16S擴增子測序分析流程

1、16SrDNA測序分析流程宏基因組測序是指對微生物群體進行高通量測序，分析特定環(huán)境中微生物群體基因組成 及功能、微生物群體的多樣性與豐度，進而分析微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系， 發(fā)現(xiàn)具有特定功能的基因。宏基因組測序無需分離純培養(yǎng)微生物，較大擴展了微生物資源的 利用，為環(huán)境微生物群落的研究提供了有效工具。宏基因組深度測序可以揭示或估計環(huán)境中 真實的物種多樣性和遺傳多樣性，挖掘具有應(yīng)用價值的基因資源，應(yīng)用于開發(fā)新的微生物活 性物質(zhì)。宏基因組研究分兩個方向：擴增子測序和全基因組測序。擴增子測序，涉及特定序列位點的PCR擴增，通常是16S/18S rDNA。宏基因組的物種 分類，一般用OUT(

2、operational taxonomic unit)，即可操作單元來表示。通常原生生物使用 16S rDNA來衡量，真核生物的OUT使用18S rDNA來衡量。主要應(yīng)用在以下幾個方面：通過宏基因組測序的方法，將腸道微生物與疾病進行關(guān)聯(lián)分 析以揭示疾病與健康個體間的微生物差異;鑒定特定環(huán)境中的特定微生物發(fā)現(xiàn)耐受菌種及相 關(guān)基因?？梢匝芯课锓N的分類，研究與特定環(huán)境相關(guān)的代謝通路，以及通過不同樣品的比較 研究微生物群落內(nèi)部、微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系。擴增子序列(16rDNA)分析流程:軟著和專利自建數(shù)據(jù)庫硬云生信團隊個性化分累計服務(wù)用戶成員析模塊 客土近超I帥個5000名數(shù)1部冊登記號

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