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文檔簡介
生存分析
張俊輝
2011.11.22
生存分析中的幾個(gè)基本概念“死亡”事件——失敗事件(failureevent)生存時(shí)間(survivaltime):完全數(shù)據(jù)、截尾數(shù)據(jù)、截尾死亡概率(mortalityprobability)
生存概率(survivalprobability)生存率(survivalrate)中位生存時(shí)間(mediansurvivaltime)
(一)死亡事件(deathevent)
又稱失效事件(failureevent)或終點(diǎn)事件。死亡事件是一個(gè)廣義的概念,不單是指通常意義下的生物體死亡,而是泛指標(biāo)志某種處理措施失敗或失效的特征事件。(二)生存時(shí)間(survivaltime):指觀察到的存活時(shí)間。生存時(shí)間是一個(gè)廣義概念,不單是指通常意義下生物體的存活時(shí)間,而是泛指研究者所關(guān)心的某現(xiàn)象的持續(xù)時(shí)間。生存時(shí)間的兩種類型完全數(shù)據(jù)(completedata):指從觀察起點(diǎn)到發(fā)生死亡事件所經(jīng)歷的時(shí)間。截尾數(shù)據(jù)(censoreddata):簡稱截尾值(censoredvalue),又稱刪失值或終檢值。生存時(shí)間觀察過程的截止不是由于死亡事件,而是由于其他原因引起的,稱為截尾(censored)。截尾的原因包括失訪、退出和終止。截尾數(shù)據(jù)指從觀察起點(diǎn)到截尾所經(jīng)歷的時(shí)間。死亡概率:指在某單位時(shí)段開始時(shí)存活的個(gè)體在該時(shí)段內(nèi)死亡的可能性大小。生存概率
:指某單位時(shí)段開始時(shí)存活的個(gè)體到該時(shí)段結(jié)束時(shí)仍存活的可能性大小。生存率:指觀察對象活過tk時(shí)刻的概率。生存率也是一個(gè)廣義概念,研究者定義的死亡事件不同,其含義也不同,可以是緩解率或有效率。中位生存時(shí)間又稱半數(shù)生存期,是指生存率為0.5時(shí)對應(yīng)的生存時(shí)間,表示有50%的觀察對象可活這么長時(shí)間。主要內(nèi)容1.未分組資料數(shù)據(jù)的生存分析
(Kaplan-Meier過程)2.分組資料數(shù)據(jù)的生存分析
(LifeTables過程)3.生存曲線的比較
(log-rankTest)未分組資料的生存分析特點(diǎn):每個(gè)觀察個(gè)體都有一個(gè)生存時(shí)間例15.1某醫(yī)師采用手術(shù)療法治療12例宮頸癌患者,隨訪時(shí)間(月)記錄如下:1,2,4,5,7,8+,11,15,18,33+,36,38+。試估計(jì)各時(shí)點(diǎn)生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤、各時(shí)點(diǎn)總體生存率的95%置信區(qū)間、中位生存時(shí)間,并繪制生存曲線。
未分組資料的生存分析乘積極限法——由Kaplan-Meier于1958年首先提出,又稱Kaplan-Meier法(簡記為KM法)
SPSS操作步驟:設(shè)置兩個(gè)變量:生存時(shí)間(time)
結(jié)局(status):死亡=1,截尾=0SPSS操作步驟:AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框選入時(shí)間變量timeStatus框選入結(jié)局變量statusDefineEvent(定義死亡事件的取值)按鈕Singlevalue框輸入1
ContinueOptions按鈕勾選Survivaltables(生存分析表)默認(rèn)
Meanandmediansurvival(均數(shù)和中位數(shù))默認(rèn)
Survival(生存曲線圖)
ContinueOK結(jié)果解釋生存曲線表平均生存時(shí)間(mean)和中位生存時(shí)間(median)生存曲線分組資料的生存分析例15.2某醫(yī)師對110例原發(fā)性肺癌患者確診后進(jìn)行隨訪,得資料見表15.3第(2)欄~第(4)欄,試估計(jì)各時(shí)點(diǎn)生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤、各時(shí)點(diǎn)總體生存率的95%置信區(qū)間、中位生存時(shí)間,并繪制生存曲線。壽命表法SPSS操作步驟設(shè)置3個(gè)變量:時(shí)間time(采用組段的下限)
結(jié)局status(死亡=1,截尾=0)
頻數(shù)fSPSS操作步驟指定頻數(shù)變量fDataWeightCases
選中WeightcasesbyFrequencyvariable框:選入fSPSS操作步驟AnalyzeSurvivalLifeTablesTime框:選入時(shí)間變量timeDisplayTimeIntervals框:輸入10by1Status框:選入結(jié)局變量statusDefineEvent按鈕:SingleValue框輸入1ContinueOptions按鈕勾選Lifetables、SurvivalContinueOK
結(jié)果解釋此為SPSS作的分組資料的生存率曲線,為階梯型曲線。
注意:分組資料繪制的生存曲線應(yīng)該是折線連接,因?yàn)楣烙?jì)的是時(shí)段右點(diǎn)的生存率。因此需要對該曲線進(jìn)行編輯。通過點(diǎn)擊右鍵進(jìn)行編輯:
Charteditor→elements(format)→InterpolationLine
并刪掉短線,可得到折線形生存率曲線如下圖:對數(shù)秩檢驗(yàn)例15.3某臨床醫(yī)生將22例肺癌患者隨機(jī)分成兩組,分別采用化療和放化療聯(lián)合治療,從緩解出院日開始隨訪,隨訪時(shí)間(月)如下,試比較化療和放化療聯(lián)合治療的療效是否有差別?;熃M1,2,3,5,6,9+,11,13,16,26,37+放化療聯(lián)合組10,11+,14,18,22,22,26,32,38,40+,42+SPSS操作步驟設(shè)置3個(gè)變量:時(shí)間time
結(jié)局status(死亡=1,截尾=0)
組別groupSPSS操作步驟:AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框選入時(shí)間變量timeStatus框選入結(jié)局變量statusDefineEvent按鈕Singlevalue框輸入1
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