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文檔簡(jiǎn)介
1、精品1總 RNA 提取(1)液氮研磨或冰上勻漿實(shí)驗(yàn)材料;先將1ml Trizol 加到離心管中待用(2)將研磨好的樣品加到離心管中混勻,室溫放置5 min ;打開離心機(jī)預(yù)冷(3) 加 200 L氯仿,振蕩 15 sec ,室溫放置 3 min ,分層;(4) 4 o C,12,000 g,離心 15 min ;(5) 取上清,加 500 L異丙醇,混勻,室溫放置 10 min ;(6) 4 o C,12,000 g,離心 10 min ;(7) 棄上清,加 1 mL75% 乙醇,漂浮洗滌沉淀,振蕩充分;再用100% 乙醇清洗(8) 4 o C,7,500 g ,離心 5 min ;(9) 棄上
2、清,離心,用槍吸取多余液體,放在超凈臺(tái)里干燥后, 加 50 LDEPC水, 80 o C 保存。此操作中所用到的器皿均需經(jīng)過DEPC 滅活 RNA 酶處理。提取的總RNA需經(jīng) RNA 電泳檢測(cè)質(zhì)量,并用紫外分光光度計(jì)測(cè)定濃度。OD 260 值為核酸的吸收值,OD 280 值為蛋白的吸收值, OD 260/280 值在 1.8-2.0 間一般說明該核酸蛋白含量在允許的范圍內(nèi), 可正常使用;此外還有 OD 230 值為多糖和酚類的吸收值,比較干凈的核酸OD 260/230 值能達(dá)到 2.2 左右。 RNA 濃度計(jì)算公式: 總 RNA 濃度(g/mL)=A 260 ×稀釋倍數(shù)×4
3、0 。-可編輯-精品2 反轉(zhuǎn)錄 /cDNA第一鏈的合成純化 RNA 以去除基因組DNA ,操作按 TaKaRa 公司的 PrimeScriptRTreagent with gDNA Eraser(Perfect Real Time)說明書進(jìn)行。其體系為:Total RNA1 g5× gDNA Eraser Buffer2 LgDNA Eraser1 LRNase Free dH 2 O補(bǔ)齊至 10 L條件為: 42 o C,2min ;RNA 純化后,即可進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。其體系為:5×PrimeScript Buffer 2( for Real Time )4LPrimeScr
4、ipt RT enzyme mix1 LRT Primer Mix1 L上一步的反應(yīng)液10 LRNase Free dH 2 O補(bǔ)齊至 20 L操作條件為:(1) 37 oC 放置 15 min ; (2) 85 o C, 5 sec ; (3) 4 o C 保存。3 PCR按 TaKaRa 公司的 Premix Taq Version 2.0 操作, PCR 反應(yīng)體系如下:-可編輯-精品Premix Taq25 L模板5 L引物 1 (10M)1L引物 2 (10M)1LddH 2O18 LPCR 反應(yīng)條件為: 94 °C預(yù)變性 5min ;94 °C變性 30s , 5
5、3 °C退火 30s ,72 °C延伸 30s ,循環(huán) 36 次; 72 °C延伸 10min 。PCR 反應(yīng)完畢,取5L反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行1% 瓊脂糖凝膠電泳(若割膠回收則用 10 L反應(yīng)產(chǎn)物)。4 基因克隆及測(cè)序4.1PCR 產(chǎn)物切膠回收將 PCR 產(chǎn)物用 1% 瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,在紫外燈下觀察并切下預(yù)期大小的 DNA 片段。使用 TIANGEN 公司的 Universal DNA Purification Kit割膠回收試劑盒進(jìn)行純化,步驟如下:(1) 平衡吸附柱: 向吸附柱 CB2 中(吸附柱放入收集管中) 加入 500 L平衡液 BL, 13,400
6、15;g 離心 1 min ,倒掉收集管中的廢液,吸附柱CB2 重新套回收集管中;(2) 按 100 mg agarose 膠加入 100 L溶液 PC,置于 50 o C 中 10 min 左右,中途混勻幾次,至膠完全融化;(3) 將樣品倒入一個(gè)吸附柱 CB2 中(吸附柱放入收集管中) ,室溫下 13,400×g 離心 1 min ,倒掉收集管中的廢液,吸附柱CB2 重新套回收集管中;-可編輯-精品(4) 向吸附柱 CB2 中加入 600 L漂洗液 PW (加乙醇),室溫下 13,400 ×g離心 1 min ,倒掉收集管中的廢液,吸附柱CB2 重新套回收集管中;(5)
7、重復(fù)上一步驟;(6) 將吸附柱 CB2 放入收集管中,室溫下 13,400 ×g 離心 2 min ,盡量除去漂洗液,將吸附柱置于室溫放置數(shù)分鐘,徹底晾干;(7) 將柱子套入一新的滅菌 1.5 mL 離心管中,向吸附膜中間位置懸空滴加50 L 洗脫緩沖液,室溫放置2 分鐘, 13,400 ×g 室溫離心 2 min ,收集到的洗脫液即為回收的DNA 純化液;(8) 取 5L 的純化液體進(jìn)行 1% 瓊脂糖凝膠電泳,以檢查純度,并測(cè)量溶液中 DNA 含量。4.2 目的片段與載體連接(1) 膠回收產(chǎn)物與 T 載體連接體系,參考 Takara 公司 pMD18-T 載體的試劑盒說明
8、書。在滅菌的 0.5 mL 離心管中配制如下溶液( 10 L:)回收 DNA4 LLigation Solution5 LpMD18-T Vector1 L(2) 16 oC 反應(yīng) 30 分鐘,所得產(chǎn)物保存于 4 o C 冰箱備用。4.3 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化 E.coli DH5(1) 將 5 L 連接產(chǎn)物加入到 100 LE.coli DH5 感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕旋轉(zhuǎn)離心管混勻內(nèi)容物,冰上靜置 30 min ;(2) 42 oC 水浴熱激轉(zhuǎn)化 90 sec ,立即放回冰上,放置 3 min ;-可編輯-精品(3) 每管加入 500 L LB 培養(yǎng)基(室溫放置), 37 o C 160-180 rpm振蕩培養(yǎng) 45-60 min,使菌體復(fù)蘇并表達(dá)抗性基因;(4) 在含有 Amp ( 100 g/mL)的選擇性平板上加入60-100 L 菌液,用無菌涂布棒輕輕涂布均勻后,用Parafilm膜封好;(5) 將培養(yǎng)皿正放, 37 o C 約 50 min ,待液體全部吸收后,倒置平板繼續(xù)培養(yǎng) 10-16 h 。4.4 轉(zhuǎn)化子的篩選及鑒定(1) 用無菌槍頭挑取 LB 平板上 3-5 個(gè)單菌落,分別接種到 3.5 mL LB 液體培養(yǎng)基中(含 100 g/mL Amp ), 37 o C,16
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