微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)培訓(xùn)課件

1、微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)教學(xué)重點(diǎn) 微生物的分類單元與命名 微生物的分類方法 微生物的分類系統(tǒng)微生物的鑒定方法 2微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)教學(xué)重點(diǎn) 微生物的分類單元與命名2微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 微生物分類學(xué)是研究微生物分類理論和技術(shù)方法的科學(xué)。其目的是研究各類微生物的特征及其親緣關(guān)系，為微生物資源的利用、控制和改造提供理論根據(jù)。其內(nèi)容包括 分類（classification） 鑒定(identification)和 命名(nomenclature)3部分。 3微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 微生物分類學(xué)是研究微生物分類理論和技術(shù)方法的科 目前，已記載過的生物種數(shù)約為150余萬種，其中微生物為1

2、020萬種，而且還在急劇的擴(kuò)大。 分類是根據(jù)一定的原則對(duì)微生物分群歸類，根據(jù)相似性或相關(guān)性水平排列成系統(tǒng)，并描述各個(gè)類群的特征。 鑒定是指借助于現(xiàn)有的微生物分類系統(tǒng)，通過特征測(cè)定，確定某一微生物應(yīng)歸屬類群的過程，通過鑒定可達(dá)到知類、辨名的目的。 命名是根據(jù)國際命名法規(guī)，為一個(gè)未知名字的新培養(yǎng)物確定其學(xué)名的過程。4微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 目前，已記載過的生物種數(shù)約為150余萬 生物種類極其繁多。據(jù)估計(jì)，目前人們已鑒定命名的約有200萬種，其中微生物約有20萬種。生物分類原則根據(jù)表型特征根據(jù)生物系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性水平 形態(tài)學(xué)、生理生化學(xué)、生態(tài)學(xué)等。重在應(yīng)用，不涉及進(jìn)化和親緣關(guān)系。 探尋進(jìn)化關(guān)系，反映生物

3、系統(tǒng)發(fā)育過程。微生物分類學(xué)是研究微生物分類理論和方法的學(xué)科。5微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 生物種類極其繁多。據(jù)估計(jì)，目前人們已鑒定命名第一節(jié) 微生物的分類單元與命名 一、微生物的分類單元 分類單元（taxon，復(fù)數(shù)taxa）是指某一個(gè)具體的分類群，如原核生物界（Procaryotae）中的大腸埃希氏菌屬（Escherichia）和枯草孢桿菌（Bacillus subtilis）等分別代表一個(gè)分類單元。6微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)第一節(jié) 微生物的分類單元與命名 一、微生物的分（一）種以上的分類單元 界 （Kingdom） 門 （Phylum） 綱（Class） 目（Order） 科（Family） 屬（Ge

4、nus） 種（Species） 微生物分類的目的：把各種微生物按照它們的親緣關(guān)系分群歸類，排成系統(tǒng)，以便于人們對(duì)微生物進(jìn)行鑒定和交流。分為7個(gè)基本的分類單元，由上而下一次為：7微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)（一）種以上的分類單元 界 （Kingdom） 門 （Phy 種（species） 微生物種是表型特征高度相似、親緣關(guān)系極其接近與其他種有明顯差異的一群菌株的總稱。 在具體分類時(shí)，常用一個(gè)被指定的能代表這個(gè)種群的模式菌株或典型菌株（type strain）作為該種的模式種（type s pecies）來定種，模式種往往是定為一個(gè)新屬的第一個(gè)種或第一批種之一，也可以是在某一已知屬內(nèi)任意指定的種。 8微生

5、物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 種（species） 微生物種是表型特征高（二）種以下的分類單元 1.亞種（subspecies，縮寫為subsp） 亞種是種的進(jìn)一步細(xì)分單位，一般指一明顯而穩(wěn)定的特征與模式種不同但又不足以區(qū)分為新種的菌株類群。 2.變種（Variety，縮寫為var） 變種與亞種同義，近已廢止。是指在某些（通常是較少）方面與特定的典型種的相應(yīng)特性有所不同的菌株。 3“型”（type） 型是同種之內(nèi)在某些特殊性質(zhì)上有區(qū)別的類群。它們之間的區(qū)別不象亞種那樣顯著，曾用于亞種以下的細(xì)分，但目前已廢除 。9微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)（二）種以下的分類單元 1.亞種（subsp 培養(yǎng)物(culture)：

6、一定時(shí)間一定空間內(nèi)微生物的細(xì)胞群或生長物。如微生物的斜面培養(yǎng)物、搖瓶培養(yǎng)物等。 4. 菌株（strain）菌株又稱品系。一個(gè)菌株是指由一個(gè)單細(xì)胞繁衍而來的克?。╟lone）或無性繁殖系中的一個(gè)微生物或微生物群體。如果用實(shí)驗(yàn)方法（如通過誘變）所獲得的某一菌株的變異型，則可以稱為一個(gè)新的菌株，以便與原來的菌株相區(qū)別。10微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 培養(yǎng)物(culture)： 4二、微生物分類單元的命名 微生物種名的命名和其他高等生物一樣，采用林奈創(chuàng)立的“雙名法”。 屬名在前，一般用拉丁字名詞表示，字首字母大寫。種名在后，常用拉丁文形容詞表示，全部小寫。 學(xué)名= 屬名+種名+（首次定名人）+現(xiàn)名定名人+定

7、名年份 必要、用斜體字 可省略，均用正體字11微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)二、微生物分類單元的命名 微生物種名的命名和其 Bacillus subtilis （Ehrenberg）Cohn 1872例：Staphylococcus aureus Rosenbach 188412微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) Bacillus subtilis （Ehrenberg） 如： cillus thuringiensis subspGalleria學(xué)名= 屬名+種名+（Subsp或var）+亞種（或變種）名 亞種（subspecies，縮寫subsp）或變種（variety，縮寫var）采用三名法：用斜體字用正體字，可

8、省略用斜體字13微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 如：學(xué)名= 屬名+種名+（Subsp或var）+第二節(jié) 微生物分類鑒定方法 一、經(jīng)典分類法 （一）形態(tài)特征： 1.個(gè)體形態(tài)：大小，形態(tài)，分化，結(jié)構(gòu)，染色等。 2.群體形態(tài)：培養(yǎng)特征反映，菌落和液體培養(yǎng)的特征。 （二）生理生化特征 1.營養(yǎng)特征：能否利用多糖、雙糖、單糖、脂肪酸CO2作為碳源和能源；能否利用蛋白質(zhì)、蛋白胨、氨基酸、銨鹽等。 14微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)第二節(jié) 微生物分類鑒定方法 一、經(jīng)典分類法 （一 2代謝產(chǎn)物 如通過檢查微生物能否產(chǎn)生有機(jī)酸、乙醇、碳?xì)浠衔?、氣體及硫化氫等；能否分解色氨酸產(chǎn)生吲哚；能否分解糖，能否產(chǎn)生色素、抗生素等。 3酶活性

9、 觀察是否有氧化酶、接觸酶、脲酶、凝固酶等。常測(cè)定的有淀粉水解、油脂水解、酪素水解、明膠液化等項(xiàng)目。 4在牛乳培養(yǎng)基中生長的反應(yīng) 有些使牛乳中的乳糖發(fā)酵產(chǎn)酸，致蛋白質(zhì)凝固；有些具蛋白酶，使酪蛋白分解為蛋白胨（胨化）；另一些細(xì)菌則把牛乳中的含氮物質(zhì)分解成氨，使牛乳變成堿性。因此，可觀察牛乳中是凝固還是胨化，是產(chǎn)酸還是產(chǎn)堿鑒定細(xì)菌。15微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 2代謝產(chǎn)物 如通過檢查微生物能否產(chǎn)生有（三）生態(tài)特征 微生物對(duì)氧氣、溫度、酸堿度、鹽度等環(huán)境因素的要求也是分類的依據(jù)。（四）對(duì)噬菌體和藥物的敏感性 噬菌體有嚴(yán)格的寄主范圍，它不僅對(duì)種有特異性，而且對(duì)同種細(xì)菌的不同型也有特異性。通過觀察噬菌斑的形

10、狀、大小，在液體培養(yǎng)基中，是否使由混濁變?yōu)槌吻宓茸鳛殍b定依據(jù)。 (五)血清學(xué)反應(yīng) 常用已知菌種、型或菌株制成抗血清(抗體)，與待鑒定的對(duì)象(抗原)是否發(fā)生特異性結(jié)合反應(yīng)來鑒定未知菌種、型或菌株。16微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)（三）生態(tài)特征 微生物對(duì)氧氣、溫度、酸堿度、鹽 二、化學(xué)分析法 （一）細(xì)胞壁的化學(xué)成分 如G細(xì)胞壁的肽聚糖含量少，有較多的脂蛋白、脂多糖，而G+菌細(xì)胞壁的肽聚糖含量多，含有磷壁酸。革蘭氏G+菌中，不同的菌種肽聚糖的含量差異很大(30%95%)，結(jié)構(gòu)和組分上也因菌種而異。 （二）全細(xì)胞水解液的糖型 放線菌全細(xì)胞水解液的糖型可分為阿拉伯糖，半乳糖， 無糖， 木糖和阿拉伯糖 4類。 （

11、三）脂肪酸組成 通過氣-液相質(zhì)譜分析測(cè)定微生物所含的飽和脂肪酸及不飽和脂肪酸組成的差異。17微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 二、化學(xué)分析法 （一）細(xì)胞壁的化學(xué)成分17微生 （四）磷脂、醌、多胺分析 磷脂 磷脂的種類很多，其中有5種可作為鑒定的指標(biāo)：磷脂酰乙醇胺（PE）、磷脂酰甲基乙醇胺(PME)、磷脂酰膽堿(PC)、磷脂酰甘油(PG)和一種含葡萄糖胺未知結(jié)構(gòu)的磷脂。 醌 用于細(xì)菌分類主要是甲基萘醌（menaquinone，即VitK）和泛醌（ubiquinone，即輔酶Q ）。甲基萘醌用于放線菌與革蘭氏陽性菌的分類。 多胺 用經(jīng)典分類方法不易區(qū)別，但用多胺分析能快速區(qū)別。 如黃單胞菌屬（Xanthomo

12、nas）與植物致病假單胞菌及一些腐生假單胞菌，大多數(shù)特征都一樣，前者主要是亞精胺，后者主要是腐胺。18微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) （四）磷脂、醌、多胺分析 醌 用于細(xì)菌分 運(yùn)用高度標(biāo)準(zhǔn)化的SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）分析，對(duì)支原體、細(xì)菌、放線菌和真菌的鑒定。大量研究表明全細(xì)胞蛋白質(zhì)分析和DNA-RNA雜交有高度相關(guān)性，故此法可用于種和種以下的分類鑒定。常用的電泳方法有單向電泳和 雙向電泳，并應(yīng)用特定的計(jì)算機(jī)軟件對(duì)電泳圖譜進(jìn)行分析。（五）蛋白質(zhì)分析19微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 運(yùn)用高度標(biāo)準(zhǔn)化的SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳（三、遺傳特征分類法 （一）DNA的堿基組成(G+C) mol% 不同種的微生

13、物DNA堿基對(duì)排列順序不同，其(G+C) mol%值一般隨種的不同而變化。一般認(rèn)為，親緣關(guān)系相近的種，其堿基對(duì)排列順序相近，其(G+C) mol%值也接近。但(G+C) mol%值接近的兩個(gè)種的親緣關(guān)系則不一定接近。 2.5%4.0% 同種； 2% 無分類學(xué)上的意義； 5% 兩個(gè)不同的種； 10% 不同屬 。方法: 熱變性溫度法、浮力密度法和高效液相色譜法。20微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)三、遺傳特征分類法 （一）DNA的堿基組成(G+C （二）核酸雜交法 不同微生物DNA堿基排列順序的異同直接反應(yīng)它們之間親緣關(guān)系，堿基排列順序差異越小，它們之間的親緣關(guān)系越近，反之亦然。 由于堿基對(duì)的排列順序不能由D

14、NA(G+C) mol%值反映微生物的親緣關(guān)系，所以，目前分類學(xué)主要采用較為間接的比較方法核酸雜交（nucleic acid hybridization），來比較不同微生物DNA中堿基排列順序的相似程度，以進(jìn)行微生物的分類。 21微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) （二）核酸雜交法21微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 1.DNA-DNA雜交 原理：在高溫條件下，DNA雙鏈離解成單鏈（變性），降溫（退火）后互補(bǔ)的單鏈又可以重新結(jié)合形成雙鏈DNA（復(fù)性）。根據(jù)DNA的這個(gè)特性，將兩個(gè)不同的細(xì)菌的單鏈變性DNA混合，如果： 結(jié)合成完整的雙鏈雜交率為100%。同源程度很高，其堿基順序完全相同； 部分結(jié)合，雜交率小于100%。同

15、源程度不高， 則單鏈會(huì)形成不同微生物之間。 不同微生物之間，DNA同源程度越高，其雜交率就越高。22微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 1.DNA-DNA雜交22微生物的分類醫(yī)學(xué) DNA-DNA分子雜交測(cè)定核酸同源性的原理23微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) DNA-DNA分子雜交測(cè)定核酸同源性的原理23微生20% 不同菌屬；20%60% 屬內(nèi)密切相關(guān)的種；60%的 同種；70% 同一亞種。24微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)20% 不同菌屬；24微生物的分類醫(yī) 2.DNA rRNA雜交 當(dāng)兩個(gè)菌株DNA 的非配對(duì)堿基超過10%20%時(shí)，DNA-DNA雜交往往不能形成雙鏈，因而限制DNA DNA雜交主要用于種水平上的分類。 比較親

16、緣關(guān)系更遠(yuǎn)的菌株之間的關(guān)系，需要用rRNA與DNA雜交。rRNA 是DNA 轉(zhuǎn)錄的產(chǎn)物。 rRNA-DNA雜交也可以顯示不同的細(xì)菌的堿基順序的相似程度，因?yàn)閞RNA的堿基順序與一股單鏈DNA的堿基順序互補(bǔ)。 DNA同源性很低的兩菌株，DNA-DNA雜交率很低或不能雜交時(shí)，用DNA- rRNA雜交，仍可表現(xiàn)出較高的雜交率，故可以比較親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的菌株間的關(guān)系，進(jìn)行屬及屬以上分類單元的分類。 DNA- rRNA雜交與DNA DNA雜交的原理和方法基本相同。25微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 2.DNA rRNA雜交25微生物的分類醫(yī)學(xué)知 3.核酸探針 核酸探針（probe）是指能特異識(shí)別特異核苷酸序列的、帶

17、有標(biāo)記的一段單鏈DNA或 RNA分子。換句話說，它是能與被檢測(cè)的特定核苷酸序列（靶序列）互補(bǔ)結(jié)合，而不與其他序列結(jié)合的帶標(biāo)記的単鏈核苷酸片段。 根據(jù)特異性的不同，核酸探針在微生物鑒定與檢測(cè)中的作用也不同，有的探針只用于某一菌型的檢測(cè)，有的可用于某一種、屬、科至更大類群范圍的微生物的檢測(cè)或鑒定。 核酸探針 分為基因組DNA探針、RNA基因（cDNA）探針、RNA探針和人工合成寡核苷酸探針等。26微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 3.核酸探針26微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) （三）16S rRNA寡核苷酸分類目錄 即16S rRNA寡核苷酸序列比較分析?，F(xiàn)已被公認(rèn)為是研究生物進(jìn)化的合適方法。主要原因是： （1）16S

18、 rRNA普通存在于原核生物和真核生物細(xì)胞中，可用以比較它們?cè)谶M(jìn)化上的關(guān)系； （2）16S rRNA有重要并恒定的生理功能； （3）rRNA的基因在細(xì)胞中是穩(wěn)定的，不會(huì)轉(zhuǎn)移； （4）16S rRNA分子的某些堿基順序非常保守，同時(shí)又有可變區(qū)段，可用作探索生物的主要進(jìn)化歷程； （5）16S rRNA在細(xì)胞中含量大易于提取，分子量（1540bp）適中，且信息量大又易于分析。所以，16S rRNA是理想的研究材料。 27微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) （三）16S rRNA寡核苷酸分類目錄27微生物的分 16S rRNA寡核苷酸編目分析依據(jù)的原理：用一種核糖核酸酶水解rRNA，可產(chǎn)生一系列寡核苷酸片斷。如果兩

19、種或兩株微生物親緣關(guān)系越接近，則它們產(chǎn)生的寡核苷酸片斷的順序也越近，反之亦然。 古菌域這個(gè)“第三界生物”正是基于16S rRNA寡核苷酸序列比較分析而確定的。28微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 16S rRNA寡核苷酸編目分析依據(jù)的原理：四、數(shù)值分類法 20世紀(jì)60年代，隨計(jì)算機(jī)的應(yīng)用而發(fā)展的細(xì)菌分類方法。它對(duì)細(xì)菌的各種生物學(xué)性狀按“等重要原則”進(jìn)行分類，一般需選用50項(xiàng)以上的形態(tài)的、生理的、生化的、遺傳的、生態(tài)的和免疫的特征等指標(biāo)逐一進(jìn)行比較，通過計(jì)算機(jī)分析各菌間相似度，劃分細(xì)菌的屬和種，并確定它們的親緣關(guān)系。29微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)四、數(shù)值分類法 20世紀(jì)60年代，隨計(jì)算機(jī)的 數(shù)值分類可大致分為5個(gè)

20、步驟： 1.確定分類單位和選擇分類特征：數(shù)值分類最低等級(jí)的分類單位稱操作分類單位（OTU），OTU可以是菌株、種或?qū)俚取?選擇 50個(gè)以上乃至幾百個(gè)， 所選性狀盡可能包括微生物的各個(gè)方面。 2.性狀編碼：將實(shí)驗(yàn)測(cè)得的結(jié)果 ，如陽性用“+”表示，陰性用“-”表示，轉(zhuǎn)化成計(jì)算機(jī)能識(shí)別、運(yùn)算的符號(hào)并編碼后，把它們排列成序號(hào)，形成一個(gè)性狀（原始數(shù)據(jù)）矩陣，然后分別用1（陽性）和0（陰性）符號(hào)輸入計(jì)算機(jī)。30微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 數(shù)值分類可大致分為5個(gè)步驟： 1 3.計(jì)算兩菌株間的相關(guān)系數(shù)：計(jì)算機(jī)運(yùn)用專門編寫的程序，對(duì)OTU進(jìn)行兩兩比較，最后計(jì)算出OTU之間總的相似系數(shù)。 4.列出相似度矩陣：由計(jì)算機(jī)計(jì)

21、算各OTU之間的相似性并根據(jù)相似性的數(shù)值進(jìn)行聚類分析、分群歸類，得到相似度矩陣，即S矩陣。例如我們對(duì)10個(gè)菌株進(jìn)行數(shù)值分類，經(jīng)過系統(tǒng)聚類得到圖A的S矩陣，相似度為百分?jǐn)?shù)，100表示每個(gè)OTU自己與自己相比，自然全同。31微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 3.計(jì)算兩菌株間的相關(guān)系數(shù)：計(jì)算機(jī)運(yùn)用專門 將相似度高的和低的分別列在一起，結(jié)果得到圖B 所示的矩陣。 10個(gè)菌株的相似度矩陣 對(duì)10個(gè)菌株進(jìn)行數(shù)值分類，經(jīng)過系統(tǒng)聚類得到圖A的S矩陣32微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 將相似度高的和低的分別列在一起，結(jié)果得到 1微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)培訓(xùn)課件 圖C 10個(gè)菌株間相似度的樹狀譜 虛線表示各菌株相似度的水平，可用作屬與種兩

22、個(gè)不同層次的分類單元34微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 圖C 10個(gè)菌株間相似度的樹狀譜 虛線表示第三節(jié) 微生物的分類系統(tǒng)一、生物的界級(jí)分類學(xué)說兩界系統(tǒng)三界系統(tǒng)四界系統(tǒng)五界系統(tǒng)六界系統(tǒng)35微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)第三節(jié) 微生物的分類系統(tǒng)一、生物的界級(jí)分類學(xué)說兩界系統(tǒng)三36微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)36微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 20世紀(jì)70年代末美國的伍斯（Woese）等人對(duì)大量微生物和其他生物進(jìn)行16S rRNA（或18S rRNA）的寡核苷酸測(cè)序，并比較其同源性水平后，首次提出了生命第三種形式古菌的存在。 隨后他及其同事們又對(duì)大量菌株進(jìn)行16S rRNA（或18S rRNA）序列研究，相繼發(fā)現(xiàn)極端啫鹽菌和極端嗜酸嗜

23、熱菌也和產(chǎn)甲烷菌一樣，具有既不同于其他細(xì)菌也不同于真核生物的序列特征，而它們之間則具有許多共同序列，從而提出了三域?qū)W說（Three Domains Theory），即將生物分為三域：古菌域、細(xì)菌域和真核生物域。37微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 20世紀(jì)70年代末美國的伍斯（Woese）等 系統(tǒng)發(fā)育樹(phylogenetic tree) 通過比較生物大分子序列差異的數(shù)值構(gòu)建的系統(tǒng)樹稱為分子系統(tǒng)樹，其特點(diǎn)是用一種樹狀分枝的圖型來概括各種(類)生物之間的親緣關(guān)系。38微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 系統(tǒng)發(fā)育樹(phylogenetic tree) 系統(tǒng)發(fā)育樹39微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)系統(tǒng)發(fā)育樹39微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)

24、 1.提出了一種全新的正確衡量生物間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的方法； 2.對(duì)探索生命起源及原始生命的發(fā)育進(jìn)程提供了線索和理論依據(jù) 3.突破了細(xì)菌分類僅靠形態(tài)學(xué)和生理生化特性的限制，建立了全新的分類理論； 4.為微生物生物多樣性和微生物生態(tài)學(xué)研究建立了全新的研究理論和研究方法，特別是不經(jīng)培養(yǎng)直接對(duì)生態(tài)環(huán)境中的微生物進(jìn)行研究。 意義：40微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 1.提出了一種全新的正確衡量生物間系統(tǒng)發(fā)育一、 細(xì)菌的分類系統(tǒng) 伯杰氏手冊(cè)最初是由美國賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授伯杰（D.Bergey）（18601937）及其同事為細(xì)菌的鑒定而編寫，第1版名為伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)（Bergeys Manual fo D

25、eteminative Bacteriology）。該書自1923年第1版問世以來，已進(jìn)行過8次修改，現(xiàn)已發(fā)行第9版。 伯杰氏手冊(cè): 是目前進(jìn)行細(xì)菌分類、鑒定的最重要參考書，其特點(diǎn)是描述非常詳細(xì)，包括對(duì)細(xì)菌各個(gè)屬種的特征及進(jìn)行鑒定所需做的實(shí)驗(yàn)的具體方法。41微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)一、 細(xì)菌的分類系統(tǒng) 伯杰氏手冊(cè)最初是由 第一版(系統(tǒng)手冊(cè)) 1984年問世，至1989年出齊，共4卷。1994年又將伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)14卷中有關(guān)屬以上分類單元的分類鑒定資料進(jìn)行少量的修改補(bǔ)充后匯集成一冊(cè)仍用原來的書名出版，故稱伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)第9版。 第二版 系統(tǒng)手冊(cè) 分5卷，將從2000年起陸續(xù)出版。第2版與

26、第1版最大的區(qū)別，是將原核生物分為古菌域和細(xì)菌域，主要是基于分子系統(tǒng)發(fā)育資料而不是表型特征。42微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 第一版(系統(tǒng)手冊(cè)) 1984年問世， 系統(tǒng)手冊(cè)第1版共分4卷：第一卷：一般醫(yī)學(xué)和工農(nóng)業(yè)方面重要的革蘭氏陰性 細(xì)菌，共分11個(gè)組。 第二卷：放線菌以外的革蘭氏陽性細(xì)菌，分6個(gè)組。 第三卷：光合細(xì)菌、古細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌及其他革蘭氏 陽性細(xì)菌，分8個(gè)組。第四卷：放線菌，分8個(gè)組。43微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí) 系統(tǒng)手冊(cè)第1版共分4卷：43微生物的分類醫(yī)學(xué)系統(tǒng)手冊(cè)第2版 內(nèi)容為：第一卷：114組，包古菌、藍(lán)細(xì)菌、光合細(xì)菌和最 早分支的屬。第二卷：1519組，包括變形桿菌（屬G-真細(xì)菌類）。第三卷：2022組，包括低（G+C）mol%的G+菌。第四卷：23組，包括高（G+C）mol%值的G+菌（放 線菌類及相關(guān)的G+菌）。第五卷：2430組，包括浮霉?fàn)罹?、螺旋體、絲桿菌、 擬桿菌、梭桿菌（屬G-菌類）。44微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)系統(tǒng)手冊(cè)第2版 內(nèi)容為：44微生物的分類醫(yī)學(xué)知識(shí)二 真菌（菌物）分類系統(tǒng) 真菌的分類系統(tǒng)較多，有G.W.Martin（1950年）、G.C.Ainsw