pnas科學(xué)家構(gòu)建腫瘤進化樹解析癌轉(zhuǎn)移機制-medsci

1、PNAS：科學(xué)家構(gòu)建腫瘤“進化樹”，癌轉(zhuǎn)移機制2016-9-13 作者：佚名 來源：生物探索 我要評論11Tags: 腫瘤 進化樹轉(zhuǎn)移導(dǎo)語：近期，PNAS期刊象?？茖W(xué)家們開發(fā)出一種了一篇文章揭示了同一腫瘤組織的細胞存在差異的現(xiàn)Canopy，可以通過分析細胞的外顯子數(shù)據(jù)獲取腫瘤的“進化史”，從而篩選出精確治療的生物標志物，有望實現(xiàn)個性化醫(yī)療、解決耐藥性問題。腫瘤學(xué)家認為，對患者的腫瘤樣本進行活檢可以獲取組織的生理學(xué)和組學(xué)信息。是一種順應(yīng)“適者生存”法則而發(fā)展的疾病。隨著病情的發(fā)展，腫瘤組織的細胞會不斷進化。即便是同一種，患者的腫瘤類型也存在差異。那么，如何實現(xiàn)個性化治療呢？來自種開源性醫(yī)學(xué)院和和

2、賓夕法尼亞大學(xué)Canopy，它可以通過分析細胞的的科學(xué)家們通過跨學(xué)科合作，開發(fā)出一拷貝數(shù)量變化和單核苷酸多態(tài)斷出腫瘤的進化史。研究團隊分析了多種，包括白血病、癌?？傮w而言，腫瘤的進化歷程與所有影響癌細胞命運的突變有關(guān)。同一腫瘤組織常常混合著多種不同的癌細胞系，它們在組成、表達和生理學(xué)上均有差異。這種異質(zhì)性會導(dǎo)致靶向治療，同時耐藥性問題。Canopy：繪制腫瘤的“進化樹”組學(xué)和生物信息學(xué)專業(yè)的博士生（音譯，Yuchao Jiang）、放射腫瘤學(xué)助理教授Andy Minn的博士后（音譯，Yu Qiu）和統(tǒng)計學(xué)Nancy R Zhang合作并將其研究成果在PNAS期刊。他們研究的亮點在于了同一腫瘤組

3、織不同位置、不同時間的多份樣本，并對這些樣本進行全外顯子分析。隨后，研究將包括正常組織、組織在內(nèi)的這些數(shù)據(jù)輸入Canopy，從而獲取腫瘤的“進化樹”。借助Canopy，腫瘤學(xué)家能夠更好地了解腫瘤的發(fā)展趨勢，以及篩選出腫瘤樣本中不同癌細胞的潛在生物標志物。這些生物標志物與耐藥性、侵襲性等有關(guān)聯(lián)，從而有助于早期患者得到準確的和預(yù)后。進化樹（來源：賓夕法尼亞大學(xué)）轉(zhuǎn)移機制同時，研究團隊以動物為模型，研究了的轉(zhuǎn)移機制。他們將人類細胞注入小鼠體內(nèi)，發(fā)現(xiàn)這些性會轉(zhuǎn)移至肺、骨骼或其他組織中，隨后對這些性癌細胞以及轉(zhuǎn)移癌細胞進行全外顯子組，分析它們之間的單核苷酸多態(tài)和拷貝數(shù)變化。結(jié)果顯示，相比于變模式。性癌細

4、胞，來自于不同組織的轉(zhuǎn)移性癌細胞型不同，且均有特定突通過將突變類型與腫瘤 “進化樹”的不同分支相匹配，腫瘤學(xué)家能夠腫瘤的轉(zhuǎn)移部位和嚴重程度，從而制定出更好的治療方案。將Canopy應(yīng)用于更大的樣本庫是團隊今后的主攻方向之一。研究表示，最近單細胞技術(shù)發(fā)展迅速，有望應(yīng)用于腫瘤研究中。但是，可靠的同步分析仍然處于初期階段。這一研究表明，傳統(tǒng)的大容量可以用于鑒定腫瘤亞克隆，大樣本對于腫瘤異質(zhì)性的研究很重要。未來，或以將大樣本與單細胞分析結(jié)合，用于挖掘疾病的致病機理和治療線索。原始出處：Jiang Y1, Qiu Y2, Minn AJ2, Zhang NR3.Assessingratumor heterogeneity and tracking longitudinal and spatial clonal evolutionary histo