醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)介紹課件

1、medline數(shù)據(jù)庫(kù)介紹陳小忠Chen Xiaozhong廣東省人民醫(yī)院圖書(shū)館medline 由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館(NLM)編制的Medline數(shù)據(jù)庫(kù)是世界上最具權(quán)威的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn) 書(shū)目數(shù)據(jù)庫(kù)。Medline收錄內(nèi)容包括基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、牙科學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、藥物學(xué)、衛(wèi)生保健、營(yíng)養(yǎng)衛(wèi)生、職業(yè)衛(wèi)生、衛(wèi)生管理等，涉及生物學(xué)、人文科學(xué)、情報(bào)科學(xué)等。medline 數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)容與以下3種印刷型檢索工具對(duì)應(yīng)：Index Medicus(醫(yī)學(xué)索引)，International Nursing lndex(國(guó)際護(hù)理索引)，Index to Dental Literature(牙科文獻(xiàn)索引)。Medline收錄

2、了1966年至今的1千多萬(wàn)條記錄，每月平均入庫(kù)記錄近4萬(wàn)條。Medline收錄的期刊將近4 500種。以2001年的Medline數(shù)據(jù)為例，92的原文為英語(yǔ)，78的記錄有文摘。網(wǎng)上Medline 數(shù)據(jù)每周更新，光盤(pán)數(shù)據(jù)每月更新。medline Medline有多種光盤(pán)產(chǎn)品，如OVID系統(tǒng)、Cambridge系統(tǒng)，還有Dialog系統(tǒng)，EBSCO系統(tǒng)等。國(guó)內(nèi)使用最普遍的是WinSPIRS系統(tǒng)的“SilverPlatter Medline on CD”。1997年6月，由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBl)開(kāi)發(fā)的Medline網(wǎng)絡(luò)版PubMed掛上因特網(wǎng)供全球用戶(hù)免費(fèi)使用。medli

3、ne Medline 光盤(pán)數(shù)據(jù)庫(kù)（光盤(pán)版） 加了6各數(shù)據(jù)庫(kù): HealthStar Cancerlist Toxiline Bioethicsline popline AidslineMeSH詞表 MeSH詞表中現(xiàn)有主題詞1.8萬(wàn)個(gè)。通過(guò)MeSH詞表可以查得：哪些是主題詞、哪些不是主題詞、主題詞有哪些上位詞下位詞、主題詞的歷史變更和用法注釋、主題詞的相關(guān)詞(see related)等。MeSH詞表含字順表和樹(shù)形結(jié)構(gòu)兩大部分。 MeSH詞表的字順表(alphabetic list) 字順表按主題詞、款目詞、副主題詞的字母順序排列。 舉例： Hepatitis C.6.552.380+ Renal

4、 Dialysis E2.870.300+ E2.912800+ 2001； see HEMODLALYSIS l967-2000 Acetylsalicylic Acid see Aspirin AIDS see Acquired Immunodificiency Syndrome MeSH詞表的字順表(alphabetic list) MeSH詞表中約有十分之一的主題詞與自然詞序相反，稱(chēng)為倒置主題詞。例如“Hepatitis，A1coholic”(肝炎，乙醇性)，“Leukemia，Lymphocytic，Chronic”(白血病，淋巴細(xì)胞，慢性)。倒置主題詞中，核心詞在前，修飾詞在后，用

5、逗號(hào)表示倒置。主題詞倒置的優(yōu)點(diǎn)是：突出核心詞；含有相同核心詞的主題詞在字順表或索引中按字母順序集中排在一起，方便選詞。 MeSH詞表的字順表(alphabetic list) 款目詞(entry word，entry term) 款目詞是主題詞的同義詞或近義詞，不 能直接用來(lái)進(jìn)行主題詞檢索，而要用“see” 引見(jiàn)的主題詞去檢索，因?yàn)橹挥兄黝}詞才是 MeSH字段的標(biāo)引詞。例如：MeSH詞表的樹(shù)形結(jié)構(gòu)(Tree Structures) 樹(shù)形結(jié)構(gòu)表按主題詞的分類(lèi)屬性編排， 它揭示了主題詞之間的隸屬關(guān)系和并列關(guān) 系，提供了從分類(lèi)進(jìn)行選詞的途徑。例如：WinSPIRS系統(tǒng)的Medline檢索 陳小忠Ch

6、en Xiaozhong廣東省人民醫(yī)院圖書(shū)館WinSPIRS WinSPIRS是運(yùn)行于Windows環(huán)境下的美國(guó)“銀盤(pán)公司信息檢索系統(tǒng)”(The Silver Platter Information Retrieval System)。WinSPIRS檢索系統(tǒng)供檢索銀盤(pán)公司出版的 Medline，EMBase，BA等多種光盤(pán)數(shù)據(jù)庫(kù)。 WinSPIRSWinSPIRSWinSPIRSWinSPIRSWinSPIRS檢索操作 陳小忠Chen Xiaozhong廣東省人民醫(yī)院圖書(shū)館Searches 在Searches狀態(tài)下，直接在檢索框內(nèi)輸入檢索詞或檢索式，然后點(diǎn)擊右邊的Search按鈕(或按Ent

7、er鍵)。屏幕中間部分為檢索歷史區(qū)，顯示輸入的檢索式和檢出記錄 數(shù)。屏幕下方為檢索結(jié)果顯示區(qū)。 檢索框內(nèi)輸入的檢索詞可以是單詞或詞組， 也可以是含有運(yùn)算符的檢索式。用主題詞 加副主題詞檢索的格式是： stomach neoplasms/diagnosis 或者 stomach-neoplasms-diagnosisSearches searchesSearches Searches Searches Searches Searches Searches Searches Searches 詞表告訴我們，Stroke不是主題詞，主題詞是Cerebrovascular Accident。 通過(guò)Te

8、rm Information按鈕或雙擊該主題詞， 可了解到主題詞的定義、定義出處,注釋、歷史變化、樹(shù)形結(jié)構(gòu)號(hào)、上位詞下位詞等情況。 Searches 詞表告訴我們，Stroke不是主題詞，主題詞是Cerebrovascular Accident。 通過(guò)Term Information按鈕或雙擊該主題詞， 可了解到主題詞的定義、定義出處,注釋、歷史變化、樹(shù)形結(jié)構(gòu)號(hào)、上位詞下位詞等情況。 中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(CBMdisc) 陳小忠Chen Xiaozhong廣東省人民醫(yī)院圖書(shū)館一、數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介 中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(China BioMedical Literature on discsCB

9、Mdisc)是中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所開(kāi)發(fā)研制的文摘型光盤(pán)數(shù)據(jù)庫(kù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了1978年至今1 000多種中文生物醫(yī)學(xué)期刊、匯編以及會(huì)議論文的題錄與文摘，文獻(xiàn)總量250余萬(wàn)條，年增長(zhǎng)約20萬(wàn)條。該數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋了印刷型檢索工具中文科技資料目錄(醫(yī)藥衛(wèi)生)分冊(cè)。 。二、檢索途徑 CBMdisc共有五條檢索途徑：基本檢索、主題詞表輔助檢索、索引詞表輔助檢索、分類(lèi)表檢索、期刊表輔助檢索。 1基本檢索基本檢索界面如圖所示。檢索字段選擇中的“缺省檢索”表示在中文標(biāo)題、文摘、主題詞、特征詞、關(guān)鍵詞、期刊6個(gè)字段中搜詞檢索。其他的檢索字段選擇有：全部(字段)、中文題目、英文題目、作者、參考文獻(xiàn)等。2001

10、年起CBMdisc增加的用于引文檢索的“參考文獻(xiàn)”，即通過(guò)被引用文獻(xiàn)的著者檢索得到引用文獻(xiàn)情況。 二、檢索途徑 二、檢索途徑 主題詞表輔助檢索 中文生物醫(yī)學(xué)期刊數(shù)據(jù)庫(kù)（CMCC） 主題詞表輔助檢索 CHKD檢索的結(jié)果 外文生物醫(yī)學(xué)庫(kù) PubMed 陳小忠Chen Xiaozhong廣東省人民醫(yī)院圖書(shū)館 概況網(wǎng)址：/pubmed 或 /pubmed 或 由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館（National Library of Medicine - NLM）國(guó)家生物技術(shù)信息中心（NCBI）向因特網(wǎng)用戶(hù)提供免費(fèi)MEDLINE檢索服務(wù)(起始時(shí)間：1997-6-26)PubMed PubMed(http：/WWWn

11、cbi.nlmnihgovpubmed)是由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館(NLM)下屬美國(guó)生物技術(shù)信息中心(NCBI)研制的基于Web的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)，是NCBI檢索系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫(kù)之一。在系統(tǒng)中可以與NCBI其他數(shù)據(jù)庫(kù)如基因序列中心、電子期刊出版商網(wǎng)站鏈接，也可與美國(guó)圖書(shū)館館藏資源鏈接。PubMed具有期刊收錄生命科學(xué)文獻(xiàn)范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn)。 收錄70余個(gè)國(guó)家4600余種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄與文摘，是世界上最權(quán)威的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)現(xiàn)有1950年以來(lái)的1400多萬(wàn)篇文獻(xiàn)的記錄目前每年增加30多萬(wàn)條文獻(xiàn)記錄85%的文獻(xiàn)為英文，收錄中文刊60余種提供了與其他10多種數(shù)據(jù)庫(kù)檢索的無(wú)縫鏈接新增跨庫(kù)檢索

12、功能（cross-database search） 概況 數(shù)據(jù)類(lèi)型（狀態(tài)）Publisher Supplied Ctitations：出版商提供的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，周二周六每天均有新數(shù)據(jù)加入，標(biāo)識(shí)PubMed - as supplied by publisherIn Process Citations：正在處理的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，周二周六每天將處理完畢的數(shù)據(jù)向MEDLINE提供一次更新，標(biāo)識(shí)PubMed - in processMEDLINE：處理完畢的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。標(biāo)識(shí)PubMed - indexed for MEDLINE PubMed PubMed PubMed 檢索特點(diǎn)詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換邏輯運(yùn)算符AND、OR、

13、NOT須大寫(xiě)，運(yùn)算順序?yàn)閺淖笾劣抑付ㄗ侄螜z索：檢索詞字段標(biāo)識(shí)符截詞檢索用星號(hào)（*），不超過(guò)150個(gè)詞使用雙引號(hào)（“ ”）強(qiáng)制進(jìn)行短語(yǔ)檢索可保存檢索史，使用“#”來(lái)代替檢索式剪貼板功能（最多可保留500條記錄）Cubby功能：保存檢索策略供以后使用 摘要和免費(fèi)全文鏈接圖標(biāo)在題錄（Summary）顯示格式下，分別以如下圖標(biāo)表示該記錄是否有摘要或是否可免費(fèi)獲得全文，并提供相應(yīng)的鏈接免費(fèi)電子期刊查詢(xún) 在因特網(wǎng)的免費(fèi)資源中，學(xué)術(shù)性免費(fèi)電子期刊是教學(xué)科研中最有價(jià)值的網(wǎng)絡(luò)共享資源 之一。它具有跨時(shí)空性、可檢索性、高整合性和易存貯性等特點(diǎn)，因此廣受青睞。雖然免費(fèi)學(xué)術(shù)期刊占整個(gè)電子期刊的比例較小，但其中不乏重要

14、的專(zhuān)業(yè)期刊。熟悉免費(fèi)電子期刊的查詢(xún)是網(wǎng)絡(luò)時(shí)代科研人員一項(xiàng)實(shí)用的檢索技能。一、免費(fèi)電子期刊的類(lèi)型 按免費(fèi)電子期刊出版形式不同，有純網(wǎng)絡(luò)版電子期刊和平行出版物兩種。純網(wǎng)絡(luò)版電子期刊直接在網(wǎng)上發(fā)布，不發(fā)行印刷本，如BioMed Central在線(xiàn)出版的系列期刊。大部分免費(fèi)電子期刊屬于后者，即在出版印刷版的同時(shí)，將期刊全部或部分卷期的全文發(fā)布于網(wǎng)上，供免費(fèi)使用，如Cancer Research。這類(lèi)期刊中不乏高質(zhì)量的學(xué)術(shù)期刊。 一、免費(fèi)電子期刊的類(lèi)型 按免費(fèi)范圍劃分，可將電子期刊分為全刊免費(fèi)、過(guò)刊免費(fèi)、少量文獻(xiàn)免費(fèi)3種類(lèi)型。全刊免費(fèi)的電子期刊信息發(fā)布快，一般在出版日前幾天就可在網(wǎng)上瀏覽到全刊，如Bri

15、tish Medical Journal。另有不少學(xué)術(shù)價(jià)值較高的電子期刊屬于第二種情況，即若干個(gè)月之前的 過(guò)刊免費(fèi)，如Journal of Virology。第三類(lèi)少量文獻(xiàn)免費(fèi)的期刊，只免費(fèi)提供最新一期或某幾期中的少量文獻(xiàn)全文，如JAMA只免費(fèi)提供最新一期中的一篇全文。 目前學(xué)術(shù)性免費(fèi)電子期刊基本都是國(guó)外期刊，國(guó)內(nèi)免費(fèi)的醫(yī)學(xué)電子期刊極為罕見(jiàn)。 提供期刊全文的網(wǎng)站 FreeMedicalJournals (http：/WWW.freemedicalJ) 提供醫(yī)學(xué)免費(fèi)電子期刊瀏覽與預(yù)告服務(wù)的專(zhuān)業(yè)網(wǎng)站，至2004年2月共收錄英、法、德等19種語(yǔ)言的1 340多種醫(yī)學(xué)免費(fèi)電子期刊網(wǎng)址鏈接，其中約360

16、種期刊被Medline收錄。在該網(wǎng)站主頁(yè)上，將全部免費(fèi)、出版16個(gè)月后免費(fèi)、1年后免費(fèi)、2年后免費(fèi)4類(lèi)期刊中影響因子較高的刊物分別列出，為用戶(hù)判別期刊質(zhì)量提供參考。 提供期刊全文的網(wǎng)站 查詢(xún)時(shí)可按Specialty(專(zhuān)業(yè))或Title(刊名字順)瀏覽免費(fèi)期刊刊名列表，刊名后標(biāo)有期刊的免費(fèi)范圍，未標(biāo)注范圍的期刊表示全刊免費(fèi)?？么煮w字顯示，表示該刊被Medline所收錄。New Journals(新增期刊)可瀏覽最近1個(gè)月中新增的免費(fèi)期刊。用戶(hù)也可通過(guò) Journal Alert(新刊快報(bào))功能，免費(fèi)注冊(cè)自己的相關(guān)信息及E-mail地址，F(xiàn)reeMedicalJournals將直接把新增期刊的

17、信息發(fā)送到用戶(hù)的電子信箱中。 提供期刊全文的網(wǎng)站提供期刊全文的網(wǎng)站提供期刊全文的網(wǎng)站提供期刊全文的網(wǎng)站HighWire Press HighWire Press( 或 ) HighWire Press于1995年由斯坦福大學(xué)圖書(shū)館創(chuàng)建，收錄文獻(xiàn)以生物醫(yī)學(xué)為主，涉及物理學(xué)、社會(huì)科學(xué)等學(xué)科。至2003年6月止，共收錄335個(gè)加盟期刊網(wǎng)站近56萬(wàn)篇免費(fèi)全文，其中免費(fèi)期刊約160種。HighWire Press自稱(chēng)是目前全球最大的免費(fèi)自然科學(xué)全文文檔。同時(shí)，它還收錄了大量收費(fèi)全文，提供全文訂購(gòu)服務(wù)，可回溯檢索至1948年。HighWire的特色在于不僅可按刊名瀏覽免費(fèi)期刊，還提供335個(gè)期刊網(wǎng)站和Medl