液體活檢專家共識(shí)

1、液體活檢的專家共識(shí)軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院附屬醫(yī)院秦海峰ContentContent基因變異類別及分析技術(shù)需求液態(tài)活檢的應(yīng)用耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析精準(zhǔn)診斷-分子分型ContentContent基因變異類別及分析技術(shù)需求液態(tài)活檢的應(yīng)用耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析精準(zhǔn)診斷-分子分型原癌基因(proto-oncogene)癌基因活化(oncogene)基因變異類別抑癌基因(tumor suppressor gene, TSG)功能缺失活化失活基因突變擴(kuò)增或缺失易位融合表觀遺傳修飾 其他基因 Modifying gene調(diào)節(jié)功能異常表達(dá)異常分子標(biāo)志物種類及其對(duì)應(yīng)的檢測(cè)方法 Bio-specimen & variati

2、on DNA： mutation, translocation, CNV, MSI Deletion RNA: Single gene expression Gene expression profile Protein Single protein Protein profiling Epigenetic: Methylation pattern Technology DNASequencing, RT-PCRqPCR, aCGHFISH, CISH RNAqRT-PCRMicroarray techniquesTaqMan gene expression array ProteinIHC,

3、 ELISA, mass spectrometry EpigeneticMS-PCR, bisulphate-PCR-sequencingMethylation micorarrayNGS目前NGS檢測(cè)變異類型：SNV, Indels, Rearrangement/fusion, CNV及少數(shù)表觀變異 二代測(cè)序（NGS）技術(shù)應(yīng)用于臨床腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)診斷的共識(shí)（第一版2016.04.23）中國(guó)腫瘤驅(qū)動(dòng)基因分析聯(lián)盟（CAGC）中國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)（CSCO）國(guó)內(nèi)共識(shí)推薦NGS用于臨床檢測(cè)“首先我們非常清楚液體活檢和NGS的哪些部分可以應(yīng)用到臨床，如小的PANEL可用于現(xiàn)在市場(chǎng)上CFDA已經(jīng)批準(zhǔn)的藥物的檢

4、測(cè)，這些可以應(yīng)用到臨床”。2016年3月5日第十三屆中國(guó)肺癌高峰論壇吳一龍共識(shí)：檢測(cè)已知的、多個(gè)平行臨床可藥物抑制的靶點(diǎn)，液體活檢技術(shù)推薦NGS方法共識(shí)：用于發(fā)現(xiàn)未知基因，探索療效監(jiān)測(cè)、預(yù)后判斷和發(fā)現(xiàn)耐藥機(jī)制等，液體活檢技術(shù)建議使用NGS方法。 2016年3月5日第十三屆中國(guó)肺癌高峰論壇共識(shí)中包括的9個(gè)內(nèi)容、36項(xiàng)聲明 共識(shí)NGS在腫瘤臨床診斷中的質(zhì)量要求NGS在腫瘤臨床應(yīng)用中的檢測(cè)內(nèi)容NGS在應(yīng)用中的樣本要求NGS測(cè)序技術(shù)及流程N(yùn)GS數(shù)據(jù)的產(chǎn)生、管理及分析NGS結(jié)果分析報(bào)告及查詢NGS在腫瘤臨床應(yīng)用中的知情同意書臨床診斷與研究的區(qū)別CAGC POI項(xiàng)目NGS測(cè)試（Test）的監(jiān)督管理Cont

5、entContent基因變異類別及分析技術(shù)需求液態(tài)活檢的應(yīng)用耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析精準(zhǔn)診斷-分子分型西方： 2013 ASCONRAS1%KRAS25%未檢測(cè)到突變36%ERFR (敏感)17%MEK11 gone 3%HER2 3%2%東方： 370例中國(guó)肺腺癌BRAF M+2%PI3K M+4%C-MET Amp5$PTENM+6%EML4-ALK7%KRAS7%EGFR M+40%未知29%肺癌中已發(fā)現(xiàn)的驅(qū)動(dòng)基因及頻率 關(guān)注de novo Unkown！ 關(guān)注耐藥后的變異 ！ !肺癌中已發(fā)現(xiàn)的驅(qū)動(dòng)基因及頻率原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶的基因突變異質(zhì)性（空間分布差異性）同一瘤灶內(nèi)基因突變異質(zhì)性治療前后基因突

6、變異質(zhì)性時(shí)間分布差異性肺癌瘤內(nèi)異質(zhì)性實(shí)例 腫瘤細(xì)胞之間存在較強(qiáng)的分子異質(zhì)性Cancer Genome Landscapes. Science (New York, NY). 2013;339(6127):1546-1558.ContentContent基因變異類別及分析技術(shù)需求液態(tài)活檢的應(yīng)用耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析精準(zhǔn)診斷-分子分型A Single Dominant Mechanism of Acquired Resistance to Rociletinib is not Readily IdentifiableA Single Dominant Mechanism of Acquired Res

7、istance to Rociletinib is not Readily IdentifiablePresented By Lecia Sequist at 2015 ASCO Annual Meeting耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析15 AZD9291 treated pts6 cases of C797S mutations (40%) Oxnard, et al. Nat med, 2015耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析Acquired resistance to Rociletinib 12 Pts with 13 T790M+ samples: 7 samples retained T

8、790M (3 EGFR amp); 6 samples loss of T790M ( 2 conversion to SCLC) 2015 ASCO, 20 cases:FGFR3 mut;MET ampAcquired resistance to AZD 9291 15 plasma DNA samples from 15 pts6/15 C797S + E19 del + T790M5/15 E19 del + T790M4/15 E19 del HER2 amp BRAF mut NRAS mut MET amp EGFR-independent Presented By Chris

9、tine Lovly at 2015 ASCO Annual Meeting耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析Circulating tumour DNA profiling reveals heterogeneity of EGFR inhibitor resistance mechanisms in lung cancer patientsPresented By Jacob J.Chabon at 2016 ASCO Annual MeetingALK TKI resistanceCamidge DR;Doebele RC ;Treating ALK-positive lung cancer-early

10、 successes and future challenges.Nat Rev Clin Oncol.2012V9N5:268-77 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析EGFR mut T790M C797S L798IOxnard, et al. Nat med, 2015; ASCO 2015; Lin, Nat Genet, 2015; Alice Shaw, NEJM 2015TKIALK fusion ALK C1156YALK L1198F +C1156YBypassBypassBypassBypassTKITKITKITKITKI耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析ContentContent

11、基因變異類別及分析技術(shù)需求液態(tài)活檢的應(yīng)用耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析精準(zhǔn)診斷-分子分型7540Liquid biopsy: blood sampling for testings as done in biopsied tissue samplesCirculating markers: DNA Circulating tumor cells (CTCs) Exosome Proteins RNA Platelets Immune cells (TCR repertoire) Liquid Biopsy and Circulating BiomarkersAM Newman, et al. Nat Me

12、d, 2014CAPP_Seq: targets 521 exons and 13 introns from 139 recurrently mutated genes, in total covering 125 kb (0.004% of the human genome) 17 NSCLC pts5000X coveragectDNA 超敏感深部測(cè)序：發(fā)現(xiàn)臨床藥物靶點(diǎn)約3/4 ALK融合為經(jīng)典的EML4-ALK融合，但有1/4為與其他基因的融合，包括：STRN-ALKCATSPERB-ALKACVR1-ALKCLIP1-ALKDPH6-AS1-ALKKIF5B-ALKRP11-320M2

13、.1-ALKUGP2-ALK燃石血檢：10000X coveragectDNA 超敏感深部測(cè)序：發(fā)現(xiàn)臨床藥物靶點(diǎn)Burning Rock Dx 內(nèi)部數(shù)據(jù)請(qǐng)勿拍照Aaron M Newman et al. Nat Med. 2014 突變譜動(dòng)態(tài)變化反映實(shí)時(shí)腫瘤負(fù)荷大小 基于NGS的ctDNA動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)可實(shí)現(xiàn)定性與定量有機(jī)結(jié)合，準(zhǔn)確反映腫瘤時(shí)空異質(zhì)性 液體活檢帶來(lái)的動(dòng)態(tài)監(jiān)控Zofia, et al. Journal of Thoracic, March 2016液體活檢帶來(lái)的動(dòng)態(tài)監(jiān)控L858R+T790ML858R全腦放療全腦放療+6 周期的卡鉑周期的卡鉑+培美培美+貝伐貝伐+厄洛替尼厄洛替尼厄洛替

14、尼厄洛替尼聯(lián)合治療聯(lián)合治療NivoAZD9291biopsytimeline L858R36912female, aged 60lung adenocarcinoma with bone metastases4.26.36.307.278.17T790M出現(xiàn)ALK融合消失C797S出現(xiàn)1st gen EGFR-TKI+3rd gen EGFR-TKILiver PD1st gen ALK-TKI+3rd gen EGFR-TKI2st gen ALK-TKI+3rd gen EGFR-TKIPRLiver PDLiver PR, Other PDTP53EGFR 19delALK fusion

15、EGFR T790M液體活檢帶來(lái)的動(dòng)態(tài)監(jiān)控結(jié)合隨訪，動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)，新方向，國(guó)際最前沿COMPASS（ctDNA Ominibus Mutations Predictive Association）是燃石醫(yī)學(xué)使用其朗清NGS產(chǎn)品檢測(cè)晚期NSCLC病人ctDNA從而進(jìn)行疾病隨訪以及支持治療決策的一個(gè)診斷行動(dòng)。燃石醫(yī)學(xué)血液檢測(cè)產(chǎn)品的敏感性/特異性在前處理合適的情況下已達(dá)到國(guó)際領(lǐng)先水平是COMPASS行動(dòng)開展的技術(shù)基礎(chǔ)液體活檢帶來(lái)的動(dòng)態(tài)監(jiān)控晚期晚期NSCLC驅(qū)動(dòng)基因異常驅(qū)動(dòng)基因異常臨床隨訪信息臨床隨訪信息 B和和IV期的期的NSCLC 初治復(fù)治均可初治復(fù)治均可 鱗癌，腺癌均可鱗癌，腺癌均可 身體狀況和器官身體狀況和器官功能允許開展下功能允許開展下一步抗腫瘤全身一步抗腫瘤全身治療尤其是靶向治療尤其是靶向治療治療 已知具有至少一已知具有至少一個(gè)明確的異常驅(qū)個(gè)明確的異常驅(qū)動(dòng)基因動(dòng)基因 患者配合臨床患者配合臨床隨訪以及必要隨訪以及必要的治療的治療 可以提供研究可以提供研究所需要收集的所需要收集的臨床資料臨床資料液體活檢帶來(lái)的動(dòng)態(tài)監(jiān)控目標(biāo)人群具有下列至少一個(gè)明確的基因異常EGFR：18-21號(hào)外顯子COSMIC或TCGA收錄的所有突變ALK：19