PubMed使用詳解醫(yī)學(xué)課件

1、1PubMed數(shù)據(jù)庫1PubMed數(shù)據(jù)庫2 NCBI(美國生物技術(shù)信息中心）網(wǎng)址:NCBI是美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)下屬的一個機(jī)構(gòu)。NCBI創(chuàng)建了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中最著名的信息檢索系統(tǒng)。2 NCBI(美國生物技術(shù)信息中心）網(wǎng)址:http:/ww3NCBI生物醫(yī)學(xué)檢索系統(tǒng)(Entrez)Pubmed：生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫；Nucleotide：核苷酸序列數(shù)據(jù)庫；Protein：蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫；Genome：完整的基因組匯編；Structure：大分子三維結(jié)構(gòu)；PMC：數(shù)字化生物醫(yī)學(xué)期刊存儲與檢索系統(tǒng)Taxonomy：分類學(xué)數(shù)據(jù)庫；OMNI；孟德爾人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫；Books：生物醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)版圖書。

2、3NCBI生物醫(yī)學(xué)檢索系統(tǒng)(Entrez)Pubmed：生物4NCBI生物醫(yī)學(xué)檢索系統(tǒng)(Entrez)4NCBI生物醫(yī)學(xué)檢索系統(tǒng)(Entrez)5 NCBI網(wǎng)站 ()5 NCBI網(wǎng)站 (http:/www.ncbi.nlm.6PubMed主頁6PubMed主頁71. Pubmed簡介NCBI于97年5月推出，Internet用戶免費檢索。檢索全世界生物醫(yī)學(xué)期刊論文的重要工具；學(xué)科覆蓋范圍： 臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、牙科學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、藥理學(xué)、環(huán)境和公共衛(wèi)生。收錄文獻(xiàn)的時間范圍： 1948- Update everyday (Tuesday - Saturday)71. Pubmed簡介NCBI

3、于97年5月推出，Inte81. Pubmed簡介摘要型(Abstract)的數(shù)據(jù)庫, 提供文獻(xiàn)的線索；部分文獻(xiàn)（約5%）提供免費全文(鏈接網(wǎng)上免費資源或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)庫中的全文。 81. Pubmed簡介摘要型(Abstract)的數(shù)據(jù)庫91. Pubmed簡介來源期刊 5000多種 English 約4800 （約占85%) Chinese French Japanese Italy Germany期刊論文發(fā)表時所用的語言91. Pubmed簡介來源期刊 5000多種 期刊論文發(fā)10PubMed中的非英文文獻(xiàn)10PubMed中的非英文文獻(xiàn)11PubMed主頁基本檢

4、索 主題詞檢索11PubMed主頁基本檢索 主題詞檢索123、PubMed檢索基本檢索 簡單檢索 高級檢索主題詞檢索智能檢索123、PubMed檢索基本檢索133.1 PubMed基本檢索簡單檢索檢索詞的輸入形式：（1）單詞、短語、縮寫 如，interleukin；stomach cancer；AIDS（2）著者姓名：如，Smith W （3）期刊相關(guān)信息：刊名全稱、縮寫、ISSN 如，Cancer Research、JAMA1 PubMed基本檢索簡單檢索檢索詞的輸入形式143.1 PubMed基本檢索檢索規(guī)則邏輯運算 and(空格)、or、not詞語檢索 “si

5、ngle cell”；“l(fā)iver cancer”截詞檢索 bacter*， disease? bacter disease bacteria diseases bacterium作者檢索 smith ja; jones k julia s wong; wong julia s(2002年始） 143.1 PubMed基本檢索檢索規(guī)則邏輯運算 a15例: 肝癌的化學(xué)療法15例: 肝癌的化學(xué)療法16例: 肝癌的化學(xué)療法16例: 肝癌的化學(xué)療法173.1 PubMed基本檢索高級檢索173.1 PubMed基本檢索高級檢索183.1 PubMed基本檢索高級檢索字段限定檢索183.1 PubMed

6、基本檢索高級檢索字段限定檢索19 PubMed檢索字段 19 PubMed檢索字段 203.1 PubMed基本檢索 Limits功能1)字段限定檢索2)限定文獻(xiàn)類型、語種、出版日期、年齡、性別、研究對象等203.1 PubMed基本檢索 Limits功能1)21Limits功能 （限定檢索）21Limits功能 （限定檢索）22字段限定22字段限定23 Limits：限定文獻(xiàn)類型、語種、出版日期、年齡、性別、研究對象等23 Limits：限定文獻(xiàn)類型、語種、出版日期、243.1 PubMed基本檢索檢索歷史243.1 PubMed基本檢索檢索歷史25查看檢索歷史，進(jìn)行邏輯運算25查看檢索歷史

7、，進(jìn)行邏輯運算263.1 PubMed基本檢索實例1、哮喘治療(限定題目字段)的英文綜述文獻(xiàn)2、近五年來中國研究者發(fā)表的有關(guān)Aids病研究的文獻(xiàn)263.1 PubMed基本檢索實例1、哮喘治療(限定273.2 PubMed主題詞檢索(MeSH）273.2 PubMed主題詞檢索(MeSH）28什么是主題詞(MeSH詞)?主題詞是經(jīng)人工規(guī)范化處理的最能表達(dá)文章主題概念的語詞。所謂規(guī)范化處理，就是在文獻(xiàn)存儲時，對文獻(xiàn)中的同義詞、近義詞、多義詞等加以嚴(yán)格的控制和規(guī)范，使得同一主題概念的文獻(xiàn)相對集中在一個主題詞下。 主題詞 關(guān)鍵詞 Neoplasms neoplasm、tumors、tumor、can

8、cer Aspirin aspirin、acetylsalicylic acid、 micristin、 solprin28什么是主題詞(MeSH詞)?主題詞是經(jīng)人工規(guī)范化處理的最29 Medical Subject Headings, MeSH字順表(2萬多個醫(yī)學(xué)詞匯) 如:aspirin,hepatitis,asthma等 樹狀結(jié)構(gòu)表（分類表） 16大類副主題詞表（80多個副主題詞）29 Medical Subject Headings,30MeSH字順表30MeSH字順表31MeSH樹狀結(jié)構(gòu)(Tree Structures)31MeSH樹狀結(jié)構(gòu)(Tree Structures)32MeS

9、H副主題詞表(Subheadings)Abnormalities、Administration & Dosage、Adverse Effects、Analysis、Anatomy & Histology、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、DiagnosisDiagnosis use、Diet therapy、Drug therapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Ps

10、ychology、Surgery、Therapeutic Use、Therapy.32MeSH副主題詞表(Subheadings)Abnorm33MeSH的標(biāo)引和檢索MeSH應(yīng)用 PubMed（Medline） 中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBMdisc) 醫(yī)學(xué)搜索引擎標(biāo)引人員根據(jù)文章的內(nèi)容，給出多個MeSH詞，以確切描述一篇文章內(nèi)容的重點。檢索人員根據(jù)檢索需求，選擇相關(guān)MeSH詞進(jìn)行檢索。33MeSH的標(biāo)引和檢索MeSH應(yīng)用34例:肝癌的手術(shù)治療34例:肝癌的手術(shù)治療35例:肝癌的手術(shù)治療35例:肝癌的手術(shù)治療36363737383839MeSH詞檢索的特點不必考慮自由詞的各種變化形式，提高檢索

11、效率。可以很容易地檢索寬廣的概念，提高查全率；MeSH詞一般都反映了記錄較為重要的內(nèi)容，具有較高的檢準(zhǔn)率；可以選用相關(guān)的副主題詞進(jìn)行組配，對檢索進(jìn)行限定。39MeSH詞檢索的特點不必考慮自由詞的各種變化形式，提高檢40舉例:消化系統(tǒng)疾病的CT診斷擴(kuò)展主要主題40舉例:消化系統(tǒng)疾病的CT診斷擴(kuò)展41 3.3 PubMed的智能檢索41 3.3 PubMed的智能檢索42詞語自動匹配，優(yōu)化檢索策略自由詞和MeSH詞聯(lián)合42詞語自動匹配，優(yōu)化檢索策略自由詞和MeSH詞聯(lián)合43PubMed智能檢索原理對于輸入檢索框中的非限定檢索詞，系統(tǒng)將依次到MeSH詞轉(zhuǎn)換表、刊名轉(zhuǎn)換表、短語表以及作者索引表中進(jìn)行詞

12、語匹配查找。檢索詞加入有些限定（如字段限止, 引號等），自動匹配檢索功能關(guān)閉。 例： heart diseaseti“l(fā)iver cancer”43PubMed智能檢索原理對于輸入檢索框中的非限定檢索詞，44自動匹配檢索功能關(guān)閉44自動匹配檢索功能關(guān)閉454. PubMed檢索結(jié)果處理Display(顯示)Send to(輸出)454. PubMed檢索結(jié)果處理Display(顯示)46Display(檢索結(jié)果顯示)46Display(檢索結(jié)果顯示)47Send to(檢索結(jié)果輸出)47Send to(檢索結(jié)果輸出)48Clipboard剪貼板可集中存放一次或多次檢索結(jié)果當(dāng)中的選定記錄，方便用

13、戶集中打印、下載文獻(xiàn)。剪貼板中可存的最多記錄為500條，如果八小時內(nèi)無作何操作，記錄將自動消失。48Clipboard剪貼板可集中存放一次或多次檢索結(jié)果當(dāng)中495. PubMed鏈接Related ArticlesFull Text495. PubMed鏈接Related Articles50Related Articles(相關(guān)文獻(xiàn)鏈接)50Related Articles(相關(guān)文獻(xiàn)鏈接)51Full Text(全文鏈接)網(wǎng)上免費資源 或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)庫中的全文 51Full Text(全文鏈接)網(wǎng)上免費資源 或者自己的圖526. My NCBI(個性化功能) 52

14、6. My NCBI(個性化功能) 536. My NCBI(個性化功能)536. My NCBI(個性化功能)546. My NCBIMy Saved Data546. My NCBIMy Saved Data556. My NCBI Save Search556. My NCBI Save Search566. My NCBI Save SearchEmail發(fā)送新文獻(xiàn)跟蹤專題最新文獻(xiàn)566. My NCBI Save SearchEmai57通過My NCBI查看新文獻(xiàn)57通過My NCBI查看新文獻(xiàn)586. My NCBISearch Filters586. My NCBISearch

15、 Filters596. My NCBISearch Filters596. My NCBISearch Filters6060616. My NCBIPreferences616. My NCBIPreferences627. 其他輔助工具627. 其他輔助工具637.1 Journal Database可以從期刊的名稱(全稱或縮寫)、ISSN號、刊名中的任意詞來查找期刊信息。637.1 Journal Database可以從期刊的名646465專為臨床醫(yī)生設(shè)計的查找有關(guān)某一疾病的治療、診斷、病因、預(yù)后等與臨床密切相關(guān)問題的文獻(xiàn)。7.2 Clinical Queries檢索系統(tǒng)評價(循證醫(yī)學(xué)

16、證據(jù))65專為臨床醫(yī)生設(shè)計的查找有關(guān)某一疾病的治療、診斷、病因、預(yù)667.3 Citation Matcher 引文匹配器引文匹配器可通過已知的刊名、日期、卷、期、論文首頁碼、作者名等任一項信息查找論文的詳細(xì)信息。 經(jīng)常用于核對參考文獻(xiàn)667.3 Citation Matcher 引文匹配器引文67查找引文信息 1、Gene Therapy, 1999, and the title words, mitochondrial gene therapy. 2、Arthritis Rheum, 1982, page 1271 3、V. Lee, Biochemical Pharmacology, vol. 29, issue 14 4、A powder formulation of measles vaccine f