2020年癌癥診斷領(lǐng)域突破性成果

【1】NatCommun:成功繪制出關(guān)鍵5hmC生物標(biāo)志物的全基組圖譜有望改善人類癌癥的診斷doi:10.1038/s41467-020-20001-w近日，一篇發(fā)表在國(guó)際雜志NatureCommunications上的研究報(bào)告中，來(lái)自芝加哥大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究繪制出了一張涵蓋多種人類組織類型的全基因組5-羥甲基胞嘧啶（5hmC）圖譜，該圖譜揭示了5hmC作為能檢測(cè)多種嚴(yán)重人類疾?。ū热绨┌Y和多種慢性疾?。┑耐ㄓ眯蜕飿?biāo)志物的強(qiáng)大性能。與基因抑制標(biāo)志物5mC不同的是，5hmC是一種特殊的基因激活標(biāo)志物，其代表了參與胚胎發(fā)生調(diào)節(jié)、神經(jīng)過(guò)程和致癌過(guò)程的最普遍流行的途徑之一，這種新型圖譜的繪制或有望幫助科學(xué)家們理解誘發(fā)多種疾病的多種生物學(xué)驅(qū)動(dòng)因子，這對(duì)于開發(fā)新一代診斷檢測(cè)試劑非常重要。研究者ChuanHe教授說(shuō)道，此前研究表明，5hmC或能作為一種優(yōu)秀的生物標(biāo)志物進(jìn)行包括癌癥在內(nèi)的多種人類疾病的診斷和預(yù)后評(píng)估，但缺少全身組織的圖譜或會(huì)限制我們對(duì)這一標(biāo)記及其潛在的組織特異性的全面了解。通過(guò)聯(lián)合研究，這項(xiàng)研究擴(kuò)展了我們對(duì)全局生物標(biāo)志物的理解，同時(shí)這也是研究人員所報(bào)道的最廣泛的關(guān)于5hmC修飾的人體組織圖譜，新型圖譜的繪制證實(shí)了5hmC或能作為基因體和

增強(qiáng)子的普遍基因激活標(biāo)志物，其具有非常好的組織和細(xì)胞類型特異性，對(duì)于未來(lái)改善人類癌癥的早期診斷和人類慢性疾病的監(jiān)測(cè)或許至關(guān)重要。【2】NatCommun:新型表觀基組平臺(tái)或有望實(shí)現(xiàn)對(duì)早期胰腺癌的準(zhǔn)確診斷doi:10.1038/s41467-020-18965-w近日，一篇刊登在國(guó)際雜志NatureCommunications上的研究報(bào)告中，來(lái)自藍(lán)星基因公司(BluestarGenomics)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究證實(shí)了其所開發(fā)的新型平臺(tái)在檢測(cè)早期胰腺癌方面的強(qiáng)大潛力，這或有望幫助解決目前僅在美國(guó)每年都有超過(guò)6萬(wàn)名被診斷為胰腺癌患者未得到及時(shí)診斷的需求。這種新型的表觀基因組平臺(tái)能通過(guò)分析簡(jiǎn)單的血樣，并診斷患者機(jī)體血液中循環(huán)的DNA中是否存在胰腺癌細(xì)胞的DNA信息，從而就能實(shí)現(xiàn)對(duì)疾病的非侵入性精準(zhǔn)檢測(cè)，并能夠更加及時(shí)地對(duì)患者采取治療措施并提高患者的生存率?！?】NatCommun:新型表觀基組平臺(tái)或有望實(shí)現(xiàn)對(duì)早期胰腺癌研究者SamuelLevy表示，胰腺癌是一種致死性的疾病，目前針對(duì)大規(guī)模人群并沒(méi)有有效的篩查手段。這項(xiàng)研究中我們所開發(fā)的新技術(shù)就能為開發(fā)新型篩查手段提供基礎(chǔ)，并能為液體活檢和未來(lái)癌癥的篩查設(shè)定一種新標(biāo)準(zhǔn)。研究人員納入了307名患者（40歲及以上的患者）進(jìn)行研究，他們使用新技術(shù)識(shí)別出了成千上萬(wàn)個(gè)基因的不同模式，這些模式或能充當(dāng)用于基于血液的胰腺癌檢測(cè)的生物標(biāo)志物，幫助開發(fā)新型癌癥篩查技術(shù)?！?】SciRep:科學(xué)家有望盡可能早地對(duì)胰腺癌進(jìn)行診斷doi:10.1038/S41598-020-59523-0胰腺癌很少會(huì)在早期被發(fā)現(xiàn)，因?yàn)榛颊叩陌Y狀通常直到癌癥進(jìn)展才會(huì)表現(xiàn)出來(lái)，通常治療胰腺癌的手段包括手術(shù)、化療或放療。近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志ScientificReports上的研究報(bào)告中，來(lái)自密蘇里大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究發(fā)現(xiàn)，一種諸如RNA等新型的生物片段或能作為檢測(cè)早期胰腺癌的生物標(biāo)志物。研究者SenthilKumar教授說(shuō)道，如果我們盡可能早地對(duì)胰腺癌進(jìn)行診斷，那么臨床醫(yī)生就會(huì)對(duì)患者及時(shí)采取治療措施，最終幫助改善患者的治療和預(yù)后表現(xiàn)。通過(guò)以一種微創(chuàng)的方式抽取患者的血液樣本，研究者就能對(duì)存在于血液中的外泌體進(jìn)行分析，外泌體中包含有來(lái)自正常和腫瘤細(xì)胞中不同的生物學(xué)信息。【4】Cell:液體樣品檢測(cè)可用于癌癥的診斷doi:10.1016/j.cell.2020.07.009由于在早期發(fā)現(xiàn)癌癥時(shí)更容易成功得到治療，因此癌癥研究的主要目標(biāo)之一是開發(fā)新的方法，以便在腫瘤開始擴(kuò)散之前及早發(fā)現(xiàn)它們。其中一類方法是液體活檢，這些測(cè)試旨在通過(guò)檢測(cè)血液樣本中的生物標(biāo)志物來(lái)發(fā)現(xiàn)和診斷。近日，發(fā)表在Cell雜志的一項(xiàng)研究中，研究者表示，癌癥醫(yī)學(xué)中的一項(xiàng)重大任務(wù)就是根據(jù)血液檢查診斷患者是否患有早期癌癥。以前有關(guān)液體活檢的許多工作都集中在檢測(cè)和分析癌細(xì)胞釋放到血液中的癌癥基因。這些液體活檢中的一部分，包括MSK-ACCESS，已被批準(zhǔn)為監(jiān)測(cè)治療并指導(dǎo)癌癥患者接受靶向治療。這項(xiàng)新的研究重點(diǎn)不是分析基因，而是檢查EVP中包含的蛋白質(zhì)。研究者指出，腫瘤可能釋放EVP，以此作為準(zhǔn)備身體其他部位擴(kuò)散時(shí)接受癌細(xì)胞的一種方式。[5]NatCommun:新技術(shù)提早4年診斷癌癥！中外科學(xué)家開發(fā)突破性癌癥早期診斷技術(shù)！doi:10.1038/s41467-020-17316-z一個(gè)包括復(fù)旦大學(xué)、山東大學(xué)、加州大學(xué)圣地亞哥分校、鹍遠(yuǎn)基因等機(jī)構(gòu)的研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種非侵入性血液測(cè)試，可以檢測(cè)一個(gè)人是否患有五種常見(jiàn)癌癥（胃癌、食道癌、結(jié)直腸癌、肺癌和肝癌），且可以比目前的癌癥診斷方法早四年檢測(cè)出癌癥。相關(guān)研究成果發(fā)表在NatureCommunications上。這項(xiàng)被稱為PanSeer的ctDNA甲基化多癌篩查技術(shù)可以在收集樣本時(shí)無(wú)癥狀且僅在一到四年后被診斷為癌癥的個(gè)體中檢測(cè)出91%的癌癥樣本。此外，在收集樣本時(shí)已經(jīng)確診的113名患者中，該檢測(cè)準(zhǔn)確地檢測(cè)出了88%的癌癥。該測(cè)試也識(shí)別出95%的無(wú)癥狀癌癥樣本。該技術(shù)由鹍遠(yuǎn)基因原創(chuàng)研發(fā)。這項(xiàng)研究的獨(dú)特之處在于，研究人員獲得了尚未確診的無(wú)癥狀患者的血樣。這使得研究小組能夠開發(fā)出一種比傳統(tǒng)診斷方法更早發(fā)現(xiàn)癌癥標(biāo)志物的檢測(cè)方法。這些樣本是復(fù)旦大學(xué)2007年開展的一項(xiàng)為期10年的縱向研究的一部分。研究人員的最終目標(biāo)是在每年的健康檢查中進(jìn)行例行的血液檢測(cè)。但目前的重點(diǎn)是根據(jù)家族史、年齡或其他已知的風(fēng)險(xiǎn)因素，檢測(cè)高風(fēng)險(xiǎn)人群。圖片來(lái)源：Wikimedia【6】Nature子刊：基于ctDNA的液體活檢技術(shù)在癌癥診斷中的成用進(jìn)展!doi:10.1038/S43018-020-0043-5近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志NatureCancer上題為“CirculatingtumorDNAandliquidbiopsyinoncology”的綜述報(bào)告中，來(lái)自多倫多大學(xué)的科學(xué)家們深入分析了循環(huán)腫瘤DNA和腫瘤液體活檢的研究進(jìn)展。如今利用分析循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）來(lái)檢測(cè)及監(jiān)測(cè)癌癥的技術(shù)越來(lái)越成熟，而且越來(lái)越多的研究證據(jù)揭示了該技術(shù)在診斷測(cè)試中的能力，ctDNA液體活檢在實(shí)體瘤和惡性血液癌癥中的診斷、特性分析及管理中的全部潛力將通過(guò)評(píng)估臨床實(shí)用性的介入性臨床試驗(yàn)來(lái)揭示，這篇綜述報(bào)告匯總，研究人員討論了ctDNA液體活檢在癌癥檢測(cè)中的應(yīng)用以及未來(lái)臨床應(yīng)用的前景。文章中，研究人員從以下幾方面進(jìn)行了闡述，1）轉(zhuǎn)移性實(shí)體瘤中的ctDNA；2）免疫療法反應(yīng)的基因組關(guān)聯(lián)性；3）從臨床試驗(yàn)到臨床應(yīng)用；4）ctDNA的動(dòng)態(tài)變化和療法反應(yīng)；5）獲得性耐藥性的識(shí)別和特性分析；6）癌前診斷和篩查；7）引入基于ctDNA的癌癥篩查；8）基于ctDNA的臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)等。研究者表示，建立基于ctDNA的癌癥篩查或?qū)⑿枰獙⒅T如此類檢測(cè)技術(shù)整合到現(xiàn)有的臨床護(hù)理治療中去，由于相關(guān)危害會(huì)相對(duì)減少，因此癌癥風(fēng)險(xiǎn)較高的人群通常會(huì)接受初級(jí)癌癥篩查。比如，癌癥易感性基因種系突變的人群通常要接受密集性的篩查程序，包括定期體檢、血液檢查和醫(yī)學(xué)成像等。同樣地，研究人員還建議人們?cè)谙薅ǖ哪挲g范圍內(nèi)進(jìn)行子宮頸癌的篩查從而提高篩查試驗(yàn)的陽(yáng)性預(yù)測(cè)值，這些設(shè)置對(duì)于評(píng)估基于ctDNA的篩查策略或許是理想的，因?yàn)楝F(xiàn)有的試驗(yàn)具有能夠形成進(jìn)行比較的基礎(chǔ)性特彳正?！?】Cell:科學(xué)家開發(fā)出一種新型的血液檢測(cè)手段或能有效改善對(duì)肝癌人群的篩查doi:10.1016/j.cell.2020.05.038近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志Cell上的研究報(bào)告中，來(lái)自美國(guó)國(guó)家癌癥研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究開發(fā)出了一種新型檢測(cè)手段，其能幫助識(shí)別更有可能患上肝細(xì)胞癌(HCC，hepatocellularcarcinoma)的人群。肝細(xì)胞癌是一種最常見(jiàn)的肝癌類型，這種新方法能利用簡(jiǎn)單的血液檢測(cè)手段來(lái)檢查患者此前是否暴露于特定的病毒感染中。研究者XinWeiWang說(shuō)道，與當(dāng)前的篩選手段結(jié)合在一起時(shí)，這種新型檢測(cè)手段在篩查HCC風(fēng)險(xiǎn)人群中扮演著非常重要的角色，其能幫助臨床醫(yī)生盡可能早地發(fā)現(xiàn)和并治療HCC。這種新方法相對(duì)簡(jiǎn)單且便宜，僅需要患者少量的血液樣本就能進(jìn)行檢測(cè)?！?】ClinCancerRes:突破!新型血液檢測(cè)技術(shù)或能更早地實(shí)現(xiàn)胰腺癌的診斷！doi:10.1158/1078-0432.CCR-19-3313近日，一篇發(fā)表在國(guó)際雜志ClinicalCancerResearch上的研究報(bào)告中，來(lái)自賓夕法尼亞大學(xué)Perelman醫(yī)學(xué)院等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究開發(fā)了一種新型的血液檢測(cè)手段，其不僅能夠檢測(cè)尚處于早期階段的常見(jiàn)胰腺癌，還能幫助臨床醫(yī)生準(zhǔn)確評(píng)估患者的疾病進(jìn)展階段及對(duì)患者進(jìn)行最佳的治療。在盲法研究中，相比其它任何的生物標(biāo)志物而言，這種新型的液體活檢技術(shù)能夠進(jìn)行更為準(zhǔn)確地檢測(cè)，同時(shí)還能比單獨(dú)使用成像技術(shù)而言更加準(zhǔn)確地對(duì)患者的疾病進(jìn)行分期。胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC，Pancreaticductaladenocarcinoma)是一種最常見(jiàn)的胰腺癌，其是癌癥患者死亡的第三大原因，患者總體的5年生存率僅為9%，大部分患者在確診后存活時(shí)間不足一年。目前針對(duì)這種癌癥最大的挑戰(zhàn)之一就是如何在疾病進(jìn)展或擴(kuò)散之前對(duì)其準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)，如果發(fā)現(xiàn)的早，患者或許會(huì)選擇外科手術(shù)來(lái)移除腫瘤，而且這或許是可以治愈的。對(duì)于局部疾病進(jìn)展的患者而言，即癌癥除了胰腺外并不會(huì)進(jìn)行擴(kuò)散，但根據(jù)腫瘤的大小和位置并不適合進(jìn)行手術(shù)的患者。【9】Nature:科學(xué)家成功利用機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)對(duì)肺癌患者進(jìn)行早期診doi:10.1038/S41586-020-2140-0日前，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志Nature上的研究報(bào)告中，來(lái)自斯坦福大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究或有望利用機(jī)器學(xué)習(xí)手段來(lái)檢測(cè)人類患者機(jī)體中的早期肺癌。文章中，研究人員分析并檢測(cè)了這種機(jī)器學(xué)習(xí)系統(tǒng)，以及其尋找血液樣本中的循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）的能力。肺癌是一種最常見(jiàn)的致死性癌癥，與很多癌癥一樣，肺癌發(fā)現(xiàn)得越早，患者的生存機(jī)會(huì)就越大。但很不幸的是，目前研究人員僅能通過(guò)CT掃描來(lái)對(duì)肺癌進(jìn)行診斷，這種檢測(cè)手段不僅昂貴而且假陽(yáng)性率較高，基于這一原因，研究人員一直想通過(guò)研究開發(fā)出能在早期階段對(duì)肺癌進(jìn)行診斷的血液檢測(cè)手段?！?0】NatBiotechnol:科學(xué)家開發(fā)出有望加速癌癥診斷的新技術(shù)—scTRIPdoi:10.1038/s41587-019-0366-x近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志NatureBiotechnology上的研究報(bào)告中，來(lái)自歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究開發(fā)了一種便宜快速的方法來(lái)檢查單一細(xì)胞中的遺傳差異。就能夠接收到的信息而言，該方法的性能優(yōu)于現(xiàn)有的技術(shù)，這種新方法有望成為單細(xì)胞研究的新