即核酶，酶是由生物體產(chǎn)生的、具有高度催化效率和高度特異性的生物催化劑，其中有核酸（RNA）組成的稱為核酶。11.輔酶和輔基：輔酶是輔助因子與酶蛋白以非共價鍵方式結(jié)合的復(fù)合酶。輔基是輔助因子與酶蛋白以共價鍵的方式結(jié)合的復(fù)合酶。12.固定化酶：將水溶性酶用物理或化學(xué)方法處理，固定于高分子支持物(或載體)上而成為不溶于水，但仍有酶活性的一種酶制劑形式，稱固定化酶(immobilized

12、 enzyme)。13.同工酶：存在于同一種屬或不同種屬，同一個體的不同組織或同一組織、同一細(xì)胞，具有不同分子形式但卻能催化相同的化學(xué)反應(yīng)的一組酶，稱之為同工酶（isoenzyme）生物氧化1.生物氧化：糖類、脂肪、蛋白質(zhì)等有機(jī)物質(zhì)在細(xì)胞中進(jìn)行氧化分解生成CO2和H2O并釋放出能量的過程稱為生物氧化（biological oxidation），其實質(zhì)是需氧細(xì)胞在呼吸代謝過程中所進(jìn)行的一系列氧化還原反應(yīng)過程。2.氧化磷酸化：代謝物在生物氧化過程中釋放出的自由能用于合成ATP（即ADP+PiATP）,這種氧化放能和ATP生成（磷酸化）相偶聯(lián)的過程稱氧化磷酸化。3.底物水平磷酸化：高能化合物直接傳遞

13、和提供Pi使GDP或ADP生成GTP或ATP的過程。4.呼吸鏈：線粒體基質(zhì)是呼吸底物氧化的場所，底物在這里氧化所產(chǎn)生的NADH和FADH2將質(zhì)子和電子轉(zhuǎn)移到內(nèi)膜的載體上，經(jīng)過一系列氫載體和電子載體的傳遞，最后傳遞給O2生成H2O。這種由載體組成的電子傳遞系統(tǒng)稱電子傳遞鏈（eclctron transfer chain),因為其功能和呼吸作用直接相關(guān)，亦稱為呼吸鏈。5.磷氧比（P0）：呼吸過程中無機(jī)磷酸（Pi）消耗量和分子氧（O2）消耗量的比值稱為磷氧比。由于在氧化磷酸化過程中，每傳遞一對電子消耗一個氧原子，而每生成一分子ATP消耗一分子Pi ，因此P/O的數(shù)值相當(dāng)于一對電子經(jīng)呼吸鏈傳遞至分子氧

14、所產(chǎn)生的ATP分子數(shù)。NADH呼吸鏈： P/O 3，F(xiàn)ADH2呼吸鏈： P/O 26.能荷：是指在腺苷酸庫（由ATP、ADP和AMP三種腺苷酸總濃度構(gòu)成）中所所負(fù)荷的高能磷酸基的數(shù)量。意義： 能荷由ATP 、 ADP和AMP的相對數(shù)量決定，數(shù)值在01之間，反映細(xì)胞能量水平。 能荷對代謝的調(diào)節(jié)可通過ATP 、 ADP和AMP作為代謝中某些酶分子的別構(gòu)效應(yīng)物進(jìn)行變構(gòu)調(diào)節(jié)來實現(xiàn)。7.a-磷酸甘油穿梭：由于NADH和NAD+都不能自由穿過線粒體內(nèi)膜，因此胞液中由糖酵解途徑產(chǎn)生的NADH必須通過特殊的穿梭系統(tǒng)才能進(jìn)入線粒體內(nèi)。這類穿梭系統(tǒng)是由一對-磷酸甘油脫氫酶同工酶完成的。胞液中的-磷酸甘油脫氫酶先將

15、NADH中的氫原子轉(zhuǎn)移至磷酸二羥丙酮上，形成-磷酸甘油，后者擴(kuò)散至線粒體外膜與內(nèi)膜的間隙中，并且在內(nèi)膜表面的-磷酸甘油脫氫酶的作用下，將氫原子轉(zhuǎn)移至內(nèi)膜中的FAD上，并經(jīng)FADH2呼吸鏈氧化。同時，脫氫產(chǎn)生的磷酸二羥丙酮又返回到胞液中，參與下一輪穿梭。通過此循環(huán)可以將胞液中2個ATP交給線粒體內(nèi)的FAD。8.蘋果酸/天冬氨酸穿梭系統(tǒng)：當(dāng)胞液中的NADH濃度升高時，由于胞液中的蘋果酸脫氫酶對NADH有很強(qiáng)的親和力，所以此酶將以NADH作為還原劑，迅速催化草酰乙酸還原成蘋果酸。蘋果酸通過線粒體內(nèi)膜上的蘋果酸/-酮戊二酸載體進(jìn)入到線粒體基質(zhì)，然后在線粒體基質(zhì)中的蘋果酸脫氫酶的催化下，又重新生成草酰乙

16、酸和NADH。所生成的NADH隨即進(jìn)入NADH呼吸鏈進(jìn)行氧化磷酸化，而草酰乙酸則在線粒體基質(zhì)中的谷草轉(zhuǎn)氨酶催化下行成天冬氨酸，同時將谷氨酸變成-酮戊二酸并穿過線粒體內(nèi)膜進(jìn)入胞液，再由胞液中的谷草轉(zhuǎn)氨酶催化，將其轉(zhuǎn)變成為草酰乙酸參與下一輪穿梭。通過此循環(huán)可以將胞液中3個ATP交給線粒體內(nèi)的NAD+。糖1.糖酵解：糖酵解是將葡萄糖降解為丙酮酸并伴隨著ATP生成的一系列反應(yīng)，是生物體內(nèi)普遍存在的葡萄糖降解的途徑。該途徑也稱作Embden-Meyethof-Parnas途徑，簡稱途徑。生物學(xué)意義 是葡萄糖在生物體內(nèi)進(jìn)行有氧或無氧分解的共同途徑,通過糖酵解，生物體獲得生命活動所需要的能量； 形成多種重要

17、的中間產(chǎn)物，為氨基酸、脂類合成提供碳骨架； 為糖異生提供基本途徑。2.三羧酸循環(huán)：在線粒體中，乙酰CoA首先與草酰乙酸縮合生成檸檬酸，然后經(jīng)過一系列的代謝反應(yīng)，乙?；谎趸纸?，而草酰乙酸再生的循環(huán)反應(yīng)過程。由于該循環(huán)的第一個產(chǎn)物是檸檬酸，故稱檸檬酸循環(huán)；再循環(huán)過程中產(chǎn)生了含3個羧基的中間產(chǎn)物（檸檬酸、順烏頭酸、異檸檬酸），因此又叫三羧酸循環(huán)，簡稱TCA循環(huán)；又由于提出該循環(huán)的主要貢獻(xiàn)者是英國生化學(xué)家Krebs，所以又稱Krebs循環(huán)，該循環(huán)可分為8大步反應(yīng)。TCA循環(huán)式糖、脂肪、蛋白質(zhì)三大物質(zhì)徹底氧化分解的共同通道，具有重要的生物學(xué)意義。·意義：1.是有機(jī)體獲得生命活動所需能量的主

18、要途徑2.是糖、脂、蛋白質(zhì)等物質(zhì)代謝和轉(zhuǎn)化的中心樞紐3.形成多種重要的中間產(chǎn)物3.是發(fā)酵產(chǎn)物重新氧化的途徑3.磷酸戊糖途徑：在細(xì)胞溶質(zhì)中，該途徑包括氧化和非氧化兩個階段，首先6-磷酸葡萄糖（G-6-P）直接氧化脫氫，產(chǎn)生NADPH+H+,然后經(jīng)過一些列代謝反應(yīng)生成磷酸戊糖等中間代謝物，再重新進(jìn)入糖氧化分解途徑的一條葡萄糖旁路代謝途徑。此途徑從G-6-P開始，又稱為磷酸己糖之路。其生物學(xué)意義：1.產(chǎn)生大量NADPH,主要用于還原（加氫）反應(yīng)，為細(xì)胞提供還原力2.產(chǎn)生大量的磷酸核糖和其它重要中間產(chǎn)物3.與光合作用聯(lián)系，實現(xiàn)某些單糖間的轉(zhuǎn)變4.糖異生作用：非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)化成糖代謝的中間產(chǎn)物后，在相應(yīng)的酶催化下,繞過糖酵解途徑的三個不可逆反應(yīng),利用糖酵解途徑其它酶生成葡萄糖的途徑稱為糖異生。5.糖的有氧氧化脂1.氧化：脂肪酸氧化作用發(fā)生在-碳原子上，分解出CO2，生成比原來少一個碳原子的脂肪酸，這種氧化作用稱為-氧化作用。2.氧化：脂肪酸在體內(nèi)氧化時在羧基端的-碳原子上進(jìn)行氧化，碳鏈逐次斷裂，每次斷下一個二碳單位，既乙酰CoA，該過程稱作-氧化。3.氧化：脂肪酸的-氧化指脂肪酸的末端甲基（-端）經(jīng)氧化轉(zhuǎn)變成羥基，繼而再氧化成羧基，從而形成，-二羧酸的過程。4.ACP:酰基載體蛋白。飽和脂肪