小麥雌性育性與分子標記的關聯(lián)分析

1、作物遺傳育種專業(yè)畢業(yè)論文 精品論文 小麥雌性育性與分子標記的關聯(lián)分析關鍵詞：小麥 雌性育性 分子標記 關聯(lián)分析摘要：本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得

2、出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別

3、達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。正文內(nèi)容 本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性

4、)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2A

5、L、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25

6、、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系

7、)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖

8、群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關

9、聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS

10、和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟

11、件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型

12、值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95

13、等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SS

14、R標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和

15、Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)

16、法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3

17、)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標

18、記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND1

19、26在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的

20、關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，

21、尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR

22、標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的

23、目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xc

24、fd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連鎖群2AL、2DS以及Xcfd88所在連鎖4AL連鎖群分別利用18、30、19個SSR標記進一步關聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)2DS和4AL連鎖群上存在與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記-Xwmc25(2DS)、Xgwm71(2DS)和Xwmc232(4AL)，標記的效應分別達到0.5833、0.5824和0.2841，而2AL上未找到獨有的關聯(lián)標記。 (4)對2DS連鎖群的標記在三個大小不同的群體中進行研究發(fā)現(xiàn)，連鎖分析定位的標記-Xgwm296

25、、Xgdm35、Xbrac95等都與taf1位點之間存在強烈的連鎖不平衡，并尋找到與Xgwm296、Xgdm35等同樣具有較大的LD值的標記-Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515。本研究對包括小麥雌性不育系的261個小麥現(xiàn)有品種(系)組成的目標群體使用STRUCTRE軟件進行群體結構評估，并利用TASSEL軟件的GLM模型檢測41個多態(tài)性SSR標記與小麥雌性育性D.F.(國內(nèi)法育性)和I.F.(國際法育性)兩種表型值的關聯(lián)程度，確定入選SSR標記，再對入選標記所在的連鎖群進行分析，尋找到與小麥雌性育性更加緊密關聯(lián)的SSR標記。并在連鎖分析的基礎上使用三個大小不同的群體對與2DS連鎖群上的taf1位點緊密連鎖的9個SSR標記及其側翼標記進行連鎖不平衡分析。得出以下結果： (1)群體結構評估結果顯示，包括小麥雌性不育系XND126在內(nèi)的261份小麥品種(系)組成的目標群體存在三個亞群。 (2)關聯(lián)分析結果顯示，標記Xcfd36和Xcfd88與小麥雌性育性兩種表型值相關聯(lián)，兩個標記對D.F.和I.F.的效應分別是0.1585、0.113和0.087、0.0596。 (3)對Xcfd36所在連