學(xué)習(xí)部2015版必修課總結(jié)生物化學(xué)口腔生化by_第1頁
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文檔簡介

1、石頁版】北醫(yī)生化總結(jié)【By12 級口腔班】第一章:蛋白質(zhì)化學(xué):1. Isoelectric po,:等電點在某一值的溶液中,氨基酸解離負離子的趨勢相同,氨基酸以兼性存在,所帶的凈電荷為零,這個值叫做稱為氨基酸的等電點。2. Motif:模體多肽鏈中相鄰的幾個二級結(jié)構(gòu)在空間上相互接近,形成有規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)體,有的將這種規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)的體稱為超二級結(jié)構(gòu),它們可直接作為三級結(jié)構(gòu)的“建筑塊”或域結(jié)構(gòu)的組成,是蛋白質(zhì)發(fā)揮特定功能的基礎(chǔ),稱為模體或模序。3. Subunit:亞基組成寡聚蛋白的單條多肽鏈叫做寡聚蛋白的亞基,具有獨立的一、二、三級結(jié)構(gòu),單獨存在時一般無生物活性。(亞基之間以非共價鍵聯(lián)系,亞基

2、可以相同或不同。)4.:結(jié)構(gòu)域域結(jié)構(gòu)()是在較大的蛋白質(zhì)分子中所形成的兩個或多個在空間上可明顯區(qū)別的局部區(qū)域。結(jié)構(gòu)域具有獨特的空間構(gòu)象,與分子整體以共價鍵相連,并承擔(dān)特定的生物學(xué)功能。5. Molecular disease:分子病由于結(jié)構(gòu)改變,蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)中的關(guān)鍵氨基酸發(fā)生改變,從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)功能,出現(xiàn)相應(yīng)的臨床癥狀,這類遺傳性疾病稱為分子病。(由于蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病。)6.Allosteric effect:別構(gòu)效應(yīng)蛋白質(zhì)的特殊部位(調(diào)節(jié)位點)與小分子化合物(效應(yīng)物)結(jié)合后,引起空間構(gòu)象的改變,從而促使其生物化學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變的現(xiàn)象。包括正協(xié)同和負協(xié)同。7. Protein d

3、enaturation: 蛋白質(zhì)變性在某些物理、化學(xué)物活性喪失的現(xiàn)象。下,蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象被破壞(但其一級結(jié)構(gòu)不變),導(dǎo)致蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)改變、生重點內(nèi)容:1、結(jié)構(gòu)層次元素組成:C、H、O、N(16%)、S特點為含氮量均接近 16%結(jié)構(gòu):20 種 L- 氨基酸(脯氨酸不是 氨基酸,甘氨酸不是 L 氨基酸)可分為芳香族、含硫、酸性、堿性氨基酸等Ala Gly Val Leu Ile Pro Ser Cys Met Asn Gln Thre Trp Tyr Asp Glu Lys Arg His一級結(jié)構(gòu):肽鍵(帶雙鍵性質(zhì),形成肽平面);以多肽鏈為基本結(jié)構(gòu)形式;方向從 N 端指谷胱甘肽是以谷氨酸的

4、羧基成鍵)二級結(jié)構(gòu):穩(wěn)定力(氫鍵);( 螺旋, 折疊, 轉(zhuǎn)角(180回折部分),無規(guī)卷曲) 螺旋:右手螺旋;3.6 個 AA/圈,螺距 0.54nm;以平行于長軸的氫鍵維系;側(cè)鏈伸出螺旋 折疊:多肽鏈充分伸展,肽平面折疊成鋸齒狀;側(cè)鏈交錯位于鋸齒狀結(jié)構(gòu)的上下方;氫鍵維系:氫鍵的方向垂直長軸;可有順平行片層和反平行片層結(jié)構(gòu)。向 C 端。(注:三級結(jié)構(gòu)特點:進一步盤曲、折疊的多肽鏈分子長度大大縮短,呈棒狀、三級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性主要靠次級鍵維持,尤其是疏水鍵;狀或球狀;疏水基團多位于分子,親水基團多位于分子表面;分子表面或某些部位形成了發(fā)揮生物學(xué)功能的特定區(qū)域。四級結(jié)構(gòu)特點:以非共價鍵相聯(lián)系的多個亞基(

5、寡聚蛋白)2、重要性質(zhì):兩性解離及帶電狀態(tài)判定:-比較等電點與當前大小紫外吸收:Trp、Tyr 和e 在 280nm 波長附近具有最大吸收峰。Trp 的最大吸收是膠體,有水化層,沉淀、結(jié)絮(溶強酸堿)、凝固(不溶酸堿)變性:空間構(gòu)象被破壞,導(dǎo)致理化性質(zhì)改變、生物活性喪失,一級結(jié)構(gòu)不變,不一定沉淀顯色反應(yīng):茚三酮(氨基酸)、雙縮脲(蛋白質(zhì))3、分離純化:;鹽析;電泳;親和層析;離子交換層析;分子篩;超速離心。超濾:根據(jù)分子大?。畸}析(沉淀):破壞水化層/結(jié)合沉淀;電泳:利用電荷種類及數(shù)量,分子大小及形狀,溶液離子強度及離子交換層析:電荷、分子量、分子形狀親和層析:生物特性分子篩:(即為實驗做過的

6、凝膠過濾層析)大分子先洗脫下來4、結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系(舉例)蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系各種蛋白質(zhì)均有其特定功能,蛋白質(zhì)功能由其空間結(jié)構(gòu)決定,空間結(jié)構(gòu)由一級結(jié)構(gòu)決定,蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)和空間結(jié)構(gòu)均與蛋白質(zhì)的功能有關(guān)。一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ),一級結(jié)構(gòu)是生物功能的基礎(chǔ):結(jié)構(gòu)不同,功能不同;結(jié)構(gòu)相似,功能相似。蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)是其生物學(xué)活性的基礎(chǔ),構(gòu)象發(fā)生改變,其功能活性也隨之改變??臻g結(jié)構(gòu)體現(xiàn)生物活性:結(jié)構(gòu)相似,功能相似。3、分子病【經(jīng)典舉例】鐮形細胞貧血癥:編碼珠蛋白 鏈的結(jié)構(gòu)第六個子由 CTTCAT,相應(yīng)的多肽序列中 N 端的第六個氨基酸由 GluVla;其空間結(jié)構(gòu)發(fā)生相應(yīng)改

7、變,在表面形成互補區(qū),使蛋白質(zhì)分子之間彼此聚合,促使紅細胞在低氧壓下變形成鐮形,喪失氧的生物活性。4、蛋白構(gòu)象疾?。函偱2?,由于朊淀。蛋白(PrP)構(gòu)象改變導(dǎo)致蛋白質(zhì),形成抗蛋白水解酶的淀粉樣沉第二章:核酸:1. DNA denaturation:DNA 變性在某些理化作用下,DNA 分子互補堿基對之間的氫鍵斷裂,DNA 雙螺旋打開,變?yōu)閱捂湣?. melting temperature , Tm:融解溫度變性是在一個相當窄的溫度范圍內(nèi)完成,在這一范圍內(nèi),紫外光吸收值達到最大值的 50%時的溫度稱為 DNA的解鏈溫度,又稱融解溫度。3. Hypochromic effect:高色效應(yīng)變性DNA

8、 在波長 260 納米的光吸收增強的效應(yīng)叫做增色效應(yīng)。4. Nucleic acid hybridization:核酸分子雜交不同的DNA 單鏈分子或 DNA、RNA 分子放在一起,若二者序列完全互補或部分互補,則可形成雜合雙鏈分子。重點內(nèi)容:1、核酸的種類:RNA DNA2、核酸的分子組成:核苷酸(nucleotide)(戊糖 堿基磷酸)3、DNA 的二級結(jié)構(gòu):雙螺旋結(jié)構(gòu)模型反向平行雙鏈,右手雙螺旋:脫氧核糖-磷酸骨架位于外側(cè),堿基對位于內(nèi)側(cè), 10.5bp/圈,螺距為 3.54 nm堿基互補配對:AT 配對(二氫鍵),GC 配對(三氫鍵);堿基對平面垂直縱軸維持結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力量:氫鍵維持雙鏈

9、橫向穩(wěn)定,堿基堆積力維持螺旋縱向穩(wěn)定表面功能區(qū):小溝較淺;大溝較深,是蛋白質(zhì)識別 DNA 堿基序列的基礎(chǔ)3、DNA 的高級結(jié)構(gòu):超螺旋原核生物為負超螺旋真核細胞的基本結(jié)構(gòu)是核小體4、RNA 的空間結(jié)構(gòu):為單鏈結(jié)構(gòu),局部雙螺旋,形成局部發(fā)卡結(jié)構(gòu) or 莖環(huán)結(jié)構(gòu)5、mRNA 結(jié)構(gòu)特點:5加帽,3加尾,指導(dǎo)蛋白質(zhì)的氨基酸序列6、tRNA 結(jié)構(gòu)特點:1、含稀有堿基(DHU,假尿嘧啶,mG,mA);2、二級結(jié)構(gòu)為三葉草形;4 環(huán) 1 臂3、3末端為 CCA-OH, 連接氨基酸,4、三級結(jié)構(gòu)為倒“L” 形;7、rRNA 結(jié)構(gòu)特點:花束結(jié)構(gòu),形成多個發(fā)卡8、三類核糖核酸功能9、比較 DNA 和 RNA 組成

10、的異同點異:(1)核苷酸中的戊糖成分不同,DNA 為脫氧核糖,RNA 為核糖(2)嘧啶成分不同,DNA 為胞嘧啶和胸腺嘧啶,RNA 為胞嘧啶和尿嘧啶同:磷酸其余堿基10、理化性質(zhì)紫外線吸收 260nm 峰值變性:加熱,酸堿過強等解離??善茐木S持雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的堿基堆積力和氫鍵這兩種非共價鍵,導(dǎo)致雙鍵完全DNA 變性:二級結(jié)構(gòu)被破壞,雙螺旋,氫鍵斷開,無非共價鍵斷裂性質(zhì)改變:黏度降低,增色效應(yīng)(260nm 處光吸收增強),有一定溫度范圍(重點稱溶解溫度 Tm,此時 50%DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)被破壞),GC 含量越多、鏈越長、溶液離子強度越大,Tm 越高復(fù)性:DNA 變性可逆,在適宜條件下,如溫度、

11、恢復(fù)到生理范圍,分離的雙鏈 DNA可自動退火,再次互補結(jié)雙螺旋。雜交:不同來源的核酸變性后合并在一起只要核酸分子中含有可以形成堿基互補配對的序列,復(fù)性也會發(fā)生在不同來源的核苷酸堿形成雜化雙鏈。第三章:酶:(前五個比后面的重要)1、essential group:必需基團酶分子中與酶活性密切相關(guān)、不可缺少的化學(xué)基團稱必須基團。包括活性中心內(nèi)的必需基團和活性中心外的必需基團。2、active center:活性中心酶分子中必需基團相對集中,團兩類。一定空間結(jié)構(gòu)區(qū)域,與催化作用直接相關(guān),稱活性中心。包括結(jié)合和催化基3、proenzyme:酶原細胞內(nèi)和初的無活性的酶前身物稱酶原。4、isozyme:同

12、工酶催化相同的化學(xué)反應(yīng),但分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)和免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。5、allosteric enzyme:變構(gòu)酶一些代謝物可與某些酶分子活性中心外的某部分可逆的結(jié)合,使酶構(gòu)象改變,從而改變酶的催化活性,此種調(diào)節(jié)房事稱變構(gòu)調(diào)節(jié),受這種調(diào)節(jié)的酶稱變構(gòu)酶。6、enzyme:酶一類由活細胞產(chǎn)生,對其特異底物具有高效催化作用的蛋白質(zhì)。某些 RNA 也有酶活性7、zymogenactivation:酶原激活酶原在蛋白酶等作用下經(jīng)一定的加工剪切,使肽鏈重新折疊形成活性中心或的酶原變成有活性的酶的過程。出活性中心(本質(zhì)),從無活性8、酶活性:指酶催化特定化學(xué)反應(yīng)的能力??捎迷谝欢l件下其所催化某一化學(xué)反應(yīng)

13、的速度表示。重點內(nèi)容:酶的作用特點極高的催化效率高度專一性(特異性)【絕對專一性、相對專一性、酶活性可調(diào)性高度不穩(wěn)定性酶促反應(yīng)動力學(xué)結(jié)構(gòu)專一性】影響:酶濃度、底物濃度、溫度、激動劑、抑制劑作用物濃度S:雙曲線,初始S很低,V 隨S直線上升;隨S增高,反應(yīng)速度趨于緩和;S繼續(xù)增高,V 達到 Vmax。抑制劑:不可逆性抑制劑、可逆性抑制劑(競爭性、非競爭性、反競爭性)1、競爭性抑制、非競爭性抑制和反競爭性抑制作用的動力學(xué)特點各是什么?競爭性抑制:抑制劑的結(jié)構(gòu)與底物結(jié)構(gòu)相似,共同競爭酶的活性中心。抑制作用大小與抑制劑和底物的濃度比以及酶對他們的親和力有關(guān)。動力學(xué)特點Vmax 不變,表觀 Km 增大。

14、非競爭性抑制:抑制劑與底物結(jié)構(gòu)不相似或完全不同,只與酶活性中心以外的必需基團結(jié)合。不影響酶在結(jié)合抑制劑后再與底物的結(jié)合。該抑制作用的強弱只與抑制劑的濃度有關(guān)。動力學(xué)特點 Vmax 下降,表觀Km 不變。反競爭性抑制:抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合,生成的三元復(fù)合物不能解離出產(chǎn)物。動力學(xué)特點 Vmax 下降,表觀Km 下降。2、Km 有何意義?重要特征物理常數(shù),與酶濃度無關(guān)。不同的酶具有不同 Km 值物理意義:Km 等于酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。Km 值只是在固定的底物,一定的溫度和條件下,一定的緩沖體系中測定的,不同條件下具有不同的 Km 值。Km 值近似等于ES的解離常數(shù),可

15、表示酶與底物之間的親和力:Km 值大表示親和程度小,酶的催化活性低; Km值小表示親和程度大,酶的催化活性高從 km 可判斷酶的專一性和天然底物。 Km 最小的底物,通常就是該酶的最適底物,也就是天然底物。km 還可以推斷某一代謝物在體內(nèi)可能的代謝途徑。從 km 的大小,可以知道正確測定酶可。測定時,通常用 4km 的底物濃度即時所需的底物濃度。在進行酶第二階段重點在于代謝過程,對于第四章:糖代謝:1 glycolysis:糖酵解要求不深。在缺氧情況下,葡萄糖分解為乳酸的過程稱為糖酵解。Ps:* 酵解途徑(glycolytic pathway):葡萄糖轉(zhuǎn)變成 2 gluconeogenesis

16、:糖異生由非糖化合物轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛱窃倪^程稱糖異生。酸的過程。3 pentoseosate pathway:磷酸戊糖途徑6-磷酸葡萄糖經(jīng)氧化反應(yīng)及一系列入酵解途徑。glycogenolysis:糖原分解指肝糖原分解為葡萄糖的過程。glycogenesis:糖原轉(zhuǎn)移反應(yīng),生成 NH、CO2、核糖及 6-磷酸果糖和 3-磷酸甘油醛而進由葡萄糖糖原的過程稱為糖原。知識總結(jié):(本章要求不具體,僅留知識總結(jié)作參考)糖代謝的途徑包括:糖酵解、有氧氧化、磷酸戊糖途徑、糖異生、糖原Glc分解己糖激酶或葡萄糖酶 磷酸葡萄糖酶磷酸戊糖途徑糖原磷酸化酶G6PDG-6-PG-1-P磷酸變位酶F-1,6-P 酶UDP

17、-Glc直鏈糖原分支糖原UDP-Glc 焦磷酸化酶糖原合酶分枝酶/脫枝酶果糖異構(gòu)酶F-6-P果糖激酶 1F-1,6-P蘋果酸脫氫酶蘋果酸醛縮酶 丙糖異構(gòu)酶延胡索酸水合酶延胡索酸琥珀酸脫氫酶琥珀酸DHAPGD-3PGD-3P 脫氫酶1,3-BPGPG 激酶3-PGPG 變位酶2-PG琥珀酸輔酶 A琥珀酰輔酶 A酶 酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體 酮戊二酸烯醇化酶PEP酸激酶PEP 羧激酶草酰乙酸異檸檬酸脫氫酶異檸檬酸順烏頭酸水合酶檸檬酸酸羧化酶Pyruvate乳酸脫氫酶LaceAcytyl-CoA酸脫氫酶復(fù)合體草酰乙酸檸檬酸合酶一,糖酵解(本過程及其他具體過程自行參照1、基本過程:二個階段,共 10 步反

18、應(yīng)耗能階段:前五步反應(yīng)產(chǎn)能階段:后五步反應(yīng)2、特點(1)亞細胞定位:胞液課件輕松學(xué)習(xí) blabla)(2)二步耗能、二步產(chǎn)能(底物水平磷酸化);一步脫氫,生成 1 分子NADH高能化合物:1,3-二磷酸甘油酸,磷酸烯醇式酸。NADH 的利用:無氧時,用于還原酸生成乳酸;有氧時,用于生成ATP(1.5 或 2.5 個ATP/NADH)產(chǎn)能量:1 分子葡萄糖無氧酵解時凈生成 2 分子 ATP(3)三步單向反應(yīng)、三種關(guān)鍵酶己糖激酶:不受ATP/的調(diào)節(jié)磷酸果糖激酶 1(限速酶)(PFK-1) 抑制劑:檸檬酸,ATP/激活劑:2,6-二磷酸果糖(是由 PFK-2 在激素作用下調(diào)節(jié)活性生成)1,6-二磷酸

19、果糖(正反饋)酸激酶:受ATP/ 3、糖酵解的生理意義緊急供能:肌肉劇烈運動生理供能:紅細胞、視網(wǎng)膜、腦和骨髓等的抑制(3)病理供能:嚴重貧血、呼吸和循環(huán)功能二,糖的有氧氧化1.酸氧化脫羧部位:線粒體內(nèi)膜脫氫、脫羧同時進行,凈生成 1 分子 NADH中間物不脫離酶復(fù)合體,反應(yīng)單向進行(受參與反應(yīng)的原料產(chǎn)物及脂肪酸調(diào)節(jié))(4)=酸脫氫酶復(fù)合體組成:3 種酶、5 種輔酶酸脫氫酶:TPP=二氫硫辛酰胺轉(zhuǎn)乙酰酶:硫辛酸、輔酶A=二氫硫辛酰胺脫氫酶:FAD、NAD+三部位:線粒體(基質(zhì)、內(nèi)膜)4 步脫氫(3 個 NADH1 個 FADH2)、1 步底物水平磷酸化(GTP)1 個乙酰輔酶A 經(jīng)過TAC 生

20、成 10 個ATP1 個酸徹底氧化生成 CO2 和水時生成 12.5 個 ATP1 個葡萄糖徹底氧化生成 CO2 和水時生成 30 或 32 個 ATP(3)投入 1 個乙?;?,產(chǎn)出 2 個 CO2;中間物凈含量不變(4)1 種酶復(fù)合體( 酮戊二酸脫氫酶系),1 種呼吸鏈組成成分(琥珀酸脫氫酶)(5)3 種關(guān)鍵酶:后 2 種酶為主要調(diào)節(jié)酶(除ATP/檸檬酸合酶異檸檬酸脫氫酶(限速酶)酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體(由 3 種酶 5 種輔酶組成)循環(huán)中產(chǎn)物外 Ca+也可激活)(6)主要生理意義:高效供能;三大營養(yǎng)素最終代謝途徑;是相互轉(zhuǎn)變的代謝樞紐;供H+三,磷酸戊糖途徑1、部位:細胞液2、 2 步脫氫,

21、產(chǎn)出 2 個 NH3、關(guān)鍵酶:6-磷酸葡萄糖脫氫酶4、意義(1)生成磷酸核糖:提供核酸原料(2)生成NH:供代謝所需還原當量(*)維持紅細胞功能供生物轉(zhuǎn)化所需還原當量(3)連接 3C、4C、5C、6C、7C四,糖原分解:1、部位:細胞液2、關(guān)鍵酶:葡萄糖激酶/己糖激酶;糖原合酶*糖原合酶磷酸化后失活 3、活性葡萄糖:UDPG4、意義:(1)分解:1、部位:細胞液能量(2)維持血糖2、關(guān)鍵酶:糖原磷酸化酶;葡萄糖 6 磷酸酶*糖原磷酸化酶磷酸化后激活3、肌肉組織缺少葡萄糖 6 磷酸酶,故肌糖原不能補充血糖4、意義:(1)肌糖原供能(2)肝糖原維持血糖注:肌糖原分解為 G6P 之后直接進行糖酵解五

22、,糖異生1、部位:線粒體,細胞液,微粒體2、原料:甘油、生糖氨基酸、乳酸等3、關(guān)鍵酶:酸羧化酶:激活劑(乙酰 CoA)磷酸烯醇式酸羧激酶果糖二磷酸酶(限速酶):激活劑(檸檬酸);抑制劑(2,6-二磷酸果糖)葡萄糖 6 磷酸酶:糖原分解及糖異生途徑共有的關(guān)鍵酶4、肌肉缺少葡萄糖 6 磷酸酶,需進行乳酸循環(huán)5、主要生理意義:調(diào)節(jié)血糖總反應(yīng)式磷酸戊糖途徑3*6-磷酸葡萄糖+6N+ 2*6-磷酸果糖+3-磷酸甘油醛+6NH+H+3CO2第五章:脂代謝:(本章名解課件上提示不多,故以輕松學(xué)習(xí)為準)1.essential fatty acid:必需脂肪酸必需脂肪酸:必需但自身不能或,必須依賴食物供給的脂肪

23、酸,如亞油酸、亞麻酸和花生四烯酸。fat mobilization:脂肪動員在脂肪細胞中的甘油三酯,被脂肪酶逐步水解為游離脂肪酸及甘油并ketone body:入血以供其它組織氧化利用的過程。是肝臟中脂肪酸氧化的正常中間產(chǎn)物,由乙酰乙酸、羥丁酸和4.apoprotein:載脂蛋白組成。血漿脂蛋白中的蛋白質(zhì)部分。(血漿脂蛋白:血脂在血漿中與蛋白質(zhì)結(jié)合,以脂蛋白的形式)知識總結(jié):一,甘油三酯代謝1.脂肪動員:限速酶:甘油三酯脂肪酶(激素性敏感脂肪酶)脂解激素:(胰高血糖素、促腎上腺皮質(zhì)激素、腎上腺素、甲狀腺激素)抗脂解激素:(胰島素、素 E2)甘油代謝:經(jīng)糖途徑代謝(糖異生、糖分解)脂肪酸的 -氧

24、化:(肝肌肉發(fā)達、腦紅細胞不進行)氧化全過程分 4 個階段(活化、轉(zhuǎn)移、 氧化、乙酰 CoA 經(jīng)TAC 氧化)活化階段在胞液、轉(zhuǎn)移由胞液進線粒體基質(zhì)、氧化終產(chǎn)物是 CO2、H2O、ATP 氧化反復(fù)進行,其產(chǎn)物是乙酰 CoA 和 ATP轉(zhuǎn)移階段為限速步驟,肉堿脂酰轉(zhuǎn)移酶 I 為限速酶粒體基質(zhì)內(nèi)進行每氧化一次,少兩個 C 出一個乙酰 CoA 和一個 FADH2 一個 NADH:(肝細胞線粒體產(chǎn)生、心肌骨骼肌腦利用)4.限速酶:HMG 輔酶A原料及產(chǎn)物:乙酰 CoA(酶氧化生成),產(chǎn)出乙酰乙酸-羥丁酸意義:能源物質(zhì):腦組織、肌肉、心肌、腎。重要能源。具有水溶性,可通過血腦屏障,是腦組織的長期饑餓或者

25、是糖供給分解 終產(chǎn)物為乙酰 CoA時,將代替葡萄糖而成為腦和肌肉能量的主要來源。去向為腎肺排出或少量生成葡萄糖5.脂肪酸:(肝腦腎乳腺脂肪)1、飽和脂肪酸:乙酰 CoA 轉(zhuǎn)運、活化、(1)轉(zhuǎn)運:檸檬酸-、碳鏈加長酸循環(huán)(2)活化 部位:胞液原料:乙酰 CoA;活化形式:丙二酸限速酶:乙酰 CoA 羧化酶CoA激活劑:檸檬酸 抑制劑:長鏈脂酰 CoA:轉(zhuǎn)移、縮合、還原、脫水、再還原(3)部位:胞液原料:7 個丙酰 CoA+1 個乙酰 CoA直接產(chǎn)物:軟脂酸脂肪酸酶復(fù)合體:7 種酶+1 種 ACP還原當量:NH反應(yīng)重復(fù)進行,“加 3 減 1” (CO2)(4)碳鏈加長:以輔酶 A 為?;d體,NH

26、 提供還原當量內(nèi)質(zhì)網(wǎng)體系:“加 3 減 1” 線粒體體系:“加 2”葡萄糖與脂肪酸的相互轉(zhuǎn)化?葡萄糖能轉(zhuǎn)化為脂肪。糖酵解乙酰輔酶 A丙二酰輔酶 A脂肪酸的(偶數(shù))脂肪中的甘油能轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟牵嵬欠窨梢??),奇?shù)可以,因為乙酰輔酶A 不能夠進行糖異生作用。(肝生成的丙二,磷脂代謝甘油磷脂原料:脂肪酸、甘油、磷酸、含氮化合物(乙醇胺、膽堿)ATP途徑:甘油二酯(腦磷脂卵磷脂)CDP-甘油二酯(肌醇絲氨酸心磷脂)對應(yīng):腦磷脂(乙醇胺)+CH3=卵磷脂(膽堿)心磷脂=CDP-甘油二酯+磷脂酰甘油三,膽固醇代謝功能:參與細胞膜原料:乙酰 CoA N、轉(zhuǎn)化為類固醇激素膽汁酸 維生素D3 前體H+H+

27、關(guān)建酶:HMG-CoA 還原酶四,血漿脂蛋白代謝包括:甘油三酯、磷脂、膽固醇及其酯、游離脂肪酸功能:結(jié)合并運載脂類,穩(wěn)定脂蛋白結(jié)構(gòu)(基本)調(diào)節(jié)脂蛋白代謝關(guān)鍵酶活性參與脂蛋白的受體識別類型:乳糜微粒(CM):外源性甘油三酯(小腸粘膜上皮,其余為肝)極低密度脂蛋白(VLDL):內(nèi)源性甘油三酯到肝外組織低密度脂蛋白(LDL):轉(zhuǎn)運肝的內(nèi)源性膽固醇到肝外(血液中 VLDL 轉(zhuǎn)化)高密度脂蛋白(HDL):收集血液中膽固醇及磷脂運回肝臟(膽固醇的逆向轉(zhuǎn)運)1 個乙酰輔酶A 生成 10 個 ATP1 個酸生成 12.5 個ATP1 個葡萄糖生成 30 或 32 個 ATP1 個 FADH2 生成 1.5 個

28、ATP1 個 NADH 生成 2.5 個 ATP1 個軟脂酸生成 106 個 ATP第六章:生物氧化:1 oxidative res ratory chain: 氧化呼吸鏈起傳遞氫或電子作用的酶及輔酶稱為電子傳遞體,它們按一定的順序排列粒體內(nèi)膜上,組成遞氫或遞電子的鏈式反應(yīng)體系,稱為電子傳遞鏈,該體系進行的一系列與細胞攝取氧的呼吸過程相關(guān),故有稱為呼吸鏈。2 oxidativeosorylation: 氧化磷酸化代謝物氧化脫氫經(jīng)呼吸鏈傳遞給氧生成水的同時,伴有的磷酸化反應(yīng)偶聯(lián)發(fā)生,又稱偶聯(lián)磷酸化。磷酸化生成ATP 的過程為氧化磷酸化,因氧化反應(yīng)與知識總結(jié):1、ATP2、氧化呼吸鏈(見重點內(nèi)容)

29、3、能量積累:氫離子濃度梯度P/O:物質(zhì)氧化時,每消耗 1 摩爾氧原子所消耗的無機磷的摩爾數(shù),即生成ATP 的摩爾數(shù)。NADH 呼吸鏈 P/O=2.5FADH2 呼吸鏈 P/O=1.5產(chǎn)能部位:NADHCoQ, cyt bcyt c, cyt aa3O2能量指標:ATP4、氧化磷酸化 ATP 的生成:ATP 合酶復(fù)合體是 ATP的場所。氧化磷酸化后,NADH2.5ATP,F(xiàn)ADH2=1.5ATP化學(xué)滲透假說的要點:(1)H+不能通透線粒體內(nèi)膜;(2)線粒體內(nèi)膜的電子傳遞鏈中的復(fù)合物,具有質(zhì)子泵的功能,可利用遞氫體與遞電子體之間電子傳遞的能量驅(qū)動 H+由線粒體內(nèi)膜內(nèi)側(cè)定向遷移到膜外側(cè),從而(3)

30、質(zhì)子梯度具有電化學(xué)勢能,存在質(zhì)子回流線粒體內(nèi)膜內(nèi)的趨勢;粒體內(nèi)膜兩側(cè)形成質(zhì)子梯度;(4)質(zhì)子經(jīng)特定的質(zhì)子通道回流線粒體膜內(nèi)側(cè)時,可推動 ATP 合酶催化ATP。重點內(nèi)容:1、呼吸鏈的主要成分:呼吸鏈的組成:遞氫體和電子傳遞體(2H D 2H+ + 2e)。既由酶和輔酶組成分別是酰胺核苷酸類、蛋白類、鐵硫蛋白、輔酶 Q 和細胞色素類。2、簡述氧化呼吸鏈的傳遞順序。NADHFP(FMN)(Fe-S)CoQCyt bCyt c1Cyt cCyt aa3O2 FADH2FP(FMN)(Fe-S)3、 ATP 的生理作用ATP 是細胞最重要的高能磷酸酯類化合物。是生物能存在和利用的主要形式ATP 在一切

31、生物生命活動中都起重要作用,細胞核、細胞質(zhì)和線粒體中都存在有ATP3 ATP 是酶促磷酸基團轉(zhuǎn)移的“共同”4 ATP 是生物體內(nèi)主要的直接供能物質(zhì),是能量的攜帶者和轉(zhuǎn)運者,是生物體通用的能量貨幣。5 ATP 不是能量的者。在脊推動物中起能量作用的 ATP 原是磷酸肌酸4、ATP 氧化磷酸化主要抑制劑1、的調(diào)節(jié):是氧化磷酸化的主要調(diào)節(jié)者2、氧化磷酸化抑制劑的作用呼吸鏈抑制劑:抑制電子傳遞異戊巴比妥:抑制復(fù)合物 I 的 Fe-S 蛋白抗霉素A: 抑制 CytbCytc1(復(fù)合物)的電子傳遞、-:抑制cyt aa3O2解偶聯(lián)劑:使氧化磷酸化脫離2,4 二酚(DNP):破壞 H+梯度(3)ATP 合酶

32、抑制劑:抑制寡霉素:破壞H+回流的磷酸化和電子傳遞5、胞液中NADH 的氧化途徑胞液中的NADH 必須進入線粒體才可進入呼吸鏈氧化,而線粒體內(nèi)膜對NADH 不能運機制主要有 -磷酸甘油穿梭作用和蘋果酸-天冬氨酸穿梭作用。通透,需轉(zhuǎn)運。這種轉(zhuǎn)-磷酸甘油穿梭作用:胞液 NADH 中的一對氫原子通過胞液中磷酸甘油脫氫酶(輔酶為 NAD+)催化,轉(zhuǎn)移到 -磷酸甘油,后者經(jīng)內(nèi)膜外側(cè)的磷酸甘油脫氫酶(輔酶 FAD)作用,生成的磷酸二羥進入胞液繼續(xù)穿梭,而 FADH2 則進入 FADH2 氧化呼吸鏈被氧化,并產(chǎn)生 1.5 分子的 ATP。這種穿梭主要在腦、骨骼肌和肝等組織。 蘋果酸-天冬氨酸穿梭:在胞液和線

33、粒體內(nèi)蘋果酸脫氫酶(均以 NAD+為輔酶)的作用下,胞液中的 NADH 中的氫先被蘋果酸攜帶并進入線粒體,被線粒體內(nèi)的蘋果酸脫氫酶催化轉(zhuǎn)移給輔酶NAD+生成NADH,經(jīng) NADH 氧化呼吸鏈被氧化形成水,同時產(chǎn)生 2.5 分子 ATP。而生成的草酰乙酸經(jīng)天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶作用生成天冬氨酸,通過載體運出線粒體,再轉(zhuǎn)變?yōu)椴蒗R宜?,繼續(xù)穿梭作用。心肌中存在這種穿梭機制。第七章:蛋白質(zhì)代謝:1、essential amino acid:必需氨基酸體內(nèi)不能,必需由食物供給的氨基酸,包括:纈、異亮、苯丙、蛋、亮、色、蘇、賴。2、one carbon unit:一碳某些氨基酸代謝中產(chǎn)生的含有一個碳原子的基團。知

34、識總結(jié):1、氨基酸的消化吸收氮平衡:攝入氮=排出氮,即氮的“收支”平衡,反映正常成人的蛋白質(zhì)代謝情況。氨基酸的吸收:主動吸收 ( 谷氨酰基循環(huán):需谷胱甘肽)蛋白質(zhì)的作用:未被吸收的氨基酸及未被消化的蛋白質(zhì)在大腸菌中的代謝作用。組織蛋白質(zhì)的降解溶酶體內(nèi)降解:不依賴ATP依賴泛素的降解過程:依賴 ATP,泛素介導(dǎo) 2、氨基酸代謝脫氨基 氧化脫氨:L-Glu 脫氫酶轉(zhuǎn)氨基作用:轉(zhuǎn)氨酶(其輔酶為磷酸吡哆醛/胺)聯(lián)合脫氨基作用:轉(zhuǎn)氨基作用L-Glu 氧化脫氨聯(lián)合方式:氨基酸與 酮戊二酸的聯(lián)合嘌呤核苷酸循環(huán)(肌、心):參與的核苷酸:IMP、 酮酸的代謝: 生成非必需氨基酸、生糖或成脂生酮氨基酸:Leu、L

35、ys(不能生成葡萄糖)生酮兼生糖氨基酸: e、Tyr、Trp、Thr、Ile、GTP(供能)生糖氨基酸:其它氨基酸3、氨代謝氨的轉(zhuǎn)運:丙氨酸-葡萄糖循環(huán)、谷氨酰胺-谷氨酸循環(huán)氨的去路:尿素循環(huán)(鳥氨酸循環(huán))部位:線粒體、細胞液氨基酸類中間產(chǎn)物:鳥氨酸、瓜氨酸、天冬氨酸、精氨酸終產(chǎn)物:尿素關(guān)鍵酶:氨基甲酰磷酸酸酶酶(線粒體,激活劑為 N-乙酰谷氨酸,縮寫 AGA)精氨酸代琥珀尿素N 的來源:1、NH3;2、Asp的機制3、肝血氨升高NH3 入腦氨轉(zhuǎn)化為 Gln, 使 Glu 量降低 酮戊二酸轉(zhuǎn)變?yōu)?Glu,補充 Glu,故 酮戊二酸的量降低三不能正常進行ATP 生成下降腦內(nèi)供能4、脫羧作用: 氨

36、基酸脫羧酶(輔酶為磷酸吡哆醛)Glu氨基丁酸 His組胺 Trp5 羥色胺 cys?;撬?orn多胺5、一碳:Ser、Gly、His、Trp 載體為四氫葉酸直接供體為SAM6、個別氨基酸代謝Met:腎上腺素、肌酸、肉毒堿、精胺、精脒、膽堿、cys,等活性硫酸:PAPS(磷酸腺苷磷酸硫酸)以 cys 為原料Gly:嘌呤堿、血紅素、肌酸、結(jié)合膽汁酸、谷胱甘肽、一碳,等eTyr:兒茶酚胺(腎上腺素、去甲腎上腺素、多巴胺)、黑色素、甲狀腺素白化體內(nèi)缺少:酪氨酸酶苯尿癥:缺少苯丙氨酸羥化酶,應(yīng)控制e重點內(nèi)容:1、氨基酸脫氨基的主要方式;聯(lián)合脫氨基作用的特點氧化脫氨基作用、轉(zhuǎn)氨基作用、聯(lián)合脫氨基作用、(嘌

37、呤核苷酸循環(huán))聯(lián)合脫氨基有兩個途徑,一是氨基酸的 -氨基先通過轉(zhuǎn)氨基作用轉(zhuǎn)移到-酮戊二酸,生成相應(yīng)的 -酮酸和谷氨酸,然后谷氨酸在谷氨酸脫氫酶的催化下,脫氨基生成 -酮戊二酸的同時氨。二是嘌呤核苷酸循環(huán)的聯(lián)合脫氨基作用。因為大部分氨基酸不能直接氧化脫去氨基,而只有轉(zhuǎn)氨基作用是普遍存的在,但轉(zhuǎn)氨基作用并沒有最終脫掉氨基,所以體內(nèi)通過聯(lián)合脫氨基作用,使得蛋白質(zhì)降解的所有氨基酸都可以脫氨基生成氨,滿足機體脫氨基的需要。2、氨的代謝去路及尿素的特點來源:氨基酸脫氨(主要來源)腸道吸收,包括腸道內(nèi)氨基酸脫氨和尿素分解。腎小管上皮細胞氨酰胺分解去路:尿素(肝臟)谷氨酰胺非必需氨基酸以 NH4+隨尿排出體外

38、主要在肝臟的線粒體和胞液中進行;一分子尿素需消耗四分子 ATP;精氨酸的關(guān)鍵酶;尿素分子中的兩個氮原子,一個來源于NH3,一個來源于天冬氨酸。尿素代琥珀酸的特點:酶是尿素3、氨基酸的來源與去路;丙氨酸、天冬氨酸與谷氨酸與糖代謝、脂代謝的關(guān)系及基本過程來源:(1)食物消化吸收;(2)組織蛋白質(zhì)分解;(3)體內(nèi)非必需氨基酸。去路:(1)分解代謝(脫氨基脫羧基);(2)蛋白質(zhì);(3)轉(zhuǎn)變成其他含氮化合物。糖代謝:糖不僅是動物體內(nèi)的主要能源,而且也是重要的碳源。糖在分解代謝過程中產(chǎn)生的一系列 -酮酸如酸、-酮戊二酸、草酰乙酸等都可以作為氨基酸的碳鏈骨架,通過氨基化或轉(zhuǎn)氨基作用形成相應(yīng)的氨基酸。同樣,丙

39、氨酸、天冬氨酸與谷氨酸是生糖氨基酸通過脫氨基作用可以生成相應(yīng)酮酸,進入到糖代謝當中。/延糖異生途徑糖。脂代謝:脂肪動員產(chǎn)生甘油和脂肪酸,甘油可轉(zhuǎn)變?yōu)樗?,再轉(zhuǎn)變?yōu)椴蒗R宜峒?-酮戊二酸,然后接受氨基而轉(zhuǎn)變?yōu)楸彼?、天冬氨酸及谷氨酸。脂肪酸可通過 -氧化生成乙酰輔酶A,乙酰 CoA 進入 TAC 循環(huán)生成酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)榘被?。(不易發(fā)生)不生酮不成脂4、個別氨基酸脫羧基作用轉(zhuǎn)變生成的活性物質(zhì)見知識總結(jié)5、一碳一碳代謝的特點有兩個特點:不能在生物體內(nèi)以游離形式存在;必須以四氫葉酸為載體。四氫葉酸是其活性輔酶形式6、芳香族氨基酸代謝轉(zhuǎn)變生成的活性物質(zhì),該代謝異常時可能出現(xiàn)的遺傳病的生化特點苯丙氨酸-苯丙氨

40、酸羥化酶-酪氨酸多巴胺、腎上腺素、去甲腎上腺素、黑色素甲狀腺素色氨酸:5 羥色胺、維生素 PP白化?。汉谏丶毎欣野彼崦溉笔П侥虬Y:苯丙氨酸羥化酶缺失7、含硫氨基酸在體內(nèi)代謝轉(zhuǎn)變生成的活性物質(zhì)甲硫氨酸:SAM 提供活性甲基(與S 腺苷半胱氨酸循環(huán))肌酸、磷酸肌酸,(+精氨酸+甘氨酸)=肌酸酐半胱氨酸:胱氨酸(二硫鍵)PAPS 活性硫酸根(3-磷酸腺苷-5-磷酸硫酸)谷胱甘肽第八章:核酸代謝:1、de novo synthesis pathway:從頭利用磷酸核糖、氨基酸、途徑等簡單物質(zhì)為原料,經(jīng)過一系列酶促反應(yīng),核苷酸的途徑。2、salvage synthesis pathway:補救途徑利

41、用體內(nèi)游離的嘌呤或嘌呤核苷(嘧啶或嘧啶核苷),經(jīng)過簡單的反應(yīng),重新利用)途徑。核苷酸的過程,稱為補救(或知識總結(jié):1、嘌呤環(huán)的從頭原料:磷酸核糖、一碳部位:胞液、 CO2 、 Gly 、Asp 、Gln活性磷酸核糖形式:磷酸核糖焦磷酸(PRPP)兩個階段:首先IMP,再由 IMP 轉(zhuǎn)變成與 GMP在嘌呤核苷酸的過程中逐步嘌呤環(huán)調(diào)節(jié)酶:PRPP酶、PRPP 酰胺轉(zhuǎn)移酶2、嘌呤還的從頭原料:磷酸核糖、CO2 、 Asp、Gln部位:胞液兩個階段:首先UMP,再由 UMP 轉(zhuǎn)變成 CTP 與 dTMP胞嘧啶核苷酸的生成發(fā)生在三磷酸水平,由UTP 轉(zhuǎn)變?yōu)?CTP先嘧啶環(huán),再嘧啶核苷酸調(diào)節(jié)酶:磷酸核糖焦

42、磷酸酶(PRPP酶)、氨基甲酰磷酸酶(I 為尿素)重點內(nèi)容:1核苷酸的生理功能。DNA、RNA 的原料,這是體內(nèi)核苷酸最重要的功能。生物體的直接供能物質(zhì):ATP、GTP、UTP、CTP 等。主要為 ATP某些核苷酸的衍生物是多種生物質(zhì)CDP甘油二酯是甘油磷酯過程的活性中間物質(zhì): UDP葡萄糖是糖原的活性中間物質(zhì)等。的活性中間物環(huán)核苷酸 c與 cGMP 作為信息分子,參加物質(zhì)代謝和生理過程的調(diào)節(jié)。是某些輔酶(NAD+、N+、FAD、輔酶 A)的組成成分。2核苷酸從頭途徑中嘌呤、嘧啶環(huán)各元素或組件的材料來源。核糖核苷酸、脫氧核糖核苷酸的生成方式。嘧啶堿元素來源為谷氨酰胺(N3)、CO2(C2)-(

43、氨基甲酰磷酸),天冬氨酸(N1.C4-6)核糖核苷酸:見知識總結(jié)脫氧核糖核苷酸:由dUMP-dTMPGDP UDP CDP 直接還原3. 核苷酸補救有關(guān)的酶名稱、功能、酶缺陷相關(guān)的疾病。次黃嘌呤+PRPP 在 HGPRT 作用下生成 IM腺嘌呤+PRPP 在 APRT 作用下生成GPRT:次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶APRT:腺嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶腺嘌呤核苷 在腺苷酸激酶作用下由 ATP 提供磷酸 生成鳥嘌呤+PRPP 在 HGPRT 作用下生成 GMP意義:節(jié)能,節(jié)約蛋白質(zhì),某些不消耗 ATP,只能進行補救如腦和骨髓,從腺嘌呤核苷開始的要 ATP,用 PRPP 的自毀容貌癥:HGRPT缺失。

44、嘌呤過多,明顯的高尿酸血癥,痛風(fēng)伴大腦癱瘓、智力減退、舞蹈手足綜合征,身體和精神發(fā)育遲緩, 有咬指咬唇的強迫性自殘行為,.4核苷酸抗代謝藥物的作用機理及臨床意義。(摘)核苷酸抗代謝藥物是一些嘌呤、嘧啶、氨基酸或葉酸類似物,以競爭性抑制或“以假亂真”等方式干擾或阻斷核苷酸的代謝,進一步組織核酸以及蛋白質(zhì)的生物。腫瘤細胞的核酸及蛋白質(zhì)十分旺盛,因此這些抗代謝藥物具有抗腫瘤作用。1 嘌呤類似物:6-巰基嘌呤(6-MP)(次黃嘌呤類似物)作用機制: 6-MP抑制補救6-MP 核苷酸反饋抑制酰胺轉(zhuǎn)移酶抑制 IMP 和 GMP 的2 嘧啶類似物:5-氟尿嘧啶(5-FU)與胸腺嘧啶相似,途徑作用機制:其體內(nèi)

45、轉(zhuǎn)變產(chǎn)物為一磷酸脫氫核糖氟尿嘧啶(FdUMP)和三磷酸氟尿嘧啶核苷酸(FUTP),F(xiàn)dUMP 是胸苷酸核酶的抑制劑,使 dTMP3 氨基酸類似物:氮雜絲氨酸收到阻斷。FUTP 可以以 FUMP 形式摻入 RNA 分子,破壞 RNA 的結(jié)構(gòu)和功能作用機制:谷氨酰胺類似物,抑制谷氨酰胺參與反應(yīng)4 葉酸類似物:氨蝶呤和甲氨蝶呤(MTX)作用機制:競爭性抑制二氫葉酸5 核苷類似物:阿糖胞苷酶,因此抑制四氫葉酸的生成,干擾一碳代謝。作用機制:抑制核糖核苷酸還原酶,抑制 CDP 還原成 dCDP,也影響 DNA5核苷酸體內(nèi)分解代謝終產(chǎn)物。嘌呤:腺嘌呤-次黃嘌呤-黃嘌呤3基本過程:原核起始:DnaA 辨認起

46、始點DnaB 解旋酶DnaC 輔助SSB 單鏈結(jié)合蛋白 拓撲異構(gòu)酶B DnaG 引物酶延長:領(lǐng)頭鏈由聚合酶 III 直接,隨從鏈終止:切除引物、填補空缺、連接切口原核真核區(qū)別真核 1.2. 引物和速度是原核 1/10,的起始點多,雙向片段小于原核,引物為 10 個核苷酸,片段 100200 nt;原核引物十幾幾十個核苷酸,片段 10002000 nt。引物切除的酶不同(真核:RNaseH1, Fen1, 原核:Pol I)。3.4.5.需DNA 聚合酶和多種因子參加:、DNA發(fā)生在細胞周期的 S 期終止:末端與端粒酶3、逆轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄酶:RNA 指導(dǎo)的 DNA RNA 水解DNA 指導(dǎo)的 DNA

47、整合作用( egrase)無外切酶活性,轉(zhuǎn)錄錯誤率高4、DNA 損傷修復(fù)直接修復(fù):光修復(fù) (活酶)切除修復(fù):最有效的修復(fù)方式。(修復(fù)堿基、核苷酸)(重組修復(fù):(同源重組修復(fù) 非同源末端連接重組修復(fù))性干皮癥,無法修復(fù)損傷)SOS 修復(fù):DNA 嚴重受損后,應(yīng)急誘導(dǎo)產(chǎn)生的一系列復(fù)雜的修復(fù)反應(yīng)。第十一章:RNA:1、asymmetric transcription:不對稱轉(zhuǎn)錄以 DNA 為模板RNA 的過程。2、promoter:啟動子是轉(zhuǎn)錄起始位點上游的一段DNA 序列,是 RNA 聚合酶識別和結(jié)合的位置。3、Exon:外顯子在斷裂及初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中出現(xiàn),并表達為成熟 RNA 的核酸序列。4、 r

48、o:內(nèi)含子隔斷的線性表達,在剪接過程中被去除的核酸序列。5、Transcription bubble:轉(zhuǎn)錄泡RNA 聚合酶分子可以覆蓋 40bp 以上的 DNA 分子段落,轉(zhuǎn)錄解鏈范圍小于 20bp,產(chǎn)物 RNA 又和模板鏈配對形成長約 12bp 的 RNA/DNA 雜化雙鏈。這樣由酶-DNA-RNA 形成的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物,形象地稱為轉(zhuǎn)錄泡。6、Ribozyme:核酶 具有催化活性的 RNA知識總結(jié):(重點部分)1、轉(zhuǎn)錄起始于啟動子,有 RNA 聚合酶識別(上游)。終止子是可有 P 因子輔助,也可沒有2、轉(zhuǎn)錄后加工:mRNA 加工:原核是多順反子 mRNA,只要稍加工就好,真核 5末端加帽:7-甲

49、基鳥嘌呤3末端加尾:多聚A 尾反子 mRNA 要加工剪接作用:內(nèi)含子剪接和 mRNA 選擇性剪接(由于組織不同導(dǎo)致剪接結(jié)果不同) mRNA 編輯:少量改變序列甲基化修飾:tRNA 加工:剪接和剪切 3末端添加-CCArRNA 加工:剪接 甲基化修飾堿基修飾第十二章:蛋白質(zhì):(本章在課件中只提到第一個,其余的為補充) 1、Genetic Code:遺傳在 mRNA 分子的 ORF 區(qū),從 5端3端,每相鄰的 3 個核苷酸組成一組,在蛋白質(zhì)時,對應(yīng)某一種氨基酸,這就是遺傳。相鄰的三個核苷酸稱為子。2、Degeneracy:簡并性一種氨基酸對應(yīng)多個子的現(xiàn)象稱為簡并。3、Riome Cycle:核糖體

50、循環(huán)蛋白質(zhì)翻譯過程中,核糖體大小亞基聚合完成肽鏈起始、延長及終止過程后解離,它們還可以再聚完整的核糖體,開始新的肽鏈,循環(huán)往復(fù)的過程稱核糖體循環(huán)。4、frame shift muion : 移碼突變?nèi)缁蛉笔A基可導(dǎo)致移碼突變的現(xiàn)象稱閱讀框移位,或移碼突變。5、molecular chrone : 分子伴侶是細胞內(nèi)一類保守蛋白質(zhì),可識別肽鏈的非天然構(gòu)象,促進各功能域和整體蛋白質(zhì)的正確折疊。知識總結(jié):(重點部分)1、三類 RNA 在蛋白質(zhì)中的作用mRNA 模板tRNA 特異的“搬運工具”rRNA “裝配機”2、遺傳方向性連續(xù)性概念特點子的排列是從 mRNA 53端,起始在 5終止在 3子在 mRN

51、A 上連續(xù)排列 相鄰子無間斷無交叉可能導(dǎo)致移碼突變簡并性 多個子對應(yīng)一種氨基酸的現(xiàn)象通用性 所有生物均使用同一套子,說明各種生物在進化上具有同源性。擺動性 反子與子的配對:反向,不平行3、蛋白質(zhì)過程氨基酸的活化 氨基酸活化形成氨基酰-tRNA(高特異性,可校正)核糖體循環(huán)起始:起始復(fù)合物(核糖體大小、mRNA、起始 tRNA)Mg2+、GTP、起始因子延長:進位A 成肽 P 轉(zhuǎn)位 E 5 個 GTP終止:辨認終止子轉(zhuǎn)肽酶水解酶肽鏈脫離mRNA大小亞基分離真核與原核過程的異同4、蛋白質(zhì)后加工在分子伴侶輔助下折疊為天然構(gòu)象的蛋白質(zhì)二硫鍵形成,半胱氨酸氨基酸殘基的化學(xué)修飾 磷酸化 乙?;谆u基化

52、 糖基化亞基聚合、輔基連接定向輸送至特定位點:N 端結(jié)合信號肽,若至核則有核定位信號5、蛋白質(zhì)的干擾與抑制(非重點)抗腫瘤作用于過程,作用在轉(zhuǎn)錄,毒素作用于真核、抗生素作用于核糖體(原核為主)(四環(huán) 嘌呤)、干擾素抗第十三章:1、gene:表達調(diào)控負載特定遺傳信息的 DN段,包括:DNA 編碼序列、非編碼調(diào)節(jié)序列和內(nèi)含子序列。2、genome:組來自一個生物體的一整套遺傳信息稱為組。3、gene expres:表達就是轉(zhuǎn)錄及翻譯的過程,即攜帶的遺傳信息表達為 RNA 或蛋白質(zhì)產(chǎn)物的過程。4、operon :子由功能相關(guān)的一組在上串聯(lián),共同的一個轉(zhuǎn)錄,稱子。5、promoter :啟動子基礎(chǔ)元件

53、,決定的基本表達,稱啟動子。6、enhancer :增強子決定的組織特異性表達的正性調(diào)節(jié)元件,稱增強子。7、ciing element :順式作用元件可影響自身表達活性的DNA 序列,稱順式作用元件。8、traning factor :反式作用因子絕大多數(shù)真核轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子由它的編碼的轉(zhuǎn)錄,故稱反式作用因子。表達后,通過與特意的順式作用原件的識別,結(jié)合反式激活另一9、monocistron :反子一個結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄生成一個 mRNA 分子,編碼一條多肽鏈稱反子。10、polycistron:多順反子一個 mRNA 分子中攜帶了幾個多肽鏈的編碼信息。知識總結(jié):(重點部分)1、表達的規(guī)律、方式、生物學(xué)意義

54、規(guī)律:時間特異性(階段特異性) 空間特異性( 組織/細胞特異性)方式:組表達:是必不可少的,處于持續(xù)性表達。管家適應(yīng)性/調(diào)節(jié)性表達:可誘導(dǎo)(上)可阻遏(下)(housekeng gene)2、轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素特異 DNA 序列子(原核) 順式作用元件(真核)調(diào)節(jié)蛋白特異因子阻遏(激活)蛋白 基本轉(zhuǎn)錄因子特異轉(zhuǎn)錄因子(主反式作用因子) DNA(蛋白質(zhì))蛋白質(zhì)相互作用 順式作用元件與反式作用因子RNA 聚合酶 是調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)的最終體現(xiàn)3、原核轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點 因子決定 RNA 聚合酶識別的特異性子模型的普遍性原核4、乳糖結(jié)構(gòu)子受到阻遏蛋白的負性調(diào)節(jié)子結(jié)構(gòu)和作用機制、調(diào)節(jié)區(qū)、阻遏蛋白與啟動序列調(diào)節(jié)機制:

55、阻遏蛋白的負性調(diào)節(jié) 擋住 RNA 聚合酶(無乳糖)CAP 的正性調(diào)節(jié) CAP 蛋白結(jié)合在 RNA 聚合酶后,加強活性(無葡萄糖)協(xié)調(diào)調(diào)節(jié) 無葡萄糖有乳糖時乳糖子將有強轉(zhuǎn)錄活性5、真核結(jié)構(gòu)特點組結(jié)構(gòu)龐大反子一個 mRNA 含一條多肽鏈編碼重復(fù)序列多拷貝序列不連續(xù)性6、真核表達調(diào)控特點含多種 RNA 聚合酶:RNA pol I(rRNA 前體) II III(tRNA 小rRNA)活性結(jié)構(gòu)變化:對核酸酶敏感、拓撲異構(gòu)酶改變、DNA 堿基修飾、組蛋白變化正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo) 轉(zhuǎn)錄翻譯分隔進行轉(zhuǎn)錄后加工修飾7、真核mRNA 轉(zhuǎn)錄起始調(diào)節(jié)順式作用元件是轉(zhuǎn)錄起始的關(guān)鍵調(diào)節(jié)部位:啟動子增強子沉默子反式作用因子調(diào)節(jié)

56、的關(guān)鍵分子:基本、特異 其結(jié)構(gòu)為 DNA 結(jié)合域(鋅指亮氨酸拉鏈螺旋)轉(zhuǎn)錄激活域蛋白-蛋白結(jié)合域調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的動態(tài)是轉(zhuǎn)錄調(diào)控的主要方式:DNA 元件+調(diào)節(jié)蛋白第十四章:1、Homologous工程bination:同源重組發(fā)生在同源序列間的重組,通過鏈的斷裂和再連接,在 DNA 分子同源序列間進行片段交換,又稱基本重組2、DNA cloning:DNA 克隆應(yīng)用酶學(xué)方法,在體外將目的與載體 DNA 連接成具有自我能力的 DNA 分子,通過轉(zhuǎn)化/轉(zhuǎn)染/的方式導(dǎo)入宿主細胞,篩選出含目的的轉(zhuǎn)化子,再進行擴增、提取,獲得大量同一DNA 分子的過程。3、G enetic engineering:工

57、程是將外源通過體外重組后導(dǎo)入受體細胞內(nèi),使這個能在受體細胞內(nèi)、轉(zhuǎn)錄、翻譯表達的操作。4、Restriction Endonuclease:限制性核酸內(nèi)切酶識別和切割雙鏈 DNA 分子特異核苷酸序列的一類核酸酶。5、Polymerase chain reactioR (聚合酶鏈式反應(yīng))以雙鏈 DNA 分子為模板,以一對與模板互補的寡核苷酸為引物,在耐熱 DNA 聚合酶作用下,通過變性、退火、延伸循環(huán)過程DNA,經(jīng) 25-30 個循環(huán)實現(xiàn)目的 DNA 的大量擴增。6、Genomic DNA Library:組文庫把某種生物組文庫。組的全部遺傳信息通過克隆載體在一個受體菌克隆子群體中,這個群體即為這

58、種生物的7、cDNA library:cDNA 文庫以 mRNA 為模板,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄酶催化,在體外反轉(zhuǎn)錄成 cDNA,與適當?shù)妮d體(常用噬菌體或質(zhì)粒載體)連接后轉(zhuǎn)化受體菌,則每個細菌含有一段 cDNA,并能繁殖擴增,這樣包含著細胞全部 mRNA 信息的cDNA 克隆集合稱為該組織細胞的 cDNA 文庫。知識總結(jié):(重點部分) 1、主要工具酶限制性內(nèi)切核酸酶DNA 連接酶其他工具酶聚合酶反轉(zhuǎn)錄酶外切核酸末端轉(zhuǎn)移 堿性磷酸2、常用載體(克隆載體和表達載體)質(zhì)粒噬菌體標記大拷貝分子量小遺傳穩(wěn)定質(zhì)粒人工構(gòu)建的載體 兼具質(zhì)粒與噬菌體特性人工3、PCR 基本原理耐熱 DNA 聚合酶 引物鎂離子 dNTPbl

59、abla大家都知道變性: 94-95 度模板變性退火:溫度下降到比 Tm 低 5 度引物與模板結(jié)合延伸:72 度4、重組 DNA 基本過程DNA(工程基本原理)組文庫cDNA 文庫 PCR目的的獲取 化學(xué)載體的選擇與構(gòu)建克隆載體、表達載體目的與載體的連接重組 DNA 分子導(dǎo)入宿主細胞 轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)染、重組體的篩選 遺傳標記篩選法 序列、免疫轉(zhuǎn)導(dǎo)目的的表達第十五章:細胞信號傳導(dǎo):1、secondary messenger:第二信使在細胞內(nèi)傳遞信息的小分子物質(zhì),如:Ca2+、DAG、IP3、Cer (神經(jīng)酰胺)、c代謝產(chǎn)物等。、cGMP、花生四烯酸及其2、guanylate binding prote

60、in:G 蛋白是一類位于細胞膜胞漿面,與 GTP 或 GDP 相結(jié)合的蛋白質(zhì),由 a、b、g 三個亞基組成。3、calmodulin , CaM:鈣調(diào)蛋白有四個 Ca2+結(jié)合位點。與 Ca2+一起激活 CaM 激酶,磷酸化多種功能蛋白質(zhì)。4、signal transduction:信號轉(zhuǎn)導(dǎo)指細胞通過胞膜或胞內(nèi)受體感受信息分子的刺激,經(jīng)細胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)轉(zhuǎn)換,從而影響細胞生物學(xué)功能的過程。知識總結(jié):(重點部分)1、細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)體系的基本要素信號分子小分子親脂性 親水分子 親脂且只和膜受體結(jié)合(素)受體 核受體(類固醇激素 甲狀腺激素) 膜受體轉(zhuǎn)導(dǎo)體 (第二信使 c效應(yīng)體(AC) DAG IP3(

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