海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析課件_第1頁
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文檔簡介

研究生:楊冠科指導(dǎo)教師:叢麗娜教授海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析研究生:楊冠科海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析1海參鈣離子通道簡介論文的主要工作內(nèi)容結(jié)論與展望②①③海參鈣離子通道簡介論文的主要工作內(nèi)容結(jié)論與展望②①③2海參(SeaCucumber)海參(SeaCucumber)3海參自溶現(xiàn)象,困擾生產(chǎn)商多年養(yǎng)殖過程中遇到的諸多問題,持續(xù)出現(xiàn)傳統(tǒng)的理論解釋和研究方法不能滿足生產(chǎn)和科研的需要。關(guān)鍵問題-------海洋的高鹽濃度及高壓環(huán)境鹽離子濃度離子通道海參自溶現(xiàn)象,困擾生產(chǎn)商多年4離子通道(IonChannel)離子通道(IonChannel)5鈣離子通道鈣離子通道6本文用分子生物學(xué)手段對海參體內(nèi)的鈣離子通道β亞基基因進(jìn)行了研究用生物信息學(xué)手段對所得到的該基因全序列進(jìn)行了性質(zhì)分析本文用分子生物學(xué)手段對海參體內(nèi)的鈣離子通道β亞基基因進(jìn)行了研7論文的主要工作內(nèi)容總RNA的提取利用設(shè)計的簡并引物進(jìn)行RT-PCR設(shè)計引物,進(jìn)行3'RACEPCR設(shè)計引物,進(jìn)行5'RACEPCR拼接全序列并進(jìn)行生物信息學(xué)分析論文的主要工作內(nèi)容總RNA的提取8總RNA的提取TRIzol法總RNA的提取TRIzol法9RT-PCR簡并引物的設(shè)計

為了設(shè)計簡并引物,我們比對了如下物種鈣離子通道β亞基的氨基酸序列:

合浦珠母貝(Pinctadafucata,GenBankaccessionnumber:EF154452)

紫色球海膽(Strongylocentrotuspurpuratus,GenBankaccessionnumber:XM_785360)

錐實螺(Lymnaeastagnalis,GenBankaccessionnumber:AF484087)

人(Homosapiens,GenBankaccessionnumber:BC075049)

秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditiselegans,GenBankaccessionnumber:AF000198)

牛(BosTaurus,GenBankaccessionnumber:AF174417)

曼森血吸蟲(Schistosomamansoni,GenBankaccessionnumber:AY277532)目的:擴(kuò)增海參的鈣離子通道β亞基的保守區(qū)RT-PCR簡并引物的設(shè)計為了設(shè)計簡并引物,我們比對10海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析課件11最終引物HS4-1:5′-ARYAATGAYTGGTGGAT-3′HS4-2:5′-GCYTTYTGCATCATRTCT-3′注:R=A/GY=C/T最終引物HS4-1:5′-ARYAATGAYTGGTGG12RT-PCR結(jié)果

RT-PCR結(jié)果13二次PCR結(jié)果二次PCR結(jié)果14RT-PCR割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落PCR產(chǎn)物電泳圖RT-PCR割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落P15SjCaβ保守區(qū)測序結(jié)果443bpSjCaβ保守區(qū)測序結(jié)果443bp16SjCaβ保守區(qū)的BLASTXSjCaβ保守區(qū)的BLASTX17長度為443bp的產(chǎn)物5‘RACE實驗3‘RACE實驗拼接SjCaβ全序列長度為443bp的產(chǎn)物5‘RACE實驗3‘RACE實驗183′RACE引物設(shè)計3′RACEOuterPrimer:5′-TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT-3′HS4-1-GSP1(OuterPrimer):5′-TTCACCCTGGCTAACTCACG-3′3′RACEInnerPrimer:5′-CGCGGATCCTCCACTAGTGATTTCACTATAGG-3’HS4-1-GSP2(InnerPrimer):5′-GAATCGCTACGGAGAACGAAAAGTG-3′使用試劑盒:3′-FullRACECoreSetVer.2.0(TaKaRa)

3′RACE引物設(shè)計3′RACEOuterPrim193'RACEPCR結(jié)果

3’OuterPCR3’InnerPCR3'RACEPCR結(jié)果

3’OuterPCR3’Inn203’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落PCR產(chǎn)物電泳圖3’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落21SjCaβ3'RACE測序結(jié)果SjCaβ3'RACE測序結(jié)果22序列長為1019bp經(jīng)過序列比對得到此序列的5′端與SjCaβ序列保守區(qū)的3′端有188個堿基重合,且有poly(A)尾初步判斷3′端的擴(kuò)增是成功的序列長為1019bp235′RACE引物設(shè)計5′RACEOuterPrimer:5′-CATGGCTACATGCTGACAGCCTA-3′HS4-1-GSP3(OuterPrimer):5′-AGGCGGTGTGTTATCAGATTGCT-3′5′RACEInnerPrimer:5′-CGCGGATCCACAGCCTACTGATGATCAGTCGATG-3′HS4-1-GSP4(InnerPrimer):5′-GTGTCCCACTTTTCGTTCTCCGTAGC-3′使用試劑盒:5′-FullRACEKit(TaKaRa)

5′RACE引物設(shè)計5′RACEOuterPrim245'RACEPCR結(jié)果

5’InnerPCR5'RACEPCR結(jié)果

5’InnerPCR255’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落PCR產(chǎn)物電泳圖5’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落26SjCaβ5'RACE測序結(jié)果SjCaβ5'RACE測序結(jié)果27序列長為879bp經(jīng)過序列比對得到此序列的3′端與SjCaβ序列保守區(qū)的5′端有281個堿基重合因此可初步判斷5′端是擴(kuò)增成功的序列長為879bp28把上述三段序列拼接并校正后,得到SjCaβcDNA基因全長1867bp將該cDNA序列提交至GenBank(GenBankaccessionnumber:EU853658)把上述三段序列拼接并校正后,得到SjCaβcDNA基因全長29SjCaβ的生物信息學(xué)分析利用NCBI的ORFFinder分析,SjCaβ全長cDNA中,5′非編碼區(qū)(UTR)179bp,3′UTR74bp,開放閱讀框(ORF)長度1614bp,編碼537個氨基酸在3′端的非編碼區(qū)中,距離poly(A)尾上游10個核苷酸的位置有推測的真核生物基因的多聚腺苷酸加尾信號(polyadenylationsignalsite)AATAAA的出現(xiàn)SjCaβ的分子量預(yù)測值為59.8kD,理論等電點(diǎn)為8.77,分子式為C2583H4151N771O834S13Dipro軟件分析表明,在該氨基酸序列中共有3個半胱氨酸殘基,其中Cys410和Cys428之間可能會形成一個二硫鍵

SjCaβ的生物信息學(xué)分析利用NCBI的ORFFinder30ProtScale程序運(yùn)算的結(jié)果顯示:SjCaβ的第370位異亮氨酸(Ile)疏水性最強(qiáng),第501位組氨酸(His)親水性最強(qiáng),大部分氨基酸屬于親水性氨基酸(分?jǐn)?shù)為負(fù)值),由此可以推測此蛋白可能為親水性蛋白

ProtScale程序運(yùn)算的結(jié)果顯示:31海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析課件32海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析課件33SjCaβ包含有三個高度保守的功能區(qū)位于D4區(qū)的VDCCα亞基結(jié)合相關(guān)的BID區(qū)(Lys250~Phe290)位于D2區(qū)能夠調(diào)節(jié)激酶活性的SH3功能區(qū)(Val99~Ser159)位于D4區(qū)調(diào)節(jié)VDCCβ亞基活性的GK功能區(qū)(Arg265~Trp439)SjCaβ包含有三個高度保守的功能區(qū)34D1D2D2D3D3D4D4D4D5D5BIDSH3功能區(qū)GK功能區(qū)幾乎是整個D4區(qū)D1D2D2D3D3D4D4D4D5D5BIDSH3功能區(qū)G35SjCaβ內(nèi)的活性位點(diǎn)

9個蛋白激酶C(PKC)磷酸化位點(diǎn)ProteinkinaseC(PKC)phosphorylationsites9個酪蛋白激酶Ⅱ(CK2)磷酸化位點(diǎn)CaseinkinaseⅡ(CK2)phosphorylationsites2個cAMP依賴型蛋白激酶磷酸化位點(diǎn)cAMP-dependentproteinkinasephosphorylationsites

SjCaβ內(nèi)的活性位點(diǎn)9個蛋白激酶C(PKC)磷酸化位點(diǎn)36此圖模擬SjCaβ部分氨基酸(Glu77~His443)構(gòu)成的三級結(jié)構(gòu)。用箭頭指出了氨基酸殘基Pro262,Pro266,Pro272和Tyr277在此三維結(jié)構(gòu)中的位置(因其可能為β亞基與α1亞基重要的結(jié)合部位)。SjCaβ的SH3區(qū)和GK區(qū)均用白色表示。此圖模擬SjCaβ部分氨基酸(Glu77~His443)構(gòu)成37SjCaβ中GK區(qū)(Arg265~Trp439)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測。圖中BID區(qū)N端的序列用白色標(biāo)出。此模型顯示在這個重要的功能片段中是由一個中央β折疊和一個α螺旋組成。

SjCaβ中SH3區(qū)(Val99~Ser159)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測SjCaβ中GK區(qū)(Arg265~Trp439)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)38討論SjCaβ具有其他VDCCβ亞基共有的SH3區(qū),GK區(qū)以及BID區(qū)其他物種BID區(qū)中高度保守的序列PSMRP在SjCaβ中變成了PTIRP-------這段保守序列中重要的氨基酸是PKC磷酸化位點(diǎn)SMR中的絲氨酸,而TIR中的蘇氨酸也同樣是PKC磷酸化位點(diǎn),且二者都是中性氨基酸,因此推測這種變化并不會造成SjCaβ與其他物種的VDCCβ亞基在功能的差異。曼森血吸蟲(Schistosomamansoni)、日本血吸蟲(Schistosomajaponicum)和長槍烏賊(Loligobleekeri)等無脊椎動物亦有此現(xiàn)象。討論SjCaβ具有其他VDCCβ亞基共有的SH3區(qū),39結(jié)論首次從海參中克隆了電壓依賴性鈣離子通道β亞基基因的全長cDNA序列,并由此推測出相應(yīng)的氨基酸序列。所獲得基因的cDNA全長1867bp,包含一個開放閱讀框1614bp,編碼537個氨基酸。SjCaβ的分子量為59.8kD,理論等電點(diǎn)為8.77,分子式為C2583H4151N771O834S13。親水性蛋白。結(jié)論首次從海參中克隆了電壓依賴性鈣離子通道β亞基基因的40SjCaβ具有其他VDCCβ亞基共有的SH3區(qū),GK區(qū)以及BID區(qū),雖在氨基酸上略有不同,但其功能卻與其它的海洋棘皮動物比較相似。SjCaβ具有其他VDCCβ亞基共有的SH3區(qū),GK區(qū)以及41致謝感謝叢麗娜教授、朱蓓薇教授、張宗申教授、侯英敏老師、王璐老師等老師的指導(dǎo)感謝鄢榮歆、王秀霞、郝明、趙文超、王雪霞、薛衛(wèi)巍、田鵬瑋、郭茵、邊蕾、謝三群等同學(xué)的幫助最后還要感謝一直支持著我的親朋好友!致謝感謝叢麗娜教授、朱蓓薇教授、張宗申教授、侯英敏老師42THANKYOU!THANKYOU!433’RACEPCR反應(yīng)5’3’mRNAAAAA…TTTT…TTTT…AAAA…TTTT…5’3’3’adaptorouterprimerPCR反應(yīng)雙鏈DNA直接測序已知序列特異性引物Gsp1Gsp23’adaptorprimerinnerprimer3’RACEPCR反應(yīng)5’3’mRNAAAAA…TTTT445’RACEPCR反應(yīng)5’m7G-P-P-PAAA…3’5’m7G-P-P-PAAA…3’AAA…3’TAPHO-P5’adaptorRTAAA…3’5’5’Gsp1已知序列特異性引物

5’outerprimermRNAcDNARandom9mers5’RACEPCR反應(yīng)5’m7G-P-P-PAAA…45使用5’RACE方法擴(kuò)增5‘端序列3‘完整的RNA不完整的RNA3‘3‘PP去磷酸化酶(CIAP)去“帽子”酶(TAP)P5’RACEAdaptor使用5’RACE方法擴(kuò)增5‘端序列3‘完整的RNA不46TAP(—)反應(yīng):檢驗去磷酸化的反應(yīng)不徹底造成假陽性3‘完整的RNA不完整的RNA3‘3‘PP去磷酸化酶(CIAP)去“帽子”酶(TAP)5’RACEAdaptorTAP(—)反應(yīng):檢驗去磷酸化的反應(yīng)不徹底造成假陽性3‘47M-MLV(—)反應(yīng):檢測染色體DNA造成的假陽性3‘完整的RNA不完整的RNA3‘3‘PP反轉(zhuǎn)錄酶M-MLVP5’RACEAdaptorM-MLV(—)反應(yīng):檢測染色體DNA造成的假陽性3‘48ProteinkinaseC(Ser/Thr-X-Lys/Arg)CaseinkinaseII(Ser/Thr-X-X-Asp/Glu)cAMP-dependentproteinkinase(Lys/Arg-Lys/Arg-X-X-Ser/Thr)ProteinkinaseC(Ser/Thr-X-49研究生:楊冠科指導(dǎo)教師:叢麗娜教授海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析研究生:楊冠科海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析50海參鈣離子通道簡介論文的主要工作內(nèi)容結(jié)論與展望②①③海參鈣離子通道簡介論文的主要工作內(nèi)容結(jié)論與展望②①③51海參(SeaCucumber)海參(SeaCucumber)52海參自溶現(xiàn)象,困擾生產(chǎn)商多年養(yǎng)殖過程中遇到的諸多問題,持續(xù)出現(xiàn)傳統(tǒng)的理論解釋和研究方法不能滿足生產(chǎn)和科研的需要。關(guān)鍵問題-------海洋的高鹽濃度及高壓環(huán)境鹽離子濃度離子通道海參自溶現(xiàn)象,困擾生產(chǎn)商多年53離子通道(IonChannel)離子通道(IonChannel)54鈣離子通道鈣離子通道55本文用分子生物學(xué)手段對海參體內(nèi)的鈣離子通道β亞基基因進(jìn)行了研究用生物信息學(xué)手段對所得到的該基因全序列進(jìn)行了性質(zhì)分析本文用分子生物學(xué)手段對海參體內(nèi)的鈣離子通道β亞基基因進(jìn)行了研56論文的主要工作內(nèi)容總RNA的提取利用設(shè)計的簡并引物進(jìn)行RT-PCR設(shè)計引物,進(jìn)行3'RACEPCR設(shè)計引物,進(jìn)行5'RACEPCR拼接全序列并進(jìn)行生物信息學(xué)分析論文的主要工作內(nèi)容總RNA的提取57總RNA的提取TRIzol法總RNA的提取TRIzol法58RT-PCR簡并引物的設(shè)計

為了設(shè)計簡并引物,我們比對了如下物種鈣離子通道β亞基的氨基酸序列:

合浦珠母貝(Pinctadafucata,GenBankaccessionnumber:EF154452)

紫色球海膽(Strongylocentrotuspurpuratus,GenBankaccessionnumber:XM_785360)

錐實螺(Lymnaeastagnalis,GenBankaccessionnumber:AF484087)

人(Homosapiens,GenBankaccessionnumber:BC075049)

秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditiselegans,GenBankaccessionnumber:AF000198)

牛(BosTaurus,GenBankaccessionnumber:AF174417)

曼森血吸蟲(Schistosomamansoni,GenBankaccessionnumber:AY277532)目的:擴(kuò)增海參的鈣離子通道β亞基的保守區(qū)RT-PCR簡并引物的設(shè)計為了設(shè)計簡并引物,我們比對59海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析課件60最終引物HS4-1:5′-ARYAATGAYTGGTGGAT-3′HS4-2:5′-GCYTTYTGCATCATRTCT-3′注:R=A/GY=C/T最終引物HS4-1:5′-ARYAATGAYTGGTGG61RT-PCR結(jié)果

RT-PCR結(jié)果62二次PCR結(jié)果二次PCR結(jié)果63RT-PCR割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落PCR產(chǎn)物電泳圖RT-PCR割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落P64SjCaβ保守區(qū)測序結(jié)果443bpSjCaβ保守區(qū)測序結(jié)果443bp65SjCaβ保守區(qū)的BLASTXSjCaβ保守區(qū)的BLASTX66長度為443bp的產(chǎn)物5‘RACE實驗3‘RACE實驗拼接SjCaβ全序列長度為443bp的產(chǎn)物5‘RACE實驗3‘RACE實驗673′RACE引物設(shè)計3′RACEOuterPrimer:5′-TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT-3′HS4-1-GSP1(OuterPrimer):5′-TTCACCCTGGCTAACTCACG-3′3′RACEInnerPrimer:5′-CGCGGATCCTCCACTAGTGATTTCACTATAGG-3’HS4-1-GSP2(InnerPrimer):5′-GAATCGCTACGGAGAACGAAAAGTG-3′使用試劑盒:3′-FullRACECoreSetVer.2.0(TaKaRa)

3′RACE引物設(shè)計3′RACEOuterPrim683'RACEPCR結(jié)果

3’OuterPCR3’InnerPCR3'RACEPCR結(jié)果

3’OuterPCR3’Inn693’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落PCR產(chǎn)物電泳圖3’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落70SjCaβ3'RACE測序結(jié)果SjCaβ3'RACE測序結(jié)果71序列長為1019bp經(jīng)過序列比對得到此序列的5′端與SjCaβ序列保守區(qū)的3′端有188個堿基重合,且有poly(A)尾初步判斷3′端的擴(kuò)增是成功的序列長為1019bp725′RACE引物設(shè)計5′RACEOuterPrimer:5′-CATGGCTACATGCTGACAGCCTA-3′HS4-1-GSP3(OuterPrimer):5′-AGGCGGTGTGTTATCAGATTGCT-3′5′RACEInnerPrimer:5′-CGCGGATCCACAGCCTACTGATGATCAGTCGATG-3′HS4-1-GSP4(InnerPrimer):5′-GTGTCCCACTTTTCGTTCTCCGTAGC-3′使用試劑盒:5′-FullRACEKit(TaKaRa)

5′RACE引物設(shè)計5′RACEOuterPrim735'RACEPCR結(jié)果

5’InnerPCR5'RACEPCR結(jié)果

5’InnerPCR745’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落PCR產(chǎn)物電泳圖5’RACE割膠回收及菌落PCR結(jié)果割膠回收產(chǎn)物電泳圖菌落75SjCaβ5'RACE測序結(jié)果SjCaβ5'RACE測序結(jié)果76序列長為879bp經(jīng)過序列比對得到此序列的3′端與SjCaβ序列保守區(qū)的5′端有281個堿基重合因此可初步判斷5′端是擴(kuò)增成功的序列長為879bp77把上述三段序列拼接并校正后,得到SjCaβcDNA基因全長1867bp將該cDNA序列提交至GenBank(GenBankaccessionnumber:EU853658)把上述三段序列拼接并校正后,得到SjCaβcDNA基因全長78SjCaβ的生物信息學(xué)分析利用NCBI的ORFFinder分析,SjCaβ全長cDNA中,5′非編碼區(qū)(UTR)179bp,3′UTR74bp,開放閱讀框(ORF)長度1614bp,編碼537個氨基酸在3′端的非編碼區(qū)中,距離poly(A)尾上游10個核苷酸的位置有推測的真核生物基因的多聚腺苷酸加尾信號(polyadenylationsignalsite)AATAAA的出現(xiàn)SjCaβ的分子量預(yù)測值為59.8kD,理論等電點(diǎn)為8.77,分子式為C2583H4151N771O834S13Dipro軟件分析表明,在該氨基酸序列中共有3個半胱氨酸殘基,其中Cys410和Cys428之間可能會形成一個二硫鍵

SjCaβ的生物信息學(xué)分析利用NCBI的ORFFinder79ProtScale程序運(yùn)算的結(jié)果顯示:SjCaβ的第370位異亮氨酸(Ile)疏水性最強(qiáng),第501位組氨酸(His)親水性最強(qiáng),大部分氨基酸屬于親水性氨基酸(分?jǐn)?shù)為負(fù)值),由此可以推測此蛋白可能為親水性蛋白

ProtScale程序運(yùn)算的結(jié)果顯示:80海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析課件81海參鈣離子通道基因的克隆與性質(zhì)分析課件82SjCaβ包含有三個高度保守的功能區(qū)位于D4區(qū)的VDCCα亞基結(jié)合相關(guān)的BID區(qū)(Lys250~Phe290)位于D2區(qū)能夠調(diào)節(jié)激酶活性的SH3功能區(qū)(Val99~Ser159)位于D4區(qū)調(diào)節(jié)VDCCβ亞基活性的GK功能區(qū)(Arg265~Trp439)SjCaβ包含有三個高度保守的功能區(qū)83D1D2D2D3D3D4D4D4D5D5BIDSH3功能區(qū)GK功能區(qū)幾乎是整個D4區(qū)D1D2D2D3D3D4D4D4D5D5BIDSH3功能區(qū)G84SjCaβ內(nèi)的活性位點(diǎn)

9個蛋白激酶C(PKC)磷酸化位點(diǎn)ProteinkinaseC(PKC)phosphorylationsites9個酪蛋白激酶Ⅱ(CK2)磷酸化位點(diǎn)CaseinkinaseⅡ(CK2)phosphorylationsites2個cAMP依賴型蛋白激酶磷酸化位點(diǎn)cAMP-dependentproteinkinasephosphorylationsites

SjCaβ內(nèi)的活性位點(diǎn)9個蛋白激酶C(PKC)磷酸化位點(diǎn)85此圖模擬SjCaβ部分氨基酸(Glu77~His443)構(gòu)成的三級結(jié)構(gòu)。用箭頭指出了氨基酸殘基Pro262,Pro266,Pro272和Tyr277在此三維結(jié)構(gòu)中的位置(因其可能為β亞基與α1亞基重要的結(jié)合部位)。SjCaβ的SH3區(qū)和GK區(qū)均用白色表示。此圖模擬SjCaβ部分氨基酸(Glu77~His443)構(gòu)成86SjCaβ中GK區(qū)(Arg265~Trp439)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測。圖中BID區(qū)N端的序列用白色標(biāo)出。此模型顯示在這個重要的功能片段中是由一個中央β折疊和一個α螺旋組成。

SjCaβ中SH3區(qū)(Val99~Ser159)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測SjCaβ中GK區(qū)(Arg265~Trp439)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)87討論SjCaβ具有其他VDCCβ亞基共有的SH3區(qū),GK區(qū)以及BID區(qū)其他物種BID區(qū)中高度保守的序列PSMRP在SjCaβ中變成了PTIRP-------這段保守序列中重要的氨基酸是PKC磷酸化位點(diǎn)SMR中的絲氨酸,而TIR中的蘇氨酸也同樣是PKC磷酸化位點(diǎn),且二者都是中性氨基酸,因此推測這種變化并不會造成SjCaβ與其他物種的VDCCβ亞基在功能的差異。曼森血吸蟲(Schistosomamansoni)、日本血吸蟲(Schistosomajaponicum)和長槍烏賊(Loligobleekeri)等無脊椎動物亦有此現(xiàn)象。討論SjCaβ具有其他VDCCβ亞基共有的SH3區(qū),88結(jié)論首次從海參中克隆了電壓依賴性鈣離子通道β亞基基因的全長cDNA序列,并由此推測出相應(yīng)的氨基酸序列。所獲得基因的cDNA全長1867bp,包含一個開放閱讀框1614bp,編碼537個氨基酸。SjCaβ的分子量為59.8kD,理論等電點(diǎn)為8.77,分子式為C2583H4151N771O834S13。親水性蛋白。結(jié)論首次從海參中克隆了電壓依賴性鈣離子通道β亞基基因的89SjCaβ具有其他

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