精要速覽分子生物學(xué)_第1頁(yè)
精要速覽分子生物學(xué)_第2頁(yè)
精要速覽分子生物學(xué)_第3頁(yè)
精要速覽分子生物學(xué)_第4頁(yè)
精要速覽分子生物學(xué)_第5頁(yè)
已閱讀5頁(yè),還剩98頁(yè)未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡(jiǎn)介

專(zhuān)題一DNA的生物合成

一、遺傳學(xué)的中心法則和反中心法則:

DNA通過(guò)復(fù)制將遺傳信息由親代傳遞給子代;通過(guò)轉(zhuǎn)錄和翻譯,將遺傳信息傳遞給蛋白質(zhì)分子,從而決定生物的表現(xiàn)型。DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程就構(gòu)成了遺傳學(xué)的中心法則。但在少數(shù)RNA病毒中,其遺傳信息貯存在RNA中。因此,在這些生物體中,遺傳信息的流向是RNA通過(guò)復(fù)制,將遺傳信息由親代傳遞給子代;通過(guò)反轉(zhuǎn)錄將遺傳信息傳遞給DNA,再由DNA通過(guò)轉(zhuǎn)錄和翻譯傳遞給蛋白質(zhì),這種遺傳信息的流向就稱(chēng)為反中心法則。二、DNA復(fù)制的特點(diǎn)1.半保留復(fù)制:DNA在復(fù)制時(shí),以親代DNA的每一股作模板,合成完全相同的兩個(gè)雙鏈子代DNA,每個(gè)子代DNA中都含有一股親代DNA鏈,這種現(xiàn)象稱(chēng)為DNA的半保留復(fù)制(semiconservativereplication)。DNA以半保留方式進(jìn)行復(fù)制,是在1958年由M.Meselson和F.Stahl所完成的實(shí)驗(yàn)所證明。

2.有一定的復(fù)制起始點(diǎn):DNA在復(fù)制時(shí),需在特定的位點(diǎn)起始,這是一些具有特定核苷酸排列順序的片段,即復(fù)制起始點(diǎn)。在原核生物中,復(fù)制起始點(diǎn)通常為一個(gè),而在真核生物中則為多個(gè)。3.需要引物(primer):DNA聚合酶必須以一段具有3'端自由羥基(3'-OH)的RNA作為引物,才能開(kāi)始聚合子代DNA鏈。RNA引物的大小,在原核生物中通常為50~100個(gè)核苷酸,而在真核生物中約為10個(gè)核苷酸。

4.雙向復(fù)制:DNA復(fù)制時(shí),以復(fù)制起始點(diǎn)為中心,向兩個(gè)方向進(jìn)行復(fù)制。但在低等生物中,也可進(jìn)行單向復(fù)制。

5.半不連續(xù)復(fù)制:由于DNA聚合酶只能以5'→3'方向聚合子代DNA鏈,因此兩條親代DNA鏈作為模板聚合子代DNA鏈時(shí)的方式是不同的。以3'→5'方向的親代DNA鏈作模板的子代鏈在聚合時(shí)基本上是連續(xù)進(jìn)行的,這一條鏈被稱(chēng)為領(lǐng)頭鏈(leadingstrand)。

而以5‘→3’方向的親代DNA鏈為模板的子代鏈在聚合時(shí)則是不連續(xù)的,這條鏈被稱(chēng)為隨從鏈(laggingstrand)。DNA在復(fù)制時(shí),由隨從鏈中先形成的一些子代DNA短鏈稱(chēng)為岡崎片段(Okazakifragment)。岡崎片段的大小,在原核生物中約為1000~2000個(gè)核苷酸,而在真核生物中約為100個(gè)核苷酸。

5.半不連續(xù)復(fù)制:由于DNA聚合酶只能以5'→3'方向聚合子代DNA鏈,因此兩條親代DNA鏈作為模板聚合子代DNA鏈時(shí)的方式是不同的。以3'→5'方向的親代DNA鏈作模板的子代鏈在聚合時(shí)基本上是連續(xù)進(jìn)行的,這一條鏈被稱(chēng)為領(lǐng)頭鏈(leadingstrand)。而以5'→3'方向的親代DNA鏈為模板的子代鏈在聚合時(shí)則是不連續(xù)的,這條鏈被稱(chēng)為隨從鏈(laggingstrand)。DNA在復(fù)制時(shí),所形成的一些子代DNA短鏈稱(chēng)為岡崎片段(Okazakifragment)。岡崎片段的大小,在原核生物中約為1000~2000個(gè)核苷酸,而在真核生物中約為100個(gè)核苷酸。

三、DNA復(fù)制的條件:1.底物:以四種脫氧核糖核酸(deoxynucleotidetriphosphate)為底物,即dATP,dGTP,dCTP,dTTP。

2.模板(template):以親代DNA的兩股鏈解開(kāi)后,分別作為模板進(jìn)行復(fù)制。

3.引發(fā)體(primosome)和RNA引物(primer):引發(fā)體由引發(fā)前體與引物酶(primase)組裝而成。引發(fā)前體是由若干蛋白因子聚合而成的復(fù)合體;引物酶本質(zhì)上是一種依賴(lài)DNA的RNA聚合酶(DDRP)。

4.DNA聚合酶(DNAdependentDNApolymerase,DDDP):⑴種類(lèi)和生理功能:在原核生物中,目前發(fā)現(xiàn)的DNA聚合酶有三種,分別命名為DNA聚合酶Ⅰ(polⅠ),DNA聚合酶Ⅱ(polⅡ),DNA聚合酶Ⅲ(polⅢ),這三種酶都屬于具有多種酶活性的多功能酶。polⅠ為單一肽鏈的大分子蛋白質(zhì),具有5'→3'聚合酶活性、3'→5'外切酶活性和5'→3'外切酶的活性;其功能主要是去除引物、填補(bǔ)缺口以及修復(fù)損傷。polⅡ具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,其功能不明。polⅢ是由十種亞基組成的不對(duì)稱(chēng)二聚體,具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,與DNA復(fù)制功能有關(guān)。

在真核生物中,目前發(fā)現(xiàn)的DNA聚合酶有五種。其中,參與染色體DNA復(fù)制的是polα(延長(zhǎng)隨從鏈)和polδ(延長(zhǎng)領(lǐng)頭鏈),參與線粒體DNA復(fù)制的是polγ,polε與DNA損傷修復(fù)、校讀和填補(bǔ)缺口有關(guān),polβ只在其他聚合酶無(wú)活性時(shí)才發(fā)揮作用。

⑵DNA復(fù)制的保真性:為了保證遺傳的穩(wěn)定,DNA的復(fù)制必須具有高保真性。DNA復(fù)制時(shí)的保真性主要與下列因素有關(guān):①遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律;②在復(fù)制時(shí)對(duì)堿基的正確選擇;③對(duì)復(fù)制過(guò)程中出現(xiàn)的錯(cuò)誤及時(shí)進(jìn)行校正。

5.DNA連接酶(DNAligase):DNA連接酶可催化兩段DNA片段之間磷酸二酯鍵的形成,而使兩段DNA連接起來(lái)。該酶催化的條件是:①需一段DNA片段具有3'-OH,而另一段DNA片段具有5'-Pi基;②未封閉的缺口位于雙鏈DNA中,即其中有一條鏈?zhǔn)峭暾?;③需要消耗能量,在原核生物中由NAD+供能,在真核生物中由ATP供能。

6.單鏈DNA結(jié)合蛋白(singlestrandbindingprotein,SSB):又稱(chēng)螺旋反穩(wěn)蛋白(HDP)。這是一些能夠與單鏈DNA結(jié)合的蛋白質(zhì)因子。其作用為:①穩(wěn)定單鏈DNA,便于以其為模板復(fù)制子代DNA;②保護(hù)單鏈DNA,避免核酸酶的降解。7.解螺旋酶(unwindingenzyme):又稱(chēng)解鏈酶或rep蛋白,是用于解開(kāi)DNA雙鏈的酶蛋白,每解開(kāi)一對(duì)堿基,需消耗兩分子ATP。

8.拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase):拓?fù)洚悩?gòu)酶可將DNA雙鏈中的一條鏈或兩條鏈切斷,松開(kāi)超螺旋后再將DNA鏈連接起來(lái),從而避免出現(xiàn)鏈的纏繞。四、DNA生物合成過(guò)程:

1.復(fù)制的起始:

⑴預(yù)引發(fā):①解旋解鏈,形成復(fù)制叉:由拓?fù)洚悩?gòu)酶和解鏈酶作用,使DNA的超螺旋及雙螺旋結(jié)構(gòu)解開(kāi),形成兩條單鏈DNA。單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)結(jié)合在單鏈DNA上,形成復(fù)制叉。DNA復(fù)制時(shí),局部雙螺旋解開(kāi)形成兩條單鏈,這種叉狀結(jié)構(gòu)稱(chēng)為復(fù)制叉。②引發(fā)體組裝:由引發(fā)前體蛋白因子識(shí)別復(fù)制起始點(diǎn),并與引發(fā)酶一起組裝形成引發(fā)體。

⑵引發(fā):在引發(fā)酶的催化下,以DNA鏈為模板,合成一段短的RNA引物。2.復(fù)制的延長(zhǎng):

⑴聚合子代DNA:由DNA聚合酶催化,以親代DNA鏈為模板,從5'→3'方向聚合子代DNA鏈。

⑵引發(fā)體移動(dòng):引發(fā)體向前移動(dòng),解開(kāi)新的局部雙螺旋,形成新的復(fù)制叉,隨從鏈重新合成RNA引物,繼續(xù)進(jìn)行鏈的延長(zhǎng)。3.復(fù)制的終止:

⑴去除引物,填補(bǔ)缺口:RNA引物被水解,缺口由DNA鏈填補(bǔ),直到剩下最后一個(gè)磷酸酯鍵的缺口。

⑵連接岡崎片段:在DNA連接酶的催化下,將岡崎片段連接起來(lái),形成完整的DNA長(zhǎng)鏈。

⑶真核生物端粒(telomere)的形成:端粒是指真核生物染色體線性DNA分子末端的結(jié)構(gòu)部分,通常膨大成粒狀。線性DNA在復(fù)制完成后,其末端由于引物RNA的水解而可能出現(xiàn)縮短。故需要在端粒酶(telomerase)的催化下,進(jìn)行延長(zhǎng)反應(yīng)。端粒酶是一種RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體,它可以其RNA為模板,通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程對(duì)末端DNA鏈進(jìn)行延長(zhǎng)。五、DNA的損傷:

由自發(fā)的或環(huán)境的因素引起DNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的任何異常的改變稱(chēng)為DNA的損傷。常見(jiàn)的DNA的損傷包括堿基脫落、堿基修飾、交聯(lián),鏈的斷裂,重組等。引起DNA損傷的因素有:1.自發(fā)因素:

(1)自發(fā)脫堿基:由于N-糖苷鍵的自發(fā)斷裂,引起嘌呤或嘧啶堿基的脫落。

(2)自發(fā)脫氨基:C自發(fā)脫氨基可生成U,A自發(fā)脫氨基可生成I。

(3)復(fù)制錯(cuò)配:由于復(fù)制時(shí)堿基配對(duì)錯(cuò)誤引起的損傷。2.物理因素:由紫外線、電離輻射、X射線等引起的DNA損傷。其中,X射線和電離輻射常常引起DNA鏈的斷裂,而紫外線常常引起嘧啶二聚體的形成,如TT,TC,CC等二聚體。3.化學(xué)因素:

(1)脫氨劑:如亞硝酸與亞硝酸鹽,可加速C脫氨基生成U,A脫氨基生成I。

(2)烷基化劑:這是一類(lèi)帶有活性烷基的化合物,可提供甲基或其他烷基,引起堿基或磷酸基的烷基化,甚至可引起鄰近堿基的交聯(lián)。

(3)DNA加合劑:如苯并芘,在體內(nèi)代謝后生成四羥苯并芘,與嘌呤共價(jià)結(jié)合引起損傷。

(4)堿基類(lèi)似物:如5-FU,6-MP等,可摻入到DNA分子中引起損傷或突變。

(5)斷鏈劑:如過(guò)氧化物,含巰基化合物等,可引起DNA鏈的斷裂。六、DNA突變的類(lèi)型:

1.點(diǎn)突變:轉(zhuǎn)換——相同類(lèi)型堿基的取代。顛換——不同類(lèi)型堿基的取代。插入——增加一個(gè)堿基。缺失——減少一個(gè)堿基。

2.復(fù)突變:插入——增加一段順序。缺失——減少一段順序。倒位——一段堿基順序發(fā)生顛倒。易位——一段堿基順序的位置發(fā)生改變。重組——一段堿基順序與另一段堿基順序發(fā)生交換。

七、DNA突變的效應(yīng):

1.同義突變:基因突變導(dǎo)致mRNA密碼子第三位堿基的改變但不引起密碼子意義的改變,其翻譯產(chǎn)物中的氨基酸殘基順序不變。

2.誤義突變:基因突變導(dǎo)致mRNA密碼子堿基被置換,其意義發(fā)生改變,翻譯產(chǎn)物中的氨基酸殘基順序發(fā)生改變。

3.無(wú)義突變:基因突變導(dǎo)致mRNA密碼子堿基被置換而改變成終止暗碼子,引起多肽鏈合成的終止。

4.移碼突變:基因突變導(dǎo)致mRNA密碼子堿基被置換,引起突變點(diǎn)之后的氨基酸殘基順序全部發(fā)生改變。八、DNA損傷的修復(fù):

DNA損傷的修復(fù)方式可分為直接修復(fù)和取代修復(fù)兩大類(lèi)。直接修復(fù)包括光復(fù)活、轉(zhuǎn)甲基作用和直接連接作用,均屬于無(wú)差錯(cuò)修復(fù)。取代修復(fù)包括切除修復(fù)、重組修復(fù)和SOS修復(fù),后二者屬于有差錯(cuò)傾向修復(fù)。1.光復(fù)活:由光復(fù)活酶識(shí)別嘧啶二聚體并與之結(jié)合形成復(fù)合物,在可見(jiàn)光照射下,酶獲得能量,將嘧啶二聚體的丁酰環(huán)打開(kāi),使之完全修復(fù)。

2.轉(zhuǎn)甲基作用:在轉(zhuǎn)甲基酶的催化下,將DNA上的被修飾的甲基去除。此時(shí),轉(zhuǎn)甲基酶自身被甲基化而失活。3.直接連接:DNA斷裂形成的缺口,可以在DNA連接酶的催化下,直接進(jìn)行連接而封閉缺口。

4.切除修復(fù):這種修復(fù)機(jī)制可適用于多種DNA損傷的修復(fù)。該修復(fù)機(jī)制可以分別由兩種不同的酶來(lái)發(fā)動(dòng),一種是核酸內(nèi)切酶,另一種是DNA糖苷酶。①特異性的核酸內(nèi)切酶(如原核中的UvrA、UvrB和UvrC)或DNA糖苷酶識(shí)別DNA受損傷的部位,并在該部位的5'端作一切口;②由核酸外切酶(或DNA聚合酶Ⅰ)從5'→3'端逐一切除損傷的單鏈;③在DNA聚合酶的催化下,以互補(bǔ)鏈為模板,合成新的單鏈片段以填補(bǔ)缺口;④由DNA連接酶催化連接片段,封閉缺口。5.重組修復(fù):①DNA復(fù)制時(shí),損傷部位導(dǎo)致子鏈DNA合成障礙,形成空缺;②此空缺誘導(dǎo)產(chǎn)生重組酶(重組蛋白R(shí)ecA),該酶與空缺區(qū)結(jié)合,并催化子鏈空缺與對(duì)側(cè)親鏈進(jìn)行重組交換;③對(duì)側(cè)親鏈產(chǎn)生的空缺以互補(bǔ)的子鏈為模板,在DNA聚合酶和連接酶的催化下,重新修復(fù)缺口;④親鏈上的損傷部位繼續(xù)保留或以切除修復(fù)方式加以修復(fù)。

6.SOS修復(fù):這是一種在DNA分子受到較大范圍損傷并且使復(fù)制受到抑制時(shí)出現(xiàn)的修復(fù)機(jī)制,以SOS借喻細(xì)胞處于危急狀態(tài)。

專(zhuān)題二RNA的生物合成

一、RNA轉(zhuǎn)錄合成的特點(diǎn):

在RNA聚合酶的催化下,以一段DNA鏈為模板合成RNA,從而將DNA所攜帶的遺傳信息傳遞給RNA的過(guò)程稱(chēng)為轉(zhuǎn)錄。經(jīng)轉(zhuǎn)錄生成的RNA有多種,主要的是rRNA,tRNA,mRNA,snRNA和HnRNA。

1.轉(zhuǎn)錄的不對(duì)稱(chēng)性:指以雙鏈DNA中的一條鏈作為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,從而將遺傳信息由DNA傳遞給RNA。對(duì)于不同的基因來(lái)說(shuō),其轉(zhuǎn)錄信息可以存在于兩條不同的DNA鏈上。能夠轉(zhuǎn)錄RNA的那條DNA鏈稱(chēng)為反意義鏈(模板鏈),而與之互補(bǔ)的另一條DNA鏈稱(chēng)為有意義鏈(編碼鏈)。2.轉(zhuǎn)錄的連續(xù)性:RNA轉(zhuǎn)錄合成時(shí),在RNA聚合酶的催化下,連續(xù)合成一段RNA鏈,各條RNA鏈之間無(wú)需再進(jìn)行連接。

3.轉(zhuǎn)錄的單向性:RNA轉(zhuǎn)錄合成時(shí),只能向一個(gè)方向進(jìn)行聚合,RNA鏈的合成方向?yàn)?'→3'。

4.有特定的起始和終止位點(diǎn):RNA轉(zhuǎn)錄合成時(shí),只能以DNA分子中的某一段作為模板,故存在特定的起始位點(diǎn)和特定的終止位點(diǎn)。二、RNA轉(zhuǎn)錄合成的條件:1.底物:四種核糖核苷酸,即ATP,GTP,CTP,UTP。

2.模板:以一段單鏈DNA作為模板。

3.RNA聚合酶(DDRP):RNA聚合酶在單鏈DNA模板以及四種核糖核苷酸存在的條件下,不需要引物,即可從5'→3'聚合RNA。

原核生物中的RNA聚合酶全酶由五個(gè)亞基構(gòu)成,即α2ββ'σ。σ亞基與轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的識(shí)別有關(guān),而在轉(zhuǎn)錄合成開(kāi)始后被釋放,余下的部分(α2ββ')被稱(chēng)為核心酶,與RNA鏈的聚合有關(guān)。

真核生物中的RNA聚合酶分為三種:RNApolⅠ存在于核仁,對(duì)α-鵝膏蕈堿不敏感,用于合成rRNA前體;RNApolⅡ存在于核基質(zhì),對(duì)α-鵝膏蕈堿極敏感,用于合成HnRNA;RNApolⅢ存在于核基質(zhì),對(duì)α-鵝膏蕈堿敏感,用于合成tRNA前體、snRNA及5SrRNA。4.終止因子ρ蛋白:這是一種六聚體的蛋白質(zhì),能識(shí)別終止信號(hào),并能與RNA緊密結(jié)合,導(dǎo)致RNA的釋放。

5.激活因子:降解產(chǎn)物基因激活蛋白(CAP),又稱(chēng)為cAMP受體蛋白(CRP),是一種二聚體蛋白質(zhì)。該蛋白與cAMP結(jié)合后,刺激RNA聚合酶與起始部位結(jié)合,從而起始轉(zhuǎn)錄過(guò)程。三、RNA轉(zhuǎn)錄合成的基本過(guò)程:1.識(shí)別:RNA聚合酶中的σ因子識(shí)別轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),并促使核心酶結(jié)合形成全酶復(fù)合物。

位于基因上游,與RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄有關(guān)的一些DNA順序稱(chēng)為啟動(dòng)子。在原核生物中的啟動(dòng)子通常長(zhǎng)約60bp,存在兩段帶共性的順序,即5'-TTGACA-3'和5'-TATAATG-3',其中富含TA的順序被稱(chēng)為Pribnow盒。真核生物的啟動(dòng)子中也存在一段富含TA的順序,被稱(chēng)為Hogness盒或TATA盒。2.起始:RNA聚合酶全酶促使局部雙鏈解開(kāi),并催化ATP或GTP與另外一個(gè)三磷酸核苷聚合,形成第一個(gè)3',5'-磷酸二酯鍵。

3.延長(zhǎng):σ因子從全酶上脫離,余下的核心酶繼續(xù)沿DNA鏈移動(dòng),按照堿基互補(bǔ)原則,不斷聚合RNA。4.終止:RNA轉(zhuǎn)錄合成的終止機(jī)制有兩種。

⑴自動(dòng)終止:模板DNA鏈在接近轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)處存在相連的富含GC的區(qū)域,使RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物形成寡聚U及發(fā)夾形的二級(jí)結(jié)構(gòu),引起RNA聚合酶變構(gòu)及移動(dòng)停止,導(dǎo)致RNA轉(zhuǎn)錄的終止。

⑵依賴(lài)輔助因子的終止:由終止因子(ρ蛋白)識(shí)別特異的終止信號(hào),并促使RNA的釋放。四、真核生物RNA轉(zhuǎn)錄后的加工修飾:1.mRNA的轉(zhuǎn)錄后加工:

⑴加帽:即在mRNA的5'-端加上m7GTP的結(jié)構(gòu)。此過(guò)程發(fā)生在細(xì)胞核內(nèi),即對(duì)HnRNA進(jìn)行加帽。加工過(guò)程首先是在磷酸酶的作用下,將5'-端的磷酸基水解,然后再加上鳥(niǎo)苷三磷酸,形成GpppN的結(jié)構(gòu),再對(duì)G進(jìn)行甲基化。

⑵加尾:這一過(guò)程也是細(xì)胞核內(nèi)完成,首先由核酸外切酶切去3'-端一些過(guò)剩的核苷酸,然后再加入polyA。

⑶剪接:真核生物中的結(jié)構(gòu)基因基本上都是斷裂基因。結(jié)構(gòu)基因中能夠指導(dǎo)多肽鏈合成的編碼順序被稱(chēng)為外顯子,而不能指導(dǎo)多肽鏈合成的非編碼順序就被稱(chēng)為內(nèi)含子。真核生物HnRNA的剪接一般需snRNA參與構(gòu)成的核蛋白體參加,通過(guò)形成套索狀結(jié)構(gòu)而將內(nèi)含子切除掉。

⑷內(nèi)部甲基化:由甲基化酶催化,對(duì)某些堿基進(jìn)行甲基化處理。

2.tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工:主要加工方式是切斷和堿基修飾。

3.rRNA的轉(zhuǎn)錄后加工:主要加工方式是切斷。

專(zhuān)題三蛋白質(zhì)的生物合成一、蛋白質(zhì)生物合成體系:

生物體內(nèi)的各種蛋白質(zhì)都是生物體利用約20種氨基酸為原料自行合成的。蛋白質(zhì)的生物合成過(guò)程,就是將DNA傳遞給mRNA,再具體的解譯為蛋白質(zhì)中氨基酸排列順序的過(guò)程,這一過(guò)程被稱(chēng)為翻譯(translation)。參與蛋白質(zhì)生物合成的各種因素構(gòu)成了蛋白質(zhì)合成體系,該體系包括:

1.mRNA:作為指導(dǎo)蛋白質(zhì)生物合成的模板。

mRNA中每三個(gè)相鄰的核苷酸組成三聯(lián)體,代表一個(gè)氨基酸的信息,此三聯(lián)體就稱(chēng)為密碼。共有64種不同的密碼。遺傳密碼具有以下特點(diǎn):171①連續(xù)性;②簡(jiǎn)并性;③通用性;④方向性;⑤擺動(dòng)性;⑥起始密碼:AUG;終止密碼:UAA、UAG、UGA。翻譯是指以mRNA為模板,合成具有一定氨基酸順序的蛋白質(zhì)的過(guò)程.遺傳密碼即密碼子,特點(diǎn)為:

1遺傳密碼是三聯(lián)體密碼每一個(gè)密碼子是由3個(gè)核苷酸構(gòu)成,它特異地編碼多肽鏈中的一個(gè)氨基酸.

2遺傳密碼無(wú)逗號(hào)。即密碼子之間沒(méi)有空格,閱讀時(shí)是連續(xù)的,一次閱讀3個(gè)核苷酸,也不能跳過(guò)任何信使的核苷酸.

一類(lèi)由蛋白質(zhì)和核酸結(jié)合而成的復(fù)合蛋白質(zhì)。3遺傳密碼是不重迭的。閱讀時(shí)是以密碼子為單位,連續(xù)閱讀。即每個(gè)核苷酸三聯(lián)體相對(duì)獨(dú)立且在密碼子之間沒(méi)有空格。這樣任何核苷酸順序都可能以三種方式分成不同的密碼子,也就是說(shuō)有三種讀框。蛋白合成所用的閱讀框架決定于起始密碼子的位置,偶爾在翻譯過(guò)程中也有讀框的改變移碼突變?cè)诨蚪M序列資料中,潛在的基因往往是根據(jù)開(kāi)放閱讀框體;而定義也就是不間斷的有義密碼子的長(zhǎng)序列,因?yàn)殄e(cuò)誤的閱讀框架往往含有一個(gè)或多個(gè)終止密碼子.

核蛋白體循環(huán)的過(guò)程是:?jiǎn)?dòng)階段---肽鏈延長(zhǎng)階段----終止階段2.tRNA:在氨基酸t(yī)RNA合成酶催化下,特定的tRNA可與相應(yīng)的氨基酸結(jié)合,生成氨基酰tRNA,從而攜帶氨基酸參與蛋白質(zhì)的生物合成。

tRNA反密碼環(huán)中部的三個(gè)核苷酸構(gòu)成三聯(lián)體,可以識(shí)別mRNA上相應(yīng)的密碼,此三聯(lián)體就稱(chēng)為反密碼。反密碼對(duì)密碼的識(shí)別,通常也是根據(jù)堿基互補(bǔ)原則,即A—U,G—C配對(duì)。這種配對(duì)稱(chēng)為不穩(wěn)定配對(duì)。

能夠識(shí)別mRNA中5′端起動(dòng)密碼AUG的tRNA稱(chēng)為起動(dòng)tRNA。在原核生物中,起動(dòng)tRNA是tRNAfmet甲酰蛋氨酰;而在真核生物中,起動(dòng)tRNA是tRNAmet。

3.rRNA和核蛋白體:原核生物中的核蛋白體大小為70S,可分為30S小亞基和50S大亞基。真核生物中的核蛋白體大小為80S,也分為40S小亞基和60S大亞基。核蛋白體的大、小亞基分別有不同的功能:

⑴小亞基:可與mRNA、GTP和起動(dòng)tRNA結(jié)合。

⑵大亞基:①具有兩個(gè)不同的tRNA結(jié)合點(diǎn)。A位——受位或氨?;唬膳c新進(jìn)入的氨基酰tRNA結(jié)合;P位——給位或肽?;?,可與延伸中的肽酰基tRNA結(jié)合。②具有轉(zhuǎn)肽酶活性。在蛋白質(zhì)生物合成過(guò)程中,常常由若干核蛋白體結(jié)合在同一mRNA分子上,同時(shí)進(jìn)行翻譯。由若干核蛋白體結(jié)合在一條mRNA上同時(shí)進(jìn)行多肽鏈的翻譯所形成的念球狀結(jié)構(gòu)稱(chēng)為多核蛋白體。

4.起動(dòng)因子(IF):這是一些與多肽鏈合成起動(dòng)有關(guān)的蛋白因子。原核生物中存在3種起動(dòng)因子,分別稱(chēng)為IF1-3。在真核生物中存在9種起動(dòng)因子(eIF)。其作用主要是促進(jìn)核蛋白體小亞基與起動(dòng)tRNA及模板mRNA結(jié)合。5.延長(zhǎng)因子(EF):原核生物中存在3種延長(zhǎng)因子(EFTU,EFTS,EFG),真核生物中存在2種(EF1,EF2)。其作用主要促使氨基酰tRNA進(jìn)入核蛋白的受體,并可促進(jìn)移位過(guò)程。

6.釋放因子(RF):原核生物中有4種,在真核生物中只有1種。其主要作用是識(shí)別終止密碼,協(xié)助多肽鏈的釋放。7.氨基酰tRNA合成酶:該酶存在于胞液中,與特異氨基酸的活化以及氨基酰tRNA的合成有關(guān)。每種氨基酰tRNA合成酶對(duì)相應(yīng)氨基酸以及攜帶氨基酸的數(shù)種tRNA具有高度特異性。二、蛋白質(zhì)生物合成過(guò)程:

1.氨基酸的活化與搬運(yùn):氨基酸的活化以及活化氨基酸與tRNA的結(jié)合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反應(yīng)完成后,特異的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羥基與相應(yīng)的活化氨基酸以酯鍵相連接,形成氨基酰tRNA。2.活化氨基酸的縮合——核蛋白體循環(huán):活化氨基酸在核蛋白體上反復(fù)翻譯mRNA上的密碼并縮合生成多肽鏈的循環(huán)反應(yīng)過(guò)程,稱(chēng)為核蛋白體循環(huán)。核蛋白體循環(huán)過(guò)程可分為三個(gè)階段:

⑴起動(dòng)階段:①30S起動(dòng)復(fù)合物的形成。在IF促進(jìn)下,30S小亞基與mRNA的起動(dòng)部位,起動(dòng)tRNA(tRNAfmet),和GTP結(jié)合,形成復(fù)合體。②70S起動(dòng)前復(fù)合體的形成。IF3從30S起動(dòng)復(fù)合體上脫落,50S大亞基與復(fù)合體結(jié)合,形成70S起動(dòng)前復(fù)合體。③70S起動(dòng)復(fù)合體的形成。GTP被水解,IF1和IF2從復(fù)合物上脫落。

⑵肽鏈延長(zhǎng)階段:①進(jìn)位:與mRNA下一個(gè)密碼相對(duì)應(yīng)的氨基酰tRNA進(jìn)入核蛋白體的受位。此步驟需GTP,Mg2+,和EF參與。②成肽:在轉(zhuǎn)肽酶的催化下,將給位上的tRNA所攜帶的甲酰蛋氨?;螂孽;D(zhuǎn)移到受位上的氨基酰tRNA上,與其α-氨基縮合形成肽鍵。給位上已失去蛋氨?;螂孽;膖RNA從核蛋白上脫落。③移位:核蛋白體向mRNA的3'-端滑動(dòng)相當(dāng)于一個(gè)密碼的距離,同時(shí)使肽?;鵷RNA從受體移到給位。此步驟需EF(EFG)、GTP和Mg2+參與。此時(shí),核蛋白體的受位留空,與下一個(gè)密碼相對(duì)應(yīng)的氨基酰tRNA即可再進(jìn)入,重復(fù)以上循環(huán)過(guò)程,使多肽鏈不斷延長(zhǎng)。⑶肽鏈終止階段:核蛋白體沿mRNA鏈滑動(dòng),不斷使多肽鏈延長(zhǎng),直到終止信號(hào)進(jìn)入受位。①識(shí)別:RF識(shí)別終止密碼,進(jìn)入核蛋白體的受位。②水解:RF使轉(zhuǎn)肽酶變?yōu)樗饷?,多肽鏈與tRNA之間的酯鍵被水解,多肽鏈釋放。③解離:通過(guò)水解GTP,使核蛋白體與mRNA分離,tRNA、RF脫落,核蛋白體解離為大、小亞基。

三、多肽鏈合成后的加工修飾:

1.一級(jí)結(jié)構(gòu)的加工修飾:

⑴N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除:N端甲酰蛋氨酸是多肽鏈合成的起始氨基酸,必須在多肽鏈折迭成一定的空間結(jié)構(gòu)之前被切除。其過(guò)程是:①去甲酰化;②去蛋氨?;?。

⑵氨基酸的修飾:由專(zhuān)一性的酶催化進(jìn)行修飾,包括糖基化、羥基化、磷酸化、甲?;取?/p>

⑶二硫鍵的形成:由專(zhuān)一性的氧化酶催化,將-SH氧化為-S-S-。

⑷肽段的切除:由專(zhuān)一性的蛋白酶催化,將部分肽段切除。

2.高級(jí)結(jié)構(gòu)的形成:

⑴構(gòu)象的形成:在分子內(nèi)伴侶、輔助酶及分子伴侶的協(xié)助下,形成特定的空間構(gòu)象。

⑵亞基的聚合。

⑶輔基的連接。3.靶向輸送:蛋白質(zhì)合成后,定向地被輸送到其執(zhí)行功能的場(chǎng)所稱(chēng)為靶向輸送。大多數(shù)情況下,被輸送的蛋白質(zhì)分子需穿過(guò)膜性結(jié)構(gòu),才能到達(dá)特定的地點(diǎn)。因此,在這些蛋白質(zhì)分子的氨基端,一般都帶有一段疏水的肽段,稱(chēng)為信號(hào)肽。分泌型蛋白質(zhì)的定向輸送,就是靠信號(hào)肽與胞漿中的信號(hào)肽識(shí)別粒子(SRP)識(shí)別并特異結(jié)合,然后再通過(guò)SRP與膜上的對(duì)接蛋白(DP)識(shí)別并結(jié)合后,將所攜帶的蛋白質(zhì)送出細(xì)胞。

第十三章基因表達(dá)調(diào)控

一、基因表達(dá)調(diào)控基本概念與原理:

1.基因表達(dá)的概念:基因表達(dá)(geneexpression)就是指在一定調(diào)節(jié)因素的作用下,DNA分子上特定的基因被激活并轉(zhuǎn)錄生成特定的RNA,或由此引起特異性蛋白質(zhì)合成的過(guò)程。2.基因表達(dá)的時(shí)間性及空間性:⑴時(shí)間特異性:基因表達(dá)的時(shí)間特異性(temporalspecificity)是指特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按照特定的時(shí)間順序發(fā)生,以適應(yīng)細(xì)胞或個(gè)體特定分化、發(fā)育階段的需要。故又稱(chēng)為階段特異性。

⑵空間特異性:基因表達(dá)的空間特異性(spatialspecificity)是指多細(xì)胞生物個(gè)體在某一特定生長(zhǎng)發(fā)育階段,同一基因的表達(dá)在不同的細(xì)胞或組織器官不同,從而導(dǎo)致特異性的蛋白質(zhì)分布于不同的細(xì)胞或組織器官。故又稱(chēng)為細(xì)胞特異性或組織特異性。

3.基因表達(dá)的方式:

⑴組成性表達(dá):組成性基因表達(dá)(constitutivegeneexpression)是指在個(gè)體發(fā)育的任一階段都能在大多數(shù)細(xì)胞中持續(xù)進(jìn)行的基因表達(dá)。其基因表達(dá)產(chǎn)物通常是對(duì)生命過(guò)程必需的或必不可少的,且較少受環(huán)境因素的影響。這類(lèi)基因通常被稱(chēng)為管家基因(housekeepinggene)。

⑵誘導(dǎo)和阻遏表達(dá):誘導(dǎo)表達(dá)(induction)是指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被激活,從而使基因的表達(dá)產(chǎn)物增加。這類(lèi)基因稱(chēng)為可誘導(dǎo)基因。阻遏表達(dá)(repression)是指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被抑制,從而使基因的表達(dá)產(chǎn)物減少。這類(lèi)基因稱(chēng)為可阻遏基因。

4.基因表達(dá)的生物學(xué)意義:①適應(yīng)環(huán)境、維持生長(zhǎng)和增殖。②維持個(gè)體發(fā)育與分化。

5.基因表達(dá)調(diào)控的基本原理:

⑴基因表達(dá)的多級(jí)調(diào)控:基因表達(dá)調(diào)控可見(jiàn)于從基因激活到蛋白質(zhì)生物合成的各個(gè)階段,因此基因表達(dá)的調(diào)控可分為轉(zhuǎn)錄水平(基因激活及轉(zhuǎn)錄起始),轉(zhuǎn)錄后水平(加工及轉(zhuǎn)運(yùn)),翻譯水平及翻譯后水平,但以轉(zhuǎn)錄水平的基因表達(dá)調(diào)控最重要。

⑵基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素:①順式作用元件:順式作用元件(cis-actingelement)又稱(chēng)分子內(nèi)作用元件,指存在于DNA分子上的一些與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)的特殊順序。②反式作用因子:反式作用因子(trans-actingfactor)又稱(chēng)為分子間作用因子,指一些與基因表達(dá)調(diào)控有關(guān)的蛋白質(zhì)因子。反式作用因子與順式作用元件之間的共同作用,才能夠達(dá)到對(duì)特定基因進(jìn)行調(diào)控的目的。③順式作用元件與反式作用因子之間的相互作用:大多數(shù)調(diào)節(jié)蛋白在與DNA結(jié)合之前,需先通過(guò)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,形成二聚體或多聚體,然后再通過(guò)識(shí)別特定的順式作用元件,而與DNA分子結(jié)合。這種結(jié)合通常是非共價(jià)鍵結(jié)合。二、操縱子的結(jié)構(gòu)與功能:

在原核生物中,若干結(jié)構(gòu)基因可串聯(lián)在一起,其表達(dá)受到同一調(diào)控系統(tǒng)的調(diào)控,這種基因的組織形式稱(chēng)為操縱子。典型的操縱子可分為控制區(qū)和信息區(qū)兩部分。信息區(qū)由一個(gè)或數(shù)個(gè)結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起組成;控制區(qū)通常由調(diào)節(jié)基因(阻抑蛋白編碼基因)、啟動(dòng)基因(CRP和RNA聚合酶結(jié)合區(qū))和操縱基因(阻抑蛋白結(jié)合位點(diǎn))構(gòu)成。

1.原核生物乳糖操縱子:

原核生物乳糖操縱子(Lacoperon)的控制區(qū)包括調(diào)節(jié)基因,啟動(dòng)基因(其CRP結(jié)合位點(diǎn)位于RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)上游)和操縱基因;其信息區(qū)由β-半乳糖苷酶基因(lacZ),通透酶基因(lacY)和乙酰化酶基因(lacA)串聯(lián)在一起構(gòu)成。當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度升高而葡萄糖濃度降低時(shí),乳糖作為誘導(dǎo)劑與阻抑蛋白結(jié)合,促使阻抑蛋白與操縱基因分離;另一方面,細(xì)胞中cAMP濃度升高,cAMP與CRP結(jié)合并使之激活,CRP與啟動(dòng)基因結(jié)合并促使RNA聚合酶與啟動(dòng)基因結(jié)合,基因轉(zhuǎn)錄激活。2.原核生物色氨酸操縱子:

色氨酸操縱子(trpoperon)屬于阻遏型操縱子,主要調(diào)控一系列用于色氨酸合成代謝的酶蛋白的轉(zhuǎn)錄合成。色氨酸操縱子通常處于開(kāi)放狀態(tài),其輔阻遏蛋白不能與操縱基因結(jié)合而阻遏轉(zhuǎn)錄。而當(dāng)色氨酸合成過(guò)多時(shí),色氨酸作為輔阻遏物與輔阻遏蛋白結(jié)合而形成阻遏蛋白,后者與操縱基因結(jié)合而使基因轉(zhuǎn)錄關(guān)閉。色氨酸操縱子的調(diào)控還涉及轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)機(jī)制。即在色氨酸操縱子第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因與啟動(dòng)基因之間存在有一衰減區(qū)域,當(dāng)細(xì)胞內(nèi)色氨酸酸濃度很高時(shí),通過(guò)與轉(zhuǎn)錄相偶聯(lián)的翻譯過(guò)程,形成一個(gè)衰減子結(jié)構(gòu),使RNA聚合酶從DNA上脫落,導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄終止。

3.原核生物轉(zhuǎn)錄的整體調(diào)控模式:

由成群的操縱子組成的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)稱(chēng)為調(diào)節(jié)子。通過(guò)組成調(diào)節(jié)子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),對(duì)若干操縱子及若干蛋白質(zhì)的合成進(jìn)行協(xié)同調(diào)控,從而達(dá)到整體調(diào)控的目的。典型的整體調(diào)控模式是SOS反應(yīng),這是由一組與DNA損傷修復(fù)有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)基因組成。在正常情況下,這些基因均被LexA阻遏蛋白封閉。當(dāng)有紫外線照射時(shí),細(xì)菌體內(nèi)的RecA蛋白水解酶被激活,催化LexA阻遏蛋白裂解失活,從而導(dǎo)致與DNA損傷修復(fù)有關(guān)的基因表達(dá)。

三、真核基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn):

1.轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順?lè)醋樱赫婧嘶虻霓D(zhuǎn)錄產(chǎn)物一般是單順?lè)醋樱╩ono-cistron),即一個(gè)編碼基因轉(zhuǎn)錄生成一個(gè)mRNA分子,并指導(dǎo)翻譯一條多肽鏈。

2.大量重復(fù)序列:真核基因組中含大量的重復(fù)序列,這些重復(fù)序列大部分是沒(méi)有特定生物學(xué)功能的DNA片段,可占整個(gè)基因組DNA的90%。根據(jù)重復(fù)頻率可將其分為高度重復(fù)序列、中度重復(fù)序列和單拷貝序列。

3.?dāng)嗔鸦颍赫婧松镏械幕蚓哂胁贿B續(xù)性,即一個(gè)基因的編碼序列往往被一些非編碼序列分隔開(kāi)?;蛑心軌蜣D(zhuǎn)錄并進(jìn)一步編碼多肽鏈合成的部分稱(chēng)為外顯子(exon),而在轉(zhuǎn)錄后會(huì)被剪除的部分則稱(chēng)為內(nèi)含子(intron)。

三、真核基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn):

1.RNA聚合酶活性受轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控:真核生物中存在RNApolⅠ、Ⅱ、Ⅲ三種不同的RNA聚合酶,分別負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄不同的RNA。這些RNA聚合酶與相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子形成復(fù)合體,從而激活或抑制該酶的催化活性。

2.染色質(zhì)結(jié)構(gòu)改變參與基因表達(dá)的調(diào)控:真核生物DNA與組蛋白結(jié)合并形成核小體的結(jié)構(gòu),再進(jìn)一步形成染色質(zhì)。當(dāng)真核基因被激活時(shí),染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)也隨之發(fā)生改變。主要的改變有:

⑴單鏈DNA形成:基因被激活后,雙鏈DNA解開(kāi)成單鏈以利于轉(zhuǎn)錄,從而形成一些對(duì)DNAaseⅠ的超敏位點(diǎn)。

⑵DNA拓樸結(jié)構(gòu)改變:天然雙鏈DNA均以負(fù)性超螺旋構(gòu)象存在,當(dāng)基因激活后,則轉(zhuǎn)錄區(qū)前方的DNA拓樸結(jié)構(gòu)變?yōu)檎猿菪U猿菪勺璧K核小體形成,并促進(jìn)組蛋白解聚。

⑶核小體不穩(wěn)定性增加:由于組蛋白修飾狀態(tài)改變,巰基暴露等原因而引起核小體結(jié)構(gòu)改變。4.正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo):真核基因一般都處于阻遏狀態(tài),RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)子的親和力很低。通過(guò)利用各種轉(zhuǎn)錄因子正性激活RNA聚合酶是真核基因調(diào)控的主要機(jī)制。

5.轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程分別進(jìn)行:轉(zhuǎn)錄與翻譯過(guò)程分別存在于不同的亞細(xì)胞部位,可分別進(jìn)行調(diào)控。

6.轉(zhuǎn)錄后加工修飾過(guò)程復(fù)雜:特別是mRNA,轉(zhuǎn)錄后僅形成其初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物——HnRNA,然后再經(jīng)剪接、加帽、加尾等加工修飾,才能轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓膍RNA。四、真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件及激活機(jī)制:1.順式作用元件(分子內(nèi)作用元件):

⑴啟動(dòng)子:存在于結(jié)構(gòu)基因上游,與基因轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)有關(guān)的一段特殊DNA順序稱(chēng)為啟動(dòng)子。與原核生物類(lèi)似,也含有一段富含TATA的順序,稱(chēng)為T(mén)ATA盒。除此之外,還可見(jiàn)CAAT盒和GC盒。

⑵增強(qiáng)子:位于結(jié)構(gòu)基因附近,能夠增強(qiáng)該基因轉(zhuǎn)錄活性的一段DNA順序稱(chēng)為增強(qiáng)子。增強(qiáng)子的特點(diǎn)是:①在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)5’或3’側(cè)均能起作用;②相對(duì)于啟動(dòng)子的任一指向均能起作用;③發(fā)揮作用與受控基因的遠(yuǎn)近距離相對(duì)無(wú)關(guān);④對(duì)異源性啟動(dòng)子也能發(fā)揮作用;⑤通常具有一些短的重復(fù)順序。

⑶沉默子:能夠?qū)蜣D(zhuǎn)錄起阻遏作用的DNA片段,屬于負(fù)性調(diào)控元件。2.反式作用因子(分子間作用因子):真核生物反式作用因子通常屬于轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor,TF)。

(1)轉(zhuǎn)錄因子的種類(lèi):①非特異性轉(zhuǎn)錄因子(基本轉(zhuǎn)錄因子):非選擇性調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的蛋白質(zhì)因子稱(chēng)為非特異性轉(zhuǎn)錄因子。真核生物中存在的三種RNA聚合酶分別有相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子,即TFⅠ,TFⅡ,TFⅢ。其中,TFⅡ一共有六種亞類(lèi)。TFⅡD是唯一能識(shí)別啟動(dòng)子TATA盒并與之結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,而TFⅡB則可促進(jìn)聚合酶Ⅱ與啟動(dòng)子的結(jié)合。②特異性轉(zhuǎn)錄因子:能夠選擇性調(diào)控某種或某些基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的蛋白質(zhì)因子稱(chēng)為特異性轉(zhuǎn)錄因子。目前較清楚的是調(diào)控免疫球蛋白基因表達(dá)的核內(nèi)蛋白質(zhì)因子(NF)。(2)轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu):反式作用因子至少含有三個(gè)功能域,即DNA結(jié)合功能域,轉(zhuǎn)錄活性功能域和其它轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合功能域。DNA結(jié)合功能域帶共性的結(jié)構(gòu)主要有:①HTH和HLH結(jié)構(gòu):由兩段α-螺旋夾一段β-折迭構(gòu)成,α-螺旋與β-折迭之間通過(guò)β-轉(zhuǎn)角或成環(huán)連接,即螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)和螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)。②鋅指結(jié)構(gòu):見(jiàn)于TFⅢA和類(lèi)固醇激素受體中,由一段富含半胱氨酸的多肽鏈構(gòu)成。每四個(gè)半光氨酸殘基或His殘基螯合一分子Zn2+,其余約12-13個(gè)殘基則呈指樣突出,剛好能嵌入DNA雙螺旋的大溝中而與之相結(jié)合。③亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu):見(jiàn)于真核生物DNA結(jié)合蛋白的C端,與癌基因表達(dá)調(diào)控有關(guān)。由兩段α-螺旋平行排列構(gòu)成,其α-螺旋中存在每隔7個(gè)殘基規(guī)律性排列的Leu殘基,Leu側(cè)鏈交替排列而呈拉鏈狀。兩條肽鏈呈鉗狀與DNA相結(jié)合。

⑶轉(zhuǎn)錄因子的作用特點(diǎn):①同一DNA順式作用元件可被不同的轉(zhuǎn)錄因子所識(shí)別;②同一轉(zhuǎn)錄因子也可識(shí)別不同的DNA順式作用元件;③TF與TF之間存在相互作用;④當(dāng)TF與TF,TF與DNA結(jié)合時(shí),可導(dǎo)致構(gòu)象改變;⑤TF在合成過(guò)程中,有較大的可變性和可塑性。

3.轉(zhuǎn)錄激活及其調(diào)控:真核RNA聚合酶Ⅱ的激活需要依賴(lài)多種轉(zhuǎn)錄因子,并與之形成復(fù)合體。其過(guò)程首先是由TFⅡD識(shí)別啟動(dòng)子序列并與之結(jié)合;繼而RNA聚合酶Ⅱ與TFⅡD、B等聚合形成一個(gè)功能性的前起始復(fù)合體——PIC;最后,結(jié)合了增強(qiáng)子的轉(zhuǎn)錄因子與前起始復(fù)合體結(jié)合,從而形成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體。

第十四章基因重組和基因工程

一、自然界的基因轉(zhuǎn)移和重組:

基因重組(generecombination)是指DNA片段在細(xì)胞內(nèi)、細(xì)胞間,甚至在不同物種之間進(jìn)行交換,交換后的片段仍然具有復(fù)制和表達(dá)的功能。

1.接合作用:當(dāng)細(xì)胞與細(xì)胞相互接觸時(shí),DNA分子即從一個(gè)細(xì)胞向另一個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)移,這種遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移方式稱(chēng)為接合作用(conjugation)。

2.轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)染:由外來(lái)DNA引起生物體遺傳性狀改變的過(guò)程稱(chēng)為轉(zhuǎn)化(transformation)。噬菌體常??筛腥炯?xì)菌并將其DNA注入細(xì)菌體內(nèi),也可引起細(xì)菌遺傳性狀的改變。通過(guò)感染方式將外來(lái)DNA引入宿主細(xì)胞,并導(dǎo)致宿主細(xì)胞遺傳性狀改變的過(guò)程稱(chēng)為轉(zhuǎn)染(transfection)。轉(zhuǎn)染是轉(zhuǎn)化的一種特殊形式。3.整合和轉(zhuǎn)導(dǎo):外來(lái)DNA侵入宿主細(xì)胞,并與宿主細(xì)胞DNA進(jìn)行重組,成為宿主細(xì)胞DNA的一部分,這一過(guò)程稱(chēng)為整合。整合在宿主細(xì)胞染色體DNA中的外來(lái)DNA,可以被切離出來(lái),同時(shí)也可帶走一部分的宿主DNA,這一過(guò)程稱(chēng)為轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)。來(lái)源于宿主DNA的基因稱(chēng)為轉(zhuǎn)導(dǎo)基因。4.轉(zhuǎn)座:轉(zhuǎn)座又稱(chēng)為轉(zhuǎn)位(transposition),是指DNA的片段或基因從基因組的一個(gè)位置轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位

置的現(xiàn)象。這些能夠在基因組中自由游動(dòng)的DNA片段包括插入序列和轉(zhuǎn)座子兩種類(lèi)型。

⑴插入序列:典型的插入序列(insertionsequence,IS)是長(zhǎng)750-1500bp的DNA片段,由兩個(gè)分離的反向重復(fù)序列和一個(gè)轉(zhuǎn)座酶基因。當(dāng)轉(zhuǎn)座酶基因表達(dá)時(shí),即可引起該序列的轉(zhuǎn)座。其轉(zhuǎn)座方式主要有保守性轉(zhuǎn)座和復(fù)制性轉(zhuǎn)座。⑵轉(zhuǎn)座子:轉(zhuǎn)座子(transposons)是可從一個(gè)染色體位點(diǎn)轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn)的分散的重復(fù)序列,含兩個(gè)反向重復(fù)序列、一個(gè)轉(zhuǎn)座酶基因和其他基因(如抗生素抗性基因)。

免疫球蛋白重鏈基因由一組可變區(qū)基因(VH)和一組恒定區(qū)基因(CH)構(gòu)成,通過(guò)這些基因的選擇性轉(zhuǎn)座和重組,就可以轉(zhuǎn)錄表達(dá)出各種各樣的免疫球蛋白重鏈,以對(duì)付不同的抗原。5.基因重組的方式:

⑴位點(diǎn)特異性重組:在整合酶的催化下,兩段DNA序列的特異的位點(diǎn)處發(fā)生整合并共價(jià)連接,稱(chēng)為位點(diǎn)特異性重組。

⑵同源重組:發(fā)生在同源DNA序列之間的重組稱(chēng)為同源重組(homologousrecombination)。這種重組方式要求兩段DNA序列類(lèi)似,并在特定的重組蛋白或酶的作用下完成。

二、重組DNA技術(shù):

重組DNA技術(shù)又稱(chēng)為基因工程(geneticengineering)或分子克隆(molecularcloning),是指采用人工方法將不同來(lái)源的DNA進(jìn)行重組,并將重組后的DNA引入宿主細(xì)胞中進(jìn)行增殖或表達(dá)的過(guò)程。1.載體和目的基因的分離(分):對(duì)載體DNA和目的基因分別進(jìn)行分離純化,得到其純品。

⑴載體:常用的載體(vector)主要包括質(zhì)粒(plasmid)、噬菌體(phage)和病毒(virus)三大類(lèi)。這些載體均需經(jīng)人工構(gòu)建,除去致病基因,并賦予一些新的功能,如有利于進(jìn)行篩選的標(biāo)志基因、單一的限制酶切點(diǎn)等①質(zhì)粒:是存在于天然細(xì)菌

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶(hù)所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫(kù)網(wǎng)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶(hù)上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶(hù)上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶(hù)因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論