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酶通論ENZYME酶的概念酶的發(fā)現(xiàn):人們對(duì)酶的認(rèn)識(shí)經(jīng)歷了一段漫長(zhǎng)的道路。十八世紀(jì)上半葉,那時(shí)人們對(duì)于胃是怎樣消化食物的還不了解。有的科學(xué)家認(rèn)為矯健勇猛的山鷹能消化肉類(lèi)食物,是依靠粗糙的胃壁將肉磨碎的。因此,有人認(rèn)為消化是一個(gè)磨碎的物理過(guò)程。1752年,法國(guó)物理學(xué)家Sbalansani懷疑這個(gè)見(jiàn)解。他做了一個(gè)有趣的試驗(yàn),他把一塊生肉塞進(jìn)一個(gè)小金屬管子里,管子的兩頭用金屬蓋板蓋牢,蓋板上預(yù)先打了許多小孔,讓鷹把管子吞下。裝在管子里的生肉,鷹的胃壁是研磨不到的。可是過(guò)了一段時(shí)間,Sbalansani殺了鷹,從胃中取出了小金屬管卻發(fā)現(xiàn)管內(nèi)的生肉不見(jiàn)了,只留下一些淡黃色的液體。這是什么原因?Sbalansani經(jīng)過(guò)反復(fù)思考后認(rèn)為,胃的消化過(guò)程主要是一個(gè)化學(xué)過(guò)程。這是一個(gè)重要的發(fā)現(xiàn),但這個(gè)化學(xué)過(guò)程性質(zhì)如何,在當(dāng)時(shí)是無(wú)從設(shè)想。
1860年,法國(guó)的微生物學(xué)家、化學(xué)家(近代微生物的奠基人)路易.巴斯德(LouisPasteur),在關(guān)于發(fā)酵作用過(guò)程的著名研究中,他證明了象葡萄糖之類(lèi)的有機(jī)物質(zhì)溶液,如果經(jīng)過(guò)消毒,裝在嚴(yán)密封閉了容器中,是完全穩(wěn)定的??墒侨绻屵@些液體與空氣接觸,它會(huì)發(fā)酵。發(fā)酵的原因,Pasteur認(rèn)為,是隨著空氣污染進(jìn)來(lái)的酵母菌細(xì)胞所引起的。后來(lái),法國(guó)出現(xiàn)了葡萄酒變酸的討厭現(xiàn)象,大桶大桶的葡萄酒倒入大海,使得當(dāng)時(shí)的法國(guó)損失很大。法國(guó)政府委托Pasteur進(jìn)行研究。Pasteur證實(shí)了葡萄酒變酸是由另外一些微生物(乳酸菌)的存在所引起的。酶的發(fā)現(xiàn)從而挽救了面臨倒閉的法國(guó)葡萄酒制造公司。之后,巴斯德作出了結(jié)論:發(fā)酵現(xiàn)象是由微生物活細(xì)胞活動(dòng)引起的,沒(méi)有活細(xì)胞不可能引起發(fā)酵。這種錯(cuò)誤的結(jié)論,使得酶學(xué)的研究延遲了幾十年。從Pasteur這一重大發(fā)現(xiàn)之后,過(guò)了二十多年,才有了進(jìn)一步新的發(fā)展。Buchner兄弟倆(Hans&Eduard)對(duì)發(fā)酵原理的研究開(kāi)造了一個(gè)新途徑,酶化學(xué)也是從這里開(kāi)始的。和其他的大發(fā)現(xiàn)一樣,Buchner兄弟倆的發(fā)現(xiàn)也有點(diǎn)偶然的意味。他們本來(lái)的目的是想制作不含細(xì)胞的酵母菌浸液來(lái)供藥劑之用。他們用沙和酵母菌一起研磨,再加壓酶的發(fā)現(xiàn)
榨出一些液汁。待取得了榨汁后,就存在如何防腐的問(wèn)題。兄弟倆最初是打算用動(dòng)物來(lái)作實(shí)驗(yàn),不好用強(qiáng)烈的防腐劑,所以他們就采用家常食物保存中慣用的辦法,擱了許多蔗糖下去。這樣一來(lái)就引起了一個(gè)重大發(fā)現(xiàn)。酵母菌榨汁可以使蔗糖發(fā)酵,使糖發(fā)酵產(chǎn)生酒精和二氧化碳。在這里,第一次發(fā)現(xiàn)了沒(méi)有活細(xì)胞存在的發(fā)酵現(xiàn)象。酵母菌榨汁中,顯然含有一種或多種催化劑,通過(guò)這些催化劑,活酵母菌才能使糖發(fā)酵成酒精。后來(lái)又發(fā)現(xiàn)其他類(lèi)似的生物催化劑,統(tǒng)稱(chēng)為酵素酶(enzyme),從而說(shuō)明了發(fā)酵是酶作用的化學(xué)本質(zhì),為此Buchner兄弟獲得了1911年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。酶的生物學(xué)意義
生物體內(nèi)不斷進(jìn)行著各種化學(xué)變化,綠色植物和某些細(xì)菌能以十分簡(jiǎn)單的物質(zhì),如水、一氧化碳和無(wú)機(jī)鹽為原料合成各種復(fù)雜的有機(jī)物,并把太陽(yáng)能變成化學(xué)能,儲(chǔ)藏在有機(jī)物中;而其他生物以植物又能分解這些復(fù)雜有機(jī)物,從中取得能量。例如動(dòng)物以植物體中的淀粉等復(fù)雜物質(zhì)為食物,淀粉被降解成單糖,并在細(xì)胞內(nèi)進(jìn)一步分解成CO2和H2O,同時(shí)釋放出能量供生物體生長(zhǎng)、發(fā)育、運(yùn)動(dòng)等種種生命活動(dòng)所用。酶的生物學(xué)意義研究酶的化學(xué)本質(zhì)及其作用機(jī)制,對(duì)于了解生命活動(dòng)規(guī)律,指導(dǎo)生產(chǎn)實(shí)踐具有重大意義
在實(shí)驗(yàn)室中,復(fù)雜有機(jī)物的合成與分解必須要有高溫、強(qiáng)酸或強(qiáng)堿等劇烈的條件下才能進(jìn)行,而在生物體內(nèi)雖然條件十分溫和,許多復(fù)雜的化學(xué)變化卻進(jìn)行得極為順利和迅速。例如,動(dòng)物吃下的肉食在消化道內(nèi)只需要幾小時(shí)便被完全消化分解。微生物能在條件合適時(shí),幾十分鐘增殖一代,在這幾十分鐘內(nèi)合成了新細(xì)胞內(nèi)全部復(fù)雜物質(zhì)(protein,DNA,RNA,多糖,脂肪等)。有人計(jì)算,一個(gè)人每天合成100萬(wàn)億個(gè)新細(xì)胞,也就是12億/秒,但每天死亡20-40萬(wàn)億個(gè)細(xì)胞。這是什么物質(zhì)在起著如此神秘的作用?這就是生物催化劑——酶的作用。一、酶催化作用特點(diǎn)
酶—是生物體內(nèi)產(chǎn)生的具有催化功能的蛋白質(zhì)(Enzyme),或少量有催化功能的RNA(Ribozyme)。什么叫催化劑?物理化學(xué)家認(rèn)為:當(dāng)一種物質(zhì)加到化學(xué)變化的系統(tǒng)中,可使化學(xué)反應(yīng)的速度改變,而本身在變化的前后,化學(xué)性質(zhì)沒(méi)有改變,則該物質(zhì)稱(chēng)為催化劑。酶和一般化學(xué)催化劑一樣,它只加速化學(xué)反應(yīng)進(jìn)行的速度,而不改變化學(xué)反應(yīng)的平衡點(diǎn)。Enzymes,likeallothercatalysts,doesnotaffectreactionequilibria,onlyacceleratereactions.酶除了具有一般化學(xué)催化劑的特點(diǎn)外,還有它特有的一些特征:1.酶催化的反應(yīng)溫度在較溫和的條件下,在接近生物體體溫和接近中性的條件下就能發(fā)揮其作用。而一般化學(xué)催化劑催化的反應(yīng)往往需要在高溫高壓的條件下進(jìn)行。例如,固氮微生物(豆類(lèi)、花生根瘤中)在常溫常壓下以其固氮酶固定空氣中的氮?dú)?,而在合成氨工業(yè)上(氨廠)要使用鐵作催化劑,300個(gè)大氣壓和500oC的高溫,才能將空氣中的氮轉(zhuǎn)變成氨
N2+3H22NH3Fe300大氣壓,500oC2.酶比一般催化劑的效率要高得多酶的催化效率比一般催化劑高107-1013倍。例如過(guò)氧化氫(H2O2)分解成水和氧氣。
2H2O22H2O+O2在生物體內(nèi)這一反應(yīng)由過(guò)氧化氫酶催化,但同一反應(yīng)也可以由鐵離子催化。然而,過(guò)氧化氫酶催化的速度就比鐵離子催化的反應(yīng)速度大107倍,即大一百萬(wàn)倍。4.酶在強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、高溫條件下因酶蛋白變性而失去活性。5。酶的作用具有高度的專(zhuān)一性。這是它與一般化學(xué)催化劑之間最顯著的差別。酸能催化蛋白質(zhì)水解,也能催化多糖和脂肪水解。但是酶不同在于蛋白酶只能催化蛋白質(zhì)水解,淀粉酶只能催化淀粉水解。例如,脲酶只能催化尿素水解成CO2和NH3。
H2N-CO-NH2+H2OCO2+NH3將尿素分子作細(xì)微的改變,例如用甲基取代一個(gè)氫原子:CH3-CO-NH2,它就不再能被脲酶催化水解了。三、酶的命名及分類(lèi)1。習(xí)慣命名法:(1)根據(jù)其催化底物來(lái)命名;(2)根據(jù)所催化反應(yīng)的性質(zhì)來(lái)命名;(3)結(jié)合上述兩個(gè)原則來(lái)命名,(4)有時(shí)在這些命名基礎(chǔ)上加上酶的來(lái)源或其它特點(diǎn)。酶的命名2。國(guó)際系統(tǒng)命名法1961年,國(guó)際生化協(xié)會(huì)酶學(xué)委員會(huì)(TheCommissiononEnzymesoftheInternationalUnionofBiochemistry)規(guī)定:每一個(gè)酶有一特定的編號(hào)外,還有一個(gè)系統(tǒng)名稱(chēng)。這個(gè)名稱(chēng)要體現(xiàn)出底物和反應(yīng)的性質(zhì)。如:醇:輔酶Ⅰ氧化還原酶。這個(gè)系統(tǒng)命名表明該酶是氧化還原酶,底物(substrate)是醇和輔酶Ⅰ,兩個(gè)底物必須都寫(xiě)出并用:將其分開(kāi)。但兩個(gè)底物中有一個(gè)是水則可將水略去不寫(xiě)。這種命名原則很?chē)?yán)謹(jǐn),一種酶只可能有一個(gè)名稱(chēng)和一個(gè)編號(hào)。2。國(guó)際系統(tǒng)命名法
酶的習(xí)慣名稱(chēng)較方便為眾人所熟悉,所以一般在習(xí)慣名稱(chēng)后面用栝號(hào)注明系統(tǒng)命名及編號(hào)。例如,乙醇脫氫酶(EC1.1.1.1 醇:NAD氧化還原酶)。又如:酶學(xué)委員會(huì)乳酸脫氫酶(EC1.1.1.27)表示第一大類(lèi),即氧化還原酶類(lèi)表示第一亞類(lèi),被氧化基團(tuán)為CHOH基表示第一亞亞類(lèi),氫受體為NAD+表示乳酸脫氫酶在此亞亞類(lèi)中的順序號(hào)3.酶的分類(lèi)催化氧化-還原反應(yīng)。AH2+BA+BH2主要包括脫氫酶(dehydrogenase)和氧化酶(Oxidase)。如,乳酸(Lactate)脫氫酶催化乳酸的脫氫反應(yīng)。(1)氧化-還原酶Oxidoreductase3.酶的分類(lèi)轉(zhuǎn)移酶催化基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng),即將一個(gè)底物分子的基團(tuán)或原子轉(zhuǎn)移到另一個(gè)底物的分子上。
例如,谷丙轉(zhuǎn)氨酶催化的氨基轉(zhuǎn)移反應(yīng)。
AR+BA+BR(2)轉(zhuǎn)移酶Transferase谷丙轉(zhuǎn)氨酶Ala-酮戊二酸Glu3.酶的分類(lèi)水解酶催化底物的加水分解反應(yīng)。
AB+H2OAOH+BH主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。例如,脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反應(yīng):(3)水解酶hydrolase裂合酶催化從底物分子中移去一個(gè)基團(tuán)或原子形成雙鍵的反應(yīng)及其逆反應(yīng)。
ABA+B主要包括醛縮酶、水化酶及脫氨酶等。
CH2OPO3H2
CH2OPO3H2+
(4)裂合酶LyaseC=OH0-C-HH-C-OHH-C-OHCH2OPO3H2C=OCH2OHH-C=OH-C-OHCH2OPO3H2醛縮酶1,6-二磷酸果糖磷酸二羥丙酮3-磷酸甘油醛3.酶的分類(lèi)異構(gòu)酶催化各種同分異構(gòu)體的相互轉(zhuǎn)化,即底物分子內(nèi)基團(tuán)或原子的重排過(guò)程。
例如,6-磷酸葡萄糖異構(gòu)酶催化的反應(yīng)。(5)異構(gòu)酶Isomerase6-磷酸葡萄糖6-磷酸果糖ABCHOC-OHHOC-HH-C-OHH-C-OHC-2OPO3H2CH2OHC=OHOC-HH-C-OHH-C-OHC-2OPO3H23.酶的分類(lèi)合成酶,又稱(chēng)為連接酶,能夠催化C-C、C-O、C-N以及C-S鍵的形成反應(yīng)。這類(lèi)反應(yīng)必須與ATP分解反應(yīng)相互偶聯(lián)。A+B+ATP+H-O-H===AB+ADP+Pi
例如,丙酮酸羧化酶催化的反應(yīng)。丙酮酸+CO2草酰乙酸(6)合成酶LigaseorSynthetase3.酶的分類(lèi)核酸酶是唯一的非蛋白酶。它是一類(lèi)特殊的RNA,能夠催化RNA分子中的磷酸酯鍵的水解及其逆反應(yīng)。核酸酶(催化核酸)ribozyme四、酶的化學(xué)本質(zhì)及專(zhuān)一性
(一)酶是蛋白質(zhì)實(shí)驗(yàn)證據(jù)如下:(1)元素組成與分子量一致(2)化學(xué)結(jié)構(gòu)和立體結(jié)構(gòu)一致(3)物理、化學(xué)性質(zhì)一致(二)酶的輔因子
酶簡(jiǎn)單酶結(jié)合酶酶蛋白輔因子輔酶(松)輔基(緊)(三)單體酶、寡聚酶和多酶絡(luò)合物1。單體酶分子量13000-350002。寡聚酶分子量35000-幾百萬(wàn)3。多酶絡(luò)合物一般由2-6個(gè)功能相同的酶組成。分子量在幾百萬(wàn)以上。四、酶的作用專(zhuān)一性(specificity)酶作用的專(zhuān)一性是酶有別于一般催化劑的最重要的特點(diǎn)。酶的高度專(zhuān)一性,對(duì)生命活動(dòng)有重要意義,它是新陳代謝得以有條不紊地進(jìn)行的保證之一,也是酶比其他催化劑的優(yōu)越之處。(一)酶作用的決對(duì)專(zhuān)一性和相對(duì)專(zhuān)一性(1)鍵的專(zhuān)一性不同的酶,其專(zhuān)一性程度可以很不相同。一些酶對(duì)底物的專(zhuān)一性要求較低,能作用于結(jié)構(gòu)類(lèi)似的一系列化合物,通常稱(chēng)為相對(duì)專(zhuān)一性。例如,酯酶可以水解任何醇與醇所形成的酯,它不受酯鍵兩端基團(tuán)R和R’的限制。OR=C-O-R’+H2ORCOOH+R’OH又如二肽酶可以水解二肽的肽鍵,而不管這個(gè)二肽是由哪兩種氨基酸組成的。
OH2N-C-C-NH-C-COOHRR(2)基團(tuán)專(zhuān)一性還有一些酶對(duì)底物的要求較高,不但要求底物具有一定的化學(xué)鍵,而且對(duì)鍵的某一端所連的基團(tuán)也有一定的要求。例如,-葡萄糖苷酶能催化任何-葡萄糖苷的水解。此酶要求底物是D-葡萄糖通過(guò)-糖苷鍵所形成的糖苷,但不要求R基團(tuán)。R基可以是直鏈的,支鏈的或環(huán)狀的脂肪族基團(tuán)或芳香環(huán)。oR+ROHOH胰蛋白酶能夠水解堿性氨基酸,如精氨酸或賴(lài)氨酸的羧基形成的肽鍵,而對(duì)此肽鍵氨基端的氨基酸殘基沒(méi)有什么要求?!狽H-C-CO—NH—CHLysRArg或此外,還有一些酶對(duì)底物的要求是絕對(duì)專(zhuān)一性(absolutespecificity)。除一種底物外,不作用任何其他物質(zhì)。對(duì)底物分子作任何細(xì)微的改變,酶就不能對(duì)它催化作用了。例如脲酶只能作用于尿素,催化其水解產(chǎn)生NH3和CO2。R如果在尿素分子上加進(jìn)一個(gè)甲基,脲酶就不能催化這個(gè)反應(yīng)。
H2N-CO-NH2+H2O2NH3+CO2H3C-NH-CO-N
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