生物資訊的使用

1、生物資訊的使用也許您不必將它當(dāng)成您的研究領(lǐng)域但您最好知道如何使用這個(gè)工具張猷忠陽(yáng)明大學(xué)生化所1何謂生物資訊？生物資訊有那些？相關(guān)文獻(xiàn)資料期刊報(bào)告、統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)、醫(yī)院病歷、專利資訊、辭典書(shū)籍等。核酸及蛋白質(zhì)序列基因體序列、cDNA序列、起動(dòng)子序列、轉(zhuǎn)錄因子序列等。分析工具軟體GCG, BLAST, FastA, 在不同人眼中的生物資訊(學(xué))：分子生物學(xué)家，遺傳學(xué)家結(jié)構(gòu)生物學(xué)家，藥物或藥理學(xué)家資訊學(xué)家2什麼是生物資訊學(xué)？BioinformaticsInfomation biology (Infobiology)Computational biologyBiologistInformaticistSta

2、tisticist3瞭解生物資訊的重要性可以知道有那些資訊是已知的可以知道在那裏可以找到這些資訊要知道如何使用這些資訊還要知道目前的潮流趨勢(shì)4瞭解生物資訊的重要性Genome projects500 viruses, 25 bacteria, Caenorhabditis elegans, Saccharomyces cerevisiae, Drosophila melanogaster; Human, mouse, rice, Post-genomic era Genomics, Drug discovery, Disease gene finding, Molecular evolutio

3、n, Biotechnology, Positional candidate cloning vs functional cloning5生物資訊的產(chǎn)生及累積期刊文獻(xiàn)報(bào)告科學(xué)期刊總數(shù)(ISI): 8,657hiv (PubMed): 89,174; 12 (1984); 8,235 (1999); 241 (1999, JV)基因體序列800 organismsEST(表現(xiàn)序列標(biāo)幟)February 19, 1999: 1,270,291 (human); 2,153,771July 28, 2000: 2,208,221 (human); 5,292,0226生物資訊的產(chǎn)生及累積8,604,

4、000,000 bases in 7,077,000 sequence records June, 20007生物資訊的整理及分析：以RSDB為例跨領(lǐng)域的合作 (中央、臺(tái)大及陽(yáng)明)資料的蒐集及提供序列分析程式軟體的開(kāi)發(fā)演算法的改進(jìn)及加快電腦運(yùn)算速度資料庫(kù)的建立搜尋引擎及查詢介面資料探採(cǎi) (基因的表現(xiàn)調(diào)節(jié)、基因體結(jié)構(gòu)、生物演化及分類)8生物資訊的獲得期刊、書(shū)籍等各類印刷品套裝應(yīng)用軟體程式各型新聞媒體各類書(shū)報(bào)討論會(huì)、研習(xí)會(huì)、研討會(huì)或各型學(xué)術(shù)會(huì)議網(wǎng)路上的各種生物資訊資源9個(gè)人電腦上的生物資訊軟體免費(fèi)軟體ISIS Draw, Array Viewer, Spotfinder, Lucy, Clusta

5、lW, Glimmer, Staden (Unix), AAT, MUMmer, Annotator, Assembler, btab, Blast2, 付費(fèi)軟體VectorNTI, MacVector, DNAsis, Plasmid Premier, Primer Premier 5, Array Disigner, Spotfire, 10網(wǎng)路上的生物資訊資料庫(kù)PDB, Genbank, EMBL, SwissProt, dbEST, HTGs, dbSTS, TransFac, PubMed, OMIM, TDB, KEGG, USPTO, 生物資訊學(xué)分析工具ExPASy, Stade

6、n, GCG, BCM launcher, Biology workbench, Deambulum, 教學(xué)網(wǎng)站，大學(xué)系所或公司網(wǎng)頁(yè)P(yáng)OST, 搜尋網(wǎng)站W(wǎng)ebBio, Biohunt, Nee-How, InFoseek, Yahoo, Alta Vista, GAIS, 11網(wǎng)路上的生物資訊：基因體計(jì)畫(huà)相關(guān)網(wǎng)站Sanger Ceter, Genome Research (DOE), Joint Genome Institute (DOE), Human genome center (LLNL), hgsc (BCM), TIGR, Human Genome Projecy (ELSI), G

7、enome Sequencing Ceter (wustl), NHGRI, Entrez Genome View (NCBI), The Human Transcript Map (NCBI), Genome Catalog (ORNL), Human Genome Advanced Annotation Tutorial, 12網(wǎng)路上的生物資訊：文獻(xiàn)查詢工具NCBI (National Center for Biotechnology Information): Entrez (PubMed)NHRI (National Health Research Institute): Hint E

8、xPASy: SeqAnalRefMedscape13網(wǎng)路上的生物資訊：序列的搜尋及取得NCBI (National Center for Biotechnology Information): EntrezEBI (European Bioinformatics Institute): SRSGenomeNet (Institute for Chemical Research, Kyoto University): DBGET/LinkDB, STAGDDBJ (DNA Data Bank of Japan, National Institute of Genetics):getentry:

9、 by accession numbersSfgate & WAIS: by key wordsSRS: by key words14網(wǎng)路上的生物資訊：序列分析工具免費(fèi)使用：BCM launcherExPASyDEAMBULUM需有帳號(hào)：GCGStadenBiology workbench15網(wǎng)路上的生物資訊：專利查詢工具Apipa: 工總提供書(shū)目式國(guó)內(nèi)專利公報(bào)查詢。無(wú)法針對(duì)化學(xué)結(jié)構(gòu)與DNA序列檢索。無(wú)全文資料。IPN, USPTO, EPO:利用網(wǎng)際網(wǎng)路查詢。無(wú)法針對(duì)化學(xué)結(jié)構(gòu)與DNA序列查詢。CA-STN, Beilstein:付費(fèi)資料庫(kù)，檢索費(fèi)用昂貴。無(wú)中華民國(guó)專利資料。16國(guó)內(nèi)現(xiàn)有生物資訊的資源生物資