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文檔簡介

1、一、PPT模板與軟件:I.ScienceSlides:ScienceSlides是一種PPT插件,可方便的畫出各種細(xì)胞器化學(xué)結(jié)構(gòu),用來論文畫圖確實(shí)很好用。特別是用這個和AI(illustrator)結(jié)合,畫的圖可以媲美老外的CNS哦。2. 科研醫(yī)學(xué)美圖PPT模板3.200+套絕美PPT模板二、代謝與信號分析軟件:I. CellNetAnalyzerCellNetAnalyzer,是一種細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)分析工具,前身是FluxAnalyzer,是基于MatLab的代謝網(wǎng)絡(luò)和信號傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)分析模塊,。這是一個典型的代謝流分析工具,可以進(jìn)行代謝流的計(jì)算、預(yù)測、目標(biāo)函數(shù)的優(yōu)化,端途徑分析、元素模式分析,以及代謝

2、流之間的對比等??梢曰緷M足研究一個中型代謝網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)尤其是計(jì)算流分配的要求,大部分論文中的代謝網(wǎng)絡(luò)分析都是或明或暗的用這個分析的。2信號通路圖匯總藥理學(xué)思維導(dǎo)圖三、二維、三維構(gòu)圖軟件:1. DeepViewer_4.10_PCDeepViewer,曾經(jīng)也叫做Swiss-PdbViewer,是一個可以同時分析幾個蛋白的應(yīng)用程序。為了結(jié)構(gòu)比對并且比較活性位點(diǎn)或者任何別的相關(guān)部分,蛋白質(zhì)被分成幾個層次。氨基酸突變,氫鍵,原子間的角和距離在直觀的圖示和菜單界面上很容易獲得。2. pymol-0_99rc6-bin-win32PyMOL是一個開放源碼,由使用者贊助的分子三維結(jié)構(gòu)顯示軟件。PyMOL適用

3、于創(chuàng)作高品質(zhì)的小分子或是生物大分子(特別是蛋白質(zhì))的三維結(jié)構(gòu)圖像。PyMOL的源代碼目前仍可以免費(fèi)下載,供使用者編譯。對于Linux、Unix以及MacOSX等操作系統(tǒng),非付費(fèi)用戶可以通過自行編譯源代碼來獲得PyMOL執(zhí)行程式;而對于Windows的使用者,如果不安裝第三方軟件,則無法編譯源代碼。四、分子生物學(xué)軟件LaserGene是美國DNAStar公司發(fā)行的綜合性序列工具軟件,可用于發(fā)現(xiàn)和注釋DNA序列中的基因,并操作所關(guān)注的DNA的其他feature?,F(xiàn)階段版本的LaserGene包括EditSeq、MapDraw、SeqMan、GeneQuest、PrimerSelect、Megali

4、gn、Protean應(yīng)用程序,具有序列的編輯、轉(zhuǎn)換、開放閱讀框的查找、引物設(shè)計(jì)、酶切作圖、序列比較等功能,其功能幾乎囊括了分子生物學(xué)領(lǐng)域大多數(shù)內(nèi)容。1. modfitLT-BD周期分析軟件ModFitLT是由美國VeritySoftwareHouse公司設(shè)計(jì),是用于流式細(xì)胞術(shù)中進(jìn)行細(xì)胞周期分析的軟件。它通過對DNA含量直方圖進(jìn)行曲線擬合,能快速計(jì)算出分析細(xì)胞周期各時相細(xì)胞的含量、G1/S/G2+M細(xì)胞的百分比,并測量腫瘤細(xì)胞的DNA指數(shù)(DNAIndex)、及析凋亡細(xì)胞亞二倍體所占的比例,實(shí)為研究凋亡細(xì)胞生物與藥理小伙伴的一大利器。2. odysseywesternblotLi-cor公司推出

5、的Odyssey紅外激光雙色圖像分析系統(tǒng)配套軟件。是掃完Western后在自己電腦上分析的必備軟件(反正浙大醫(yī)學(xué)院公共平臺是用的這個)。3. 漢化版DNAMAN6.0-RaindyDNAMAN是一種常用的核酸序列分析軟件,功能強(qiáng)大,使用方便。可以不同形式顯示序列,進(jìn)行DNA序列的限制性酶切位點(diǎn)分析、DNA序列比對分析(DotMatrixComparision)、序列同源性分析(兩序列同源性分析、多序列同源性分析)等。4. BioEdit是一個功能齊全的分子生物學(xué)應(yīng)用軟件,可以完成核苷酸序列和蛋白質(zhì)序列進(jìn)行所有常規(guī)的分析操作,女口:序列比對、序列檢索、引物設(shè)計(jì)、系統(tǒng)發(fā)育分析等。與DNAMAN相比

6、,其分析內(nèi)容相對更豐富一些,而且提供了很多網(wǎng)絡(luò)程序的分析界面和接口。5. chromas(基因測序峰圖查看軟件)chromas是一款非常好用的專業(yè)基因測序列查看軟件,如果在從事科研的過程中需要測序列和查看彩圖可以使用這款工具,同時還擁有打開ABI格式的功能。6. flowjo流式細(xì)胞分析軟件*版Flowjo是一款優(yōu)秀的流式細(xì)胞分析專業(yè)軟件,可以兼容幾乎所有流式儀器采集的數(shù)據(jù),可以彌補(bǔ)其它機(jī)器自帶軟件的分析功能不足的缺憾,滿足用戶的數(shù)據(jù)分析要求,這也是FlowJo備受歡迎及推崇的原(微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)查找軟件)又稱微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)查找軟件,是利用生物信息學(xué)方法在一個相對狹小的基因組區(qū)段內(nèi)開發(fā)新的S

7、SR標(biāo)記的一個工具。SSRHunter軟件能夠搜索潛在的SSR位點(diǎn),完成較為出色。此外,SSRHunter還提供了自動序列預(yù)處理、常規(guī)的序列整理和序列變換功能、以及方便的結(jié)果輸出方式。9.VectorNTI11.5.1*版VectorNTISuite是一套功能強(qiáng)大、界面美觀而又友好的分子生物學(xué)應(yīng)用軟件包。它主要包括四個組件,分別對DNA、RNA和蛋白質(zhì)進(jìn)行各種分析和操作。主要支持以下幾種分析:對分子序列的操作、常規(guī)操作、常規(guī)分析、圖形操作。五、流程圖繪制軟件:1.SmartDraw一款能夠輕松制作組織機(jī)構(gòu)圖、流程圖、地圖、房間布局圖、數(shù)學(xué)公式、統(tǒng)計(jì)表、化學(xué)分析圖表、解剖圖表、界面原型等等。自帶

8、的圖庫里包含數(shù)百個示例、數(shù)千個符號和外形可以直接套用,官網(wǎng)中下載更多的符號和外形。他簡單的操作界面使使用者只需選擇模板并更換原件就能完成制圖,而不用從白紙起步畫。2. ConceptDraw是一個強(qiáng)大的跨平臺應(yīng)用程序,他提供了強(qiáng)大的矢量繪圖工具、庫以及許多的預(yù)置的圖例形狀,內(nèi)置描述語言、支持多種格式文檔的輸入輸出、支持連接ODBC數(shù)據(jù)庫和其它許多的功能。它支持GIF、JPEGPICT、EPS、Windowsbmp以及多媒體文件。與他一些列的還有思維導(dǎo)圖繪制軟件ConceptDrawMINDMAP以及項(xiàng)目管理軟件ConceptDrawPROJECT,可以互補(bǔ)使用。3. Visio(嫌太大占內(nèi)存?

9、點(diǎn)這里)六、凝膠分析軟件:1. Gel-proanalyzer是一塊功能強(qiáng)大的凝膠分析軟件,它的功能包括泳道分析,DNA分析,分子量計(jì)算,條帶分析,Dot-blot電泳分析,菌落計(jì)數(shù)-培養(yǎng)皿計(jì)數(shù),測量面積/密度,實(shí)驗(yàn)報(bào)告輸出,宏的功能與應(yīng)用。2. QuantiScan使用簡單,功能專一的凝膠掃描、分析軟件??梢苑治觯瑨呙瓒喾N多樣的材料成分,分析凝膠,污點(diǎn)和薄層層析板等。它以極小的成本達(dá)到類似于精密顯像密度計(jì)的功能。它分析的對象不僅包括BMP.JPG圖片,還包括沒有解壓的TIF文件等,可以對幾乎所有圖片進(jìn)行多種預(yù)處理。3. QuantityOne一款來自Bio-Rad的1D凝膠定量軟件,是The

10、DiscoverySeries軟件家族的成員,可以在Bio-Rad官網(wǎng)下載到非*版。它可成像和分析一維電泳凝膠、斑點(diǎn)印跡、狹線印跡和菌落計(jì)數(shù)。QuantityOne軟件能定量和分析多種數(shù)據(jù),包括從光密度儀、儲能磷屏成像儀、熒光成像儀和凝膠成像系統(tǒng)采集的放射性、化學(xué)發(fā)光、熒光和染色等樣品。它提供自動分析功能以快速獲取高質(zhì)量結(jié)果。4. PDQuest另一款來自Bio-Rad的軟件,是2D凝膠定量軟件,也可以在Bio-Rad官網(wǎng)下載到非*版。它的分析方式主要有4種:泳道/條帶軌跡定量法;等高線直接定量法;菌落計(jì)數(shù);分子量測定5mageLab一套圖像處理軟件,也是來自Bio-Rad的軟件,全名叫做Im

11、ageLaboratory。該軟件包括文件打開,保存,顯示,打印,復(fù)制,粘貼,鏡像,旋轉(zhuǎn),反色等常用功能之外,特別提供一系列圖像處理功能,如圖像的平滑、銳化、中值濾波、灰度拉伸、亮度變換、直方圖均衡、顏色調(diào)整、二值化、邊沿提取等。采用多文檔界面,可以同時打開顯示多個圖像進(jìn)行大量處理。6.BandScan一款通用的電泳膠條帶定量分析軟件??梢允謩印⒆詣诱业綏l帶,手動的條帶可以是無規(guī)則的,可以清除背景??梢赃M(jìn)行分子量、百分比、質(zhì)量、波峰等方面的定量分析??梢灾苯邮褂脪呙鑳x??梢詫?shù)據(jù)輸出到excel文件。是一個很常用的凝膠圖像分析軟件,用它分析蛋白表達(dá)量。功能包括凝膠圖像分析、光密度掃描、分子量計(jì)

12、算、自動查找條帶、雜點(diǎn)去除、電泳遷移校正功能。它是一款非常好用的圖像處理類生物軟件。七、數(shù)學(xué)統(tǒng)計(jì)軟件1.SPSS世界上最早采用圖形菜單驅(qū)動界面的統(tǒng)計(jì)軟件,它最突出的特點(diǎn)就是操作界面極為友好,輸出結(jié)果美觀漂亮。它將幾乎所有的功能都以統(tǒng)一、規(guī)范的界面展現(xiàn)出來,使用Windows的窗口方式展示各種管理和分析數(shù)據(jù)方法的功能,對話框展示出各種功能選擇項(xiàng)。用戶只要掌握一定的Windows操作技能,精通統(tǒng)計(jì)分析原理,就可以使用該軟件為特定的科研工作服務(wù)。SPSS采用類似EXCEL表格的方式輸入與管理數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)接口較為通用,能方便的從其他數(shù)據(jù)庫中讀入數(shù)據(jù)。其統(tǒng)計(jì)過程包括了常用的、較為成熟的統(tǒng)計(jì)過程,完全可以滿

13、足非統(tǒng)計(jì)專業(yè)人士的工作需要。一款專業(yè)的制圖軟件與數(shù)據(jù)分析軟件,由OriginLab公司制作發(fā)布的。origin8.0能夠滿足一般用戶的制圖需求,而且還能支持高級用戶的數(shù)據(jù)分析與函數(shù)擬合。這款軟件適用于研究人員、工程師、科學(xué)人員,它具有簡單易學(xué)、操作靈活、功能強(qiáng)大的特點(diǎn)。使用Origin就像使用Excel和Word那樣簡單,只需點(diǎn)擊鼠標(biāo),選擇菜單命令就可以完成大部分工作,獲得滿意的結(jié)果。3.Stata一套提供其使用者數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)管理以及繪制專業(yè)圖表的完整及整合性統(tǒng)計(jì)軟件。它提供許許多多功能,包含線性混合模型、均衡重復(fù)反復(fù)及多項(xiàng)式普羅比模式。Stata較好地實(shí)現(xiàn)了使用簡便和功能強(qiáng)大兩者的結(jié)合。盡

14、管其簡單易學(xué),它在數(shù)據(jù)管理和許多前沿統(tǒng)計(jì)方法中的功能還是非常強(qiáng)大的。用戶可以很容易的下載到別人已有的程序,也可以自己去編寫,并使之與Stata緊密結(jié)合。4.SAS一個模塊化、集成化的大型應(yīng)用軟件系統(tǒng)。SAS由于其功能強(qiáng)大而且可以編程,很受高級用戶的歡迎。也正是基于此,它是最難掌握的軟件之一。使用SAS時,你需要編寫SAS程序來處理數(shù)據(jù),進(jìn)行分析。如果在一個程序中出現(xiàn)一個錯誤,找到并改正這個錯誤將是困難的。SAS適合高級用戶使用。它的學(xué)習(xí)過程是艱苦的,最初的階段會使人灰心喪氣。然而它還是以強(qiáng)大的數(shù)據(jù)管理和同時處理大批數(shù)據(jù)文件的功能,得到高級用戶的青睞。5. graphpadprism一款醫(yī)學(xué)繪圖

15、軟件,他基于生物統(tǒng)計(jì),曲線擬合和科學(xué)繪圖于一體,是專業(yè)制作的SCI論文圖表的利器。(別說我沒告訴你,點(diǎn)這里有教程哦)6.SigmaPlot一款最佳的科學(xué)繪圖軟件,畫出精密的圖型是件極容易的事,目前巳有超過十萬的使用者,特別設(shè)計(jì)給科學(xué)家使用。本軟件允許您自行建立任何所需的圖型,您可插入多條水平或垂直軸,指定Errorbar的方向,讓您的圖更光彩耀眼,只要用SigmaPlot將圖制作完成即可動態(tài)連結(jié)給其它軟件展示使用,并可輸出成EPS、TIFF、JPEG等圖形格式,或置放于您的網(wǎng)站上以供瀏覽。非常適合網(wǎng)站動態(tài)顯示圖形使用之場所如長時間紀(jì)錄之氣象,溫度等等場合。八、圖片處理軟件1mageJ一個基于j

16、ava的公共的圖像處理軟件。其能夠顯示,編輯,分析,處理,保存,打印8位,16位,32位的圖片,支持TIFF,PNG,GIF,JPEG,BMP,DICOM,FITS等多種格式。ImageJ支持圖像棧功能,即在一個窗口里以多線程的形式層疊多個圖像,并行處理。只要內(nèi)存允許,ImageJ能打開任意多的圖像進(jìn)行處理。除了基本的圖像操作,比如縮放,旋轉(zhuǎn),扭曲,平滑處理外,ImageJ還能進(jìn)行圖片的區(qū)域和像素統(tǒng)計(jì),間距,角度計(jì)算,能創(chuàng)建柱狀圖和剖面圖,進(jìn)行傅里葉變換。2. mage-ProPlus功能強(qiáng)大的2D和3D圖像處理、增強(qiáng)和分析軟件,具有異常豐富的測量和定制功能。作為鼎鼎大名的Image-Pro軟

17、件系列中功能最強(qiáng)大的成員之一,它包含了異常豐富的增強(qiáng)和測量工具,并允許用戶自行編寫針對特定應(yīng)用的宏和插件,是世界最頂級的圖像分析軟件包。3. ACDChemSketch一款化學(xué)畫圖軟件。該軟件可用于畫化學(xué)結(jié)構(gòu)、反應(yīng)和圖形。也可用于設(shè)計(jì)與化學(xué)相關(guān)的報(bào)告和演講材料。4. ACDCanvasACD公司推出的一款強(qiáng)大的矢量繪圖軟件,程序無縫集成了用于繪畫、圖像編輯和Web設(shè)計(jì)的工具;可以以多種格式(包括動畫和Web就緒文件)導(dǎo)出繪畫作品,它在剪輯圖庫上捆綁了用于位圖編輯、展示、Web圖形和矢量圖繪制的工具。5. AdobePhotoshopCS6中文版Adobe公司旗下最為出名的圖像處理軟件之一,集圖

18、像掃描、編輯修改、圖像制作、廣告創(chuàng)意,圖像輸入與輸出于一體的圖形圖像處理軟件,深受廣大平面設(shè)計(jì)人員和電腦美術(shù)愛好者的喜愛。九、文獻(xiàn)管理軟件1、EndnoteEndnote由ThomsonScientific開發(fā)的SCI官方文件管理軟件。直接連接上千個數(shù)據(jù)庫,并提供通用的檢索方式,提高科技文獻(xiàn)的檢索效率;能管理的數(shù)據(jù)庫沒有上限;能將參考文獻(xiàn)嵌入word編輯軟件中,方便邊寫邊插入?yún)⒖嘉墨I(xiàn);同時系統(tǒng)資源占用小,有很強(qiáng)的外擴(kuò)展功能;是論文文獻(xiàn)搜索、編輯、管理、引用的小幫手。(點(diǎn)這里,有解說哦)2、Refviz文件分析軟件,與Endnote結(jié)合使用來分析文獻(xiàn)。能夠判斷搜索的準(zhǔn)確性,輔助決定進(jìn)一步閱讀方向

19、,認(rèn)為介入聚類,被成為文獻(xiàn)的眼睛而著名。3、NoteexpressNoteExpress是國內(nèi)最專業(yè)的文獻(xiàn)檢索與管理系統(tǒng),以附件方式管理參考文獻(xiàn)全文或各類文件,加上筆記功能的結(jié)合,快捷的全文檢索,數(shù)據(jù)挖掘了解最新進(jìn)展,自動完成參考文獻(xiàn)引用的格式化等,使該軟件可以作為強(qiáng)大的個人知識管理系統(tǒng)。4、MendeleyMendeley是一款免費(fèi)的跨平臺文獻(xiàn)管理軟件,同時也是一個在線的學(xué)術(shù)社交網(wǎng)絡(luò)平臺??梢绘I抓取網(wǎng)頁上的文獻(xiàn)信息添加到個人的library中,也可通過安裝插件方便在文字編輯器中插入和管理參考文獻(xiàn)。十、醫(yī)藥學(xué)類軟件1、新編全醫(yī)藥學(xué)大詞典新編全醫(yī)藥學(xué)大詞典原名網(wǎng)際金典,是醫(yī)脈通旗下一款專業(yè)醫(yī)學(xué)翻

20、譯軟件。電腦版支持詞典查詢,屏幕取詞,全文翻譯,自動學(xué)習(xí)和輔助輸入等強(qiáng)大功能;移動版另有抓拍取詞,詞庫管理,醫(yī)學(xué)咨詢等內(nèi)容。2、麥克明彩色人體解剖圖譜麥克明彩色人體解剖圖譜是由人民衛(wèi)生出版社出版的一本人體解剖類圖書,重點(diǎn)突出臨床解剖學(xué),包括了頭、顱和腦,脊柱和脊髓,上肢,胸部,腹部和盆腔,下肢,系統(tǒng)觀察幾大塊內(nèi)容,標(biāo)注清晰,內(nèi)容豐富,是最受歡迎的解剖圖譜。3、3dBody人體解剖軟件“3Dbody解剖”是一套3D解剖教學(xué)系統(tǒng)平臺,提供了男女二套全三維的數(shù)字模型,是目前最完整全面的解剖學(xué)數(shù)據(jù),涵蓋了人體所有解剖系統(tǒng),同時提供了骨性標(biāo)志圖、肌肉動作動畫、肌肉起止點(diǎn)、針灸穴位、斷層解剖、英文發(fā)音、注

21、釋等信息。數(shù)據(jù)詳實(shí),操作功能強(qiáng)大,通過實(shí)時三維操作,輕易獲得層層解剖人體的機(jī)會。十一、質(zhì)粒繪圖的專業(yè)軟件I.SimVectorSimVector是來自國外的一個非常優(yōu)秀的質(zhì)粒繪圖軟件。主要功能就是繪制高質(zhì)量的質(zhì)料圖,還有載體圖和序列圖等等。此外質(zhì)粒圖繪制軟件還支持發(fā)表質(zhì)粒圖與序列、載體圖等,非常專業(yè)。2. BVTechPlasmidBVTechPlasmidDNA質(zhì)粒繪圖軟件是免費(fèi)軟件,可以用它來繪制圓或線性的雙鏈和單鏈質(zhì)粒圖譜與。可以用不同的顏色、文本和樣式上標(biāo)注基因和限制位點(diǎn)的質(zhì)粒。3. WinplasWinplas作為一個質(zhì)粒繪圖的專業(yè)軟件,功能強(qiáng)大,而且極易上手,它可以繪制出具有發(fā)表質(zhì)量的質(zhì)粒圖譜??蓮V范應(yīng)用于論文、教程的質(zhì)粒插圖,它的特性包括:1,無論是否知道質(zhì)粒的原始序列都能繪制質(zhì)粒圖;2,可讀

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