各種生物多樣性指數(shù)計算

1、.Shannon-wiener指數(shù) ,Simpson指數(shù)計算公式      生物多樣性測定主要有三個空間尺度：多樣性，多樣性，多樣性。多樣性主要關(guān)注局域均勻生境下的物種數(shù)目，因此也被稱為生境內(nèi)的多樣性within-habitat diversity。多樣性指沿環(huán)境梯度不同生境群落之間物種組成的的相異性或物種沿環(huán)境梯度的更替速率也被稱為生境間的多樣性between-habitat diversity，控制多樣性的主要生態(tài)因子有土壤、地貌及干擾等。多樣性描述區(qū)域或大陸尺度的多樣性，是指區(qū)域或大陸尺度的物種數(shù)量，也被稱為區(qū)域多樣性regional d

2、iversity?？刂贫鄻有缘纳鷳B(tài)過程主要為水熱動態(tài)，氣候和物種形成及演化的歷史。 多樣性a. Gleason1922指數(shù)        D=S/lnA 式中A為單位面積，S為群落中的物種數(shù)目。 b. Margalef1951，1957，1958指數(shù)        D=S-1/lnN        式中S為群落中的總數(shù)目，N為觀察到的個體總數(shù)。 2Simpson指數(shù)     &

3、#160;  D=1-Pi2        式中Pi種的個體數(shù)占群落中總個體數(shù)的比例。 3種間相遇機率PIE指數(shù)        D=NN-1/NiNi-1        式中Ni為種i的個體數(shù)，N為所在群落的所有物種的個體數(shù)之和。 4Shannon-wiener指數(shù)        H=-PilnPi 式中Pi=Ni/N 。 5Pielou均勻度指數(shù)

4、        E=H/Hmax        式中H為實際觀察的物種多樣性指數(shù)，Hmax為最大的物種多樣性指數(shù)，Hmax=LnSS為群落中的總物種數(shù) 6舉例說明 例如，設(shè)有A,B,C,三個群落，各有兩個物種組成，其中各種個體數(shù)組成如下： 物種甲物種乙群落A100(1.0)0(0)群落B50(0.5)50(0.5)群落C99(0.99)1(0.01) 請計算它的物種多樣性指數(shù)。 Simpson指數(shù)： Dc=1-Pi2=1-Ni/N2=1-(99/100)2+(1/100)2=

5、0.0198 DB=1-(50/100)2+(50/100)2=0.5000 Shannon-wiener指數(shù)： HC=-Ni/N ln Ni/N i=-0.99×ln0.99+0.01×ln0.01=0.056 HB=-(0.50×ln0.50+0.50×ln0.50)=0.69 Pielou均勻度指數(shù)： Hmax=lnS=ln2=0.69 EA= H/Hmax=-(1.0×ln1.0)+0/0.69=0 EB=-(0.50×ln0.50+0.50×ln0.50)/0.69=0.69/0.69=1 EC=0.056/0.6

6、9=0.081 從上面的計算可以看出,群落的物種多樣性指數(shù)與以下兩個因素有關(guān): 種類數(shù)目,即豐富度； 種類中個體分配上的均勻性 多樣性   多樣性可以定義為沿著環(huán)境梯度的變化物種替代的程度。不同群落或某環(huán)境梯度上不同點之間的共有種越少，多樣性越大。準(zhǔn)確地測定多樣性具有重要的意義。這是因為：它可以指示生境被物種隔離的程度；多樣性的測定值可以用來比較不同地段的生境多樣性；多樣性與多樣性一起構(gòu)成了總體多樣性或一定地段的生物異質(zhì)性。 1Whittaker指數(shù)w w=S/m-1 式中：S為所研究系統(tǒng)中記錄的物種總數(shù)；m為各樣方或樣本的平均物種數(shù)。 2Cody指數(shù)c c=gH+lH/2

7、 式中：gH是沿生境梯度H增加的物種數(shù)目； lH是沿生境梯度H失去的物種數(shù)目，即在上一個梯度中存在而在下一個梯度中沒有的物種數(shù)目。 3Wilson Shmida指數(shù)T T=gH+lH/2 該式是將Cody指數(shù)與Whittaker指數(shù)結(jié)合形成的。式中變量含義與上述兩式一樣。 多樣性主要指標(biāo)為物種數(shù)S多樣性測定沿海拔梯度具有兩種分布格局：偏鋒分布和顯著的負(fù)相關(guān)格局。動物多樣性及動物多樣性的保護動物是生物界的一個重要組成局部。在各國科學(xué)家關(guān)心全球的生物多樣性問題時，我國的動物學(xué)家對本國動物多樣性受到的破壞和威脅同樣深為關(guān)切。許多有識之士已認(rèn)識到：現(xiàn)生生物的多樣性及其分布格局是億萬年生物進化歷史形成的

8、。眾多的現(xiàn)生動物不依賴于人類已生存了數(shù)千萬或數(shù)億年，而人類假設(shè)一旦失去這些動物卻難以生存。因而，保護動物的多樣性是為人類自身的生存的一項刻不容緩的工作。生態(tài)系統(tǒng)是特定生態(tài)空間中所有生物及其生活環(huán)境間在物質(zhì)循環(huán)和能量流動過程中所形成的統(tǒng)一整體。我國地域遼闊，地處寒溫帶、溫帶、暖溫帶、亞熱帶和熱帶。從東南沿海到西北內(nèi)陸，又有濕潤、半濕潤、半干旱和干旱不同的地區(qū)。在動物地理學(xué)上跨越古北界和東洋界兩大界。第四紀(jì)以來，由于北半球冰期的發(fā)生和青藏高原的隆起，使我國的自然分帶有所增加。更因地形復(fù)雜而增加了我國生態(tài)系統(tǒng)的復(fù)雜性。據(jù)初步統(tǒng)計，我國的森林生態(tài)系統(tǒng)就有16個大類，約185類生態(tài)系統(tǒng)，還有4大類草原、

9、7大類荒漠，以及高山植被等約460類生態(tài)系統(tǒng)。這樣規(guī)模的生態(tài)系統(tǒng)的多樣性是其他國家難以比較的，是我國的一項珍貴財富?？上в捎谌丝谠鲩L的巨大壓力，經(jīng)濟開展造成環(huán)境的改變和污染，以及主觀認(rèn)識的缺乏，各類生態(tài)系統(tǒng)遭到嚴(yán)重的破壞。不但造成氣候惡化、土壤侵蝕、江河泛濫等惡果，而首當(dāng)其沖的是其中許多動物物種遭到滅絕或瀕臨滅絕的厄運。如XX石屏縣境內(nèi)的異龍湖原先草茂魚肥，歷史上盛產(chǎn)鯉魚和白魚，還有一特有種為異龍中鯉。但50年代以來，先后在該湖挖河發(fā)電、放水造田，以及后來的全湖持續(xù)干涸等，異龍中鯉從此再未發(fā)現(xiàn)過。又如生存在XX洱海的20余種魚類中有7個名貴特有種和3個XX特有鯉魚的亞種。近30年來，由于水位下

10、降、產(chǎn)卵場破壞、過度捕撈和不合理放養(yǎng)等原因，這10個種或亞種均處于瀕危狀態(tài)。洱海作為一個特殊的淡水湖泊生態(tài)系統(tǒng)也將消失。物種是生命存在的根本形式，也是生態(tài)系統(tǒng)中生物群落組成的根本單元，因此群落的物種多樣性是生態(tài)系統(tǒng)構(gòu)造和功能的決定因素。可是目前世界上終究有多少物種眾說不一。不同的研究者估計數(shù)差距甚大，在180萬到3000萬種之間，已描述的種統(tǒng)計在140170萬種之間，其中動物的種類約占90以上。筆者比較保守的估計，我國動物的種類可能為昆蟲15萬種，其他無脊椎動物3.5萬種，脊椎動物的5139種(獸類499種，鳥類1186種，爬行類380種，兩棲類270種，魚類2804種)。在第四紀(jì)冰川期，東亞

11、冰川活動較弱，而且生物可隨著冰川的前進而向南退卻，與歐洲、北美洲的生物無路可退的情況截然不同。因而東亞不但物種豐富，而且保存了許多古老的種類。在脊椎動物中如大家熟悉的大熊貓、扭角羚和揚子鱷。無脊椎動物中，如蛛形綱蜘蛛目中的節(jié)板蛛科，是現(xiàn)生105科蜘蛛中最原始的一科，僅2屬約40種，僅分布于東亞。這類蜘蛛在土中打洞穴居，洞口有活蓋，夜間把洞蓋翻開一條縫，發(fā)現(xiàn)有昆蟲路過，躍出捕回洞中享用。這類蜘蛛腹部反面尚保存分節(jié)的背板，紡器位于腹部的中部。從形態(tài)到行為可以說與3億年前的蜘蛛祖先一樣，是很有學(xué)術(shù)價值的類別。此外，我國有一些地區(qū)如西南的橫斷山區(qū)，是現(xiàn)代許多生物的分化與分布中心。由上述可見，我國的動物

12、多樣性不僅在于總體上我國動物種類數(shù)約占全世界動物種類的十分之一左右，還在于有許多特有種，而且有的類群種類遠遠大于這一比例。如昆蟲中最原始的原尾目全球400多種，我國那么有120種，占全世界的近1/3。名貴蝴蝶絹蝶科世界記載53種，我國34種，占61；其中絹蝶屬全球記載37種，我國27種，占73。所以世界昆蟲學(xué)家稱中國為絹蝶王國。我國現(xiàn)生800余種淡水魚類中，約有90為我國或東亞所特有。但除脊椎動物外，目前對我國動物的家底尚不清楚。以昆蟲而論，迄今記述不到4萬種，僅占估計數(shù)15萬種的約1/4。無脊椎動物(包括昆蟲)中有許多類群尚無人進展研究。1988年世界自然和自然資源保護聯(lián)盟紅皮名錄的1006

13、種受威脅昆蟲中，美國有493種，而中國大陸僅有10種。我國國家重點保護野生動物名錄中，脊椎動物列出232個分類階元(大局部為種，少數(shù)列出目、科或?qū)俚乃蟹N)，而無脊椎動物僅列出1個屬(所有種)及24個種的保護。為保護物種多樣性，許多科學(xué)家再度提出在某些生物滅絕前應(yīng)摸清種類。尤其對尚未研究的類群或某些被無視的棲息地，如土壤、珊瑚礁、紅樹林和森林林冠等的動物種類應(yīng)調(diào)查清楚。對于的瀕危種，那么要進一步研究其分布、種群數(shù)量、棲息地、生物學(xué)及威脅存活的主要因素，提出有關(guān)的保護措施。棲息地保護無疑是保護物種的根本手段。應(yīng)該指出的是，對于某些小型無脊椎動物來說，即使一個小X圍的生態(tài)系統(tǒng)(如一個池塘或一小片樹

14、林)的保護有時也有重要的意義。隨著對有科學(xué)價值的種類認(rèn)識的加深，及全民保護動物意識的加強，這一問題今后必將越來越引起公眾的注意。除了從保護生態(tài)系統(tǒng)的角度做好物種的保護工作以外，制止濫捕和非法出口始終是保護物種中首要解決的問題。多年來，不加控制地獵殺黃羊、狍、麂、巖羊等有蹄類動物，使原來的常見種淪為稀有種。某些公司要求出口數(shù)以萬計的蟒蛇皮及大批眼鏡蛇和眼鏡王蛇。有的要求出口成噸的珊瑚，而珊瑚礁的破壞使大批海洋生物的生存受到威脅。而某些海洋生物可能為挽救人類心臟病或癌癥的關(guān)鍵藥物。每一物種都是一個獨特的基因庫。可以說，物種多樣性中包括遺傳多樣性。但遺傳多樣性又遠遠超過物種多樣性的X圍。每一物種均由

15、許多個體組成，除了孤雌生殖和一卵雙生子以外，沒有兩個個體的基因組是完全一樣的。種下可能有亞種的分化，或由許多地理或生態(tài)種群所組成，家養(yǎng)動物包含有眾多的品種和類型。因此，許多物種實際上包含成百、甚至上千個不同的遺傳類型。例如，花鰍的同一亞種中存在2n=50，75，86，94等4種染色體數(shù)目。XX動物所發(fā)現(xiàn)XXXX、昭覺、瑞麗和迪慶四個地區(qū)牛的血紅蛋白有6種基因型，運鐵蛋白共有9種不同的基因型，顯示了豐富的遺傳多樣性。分子水平上的遺傳多樣性引人注目，如在珠星雅羅魚的三個地方種群中存在著12種不同型的線粒體DNA構(gòu)造。遺傳多樣性是生命進化和適應(yīng)的根底，種內(nèi)遺傳多樣性愈豐富，物種對環(huán)境變化的適應(yīng)能力愈

16、大。遺傳的均一性威脅種群或物種的生存已是明顯的事實。分布于非洲幾個狹谷地帶的獵豹的種群在遺傳上是高度一致的。這導(dǎo)致獵豹在適應(yīng)、繁殖和對疾病抵抗力的低下，瀕臨滅絕的危險。遺傳多樣性的保存除了包含在生態(tài)系統(tǒng)和物種多樣性的保存中以外，更注意采用一系列新方法和新技術(shù)，諸如精子(或配子)和胚胎的凍存，人工授精和胚胎移植等。中國科學(xué)院XX細胞生物所和XX動物所均建有頗具規(guī)模的細胞庫。XX動物所利用西南地區(qū)動物種類繁多和資源豐富的特點，側(cè)重從動物遺傳(種質(zhì))資源的保存和利用角度建立的野生動物細胞庫，迄今已保存170余種，其中不少是我國特有的珍稀或瀕危動物，如滇金絲猴等。隨著細胞生物學(xué)和發(fā)育生物學(xué)的開展，有朝一日我們將最終提醒細胞分化和個體發(fā)育的奧秘，通過細胞培養(yǎng)或核移植一類技術(shù)，我們的后代可以從細胞庫中再建當(dāng)時地球已滅絕的動物。現(xiàn)代細胞庫也就是一個密集的基因庫。不僅凍存的細胞可以“蘇醒，細胞或凍存組織中的DNA即凍存的基因也同樣有可能“蘇醒。所以，有人形象地比喻細胞庫