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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)化學(xué)等電點(isoelectric point, pI):當(dāng)氨基酸在溶液中凈電荷為零的pH。在等電點時,氨基酸主要以兩性離子形式存在肽鍵(peptide bond):由一個氨基酸的a-羧基與另一個氨基酸的a-氨基脫水縮合而形成的化學(xué)鍵。肽:由二個或兩個以上氨基酸通過肽鍵相連而形成的化合物。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):指多肽鏈中氨基酸的排列順序與鍵合方式。二級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象。肽單元:參與組成肽鍵的6個原子位于同一平面,又叫酰胺平面或肽鍵平面。它是蛋白質(zhì)構(gòu)象的基本結(jié)構(gòu)單位。a-螺旋 ( a -helix )
2、 :是蛋白質(zhì)中最常見的一種二級結(jié)構(gòu),多肽鏈主鏈圍繞中心軸形成右手螺旋-折疊:若干條肽鏈或一條肽鏈的若干肽段平行排列,相鄰肽鏈之間靠氫鍵維持。 超二級結(jié)構(gòu)(supersecondary struture):蛋白質(zhì)分子中,由若干相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元組合在一起,形成有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體結(jié)構(gòu)域(domain):在超二級結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上組裝成的相對獨立的三維實體。折疊得較為緊密,各行使其功能。蛋白質(zhì)的變性:在某些物理和化學(xué)因素作用下,蛋白質(zhì)分子特定空間構(gòu)象被破壞,導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生物活性的喪失。復(fù)性:若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能。酶化學(xué)
3、全酶:對結(jié)合酶而言,酶蛋白與輔助因子結(jié)合之后所形成的復(fù)合物,稱為全酶,只有全酶才有催化活性,將酶蛋白和輔助因子分開后均無催化作用。全酶 = 酶蛋白 + 輔助因子酶原:某些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時沒有活性,這些沒有活性的酶的前身稱為酶原酸堿催化:通過瞬時地向反應(yīng)物提供質(zhì)子或從反應(yīng)物接收質(zhì)子以穩(wěn)定過渡態(tài)、達到降低反應(yīng)活化能、加速反應(yīng)的一種催化機制。共價催化:通過與底物形成反應(yīng)活性很高的共價過渡物降低反應(yīng)活化能,從而提高反應(yīng)速度的過程。酶的活性部位:有些必需基團雖然在一級結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),但在形成空間結(jié)構(gòu)時彼此靠近,集中在一起,形成具有一定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,并能與底物特異地結(jié)合,將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。這
4、一區(qū)域,稱為酶的活性部位(Active site)。米氏常數(shù)(Km):反應(yīng)速率達最大反應(yīng)速率一半時的底物濃度。單位是:mol/L或mmol/L競爭性抑制作用:抑制劑在化學(xué)結(jié)構(gòu)上與底物相似,能與底物競爭酶的活性中心,從而阻礙酶-底物復(fù)合物的形成,降低酶促反應(yīng)速度。 此時這種作用叫做競爭性作用。非競爭性抑制作用:有些抑制劑可與酶活性中心以外的必需基團結(jié)合,不影響酶與底物的結(jié)合,抑制劑和底物可同時結(jié)合在酶分子上,形成酶-底物-抑制劑復(fù)合物,不能釋放出產(chǎn)物,使酶活性喪失,這種抑制劑稱為非競爭性抑制劑,這種抑制作用稱為非競爭性作用。 反競爭性抑制作用:抑制劑僅與酶和底物形成的中間產(chǎn)物結(jié)合,使ES的量下降
5、。該抑制劑與單獨的酶不結(jié)合。這種抑制作用稱為反競爭性作用。酶的輔助因子:主要包括金屬離子和小分子有機化合物,在酶促反應(yīng)中主要決定反應(yīng)的種類和性質(zhì),在反應(yīng)中起到傳遞電子、原子或某些化學(xué)基團的作用。輔酶:把那些與酶蛋白結(jié)合比較松弛,用透析法可以除去的小分子有機化合物,稱為輔酶。輔基:輔基是指以共價鍵和酶蛋白結(jié)合的小分子有機物質(zhì),不能通過透析或超濾的方法除去。激活劑:凡是能提高酶活性的物質(zhì)。抑制劑:能使酶分子的某些必需基團發(fā)生變化,從而引起酶活性的下降,甚至消失,使酶反應(yīng)下降的物質(zhì)酶活力(酶活性)是指:酶催化底物化學(xué)反應(yīng)的能力。酶的專一性:絕對專一性:酶只作用于特定結(jié)構(gòu)的底物,進行一種專一的反應(yīng),生
6、成一種特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物 。相對專一性:酶作用于一類化合物或一種化學(xué)鍵。立體異構(gòu)專一性: 酶僅作用于立體異構(gòu)體中的一種。誘導(dǎo)契合學(xué)說:該學(xué)說認(rèn)為酶與底物相互接近時,其結(jié)構(gòu)相互誘導(dǎo)、相互變形和相互適應(yīng),進而相互結(jié)合。中間產(chǎn)物學(xué)說: 中間產(chǎn)物學(xué)說認(rèn)為,酶在催化反應(yīng)時,首先酶與底物形成不穩(wěn)定的中間物,然后再分解成酶與產(chǎn)物。即酶將原來活化能很高的反應(yīng)分成兩個活化能較低的反應(yīng)來進行,因而加快了反應(yīng)速率。糖類化學(xué)醛糖:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-1)是一個醛基酮糖:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-2)是一個酮基。變旋現(xiàn)象:一個旋光溶液放置后其比旋度自行改變的現(xiàn)象。糖苷:單糖
7、半縮醛上的羥基可與其它含羥基的化合物(醇、酚)縮合失水形成的縮醛衍生物。如杏仁苷、強心苷等,是多種中藥的有效成分。糖苷鍵:一個糖半縮醛羥基與另一個分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖醛鍵有O糖苷鍵和N糖苷鍵。 還原糖:醛糖的半縮醛羥基、酮糖的半縮酮羥基在堿性溶液中具有還原性。所有單糖都是還原糖,易被氧化成酸。常用費林試劑判斷還原糖。同多糖:由許多單糖分子或其衍生物縮合而成的高聚物稱為多糖,又稱為高聚糖??煞譃橥嗵呛彤惗嗵莾深?。由一種單糖縮合形成的多糖稱為同多糖。異多糖:由一種以上單糖縮合形成的多糖稱為異多糖。脂類物質(zhì)必需脂
8、肪酸:不飽和脂肪酸中亞油酸與亞麻酸人體不能自行合成,必須從食物中攝取,稱為必需脂肪酸。磷脂:含磷酸的復(fù)合脂,包括甘油磷脂和神經(jīng)鞘磷酯脂肪酸:脂肪酸(Fatty acid)是一類羧酸化合物,由碳?xì)浣M成的烴類基團連結(jié)羧基所構(gòu)成。三個長鏈脂肪酸與甘油形成三酸甘油酯(Triacylglycerols),為脂肪的主要成分。生物膜:是構(gòu)成細(xì)胞所有膜的總稱,包括圍在細(xì)胞質(zhì)外圍的質(zhì)膜和細(xì)胞器的內(nèi)膜系統(tǒng)。 流動鑲嵌模型(Mosaic fluid model):將膜描述為由蛋白質(zhì)在粘滯的流體狀脂質(zhì)雙層中所形成的鑲嵌物。被動運輸:順濃度梯度,不需要消耗能量的穿膜運輸。主動運輸:物質(zhì)逆濃度梯度的穿膜運輸,需消耗代謝能
9、,并需專一性的載體蛋白。如Na+、K+-泵 協(xié)助擴散(facilitated diffusion):從高濃度到低濃度(順濃度梯度),需借助載體蛋白的物質(zhì)運輸。包括親水性分子如糖、氨基酸等的運輸。酸?。禾?然 油 脂 長 時 間 暴露在空氣中產(chǎn)生難聞 的氣味,這 種 現(xiàn) 象 稱 為 酸 敗。核酸化學(xué)核苷酸:由核苷戊糖上的羥基與磷酸縮合而成的磷酸酯。磷酸二脂鍵:一種化學(xué)基團,指一分子磷酸與兩個醇(羥基)酯化形成的兩個酯鍵DNA雙螺旋:DNA雙螺旋(DNA double helix)是一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個右手的雙螺旋結(jié)構(gòu).DNA變性的本質(zhì):維持雙螺旋穩(wěn)
10、定性的氫鍵斷裂,堿基間堆積力遭到破壞,但不涉及到其一級結(jié)構(gòu)的改變。 DNA的溶解溫度(milting temperature):通常把DNA熱變性引起物化性質(zhì)改變一半時的溫度稱為DNA的溶解溫度。增色效應(yīng):(hyperchromic effect):由于核酸變性而引起紫外光吸收增加的現(xiàn)象。減色效應(yīng) (hypochromic effect ):由于核酸復(fù)性而引起紫外光吸收減少的現(xiàn)象。分子雜交:指不同來源的單鏈核酸之間可通過堿基互補形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。 退火(annealing):使熱變性DNA緩慢冷卻,則可發(fā)生復(fù)性,此過程稱為退火。新陳代謝與生物氧化呼吸電子傳遞鏈:按嚴(yán)格的方向和順序,即電子從氧化還
11、原電位較低的傳遞體依次通過氧化還原電位較高的傳遞體逐步流向氧分子。氧化磷酸化:代謝物在生物氧化過程中釋放出的自由能用于合成ATP(即ADP+PiATP),即在呼吸鏈電子傳遞過程中偶聯(lián)ADP磷酸化,生成ATP,這種氧化放能和ATP生成(磷酸化)相偶聯(lián)的過程稱氧化磷酸化?;瘜W(xué)滲透理論:主要認(rèn)為在電子傳遞和ATP形成之間起耦聯(lián)作用的是H+濃度。電子經(jīng)呼吸鏈傳遞時,可將質(zhì)子(H+)從線粒體內(nèi)膜的基質(zhì)側(cè)泵到內(nèi)膜胞漿側(cè),產(chǎn)生膜內(nèi)外質(zhì)子電化學(xué)梯度儲存能量。當(dāng)質(zhì)子順濃度梯度回流時驅(qū)動ADP與Pi生成ATP。P/O比:呼吸過程中無機磷酸(Pi)消耗量和原子氧(O2)消耗量的比值稱為磷氧比。由于在氧化磷酸化過程中
12、,每傳遞一對電子消耗一個氧原子,而每生成一分子ATP消耗一分子Pi,因此P/O的數(shù)值相當(dāng)于一對電子經(jīng)呼吸鏈傳遞至氧所產(chǎn)生的ATP分子數(shù)。高能化合物:指水解可釋放的能量,能驅(qū)動ADP磷酸化生成ATP的化合物。生物氧化:糖類、脂肪、蛋白質(zhì)等有機物質(zhì)在細(xì)胞中進行氧化分解生成CO2和H2O并釋放出能量的過程。呼吸鏈阻斷劑:能夠阻斷呼吸鏈中某一部位電子流的物質(zhì)稱為電子傳遞阻斷劑或呼吸鍵阻斷劑。解偶聯(lián)劑:凡能破壞氧化與磷酸化相偶聯(lián)的作用。能引起解偶聯(lián)作用的物質(zhì)稱為解偶聯(lián)劑。糖代謝糖酵解:指在氧氣不足條件下,葡萄糖或糖原分解為丙酮酸或乳酸的過程,此過程中伴有少量ATP的生成。發(fā)酵:無氧等外源氫受體的條件下,
13、底物脫氫后所產(chǎn)生的還原力H未經(jīng)呼吸鏈傳遞而直接交某一內(nèi)源性中間代謝物接受,以實現(xiàn)底物水平磷酸化產(chǎn)能的一類生物氧化反應(yīng)。乳酸發(fā)酵:指糖經(jīng)無氧酵解而生成乳酸的發(fā)酵過程,乙醇發(fā)酵同為生物體內(nèi)二種主要的發(fā)酵形式。底物水平磷酸化:物質(zhì)在生物氧化過程中,常生成一些含有高能鍵的化合物,而這些化合物可直接偶聯(lián)ATP或GTP的合成,這種產(chǎn)生ATP等高能分子的方式稱為底物水平磷酸化三羧酸循環(huán):是用于將乙酰CoA中的乙酰基氧化成二氧化碳和還原當(dāng)量的酶促反應(yīng)的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步是由乙酰CoA與草酰乙酸縮合形成檸檬酸。磷酸戊糖途徑:葡萄糖氧化分解的一種方式。由于此途徑是由6-磷酸葡萄糖(G6P)開始,故亦稱為己糖
14、磷酸旁路。糖異生作用:由簡單的非糖前體轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑倪^程。底物循環(huán):一對催化兩個途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反應(yīng)。糖的有氧氧化無氧氧化:萄糖在有氧條件下,氧化分解生成二氧化碳和水的過程稱為糖的有氧氧化(aerobicoxidation),并釋放出能量。有氧氧化是糖分解代謝的主要方式,大多數(shù)組織中的葡萄糖均進行有氧氧化分解供給機體能量。無氧氧化是指在缺氧或供氧不足的情況下,組織細(xì)胞內(nèi)的糖原,能經(jīng)過一定的化學(xué)變化,產(chǎn)生乳酸和水或乙醇和二氧化碳和水,并釋放出一部分能量的過程,也稱糖酵解。脂類代謝脂肪酸的-氧化途徑:脂酰CoA在線粒體基質(zhì)中進入氧化要經(jīng)過四步反應(yīng),即脫氫、加水、再脫氫
15、和硫解,生成一分子乙酰CoA和一個少兩個碳的新的脂酰CoA. 。?;d體蛋白:從頭合成脂肪酸,是由含有多種酶的復(fù)合體的脂肪酸合成系統(tǒng)的催化下進行的,而在它的?;s合的階段,酰基CoA不是作為直接底物,而是被轉(zhuǎn)移至復(fù)合體中的?;d體蛋白起反應(yīng)的。肉毒堿穿梭系統(tǒng):由于酸的-氧化作用是在線粒體的基質(zhì)中進行的,而在細(xì)胞液中形成的長鏈脂酰CoA不能通過線粒體內(nèi)膜,需要內(nèi)膜上的載體肉堿攜帶,以脂?;男问娇缭絻?nèi)膜而進入基質(zhì)。蛋白質(zhì)的酶促降解及氨基酸的代謝尿素循環(huán):肝臟中2分子氨和1分子CO2生成1分子尿素的環(huán)式代謝途徑。氧化脫氨基作用:是指氨基酸在酶的作用下伴有氧化的脫氨基反應(yīng)。轉(zhuǎn)氨:一個-氨基
16、酸的-氨基借助轉(zhuǎn)氨酶的催化作用轉(zhuǎn)移到一個-酮酸的過程。生糖氨基酸:能通過代謝轉(zhuǎn)變成葡萄糖的氨基酸。聯(lián)合脫氨基作用:轉(zhuǎn)氨基與谷氨酸氧化脫氨或是嘌呤核苷酸循環(huán)聯(lián)合脫氨,以滿足機體排泄含氮廢物的需求。核酸生物合成半保留復(fù)制: DNA生物合成時,母鏈DNA解開為兩股單鏈,各自作為模板按堿基配對規(guī)律,合成與模板互補的子鏈。子代細(xì)胞的DNA,一股單鏈從親代完整地接受過來,另一股單鏈則完全重新合成。兩個子細(xì)胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致。復(fù)制叉:是DNA復(fù)制時在DNA鏈上通過解旋、解鏈和SSB蛋白的結(jié)合等過程形成的Y字型結(jié)構(gòu)稱為復(fù)制叉。DNA聚合酶: DNA聚合酶 , 以DNA為復(fù)制模板,從將DNA由
17、5'端點開始復(fù)制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具備模板、引物、dNTP等的情況下)及其相輔的活性。前導(dǎo)鏈:與復(fù)制叉移動的方向一致,通過連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。滯后鏈:與復(fù)制叉移動的方向相反,通過不連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。岡崎片段:相對比較短的DNA鏈(大約1000核苷酸殘基),是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段。單鏈結(jié)合蛋白:于螺旋酶沿復(fù)制叉方向向前推進產(chǎn)生的單鏈區(qū),防止新形成的單鏈DNA重新配對形成雙鏈DNA或被核酸酶降解的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄:遺傳信息由DNA轉(zhuǎn)換到RNA的過程。作為蛋白質(zhì)生物合成的第一步,轉(zhuǎn)錄是mRNA
18、以及非編碼RNA(tRNA、rRNA等)的合成步驟。核心酶:大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由5個亞基組成(2,),沒有基的酶叫核心酶。內(nèi)含子:在轉(zhuǎn)錄后的加工中,從最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物除去的內(nèi)部的核苷酸序列。模板鏈:可作為模板轉(zhuǎn)錄為RNA的那條鏈,該鏈與轉(zhuǎn)錄的RNA堿基互補(A-U,G-C)。在轉(zhuǎn)錄過程中,RNA聚合酶與模板鏈結(jié)合,并沿著模板鏈的3'5'方向移動,按照5'3'方向催化RNA的合成。編碼鏈:DNA中,不能進行轉(zhuǎn)錄的那一條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉(zhuǎn)錄生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):簡稱PCR,在體外對特定的DNA
19、片段進行高效擴增的技術(shù),可看作生物體外的特殊DNA復(fù)制。蛋白質(zhì)的合成中心法則:指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過程。這是所有有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。在某些病毒中的RNA自我復(fù)制(如煙草花葉病毒等)和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過程(某些致癌病毒)是對中心法則的補充。翻譯是根據(jù)遺傳密碼的中心法則,將成熟的信使RNA分子(由DNA通過轉(zhuǎn)錄而生成)中“堿基的排列順序”(核苷酸序列)解碼,并生成對應(yīng)的特定氨基酸序列的過程。遺傳密碼決定蛋白質(zhì)中氨基酸順序的核苷酸順序 ,由3個連續(xù)的核苷酸組成的密碼子所構(gòu)成 。由于脫氧核糖核酸(DNA)雙鏈中一般只有一條單鏈(稱為有義鏈或編碼鏈)被轉(zhuǎn)錄為信使核糖核酸(mRNA),而另一條單鏈(稱為反義鏈)則不被轉(zhuǎn)錄,所以即使對于以雙鏈 DNA作為遺傳物質(zhì)的生物來講,密碼也用核糖核酸(RNA)中的核苷酸順序而不用DNA中的脫氧核苷酸順序表示。起始密碼子:被認(rèn)為對應(yīng)于AUG。其中原核生物的起始密碼子AUG翻譯對應(yīng)的是甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物的起始密碼子AUG翻譯對應(yīng)的是甲硫氨酸(Met)。密碼子: 信使RNA鏈上決定一個氨基酸的相鄰的三個堿基。信號肽:常指新合成多肽鏈中用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)的跨膜轉(zhuǎn)移(定位)
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