核磁處理軟件

Mestre－C

WINNMR核磁處理軟件

核磁數(shù)據(jù)處理軟件

有：NUTS、MestRe-C、Gifa等；

NUTS可以處理一維及二維核磁數(shù)據(jù)，其功能包括付立葉變換、相位校正、差譜、模擬譜、勻場練習(xí)等幾乎所有核磁儀器操作軟件的功能；其演示版在下載MestRe-C為處理一維二維核磁數(shù)據(jù)的免費(fèi)軟件，功能完善。其最新版本為2.3，有興趣可在處查看有關(guān)信息即下載；或所內(nèi)網(wǎng)站上下載；Gifa可以處理一至三維核磁數(shù)據(jù)，為運(yùn)行在LINUX操作系統(tǒng)中X-Window上的免費(fèi)軟件，有關(guān)信息可查看http://www.cbs.univ?montp1.fr/GIFA核磁處理軟件Mestre－C

軟件安裝從ftp上下載軟件，安裝完畢后，將crack軟件解壓縮后將其拷貝到安裝程序所在文件夾，覆蓋原文件即可獲取核磁數(shù)據(jù)軟件本身帶有一個ftp客戶端軟件可以從網(wǎng)絡(luò)下載數(shù)據(jù)打開已經(jīng)下載的數(shù)據(jù)軟件可以自動識別核磁數(shù)據(jù)的格式（不同儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)格式不同）對于所有的儀器，原始的核磁數(shù)據(jù)文件名為fid對于bruker儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，因其可以保存處理好的數(shù)據(jù)，可由Mestre-C軟件直接打開，文件名1D為1r，2D為2rr核磁數(shù)據(jù)的目錄結(jié)構(gòu)Bruker儀器：文件名\編號\，原始數(shù)據(jù)存儲在這個文件夾中File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號\pdata\處理編號\文件類型(allfiles)\文件名1D為1r，2D為2rr，處理過的數(shù)據(jù)存儲在這個文件夾中一維數(shù)據(jù)處理的步驟打開原始數(shù)據(jù)文件fid文件，是一個遞減的波形文件進(jìn)行傅立葉變換，設(shè)置參數(shù)，最重要的是setfunctions中的第一個參數(shù)（窗函數(shù)）調(diào)整相位基線校正積分，定標(biāo)，標(biāo)記化學(xué)位移等譜圖處理－設(shè)置窗函數(shù)單擊ft按鈕，在對話框中點(diǎn)擊setfunction(s)在打開的對話框中，修改exponentia的值缺省是0.5Hz，增加此項(xiàng)數(shù)值將會是峰型變寬，但可消除裂分相位校正可選擇自動相位校正如果效果不好，可使用手動校正點(diǎn)擊手動相位校正按鈕在對話框中點(diǎn)擊biggest按鈕在對話框中間部分按住鼠標(biāo)左鍵，調(diào)整最高峰附近的峰的相位在對話框中間部分按住鼠標(biāo)右鍵，調(diào)整遠(yuǎn)離最高峰的其他峰的相位調(diào)到峰行對稱基線校正點(diǎn)擊工具按鈕上基線校正按鈕，在菜單中選擇fullauto即可核磁畫圖

可以不做以上操作直接進(jìn)入圖譜按以下操作進(jìn)行圖譜處理。1D處理標(biāo)記峰定標(biāo)積分譜圖顯示2D處理標(biāo)記峰找出變換好的圖譜路徑如下：File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號\pdata\文件類型（所有文件allfiles）\文件名1D為1r，2D為2rr1D點(diǎn)擊PeakPicking按鈕，使用鼠標(biāo)在譜圖中進(jìn)行標(biāo)記

點(diǎn)擊PeakPicking按鈕，使用鼠標(biāo)選中（框?。┰谧V圖中進(jìn)行標(biāo)記

化學(xué)位移保留小數(shù)點(diǎn)后３－５位：

options/properties/peakpick/decimal測試參數(shù)顯示雙擊鼠標(biāo)左鍵跳出對話框選擇showspectrumparameter/ok上面有儀器頻率定標(biāo)如果化學(xué)位移出現(xiàn)偏差，可使用工具條上標(biāo)有TMS的按鈕進(jìn)行定標(biāo)：單擊TMS按鈕，鼠標(biāo)指針變?yōu)槭中驮跇?biāo)準(zhǔn)峰上單擊鼠標(biāo)在彈出的對話框中輸入化學(xué)位移值積分點(diǎn)擊積分按鈕，使用鼠標(biāo)進(jìn)行積分可使用自動積分積分值可以到出到文件點(diǎn)擊積分按鈕，按住鼠標(biāo)左鍵拉動進(jìn)行積分

用鼠標(biāo)雙擊某一積分面積跳出對話框把它定為1對積分面積進(jìn)行調(diào)整，后copy到word

鼠標(biāo)拉倒邊框處，點(diǎn)右鍵對邊框進(jìn)行調(diào)整譜圖顯示可使用工具按鈕上有關(guān)譜圖顯示的按鈕進(jìn)行譜圖放大，縮小等操作Mestre-C有關(guān)參數(shù)的設(shè)置窗口背景，options－》seting譜圖參數(shù)，options－》properties找出變換好的圖譜路徑如下：File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號\pdata\文件類型（所有文件allfiles）\文件名1D為1r，2D為2rr2D處理2D粘貼1D：從上面圖標(biāo)上點(diǎn)擊setup1DTraces再從跳出的對話框中點(diǎn)擊leadfromdisk選擇1D查找范圍，樣品所在，樣品名，圖譜編號pdat/1r雙擊。調(diào)整1D：如圖按左邊對話進(jìn)行調(diào)整。選中1D上邊（或左邊），雙擊鼠標(biāo)左鍵跳出對話框用箭頭調(diào)整1D2D校正：advance/shiftspectrumvector/pointsto增減。添加方框線：options/setting/gride.選為黑色

畫圖：選擇從上面圖標(biāo)上點(diǎn)擊紅色方框，再從跳出的對話框中點(diǎn)擊紅色方框圖旁邊的第二個圓圈圖。2D去邊框：

粘貼好1D后，選中1D上邊（或左邊），點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵/properties/set/none/ok/apply/ok2D去邊框：

粘貼好1D后，選中1D上邊（或左邊），點(diǎn)擊鼠標(biāo)右/properties/set/none/ok/apply/okNOESY,QC需要照以下路徑操作：

界面左邊lev/negative調(diào)為０（＋／－）

C和DEPT依次打開C和DEPT；將C譜取峰，校正，確定C譜范圍；將DEPT打開，并確定成與C譜相同范圍將C譜復(fù)制edit/copyspectrum在打開的DEPT中將復(fù)制的C譜粘貼在工具欄stack隨后通過工具欄“左右居”中將兩張譜對齊以下操作類推即可，此時需用edit/selectallspectrum工具選擇所用圖譜，然后再copy分別打開13和dept，固定化學(xué)位移路徑如下，view/zoom/manualzoom取消縱坐標(biāo)，擊鼠標(biāo)右擊properties/verticalscale/選擇showscale取消dept中的橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)，擊鼠標(biāo)右擊properties/verticalscale(horzscale)/選擇showscale,取消dept中的邊界線，擊鼠標(biāo)右擊properties/spectrum/spectrumborders/set/none/ok將C譜復(fù)制edit/copyspectrum在新打開文件中，再把DEPT復(fù)制至其中，拉動邊框使其左右對齊，做好的13Cdept核磁處理軟件WINNMR

網(wǎng)絡(luò)版WINNMR軟件從ftp上下載該軟件在安裝界面中選擇安裝：WINNMR1D：1DPostprocessingWINNMR2D：2DPostprocessingWIBukey2.52asoftwareprotection

安裝完后在c:\windows\d2nmr.init中加入[settings]Network=1Nethasp=1網(wǎng)絡(luò)版WINNMR軟件此軟件對1D譜放大及DEPT畫圖較好。找出變換好的圖譜路徑如下：File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號\1D為1r，2D為2rr點(diǎn)開1D點(diǎn)擊PeakPicking按鈕，使用鼠標(biāo)在譜圖中進(jìn)行標(biāo)記添加圖譜參數(shù)output/acpu從里面選擇所需參數(shù)/showselect/ok標(biāo)記峰

圖譜路徑如下analysis/peapking/pc/ok;點(diǎn)擊＊２／２對圖譜調(diào)整添加圖譜參數(shù)output/acpu從里面選擇所需參數(shù)。analysis/peakpicking/pc/ok/mousepp框出所需的峰/returnanalysis/Calibration/calibraic/returnanalysis/integration/點(diǎn)擊積分按鈕，使用鼠標(biāo)左鍵右鍵把光標(biāo)放到最小的峰上進(jìn)行積分//return/yes打印output/printersetup/setup/布局/橫向/確定/ok(此設(shè)置好后即可）

標(biāo)峰、校準(zhǔn)及積分路徑如下:調(diào)整圖譜點(diǎn)擊左邊preview鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向左拉動右邊邊框，再用鼠標(biāo)左鍵選中參數(shù)欄，將其拖到圖譜右邊。鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向上下、左右拉動邊框，用鼠標(biāo)點(diǎn)擊*2/2調(diào)整圖譜峰高。

打印:

點(diǎn)擊preview/yes選中參數(shù)把參數(shù)拖到適當(dāng)位置printoredit/copy到word，點(diǎn)擊界面左上角nmrzoom進(jìn)行放大C和DEPT按照氫譜做法打開碳譜，進(jìn)行校準(zhǔn)標(biāo)峰后點(diǎn)擊preview雙擊鼠標(biāo)左鍵跳出對話框把xstar和xstop化學(xué)位移固定，把顏色改為黑色點(diǎn)擊ok，再file/savemetafile/確定/yes儲存，return。照上述操作打開dept/preview/調(diào)整圖譜放在中間，刪除參數(shù)，雙擊取消axis、fram，選定star、stop/ok/在file/openmetafile/確定調(diào)整13C/savemetafile/確定/yes

File\open\文件所存盤\文件名\碳譜編號\1ranalysis/peakpicking/pc/ok/mousepp框出所需的峰

點(diǎn)擊preview雙擊鼠標(biāo)左鍵跳出對話框把xstar和xstop化學(xué)位移固定固定譜寬化學(xué)位移

鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向左拉動右邊邊框，再用鼠標(biāo)左鍵選中參數(shù)欄，將其拖到圖譜右邊。鼠標(biāo)左鍵選中圖譜，向下拉動上邊邊框，縮小到頁面1/3處，用鼠標(biāo)點(diǎn)擊*2/2調(diào)整圖譜峰高。

鼠標(biāo)

照上述操作打開dept/preview/調(diào)整圖譜放在中間，刪除參數(shù)，雙擊取消axis、fram，選定star、stop固定化學(xué)位移/ok/在file/openmetafile/確定調(diào)整dept/savemetafile/確定/yes

*2/2調(diào)整譜峰度

拉大、縮小邊框

選中取消

照上述操作打開dept135/preview重復(fù)上述操作/openmetafile/確定調(diào)整13C/printorcopy到2D處理

找出變換好的圖譜路徑如下：File\open\文件所存盤\文件名\樣品編號\2rr粘貼1r圖譜路徑如下：Utilities/f1-axisext/文件所存盤/文件名/樣品編號/pdata處理編號/文件類型(allfiles)/1r/acceptUtilities/f2-axisext/文件所存盤/文件名/樣品編號/pdata處理編號/文件類型(allfiles)/1r/accept

可以拉大邊框?qū)D譜大小調(diào)整，拉后要選中上邊和左邊的1D調(diào)整，點(diǎn)擊右面automaticfactor改為2調(diào)整畫面。

放大圖譜只要用鼠標(biāo)框中2D在點(diǎn)擊鼠標(biāo)左右鍵,然后分別用鼠標(biāo)點(diǎn)擊上邊和左邊的1D調(diào)整，通過點(diǎn)擊一邊把一邊變?yōu)榛疑?，另一邊變?yōu)樗{(lán)色進(jìn)行調(diào)整（灰色不變，藍(lán)色變）。打印要把右面colors設(shè)置為黑色

對于2D(hsqc、roesy)需要點(diǎn)擊左上角＋/－對正負(fù)面選擇恰當(dāng)?shù)囊幻孢M(jìn)行處理。下圖為點(diǎn)擊＋/－前

處理前圖譜不理想，處理后較好圖譜，