分子機(jī)制研究的五個(gè)層次-202212211332153

``Word文檔Word文檔分子機(jī)制爭(zhēng)辯的五個(gè)層次，你的爭(zhēng)辯在哪個(gè)層次？原創(chuàng)2016-10-18小小聊科研談一下對(duì)這個(gè)問(wèn)題的理解。個(gè)人認(rèn)為，分子機(jī)制的爭(zhēng)辯總體來(lái)說(shuō)分為5個(gè)層次：層次一：相關(guān)性；一般對(duì)應(yīng)的文章分?jǐn)?shù)在1-3層次二：因果關(guān)系；一般對(duì)應(yīng)的文章分?jǐn)?shù)在3-5層次三：直接作用；一般對(duì)應(yīng)的文章分?jǐn)?shù)在5-10層次四：嵌套組合；一般對(duì)應(yīng)的文章分?jǐn)?shù)在10-20層次五：觀念創(chuàng)新；文章的層次是CNS下面我們開(kāi)放說(shuō)一下：層次一：相關(guān)性Amarker，比如甲胎蛋白AFP之于肝癌，所以有一類(lèi)爭(zhēng)辯我們稱(chēng)之為偽基礎(chǔ)爭(zhēng)辯，爭(zhēng)辯的名字比如：PrognosticSignificanceofgeneAexpressioninBdisease.或者AssociationbetweengeneAandBdisease.需要說(shuō)明的是相關(guān)性是最弱的規(guī)律聯(lián)系的，比如的房?jī)r(jià)與肺癌的發(fā)病率之間的相關(guān)性。相關(guān)文章：（策略篇）S4E25：從外泌體爭(zhēng)辯看biomarker類(lèi)課題設(shè)計(jì)層次二：因果關(guān)系在相關(guān)性的基礎(chǔ)上深化的一層關(guān)系是因果關(guān)系，即因果關(guān)系是相關(guān)性的子集。假如A基因表達(dá)或者突變與B疾病之間存在相關(guān)性A因素作為B疾病的biomarker；假如A基因是B疾病的緣由，那么我們可以通過(guò)干預(yù)A基因影響B(tài)疾病進(jìn)展。這點(diǎn)信任大家都知道。在分子機(jī)制爭(zhēng)辯中，因果關(guān)系的存在是我們要證明的第一步，比如在進(jìn)行某中藥通過(guò)AMPKAMPK的手段就是通過(guò)WB檢測(cè)AMPKZAMPK為了證明因果關(guān)系的其次個(gè)部分就是大家常說(shuō)的挽救試驗(yàn)，即假如上調(diào)A因素導(dǎo)致了結(jié)果的消滅，對(duì)A因素的下調(diào)是否可以逆轉(zhuǎn)B相關(guān)文章：（策略篇）S5E07:信號(hào)通路爭(zhēng)辯策略三步驟（策略篇）S5E56:大名鼎鼎的Rescue挽救試驗(yàn)，是個(gè)什么鬼？層次三：直接作用承接其次個(gè)層次，假如A因素是導(dǎo)致B結(jié)果消滅的緣由，那么A因素是直接緣由呢還是間接緣由？對(duì)應(yīng)到分子機(jī)制爭(zhēng)辯中就是這樣：A基因的上調(diào)導(dǎo)致了B蛋白的磷酸化，那么A基因直接與B相互作用介導(dǎo)的（直接作用）還是通過(guò)C介導(dǎo)的呢？所以為了證明這一點(diǎn)，我們通常用分子間的直接作用來(lái)驗(yàn)證，比如蛋白與蛋白作用的co-IP，GSTPulldown，蛋白與RNA作用的RNApulldown，蛋白與DNA作用的CHIP、EMSA與RNAB是直接結(jié)合的，“分子局部”爭(zhēng)辯就是確定蛋白A的什么局部（哪些氨基酸形成）RNAB做到這一步，絕大多數(shù)分子爭(zhēng)辯的深度就夠了，即使是最頂級(jí)CNS級(jí)別的文章要求也不過(guò)如此。相關(guān)文章：（文章篇）S3E5：一文把握LncRNA—蛋白—DNA互作爭(zhēng)辯方法（文章篇）S3E7：一文把握l(shuí)ncRNA爭(zhēng)辯的套路和創(chuàng)新點(diǎn)層次四：嵌套組合既然第三層次分子機(jī)制的爭(zhēng)辯深度已經(jīng)夠CNS級(jí)別的文章了，第四層次就不僅僅是爭(zhēng)辯深度的問(wèn)題了，而是故事的豐富度，在（策略篇）環(huán)環(huán)相扣：高分文章機(jī)制爭(zhēng)辯的秘訣和（比如在第三層次的爭(zhēng)辯中，我們已經(jīng)通過(guò)各種試驗(yàn)證明白lncRNAA通過(guò)抑制蛋白B的降解上調(diào)B除了通過(guò)抑制蛋白B的降解上調(diào)B的表達(dá)（層次三，還可以通過(guò)A的方式下調(diào)C表達(dá)從而促進(jìn)B的表達(dá)；反A除了通過(guò)抑制蛋白B的降解上調(diào)B的表達(dá)（層次三，而上調(diào)表``達(dá)的蛋白B促進(jìn)了lncRNAXXX的轉(zhuǎn)錄，從而形成正反饋回路。相關(guān)文章：（策略篇）環(huán)環(huán)相扣：高分文章機(jī)制爭(zhēng)辯的秘訣（策略篇）反饋回路：基金和文章裝逼利器（文章篇）S3E10：哎呦嘿，這小丫頭片子還有兩幅面孔呢？?。ㄎ恼缕喊ミ虾?，這小丫頭片子還有兩幅面孔呢？（二）層次五：觀念創(chuàng)新層次五就是最高層次了，即觀念層面的創(chuàng)新，一般到這個(gè)層次就是CNS級(jí)別了，比如新現(xiàn)象的發(fā)覺(jué)、兩個(gè)貌似沒(méi)有關(guān)系的現(xiàn)象之間聯(lián)系的揭示等，這點(diǎn)大家看CNS的文章應(yīng)當(dāng)有感受，舉個(gè)例子：外泌體的形成與細(xì)胞自噬之間有沒(méi)有關(guān)系呢？相關(guān)文章：（文章篇）S5E08:信號(hào)通路爭(zhēng)辯方法案