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文檔簡介
生物化學(xué)氨基酸結(jié)構(gòu)與性質(zhì)1.掌握蛋白質(zhì)的基本構(gòu)成單體:氨基酸的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),從各氨基酸的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)上理解氨基酸的分類。2.掌握氨基酸的理化性質(zhì),重點(diǎn)掌握兩性電離與等電點(diǎn)含義。3氨基酸的化學(xué)性質(zhì)及其應(yīng)用目的與要求蛋白質(zhì)的元素組成蛋白質(zhì)是有機(jī)化合物,離不開C、H、O三種元素,還含有N、P、S、金屬元素等。含量%:50~556~720~2315~170.3~3微量或無元素組成:CHONS其它蛋白質(zhì)中N是特征元素,且含量恒定,為16%左右,即16克氮/100克蛋白質(zhì),故可以用定氮法測量蛋白質(zhì)含量,即:每100克蛋白質(zhì)含氮16克,100/16=6.25克蛋白質(zhì)含氮1克。所以,每克樣品含氮量×6.25×100=100克樣品蛋白質(zhì)含量(克%)。
有些蛋白質(zhì)含有其他微量元素:P、Fe、Cu、Mn、Zn、Co、Mo、I等。
2.堿水解條件:4mol/LBa(OH)2或6mol/LNaOH煮沸6小時(shí)。優(yōu)點(diǎn):水解徹底,色氨酸不被破壞,水解液清亮。缺點(diǎn):產(chǎn)生消旋產(chǎn)物,破壞的氨基酸多,一般很少使用。3.蛋白酶水解條件:蛋白酶如胰蛋白酶、糜蛋白酶,常溫37~40℃,pH值5~8。優(yōu)點(diǎn):氨基酸不被破壞,不發(fā)生消旋現(xiàn)象。缺點(diǎn):水解不完全,中間產(chǎn)物多。
蛋白質(zhì)酸堿水解常用于蛋白質(zhì)的組成分析,而酶水解用于制備蛋白質(zhì)水解產(chǎn)物。二、蛋白質(zhì)分子的基本組成單位——氨基酸(一)氨基酸的結(jié)構(gòu)通式:1、構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸均為L-α-氨基酸。2、除R為H(甘氨酸)外,其余氨基酸均具有旋光性。3、各種氨基酸的區(qū)別在于側(cè)基R基上。從氨基酸的結(jié)構(gòu)通式可以看出:(二)氨基酸的構(gòu)型:構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸除甘氨酸外,均含有α-碳原子,在空間各原子有兩種排列方式:L-構(gòu)型與D-構(gòu)型,它們的關(guān)系就像左右手的關(guān)系,互為鏡像關(guān)系,下圖以丙氨酸為例:2、按側(cè)基R基的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)分:
(1)脂肪族氨基酸(2)芳香族氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸(3)雜環(huán)氨基酸:脯氨酸、組氨酸3、按側(cè)基R基與水的關(guān)系分:
(1)非極性氨基酸:有丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、脯氨酸。(2)極性不帶電氨基酸:甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸、蘇氨酸。(3)極性帶電氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸、賴氨酸、精氨酸、組氨酸。二十種氨基酸的名稱和結(jié)構(gòu)如圖所示:注:二十種氨基酸的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)支鏈氨基酸:纈氨酸、亮氨酸,異亮氨酸含羥基的氨基酸:絲氨酸、蘇氨酸含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巰基)、甲硫氨酸(含硫甲基)含苯環(huán)的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸含胍基的氨基酸:精氨酸含咪唑基的氨基酸:組氨酸亞氨基酸:脯氨酸含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺含吲哚基的氨基酸:色氨酸含ε-氨基的氨基酸:賴氨酸(五)非蛋白氨基酸鳥氨酸、胍氨酸、高半胱氨酸、高絲氨酸、β-丙氨酸、γ-氨基丁酸等三.氨基酸的理化性質(zhì)(一)物理性質(zhì)1.形態(tài):均為白色結(jié)晶或粉末,不同氨基酸的晶型結(jié)構(gòu)不同。2.溶解性:一般都溶于水,不溶或微溶于醇,不溶于丙酮,在稀酸和稀堿中溶解性好。3.熔點(diǎn):氨基酸的熔點(diǎn)一般都比較高,一般都大于200℃,超過熔點(diǎn)以上氨基酸分解產(chǎn)生胺和二氧化碳。4..旋光性:除甘氨酸外的氨基酸均有旋光性。5.光吸收:氨基酸在可見光范圍內(nèi)無光吸收,在近紫外區(qū)含苯環(huán)氨基酸有光的吸收。(二)化學(xué)性質(zhì)1.氨基酸的兩性電離及等電點(diǎn):氨基酸既含有氨基,可接受H+,又含有羧基,可電離出H+,所以氨基酸具有酸堿兩性性質(zhì)。通常情況下,氨基酸以兩性離子的形式存在,如下圖所示:
從上圖可知:氨基酸在酸性環(huán)境中,主要以陽離子的形式存在,在堿性環(huán)境中,主要以陰離子的形式存在。在某一pH環(huán)境下,以兩性離子(兼性離子)的形式存在。該pH稱為該氨基酸的等電點(diǎn)。所以氨基酸的等電點(diǎn)可以定義為:氨基酸所帶正負(fù)電荷相等時(shí)的溶液pH。左圖是甘氨酸的電離酸堿滴定曲線,從左向右是用NaOH滴定的曲線,溶液的pH由小到大逐漸升高;從右向左是用鹽酸滴定的曲線,溶液的pH由大到小逐漸降低。曲線中從左向右第一個(gè)拐點(diǎn)是氨基酸羧基解離50%的狀態(tài),第二個(gè)拐點(diǎn)是氨基酸的等電點(diǎn),第三個(gè)拐點(diǎn)是氨基酸氨基解離50%的狀態(tài)。
通過氨基酸的滴定曲線,可用下列Henderson-Hasselbalch方程求出各解離基團(tuán)的解離常數(shù)(pK’):
根據(jù)pK’可求出氨基酸的等電點(diǎn),可由其等電點(diǎn)左右兩個(gè)pK,值的算術(shù)平均值求出。中性氨基酸:
pI=(pK’1
+pK’2)/2pK’1為α-羧基的解離常數(shù),pK’2為α-氨基的解離常數(shù)。氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算二十種氨基酸的pK,及等電點(diǎn):
2.由α-氨基參加的反應(yīng):
(1)與亞硝酸反應(yīng):放出氮?dú)?,氮?dú)獾囊话雭碜园被话雭碜詠喯跛?,在通常情況下測定生成的氮?dú)獾捏w積量可計(jì)算氨基酸的量,此反應(yīng)可用于測定蛋白質(zhì)的水解程度。(2)與甲醛的反應(yīng):用過量的中性甲醛與氨基酸反應(yīng),可游離出氫離子,然后用NaOH滴定,從消耗的堿量可以計(jì)算出氨基酸的含量。此法稱為間接滴定法。(3)與2,4-二硝基氟苯(2,4-DNFB)的反應(yīng)(Sanger反應(yīng)):在堿性條件下生成黃色的二硝基苯-氨基酸衍生物。(4)與苯異硫氰酸酯(PITC)反應(yīng)(Edman反應(yīng)):生成苯乙內(nèi)酰硫脲-氨基酸。(5)與丹磺酰氯(DNS-Cl)的反應(yīng):堿性環(huán)境生成熒光物質(zhì)DNS-氨基酸。(3)、(4)、(5)反應(yīng)用于蛋白質(zhì)的N-末端的測定。3.α-羧基參加的反應(yīng):(1)與堿反應(yīng)成鹽(2)與醇反應(yīng)成酯(3)與?;噭┓磻?yīng)成酰氯
4.α-氨基與α-羧基共同參加的反應(yīng)與茚三酮的反應(yīng):除脯氨酸與羥脯氨酸外,可與其它氨基酸生成藍(lán)紫色化合物。脯氨酸與羥脯氨酸為黃色化合物。
(1)
Millon反應(yīng):檢測Tyr或含Tyr的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。
Millon試劑:汞的硝酸鹽與亞硝酸鹽溶液。
產(chǎn)物:紅色的化合物。(2)
Folin反應(yīng):檢測Tyr或含Tyr的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。
Folin試劑:磷鉬酸、磷鎢酸混合溶液。
產(chǎn)物:藍(lán)色的鉬藍(lán)、鎢藍(lán)。(3)
坂口反應(yīng):檢測Arg或含Arg的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。
坂口試劑:α—萘酚的堿性次溴酸鈉溶液。
產(chǎn)物:磚紅色的沉淀。5.側(cè)鏈反應(yīng)(顏色反應(yīng)):(4)
Pauly反應(yīng):檢測His、Tyr及含His、Tyr蛋白質(zhì)的反應(yīng)。試劑:對氨基苯磺酸鹽酸溶液、亞硝酸鈉、碳酸鈉混合溶液產(chǎn)物:橘紅色的化合物。(5)乙醛酸的反應(yīng):檢測Trp或含Trp蛋白質(zhì)的反應(yīng)。當(dāng)Trp與乙醛酸和濃硫酸在試管中疊加時(shí),產(chǎn)生分層現(xiàn)象,界面出現(xiàn)紫色環(huán)。(6)Cys的反應(yīng):Cys或含Cys蛋白質(zhì)與亞硝基亞鐵氰酸鈉在稀氨的溶液中,產(chǎn)生一種紅色的化合物。四.氨基酸的分離測定(一)層析法層析法是利用被分離樣品混合物中各組分的化學(xué)性質(zhì)的差異,使各組分以不同程度分布在兩個(gè)
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