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1、 第五章 分子生物學(xué)技術(shù)DNA重組技術(shù)及運(yùn)用現(xiàn)代分子生物學(xué)的快速開(kāi)展,得益于上個(gè)世紀(jì)中葉以來(lái)研討方法、特別是基因操作和基因工程技術(shù)的提高?;虿僮髦饕―NA分子的切割與銜接、雜交、電泳、細(xì)胞轉(zhuǎn)化、核酸序列分析以及基因人工合成、表達(dá)、定點(diǎn)突變和PCR擴(kuò)增等,是分子生物學(xué)研討的中心技術(shù)?;蚬こ淌侵冈隗w外將核酸分子插入病毒、質(zhì)?;蚱渌d體分子,構(gòu)成遺傳物質(zhì)的新組合,使之進(jìn)入原先沒(méi)有這類分子的寄主細(xì)胞內(nèi)并進(jìn)展繼續(xù)穩(wěn)定的繁衍和表達(dá)?;蚬こ碳夹g(shù)是核酸操作技術(shù)的一部分,只不過(guò)它強(qiáng)調(diào)了外源核酸分子在另一種不同的寄主細(xì)胞中的繁衍與性狀表達(dá)?,F(xiàn)實(shí)上,這種跨越物種屏障、把來(lái)自其它生物的基因置于新的寄主生物細(xì)
2、胞之中的才干,是基因工程技術(shù)區(qū)別于其它技術(shù)的根本特征。重組DNA技術(shù)開(kāi)展史上的艱苦事件三大成就:一、在20世紀(jì)40年代確定了遺傳信息的攜帶者、即基因的分子載體是DNA而不是蛋白質(zhì),處理了遺傳的物質(zhì)根底問(wèn)題;二、50年代提出了DNA分子的雙螺旋構(gòu)造模型和半保管復(fù)制機(jī)制,處理了基因的自我復(fù)制和世代交替問(wèn)題;三、50年代末至60年代,相繼提出了“中心法那么和支配子學(xué)說(shuō),勝利地破譯了遺傳密碼,闡明了遺傳信息的流動(dòng)與表達(dá)機(jī)制。5.1 基因操作的根本工具一限制性核酸內(nèi)切酶可以識(shí)別DNA上的特定堿基序列并從這個(gè)位點(diǎn)切開(kāi)DNA分子。第一個(gè)核酸內(nèi)切酶EcoRI是Boyer實(shí)驗(yàn)室在1972年發(fā)現(xiàn)的,它能特異性識(shí)別
3、GAATTC序列,將雙鏈DNA分子在這個(gè)位點(diǎn)切開(kāi)并產(chǎn)生具有粘性末端的小片段。 圖5-1 幾種主要DNA內(nèi)切酶所識(shí)別的序列及其酶切末端。二基因克隆的載體 我們知道僅僅能在體外利用限制性核酸內(nèi)切酶和DNA銜接酶進(jìn)展DNA的切割和重組,還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足基因工程的要求,由于大多數(shù) DNA片段不具備自我復(fù)制的才干,只需將他們銜接到具備自主復(fù)制才干的DNA分子上,才干在寄主細(xì)胞中進(jìn)展繁衍。載體vector)是指具備自主復(fù)制的DNA分子,象病毒、噬菌體和質(zhì)粒等相對(duì)分子量較小的復(fù)制子均可以作為基因?qū)氲妮d體。載體三要素:自我復(fù)制才干;攜帶外源基因片段大小具有較小的分子量和較高的拷貝數(shù);插入位點(diǎn)多少具有假設(shè)干限制
4、酶單一識(shí)別位點(diǎn);易于鑒定識(shí)別具有抗菌素抗性基因大腸桿菌質(zhì)粒載體: 1、pSC101質(zhì)粒載體低拷貝數(shù)嚴(yán)緊型復(fù)制控制的大腸桿菌質(zhì)粒載體,平均每個(gè)寄主細(xì)胞僅有12個(gè)拷貝。長(zhǎng)9.09kb,帶有四環(huán)素抗性基因tetr及EcoRI、HindIII、BamHI、SalI、XhoI、PvuII以及SmaI等7種限制性核酸內(nèi)切酶的單酶切位點(diǎn),在HindIII、BamHI和SalI等3個(gè)位點(diǎn)插入外源基因,會(huì)導(dǎo)致tetr失活。大腸桿菌pSC101質(zhì)粒載體表示圖。是第一個(gè)真核基因克隆載體。缺陷:它是一種嚴(yán)緊型復(fù)制控制的低拷貝質(zhì)粒,從帶有該質(zhì)粒的寄主細(xì)胞中提取pSC101 DNA,產(chǎn)量很低。2、ColE1質(zhì)粒載體松弛型
5、復(fù)制控制的多拷貝質(zhì)粒。普通情況下,當(dāng)培育基中氨基酸被耗盡,或是在細(xì)胞培育物中參與氯霉素以抑制蛋白質(zhì)的合成,寄主染色體DNA的復(fù)制便被抑制,細(xì)胞的生長(zhǎng)也隨之停頓。而松弛型質(zhì)粒DNA卻繼續(xù)復(fù)制數(shù)小時(shí),使每個(gè)寄主細(xì)胞中ColE1質(zhì)粒的拷貝數(shù)到達(dá)10003000個(gè),占細(xì)胞總DNA的50%左右。3、pBR322質(zhì)粒載體由三個(gè)不同來(lái)源的部分組成的:第一部分來(lái)源于pSF2124質(zhì)粒易位子Tn3的氨芐青霉素抗性基因AmpR;第二部分來(lái)源于pSC101質(zhì)粒的四環(huán)素抗性基因tetr;第三部分那么來(lái)源于ColE1的派生質(zhì)粒pMB1的DNA復(fù)制起點(diǎn)ori。AmpR優(yōu)點(diǎn)是具有較小的分子量,其長(zhǎng)度為4 363bp。不僅易
6、于純化,而且即使攜帶上一段6-8kb的外源DNA片段,操作起來(lái)仍較為便利。具有兩種抗生素抗性基因以用作轉(zhuǎn)化子的選擇記號(hào)。有較高的拷貝數(shù),假設(shè)經(jīng)過(guò)氯霉素?cái)U(kuò)增,每個(gè)細(xì)胞中可累積10003000個(gè)拷貝,為重組體DNA的制備提供了極大的方便。4、pUC質(zhì)粒載體包括四個(gè)部分:(i)來(lái)自pBR322質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn)ori;(ii)氨芐青霉素抗性基因ampr;(iii)大腸桿菌-半乳糖酶基因lacZ的啟動(dòng)子及其編碼-肽鏈的DNA序列,此構(gòu)造特稱為lacZ基因;(iv)位于lacZ 基因中的接近5-端的一段多克隆位點(diǎn)MCS區(qū)段,外源基因插入后破壞了lacZ 基因的功能。優(yōu)點(diǎn): 更小的分子量和更高的拷貝數(shù)。在pB
7、R322根底上構(gòu)建pUC質(zhì)粒載體時(shí),僅保管下其中的氨芐青霉素抗性基因及復(fù)制起點(diǎn),其分子小了許多,pUC8為2750bp,pUC18為2686bp。由于缺失rop基因,pUC質(zhì)粒不經(jīng)氯霉素?cái)U(kuò)增時(shí),平均每個(gè)細(xì)胞即可達(dá)500700個(gè)拷貝。可用組織化學(xué)方法檢測(cè)重組體。pUC8質(zhì)粒構(gòu)造中具有來(lái)自大腸桿菌lac支配子的lacZ基因,所編碼的-肽鏈可參與-互補(bǔ)作用。因此,可用X-gal顯色法實(shí)現(xiàn)對(duì)重組體轉(zhuǎn)化子的鑒定。具有多克隆位點(diǎn)MCS區(qū)段,可以把具兩種不同粘性末端如EcoRI和BamHI的外源DNA片段直接克隆到pUC8質(zhì)粒載體上。5、 pGEM-3Z質(zhì)粒 長(zhǎng)度為2743bp,編碼有一個(gè)氨芐青霉素抗性基因
8、和一個(gè)lacZ基因。 含有兩個(gè)噬菌體啟動(dòng)子T7和SP6,為RNA聚合酶的附著作用提供了特異性的識(shí)別位點(diǎn)。參與T7或SP6 RNA聚合酶,所克隆的外源基因便會(huì)轉(zhuǎn)錄出相應(yīng)的mRNA。6、穿越質(zhì)粒載體shuttle plasmid vector 指由人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和選擇記號(hào),可在兩種不同的寄主細(xì)胞中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。由于這類質(zhì)粒載體可以保證外源DNA序列在不同物種的細(xì)胞之間得到擴(kuò)增,能在原核和真核細(xì)胞之間往返穿越,具有廣泛的用途。7、pBluescript噬菌粒載體 pBluescript是指由Stratagene公司開(kāi)展的一類從pUC載體派生而來(lái)的噬菌粒載體,簡(jiǎn)稱為pBS+/-
9、,如今那么更多地叫作pBluescript KS+/-或pBluescript SK+/-。SK表示多克隆位點(diǎn)區(qū)的取向,即lacZ基因是按照SacIKpnI的方向轉(zhuǎn)錄;+/ -表示單鏈?zhǔn)删wf1復(fù)制起點(diǎn)的兩種相反的取向。f1+起點(diǎn)表示當(dāng)pBluescript噬菌粒載體和輔助噬菌體共感染寄主細(xì)胞時(shí),可以回收到lacZ基因的有意義鏈DNA;而f1-起點(diǎn)那么表示當(dāng)pBluesript噬菌粒載體與輔助噬菌體共感染寄主細(xì)胞時(shí),可回收到lacZ基因的無(wú)意義鏈DNA。(i)在多克隆位點(diǎn)區(qū)MCS的兩側(cè),存在一對(duì)T3和T7噬菌體的啟動(dòng)子,用以定向指點(diǎn)插入在多克隆位點(diǎn)上的外源基因的轉(zhuǎn)錄活動(dòng);(ii)具有單鏈?zhǔn)删w
10、M13或f1的復(fù)制起點(diǎn)和一個(gè)來(lái)自ColE1質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn),保證pBluescript噬菌粒載體在有或無(wú)輔助噬菌體共感染的不同情況下,按照不同的復(fù)制方式分別合成出單鏈或雙鏈DNA;(iii編碼有一個(gè)氨芐青霉素抗性基因,作為轉(zhuǎn)化子克隆的選擇標(biāo)志;(iv)含有一個(gè)lacZ基因,可以按照X-gal-IPTG組織化學(xué)顯色法挑選噬菌粒載體的重組子。LacZ編碼-半乳糖苷酶氨基端146個(gè)氨基酸的-肽, IPTG異丙基- -D-硫代半乳糖苷誘導(dǎo)該基因表達(dá),合成的-半乳糖苷酶-肽能與宿主細(xì)胞所編碼的缺陷型-半乳糖苷酶相互補(bǔ),產(chǎn)生有活性的-半乳糖苷酶,能水解外源參與培育基中的X-gal5-溴-4-氯-3-吲哚-D-半乳糖苷,生成藍(lán)色的溴氯吲哚,使生長(zhǎng)于含X-gal培育基中的轉(zhuǎn)化菌落呈藍(lán)色。重組DNA操作過(guò)程表示圖圖5-2 DNA銜接酶能把不同的DNA片段銜接成一個(gè)整體 僅僅能在體外利用限制性核酸內(nèi)切酶和DNA銜接酶進(jìn)展DNA的切割和重組,還不能滿足基因工程的要求,只需將它們銜接到具備自主復(fù)制才干的DNA分子上,才干在寄
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