大數(shù)據(jù)sci基礎課

1、這是什么樣的餡餅，讓我來為大家下這類文章屬于數(shù)據(jù)挖掘類文章，通過分析別人的實驗高通實驗數(shù)據(jù)例如芯片或二代數(shù)據(jù)根據(jù)生物信息學方法來尋找這是什么樣的餡餅，讓我來為大家下這類文章屬于數(shù)據(jù)挖掘類文章，通過分析別人的實驗高通實驗數(shù)據(jù)例如芯片或二代數(shù)據(jù)根據(jù)生物信息學方法來尋找潛在重要的生物分子，可以作為診斷標志物或預后標志物2. 為什么用別人的數(shù)據(jù)還可章這些產生的海量大數(shù)據(jù)的上傳者一般是取某幾個重要的分子來研究來文章，因為精力有限，不可能把所有潛在的分子都研究一遍，但由于的文章必須 要數(shù)據(jù)庫，例如 GEO 數(shù)據(jù)庫。所以你可以挖掘這些 數(shù)據(jù)上傳你的原始數(shù)據(jù)到來發(fā)現(xiàn)新的潛在有價值的知識，這也是這類文章的原因和

2、新穎點。 當然你也發(fā)現(xiàn)這類文章影響因子在 1-2 之間，不高。這也是理所當然的，如沒有進一步實驗研究就能發(fā) 分以上的文章，那就是天上掉妹子的事了3. 完成這類文章要是做些首先，一個新的 idea，最好是別人在這方向沒有做類似你要做的工作。例如上面的肝癌已過了就不要做了。其次，一個新的分析方法，一般是構建生物網(wǎng)絡之類的，或根據(jù)新的生物信息學分析方法，如果這方法是你，那即使是研究的對象也是上述的肝癌也是能的最后就是寫作，其實仔細研究上面的文章發(fā)現(xiàn)也是一般的模版式或羅列式寫法。當然要寫的有新意也是不容易的。其中，可能最大的難點是數(shù)據(jù)的挖掘和分析。首先，要會用一些數(shù)據(jù)庫，例如 GEO其次，了解些基本的

3、分析方法，看懂分析結果的生物學含義。最后，就是實踐這些分析的過程，可能要編程。方向較少，所以本次公開投稿決定的方向是膽囊癌。特此邀請o 椰子同參這是GEO 數(shù)據(jù)庫中膽囊癌的數(shù)據(jù)通3-4周1 2 數(shù)據(jù)庫的這是GEO 數(shù)據(jù)庫中膽囊癌的數(shù)據(jù)通3-4周1 2 數(shù)據(jù)庫的具體講解，如數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)分析的方法和結果3目前會按照以上進度進行更新，當然可能也會有所變動。方法學重要，但寫作的思路和切入點也非常重要，關鍵點是為什么選擇膽囊癌，這是一個需要體會的東西，我會盡快錄制詳細有關寫作思路的，因為考慮到，況且文章尚未完工，防止一些耍小聰明的人，我會想個辦法呈現(xiàn)給大家，但相信感一定是可以看到的。的童鞋另一點，對于此次

4、只有2 位同學報名，感覺挺失落，大家跟帖表支持，我很欣再一點，帶著公開投稿的機會對于零基礎從來沒寫過 SCI 的童鞋來說，機會是十分難得的，既可以親身參與，又可以第一次SCI 文章以我一定會嚴格把關參與童鞋的真“零礎”的給零基礎童鞋學習，將會檢索該童鞋的情況，一些非零基礎的童鞋的行為。本欄寫的文章都是高效率的非實驗性文章，講究的是效率和高產，一般不需要耗費很多的體力和精力，所以每次公開投稿只一位即可，一切看第一次公開投稿的情況吧，如果不是很受歡迎，就不做了，畢竟也要花精力的。文獻調研：在pubed輸入allblddran本欄寫的文章都是高效率的非實驗性文章，講究的是效率和高產，一般不需要耗費很

5、多的體力和精力，所以每次公開投稿只一位即可，一切看第一次公開投稿的情況吧，如果不是很受歡迎，就不做了，畢竟也要花精力的。文獻調研：在pubed輸入allblddranermirarray。再輸入Gallbladder rotein-eraction0microarray和protein-eractionnetwork而hccmicroarray作為就2 查詢下而hccmicroarray作為就2 查詢下的膽囊癌的標志物的研究review3，數(shù)據(jù)集的來源文3，數(shù)據(jù)集的來源文geo 中及時更新，所以要通過人名和geo 中及時更新，所以要通過人名和4 Ma MZ 膽囊癌的文章，仔細比3 篇是geo

6、相符，文章的內容都是某個lincRNA實MaMZ4 Ma MZ 膽囊癌的文章，仔細比3 篇是geo 相符，文章的內容都是某個lincRNA實MaMZ是通過篩選從而得出他的lncrna 重點在于lncRNA，那么mRNA 這些Ma MZ 4，方法學上的創(chuàng)新3下期將更新 GEO 數(shù)據(jù)和分析篇章。鑒于上述講解對于零基礎從未接觸過大數(shù)據(jù)分析的童鞋來說鑒于上述講解對于零基礎從未接觸過大數(shù)據(jù)分析的童鞋來說，估計還是有點力，我會視大家的反應看是不是要進一步用手把手來做更詳細的講解。GEO 數(shù)據(jù)集和簡單分：v，2 種方法第一種（優(yōu)先原始數(shù)據(jù)數(shù)，2 種方法第一種（優(yōu)先原始數(shù)據(jù)數(shù)據(jù) cel 表達譜數(shù)據(jù)（矩陣形式）

7、12.1MINiMLformattedfamilyfile(s)中的GPL2.2SeriesMatrix12.1MINiMLformattedfamilyfile(s)中的GPL2.2SeriesMatrixFile(s)中的matrix以上就是所的文件格式，最后導入R 語言進行處理。以后的分析具體只有標有如的數(shù)據(jù)集才能在 數(shù)據(jù)庫上進行簡單的分1名稱即可：例如1名稱即可：例如2.2 3.1 2.2 3.1 3.3 和 3.3 和 44查查XX疾病背景，分析了geoXX疾病的數(shù)據(jù)，為了闡明其發(fā)生發(fā)展機制XX疾病背景，分析了geoXX疾病的數(shù)據(jù)，為了闡明其發(fā)生發(fā)展機制s Materialsand

8、Microarray ）singoftheMicroarray GOentandConstructthe XXidentificationofanetwork-basedConstructthe XXidentificationofanetwork-basedIdentificationofGOentandXX Key HYPERLINK http:/w/ 作sci*2預后分*3*miRNA-）*lncRNA-miRNA （）* 拷貝數(shù)-mRNA （，）* 甲基化-mRNA （甲基）* 轉錄因子）學到了這種文章的套路，不同與臨床性文章和meta分析，這是個目前還學到了這種文章的套路，不同與臨床性文章和meta分析，這是個目前還下兩個數(shù)據(jù)tcga，和oncemine 數(shù)據(jù)庫，是目前腫瘤最好數(shù)據(jù)庫，可以直接看