腫瘤分子診斷服務(wù)介紹培訓(xùn)課件

1、腫瘤分子診斷服務(wù)介紹腫瘤分子診斷服務(wù)介紹標(biāo)準(zhǔn)化用藥個體化用藥標(biāo)準(zhǔn)化用藥個體化用藥標(biāo)準(zhǔn)療法1標(biāo)準(zhǔn)療法2標(biāo)準(zhǔn)療法32腫瘤分子診斷服務(wù)介紹標(biāo)準(zhǔn)化用藥個體化用藥標(biāo)準(zhǔn)化用藥個體化用藥標(biāo)準(zhǔn)療法1標(biāo)準(zhǔn)療法2腫瘤藥物與相關(guān)靶標(biāo)3腫瘤分子診斷服務(wù)介紹腫瘤藥物與相關(guān)靶標(biāo)3腫瘤分子診斷服務(wù)介紹如何實現(xiàn)個體化用藥？分子分型 藥物療效4腫瘤分子診斷服務(wù)介紹如何實現(xiàn)個體化用藥？分子分型 藥物療效4腫瘤目前的服務(wù)目前的平臺目前的客戶腫瘤TaqMan-ARMs醫(yī)院感染性疾病測序健康管理公司新生兒篩查實時定量PCR研究所qPCR-HRM藥廠循環(huán)腫瘤細(xì)胞（CTC）保險公司5腫瘤分子診斷服務(wù)介紹目前的服務(wù)目前的平臺目前的客戶腫瘤T

2、aqMan-ARMs醫(yī)院體細(xì)胞基因突變檢測mRNA表達(dá)檢測循環(huán)腫瘤細(xì)胞（CTC)檢測基因多態(tài)性檢測6腫瘤分子診斷服務(wù)介紹體細(xì)胞基因突變檢測mRNA表達(dá)檢測循環(huán)腫瘤細(xì)胞（CTC)檢測體細(xì)胞基因突變檢測EGFR, K-RAS, B-RAF，C-KIT7腫瘤分子診斷服務(wù)介紹體細(xì)胞基因突變檢測EGFR, K-RAS, B-RAF，C-1、基因突變檢測技術(shù) qPCR-HRM（可用于血漿標(biāo)本檢測） Taqman-ARMS（與國際獲批的技術(shù)相當(dāng)） DNA測序（基因突變檢測的金標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)）8腫瘤分子診斷服務(wù)介紹1、基因突變檢測技術(shù) qPCR-HRM（可用于血漿標(biāo)本突變檢測技術(shù)之一 Taqman-ARMS 所有定

3、量PCR儀均可使用。 主要用于各類組織，包括手術(shù)、穿刺或鏡檢組織類。 2小時即可完成檢測 試劑盒商業(yè)化程度高，臨床認(rèn)可程度高 國內(nèi)已有試劑盒獲批SFDA9腫瘤分子診斷服務(wù)介紹突變檢測技術(shù)之一 Taqman-ARMS 所有定量PCR儀突變檢測技術(shù)之一 qPCR-HRM qPCR-HRM技術(shù)是基于高效穩(wěn)健的PCR上的高分辨熔解曲線分析（High-Resolution Melting）技術(shù)，靈敏度可以達(dá)到1%-0.1%，既能檢測已知突變，也能檢測未知突變。 qPCR-HRM的突變檢測已獲國際多中心雙盲實驗驗證（Journal of Molecular Diagnostics, Vol. 11, No

4、. 6, November 2009）。實例圖：利用HRM技術(shù)對7個樣本分別進(jìn)行EGFR（左圖）、KRAS（右圖）突變檢測，紅色表示該樣本發(fā)生突變，藍(lán)色表示未突變，藍(lán)色橫直線為陰性對照。左圖顯示2個樣本發(fā)生了EGFR突變；右圖顯示4個樣本發(fā)生了KRAS突變。EGFRKRAS10腫瘤分子診斷服務(wù)介紹突變檢測技術(shù)之一 qPCR-HRM qPCR- 血漿EGFR突變檢測： 18號外顯子：無突變19號外顯子：突變20號外顯子：無突變21號外顯子：無突變附圖主要特點： 實現(xiàn)血漿中來自腫瘤的微量DNA的突變檢測。 目前所做的臨床實驗中，血漿EGFR檢測結(jié)果與其手術(shù)標(biāo)本之間的整體符合率符合率達(dá)到91.25%

5、。 是臨床上不能手術(shù)、也同時不愿穿刺患者的替代檢測方案；也可 獲得性耐藥進(jìn)行預(yù)先檢測。qPCR-HRM用于血漿微量突變檢測11腫瘤分子診斷服務(wù)介紹 血漿EGFR突變檢測：主要特點：qPCR-HRM用于血漿微國際公認(rèn)的分子檢測金標(biāo)準(zhǔn)有明確的物價收費實驗流程較復(fù)雜，需要大型儀器突變檢測技術(shù)之一 DNA測序12腫瘤分子診斷服務(wù)介紹國際公認(rèn)的分子檢測金標(biāo)準(zhǔn)突變檢測技術(shù)之一 DNA測序12腫腫瘤類型靶向藥物基因療效佳的情況非小細(xì)胞肺癌易瑞沙（Iressa）特羅凱（Tarceva）EGFRKRASEGFR突變/KRAS野生 胃腸間質(zhì)瘤格列衛(wèi)（Gleevec）C-KitC-kit第11外顯子突變/PDGFR

6、突變 結(jié)直腸癌愛必妥KRASBRAF野生型突變檢測項目列舉13腫瘤分子診斷服務(wù)介紹腫瘤類型靶向藥物基因療效佳的情況非小細(xì)胞肺癌易瑞沙（IresEGFR突變檢測EGFR E19 / E21敏感突變 適合使用TKI藥物治療耐藥位點檢測T790M14腫瘤分子診斷服務(wù)介紹EGFR突變檢測EGFR E19 / E21敏感突變耐藥位K-RAS突變檢測15腫瘤分子診斷服務(wù)介紹K-RAS突變檢測15腫瘤分子診斷服務(wù)介紹BRAFNCCN 2010年NCCN結(jié)直腸癌臨床實踐指南指出： K-ras基因為野生型而同時具有BRAF V600E突變的患者，靶向EGFR抗體治療無效。BRAF-V600E檢測腫瘤學(xué)臨床實踐指

7、南（中國版）2010第一版16腫瘤分子診斷服務(wù)介紹BRAFNCCN 2010年NCCN結(jié)直腸癌臨床實踐指導(dǎo)腫瘤靶向治療的靶標(biāo)藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容檢測結(jié)果預(yù)測內(nèi)容吉非替尼/厄洛替尼EGFR基因突變野生型耐藥突變型敏感西妥昔單抗K-ras，B-raf基因突變野生型敏感突變型耐藥伊馬替尼C-Kit基因突變野生型耐藥突變型敏感17腫瘤分子診斷服務(wù)介紹指導(dǎo)腫瘤靶向治療的靶標(biāo)藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容檢測結(jié)果預(yù)測內(nèi)基因多態(tài)性檢測與藥物代謝毒性(UGT1A1,CYP,DPD)18腫瘤分子診斷服務(wù)介紹基因多態(tài)性檢測與藥物代謝毒性18腫瘤分子診斷服務(wù)介紹單核苷酸多態(tài)性（SNP）是最常見的基因變異至少1%的人群

8、絕大多數(shù)人群共有序列G to CSNP 位點變異的序列最常見的基因多態(tài)性 SNP10/3/202219腫瘤分子診斷服務(wù)介紹單核苷酸多態(tài)性（SNP）是最常見的基因變異至少1%的人群絕大為什么 SNPs 重要?個體 1個體 2= SNP variations in DNASNP標(biāo)志基因 A基因 B基因 ASNP 可能使基因 B 產(chǎn)生變異的蛋白質(zhì)分子10/3/202220腫瘤分子診斷服務(wù)介紹為什么 SNPs 重要?個體 1個體 2= SNP vari個體的SNP 譜SNP 譜ASNP 譜BSNP 譜CSNP 譜FSNP 譜ESNP 譜D10/3/202221腫瘤分子診斷服務(wù)介紹個體的SNP 譜SNP

9、 譜ASNP 譜BSNP 譜CSNP SNP 譜有助于確定藥物的療效和副作用乳腺癌病人個體的SNP 譜可以分成不同的類型SNP 譜 A對藥物有期望的反應(yīng)對藥物沒有期望的反應(yīng)SNP 譜 A的人對藥物有期望的反應(yīng)SNP 譜ESNP 譜 BSNP 譜 CSNP 譜D10/3/202222腫瘤分子診斷服務(wù)介紹SNP 譜有助于確定藥物的療效和副作用乳腺癌病人個體的SNP藥物代謝與SNP檢測化療藥物在體內(nèi)經(jīng)過吸收、代謝、分布和清除，通過其活性物質(zhì)對治療靶點的直接攻擊而發(fā)揮作用，整個過程需要多種蛋白質(zhì)/酶的共同參與和協(xié)同作用。SNP 主要是指在基因組水平上變異頻率大于1%的單核苷酸變異所引起的DNA序列多態(tài)

10、性，多態(tài)性會導(dǎo)致不同個體體內(nèi)各種蛋白，酶活性的差異，因此導(dǎo)致藥物使用情況的不同。23腫瘤分子診斷服務(wù)介紹藥物代謝與SNP檢測化療藥物在體內(nèi)經(jīng)過吸收、代謝、分布和清除膽紅素尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶基因（UGT1A1）UGT1A1*27(C686A)或UGT1A1*28(TA)7TAA: 野生型：6個TA UGT1A1*6(G211A)：使UGT1A1的轉(zhuǎn)錄活性下降了三分之二。導(dǎo)致對伊立替康的毒性增加。FDA提示：UGT1A1的多態(tài)性-伊立替康的毒性增加(6TA)此型的酶活性是野生型的49 。24腫瘤分子診斷服務(wù)介紹膽紅素尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶基因（UGT1A1）UGT1CYP19A1 多態(tài)

11、性影響芳香化酶抑制劑療效CYP19A1是芳香化酶的編碼基因，臨床研究已證實有著很大的影響作用。在接受芳香化酶抑制劑治療的乳腺癌患者中，攜帶CYP19A1基因rs4646（GT）突變患者的治療效果較無此突變的患者顯著2-4（下圖）。CYP19A1 rs4646（GT）SNP是乳腺癌患者接受芳香化酶抑制劑治療療效的有效預(yù)測指標(biāo)。 如圖一項對乳腺癌患者的臨床研究顯示：CYP19A1基因rs4646突變的患者使用芳香化酶抑制劑藥物療效明顯優(yōu)于野生型患者（p0.0001）1。參考文獻(xiàn)1. Ian ES et al. N Engl J Med. 2003;384:2431-42.2. Ramon C et

12、 al. Clin Cancer Res. 2008;14:811-6. 3. Lunardi G et al. J Clin Oncol. 2009; 27: 555. 4. Fasching PA et al. Breast Cancer Res Tr. 2008;112:89-98.25腫瘤分子診斷服務(wù)介紹CYP19A1 多態(tài)性影響芳香化酶抑制劑療效CYP19A1是基因表達(dá)檢測（mRNA表達(dá)）(ERCC1BRCA1TUBB3TS)26腫瘤分子診斷服務(wù)介紹基因表達(dá)檢測（mRNA表達(dá)）26腫瘤分子診斷服務(wù)介紹基因表達(dá)檢測指標(biāo)（靶向藥物）相關(guān)腫瘤藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容檢測結(jié)果預(yù)測內(nèi)容結(jié)直腸癌

13、貝伐單抗VEGFRmRNA表達(dá)水平高療效好低療效差乳腺癌曲妥珠單抗HER-2FISH/mRNA表達(dá)水平高療效好低療效差肝癌索拉非尼pDGFRmRNA表達(dá)水平低療效好高療效差27腫瘤分子診斷服務(wù)介紹基因表達(dá)檢測指標(biāo)（靶向藥物）相關(guān)腫瘤藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容28靶向藥物項目名稱樣本結(jié)果療效關(guān)系曲妥珠單抗HER2乳腺癌（手術(shù)/穿刺）+陽性療效好-HER2基因表達(dá)檢測采用RT-PCR方法替代FISH或免疫組化方法，臨床準(zhǔn)確率達(dá)97%以上。主要特點：客觀，不用人為觀察。時間短，整個檢測60分鐘左右完成。高通量，一次可以檢測6人份。28腫瘤分子診斷服務(wù)介紹28靶向藥物項目名稱樣本結(jié)果療效關(guān)系曲妥珠HER

14、2乳腺癌（手PDGFR 低表達(dá)患者的無進(jìn)展生存期和總生存期明顯長于高表達(dá)患者索拉菲尼檢測基因-PDGFR29腫瘤分子診斷服務(wù)介紹PDGFR 低表達(dá)患者的無進(jìn)展生存期和總生存期明顯長于高表貝伐單抗檢測基因-VEGFR30腫瘤分子診斷服務(wù)介紹貝伐單抗檢測基因-VEGFR30腫瘤分子診斷服務(wù)介紹化療藥物與檢測靶標(biāo)藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容奧沙利鉑/卡鉑/順鉑ERCC1/BRCA1mRNA表達(dá)水平5-FU/培美曲賽TSmRNA表達(dá)水平紫杉醇/多西紫杉醇/長春瑞濱STUBB3,STMN1mRNA表達(dá)水平替莫唑胺MGMTmRNA表達(dá)水平阿霉素/表柔比星TOPOamRNA表達(dá)水平吉西他濱RRM1mRNA表達(dá)水

15、平31腫瘤分子診斷服務(wù)介紹化療藥物與檢測靶標(biāo)藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容奧沙利鉑/卡鉑/順ERCC1表達(dá)與鉑類藥物療效相關(guān)的臨床數(shù)據(jù) ERCC1陰性患者，能從鉑類輔助化療中獲益.32腫瘤分子診斷服務(wù)介紹ERCC1表達(dá)與鉑類藥物療效相關(guān)的臨床數(shù)據(jù) ERCC1陰性患BRCA1/2表達(dá)與鉑類藥物療效相關(guān)的臨床數(shù)據(jù) BRCA1過度表達(dá)鉑類耐藥的預(yù)測因子 抗微管類藥物的敏感因子33腫瘤分子診斷服務(wù)介紹BRCA1/2表達(dá)與鉑類藥物療效相關(guān)的臨床數(shù)據(jù) BRCA1過 低TS mRNA水平的腫瘤患者接受氟類化療的效果較好，中位生存期較長。 TS低表達(dá)的患者對培美曲賽的療效好。TS高表達(dá)影響氟類和培美曲塞藥效Shir

16、ota Y et al. J Clin Oncol. 2001;19:4298-30434腫瘤分子診斷服務(wù)介紹TS高表達(dá)影響氟類和培美曲塞藥效Shirota Y et a化療藥物與檢測靶標(biāo)藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容檢測結(jié)果預(yù)測內(nèi)容奧沙利鉑/卡鉑/順鉑ERCC1/BRCA1mRNA表達(dá)水平高療效差低療效好5-FU/培美曲賽TSmRNA表達(dá)水平高療效差低療效好紫杉醇/多西紫杉醇/長春瑞濱STUBB3,STMN1mRNA表達(dá)水平高療效差低療效好替莫唑胺MGMTmRNA表達(dá)水平高療效差低療效好阿霉素/表柔比星TOPOamRNA表達(dá)水平高療效好低療效差吉西他濱RRM1mRNA表達(dá)水平高療效差低療效好35腫

17、瘤分子診斷服務(wù)介紹化療藥物與檢測靶標(biāo)藥物名稱檢測靶標(biāo)檢測內(nèi)容檢測結(jié)果預(yù)測內(nèi)容奧小 結(jié)36腫瘤分子診斷服務(wù)介紹小 結(jié)36腫瘤分子診斷服務(wù)介紹藥物名稱靶標(biāo)檢測內(nèi)容化療藥物鉑類ERCC1，BRCA1mRNA水平，2項XRCC1， GSTP1， MRP2基因多態(tài)性，4項（女，6項）BRCA1(女)異環(huán)磷酰胺CYP2C9*3基因多態(tài)性，1項絲裂霉素NQO1基因多態(tài)性，1項依托泊苷TopomRNA水平，1項CYP3A4*4 ,MDR1基因多態(tài)性，2項紫杉醇/多西紫杉醇/長春瑞濱TUBB3,STMN1mRNA水平，2項CYP8*3基因多態(tài)性，1項伊立替康UGT1A1*6, UGT1A1*28基因多態(tài)性，2項

18、吉西他濱RRM1mRNA水平，1項CDA基因多態(tài)性，1項培美曲賽TSmRNA水平，1項靶向藥物吉非替尼/厄洛替尼EGFR (Exon19/20/21)基因突變，3項西妥昔單抗K-ras , B-raf基因突變，3項EGFRmRNA水平，1項貝伐單抗VEGFRmRNA水平，1項NSCLC個體化用藥系統(tǒng)方案37腫瘤分子診斷服務(wù)介紹藥物名稱靶標(biāo)檢測內(nèi)容化療藥物鉑類ERCC1，BRCA1mRN腫瘤分子診斷服務(wù)介紹培訓(xùn)課件1 背景介紹之HNPCC與MMR MSI目前已發(fā)現(xiàn)的導(dǎo)致人類HNPCC發(fā)生的MMR有MSH2、MLH1、MSH6、PMS1、PMS2，其中MSH2和MLH1基因的功能最重要，其突變占已

19、發(fā)現(xiàn)突變的90%左右。39腫瘤分子診斷服務(wù)介紹1 背景介紹之HNPCC與MMR MSI目前已發(fā)現(xiàn)的導(dǎo)致人類1 背景介紹之HNPCC與MMR MSI研究顯示， 約有86%-95%的HNPCC具有MSI特征， 而散發(fā)型大腸癌中只有16%。 MSI所產(chǎn)生的遺傳不穩(wěn)定性將加速惡性腫瘤的發(fā)生。1997年美國NCI (national cancer institution)將MSI確定為檢測和篩選HNPCC的重要方法之一，并推薦將BAT26、BAT25、D2S123、D5S346和D17S250 5個位點作為檢測HNPCC的位點。40腫瘤分子診斷服務(wù)介紹1 背景介紹之HNPCC與MMR MSI研究顯示，

20、約有86實驗室檢測流程41腫瘤分子診斷服務(wù)介紹實驗室檢測流程41腫瘤分子診斷服務(wù)介紹HNPCC檢測項目檢測名稱檢測技術(shù)臨床意義MSI（5個位點）PCR+片段分析法HNPCC風(fēng)險評估明確是否檢測MMR突變MLH1,MSH2,MSH6基因突變檢測（35個外顯子）DNA測序HNPCC鑒別診斷確定突變位點，評估家族中高危個體風(fēng)險熱點突變檢測DNA測序確定家族中是否存在已知的突變42腫瘤分子診斷服務(wù)介紹HNPCC檢測項目檢測名稱檢測技術(shù)臨床意義MSI（5個位點）標(biāo)本要求檢測名稱標(biāo)本要求MSI檢測病理蠟塊一份（或白片10片），外加5ml抗凝外周血，4度運達(dá)MLH1,MSH2,MSH6基因突變檢測病理蠟塊一

21、份（或白片10片），常溫運達(dá)熱點突變檢測5ml抗凝外周血，4度運達(dá)43腫瘤分子診斷服務(wù)介紹標(biāo)本要求檢測名稱標(biāo)本要求MSI檢測病理蠟塊一份（或白片10片腫瘤在變We can look at tumors for changes at the DNA, RNA and protein levels. It certainly gives us a way of looking at what is happening inside a tumor, and thats very exciting. Dr. Gordon MillsChair Systems BiologyMD Anderson C

22、ancer CenterHouston, TxAs reported in“The Cancer Test” TIME (June 14, 2007)/time/magazine/article/0,9171,1633070,00.html44腫瘤分子診斷服務(wù)介紹腫瘤在變We can look at tumors for循環(huán)腫瘤細(xì)胞 1869年 Aust Med J，Ashworth最早在轉(zhuǎn)移性癌癥患者血液中觀察到。2005年 N Engl J Med，Cristofanilli證實治療前CTC數(shù)目是轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者無進(jìn)展生存期和總生存期的獨立預(yù)測因子。 循環(huán)腫瘤細(xì)胞指從實體瘤中脫離出來并進(jìn)入

23、外周血液循環(huán)的腫瘤細(xì)胞。原發(fā)腫瘤血管生成侵潤侵入血管內(nèi)侵入血管外(CTC)血管內(nèi)增殖(CTM)轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)移播散腫瘤細(xì)胞（DTC）微轉(zhuǎn)移休眠灶循環(huán)腫瘤細(xì)胞（CTC）循環(huán)腫瘤微栓（CTM）凋亡的CTC侵潤腫瘤細(xì)胞擴(kuò)增血管生成上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT）間質(zhì)上皮轉(zhuǎn)化（MET）轉(zhuǎn)移到骨髓和其他器官45腫瘤分子診斷服務(wù)介紹循環(huán)腫瘤細(xì)胞 循環(huán)腫瘤細(xì)胞指從實體瘤中脫離出來并進(jìn)入外周獲取CTC需要解決的技術(shù)問題從紅細(xì)胞和白細(xì)胞中富集惡性腫瘤細(xì)胞將惡性腫瘤細(xì)胞與紅細(xì)胞、白細(xì)胞、正常上皮細(xì)胞、造血干細(xì)胞等區(qū)分開來每10mL血液中可能僅含有幾個到幾十個循環(huán)腫瘤細(xì)胞，而10mL血液中含有的白細(xì)胞約有1億個，紅細(xì)胞有500億個。

24、46腫瘤分子診斷服務(wù)介紹獲取CTC需要解決的技術(shù)問題從紅細(xì)胞和白細(xì)胞中富集惡性腫瘤細(xì)三種技術(shù)過濾法ISET: Isolation by Size of Epithelial Tumor cells8m孔徑過濾膜，漏檢體積較小的腫瘤細(xì)胞敏感性低梯度密度法腫瘤細(xì)胞和單核細(xì)胞密度小于1.077g/mlCTC純度低，混入較多白細(xì)胞腫瘤細(xì)胞會遷移至血漿層，而聚集后容易下沉聚蔗糖-泛影葡胺(Ficoll-Hypaque)對細(xì)胞有毒性免疫磁珠法腫瘤細(xì)胞表面抗原EpCAM與包繞著磁珠的特異性單抗相結(jié)合CellSearch細(xì)胞保存方法長達(dá)96小時實驗室室間差異小EpCAM的假陽性和假陰性47腫瘤分子診斷服務(wù)介紹三種技術(shù)過濾法ISET