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微生物實驗課件實驗八質(zhì)粒提取第一頁,共二十七頁,2022年,8月28日一、質(zhì)粒的一般生物學(xué)特性

質(zhì)粒(plasmid)是獨立于細菌染色體以外的能自我復(fù)制的環(huán)狀閉合的雙股DNA,質(zhì)粒DNA一般為細菌染色體的3%左右,作為基因克隆質(zhì)粒載體的所有質(zhì)粒DNA分子都必定包括如下三個共同的組成部分:復(fù)制基因、選擇標(biāo)志基因和克隆位點。

質(zhì)粒廣泛存在于細菌細胞中,此外在霉菌、藍藻、酵母和某些動植物細胞中也發(fā)現(xiàn)有質(zhì)粒存在。

第二頁,共二十七頁,2022年,8月28日第三頁,共二十七頁,2022年,8月28日大腸桿菌乳糖操縱子簡介:

I:調(diào)節(jié)基因P:啟動子O:操縱基因

Z、Y、A:結(jié)構(gòu)基因,其中Z編碼β-半乳糖甘酶(β-galactosidase),Y編碼透性酶(permease),A編碼乙?;D(zhuǎn)移酶(acetylase).IPOZYAOri:復(fù)制子.MCS:multiplecloningsites,多克隆位點.第四頁,共二十七頁,2022年,8月28日第五頁,共二十七頁,2022年,8月28日二、堿裂解法制備質(zhì)粒DNA

注意點:使用酚-氯仿時注意安全三、瓊脂糖凝膠電泳技術(shù)(Agarosegelelectroghoresis)

注意點:制、看膠時,戴一次性手套,注意EB(溴化乙錠)第六頁,共二十七頁,2022年,8月28日堿裂解法制備質(zhì)粒DNA(書上的原理不完全正確)

染色體DNA分子大,易斷裂乘線型DNA分子質(zhì)粒DNA共價閉合環(huán)型在堿性環(huán)境中線型的染色體DNA和環(huán)型的質(zhì)粒DNA氫鍵發(fā)生斷裂,雙鏈解開而變性,但質(zhì)粒DNA只部分發(fā)生斷裂,兩條互補鏈不會完全分離。當(dāng)pH調(diào)至中性并在高鹽濃度存在的條件下,已分開的染色體DNA互補鏈不能復(fù)性,交聯(lián)形成不溶性網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),通過離心,大部分染色體DNA、不穩(wěn)定的大分子RNA和蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來。部分變性的質(zhì)粒DNA在中性環(huán)境中很快復(fù)性,呈可溶狀態(tài)保存在溶液中,離心后,存在上清中。再通過酚、氯仿、乙醇沉淀,獲得純的DNA第七頁,共二十七頁,2022年,8月28日

溶液I,50mM葡萄糖/25mMTris-Cl/10mMEDTA,pH8.0;

溶液II,0.2NNaOH/1%SDS;

溶液III,3M醋酸鉀/2M醋酸;溶液Ⅵ:酚:氯仿:異丙醇=25:24:1所用溶液第八頁,共二十七頁,2022年,8月28日質(zhì)粒的提取p143(1)新鮮培養(yǎng)含有質(zhì)粒的細菌(2)取1ml培養(yǎng)物加入1.5ml離心管中,10000rpm離心2min。(3)倒掉上清,盡可能倒干凈。(4)細菌沉淀重懸于100ul的溶液I中,用移液槍吹打至均勻。須確使細菌沉淀在溶液I中完全分散(三種成分各發(fā)揮什么作用?)。第九頁,共二十七頁,2022年,8月28日操作程序(5)加200μl新配制的溶液Ⅱ(問什么現(xiàn)配現(xiàn)用?怎樣發(fā)揮作用的?嚴(yán)格控制時間,為什么?)蓋緊管口,顛倒離心管幾次(不要振蕩),以混合內(nèi)容物。應(yīng)確保離心管的整個內(nèi)表面均與溶液Ⅱ接觸。于室溫放置2-3分鐘至液體清亮。(6)加150μl的溶液Ⅲ

(2種成分發(fā)揮怎樣的作用?仔細觀察,發(fā)生了什么現(xiàn)象?)蓋緊管口,顛倒離心管幾次(不要振蕩),以混合內(nèi)容物。應(yīng)確保離心管的整個內(nèi)表面均與溶液Ⅲ接觸。(7)4℃10000rpm離心10分種,立即將上清(400-450μl)轉(zhuǎn)移到另一離心管中。不要帶入沉淀,如有則用槍頭挑出。第十頁,共二十七頁,2022年,8月28日操作程序(8)加等體積的溶液Ⅵ,振蕩、顛倒離心管幾次以沉淀DNA,于室溫放置2分鐘,小心吸取上層水相至另一潔凈的離心管中(為什么要用這3種試劑?)。(9)加入2倍體積的冷的無水乙醇,室溫放置2分鐘,10000rpm5min,在管底可見微量的DNA沉淀,小心吸棄上清液。((10)加入1ml70%乙醇,將DNA沉淀懸浮起來后,4℃10000rpm離心5分鐘。((11)小心吸棄上清液,將離心管倒置于一張紙巾上以吸盡液體。在室溫干燥10分鐘。((12)取30μl滅菌水,用槍頭吹達沉淀,使其徹底溶解,取9μl的DNA樣品進行瓊脂糖電泳,其余-20℃保存?zhèn)溆谩5谑豁?,共二十七頁?022年,8月28日電泳準(zhǔn)備用透明膠封固玻璃板兩頭,在板一端放置電泳梳子。用1×TAE–buffer配制瓊脂糖凝膠(0.24gAgaros/32ml1×TAE–buffer),在微波爐中加熱至瓊脂糖溶解。待溶液冷卻至60℃,加入適量溴化乙錠至微紅,混勻。將溫?zé)岬沫傊悄z倒入膠模中,凝膠厚度在5-7mm之間。在凝膠完全凝固后,撕去透明膠,小心地將玻璃板移至裝有1×TAE–buffer的電泳槽中,輕輕地拔去梳子,且使緩沖液沒過膠面。第十二頁,共二十七頁,2022年,8月28日DNA電泳取9μl的DNA樣品與1μl的10*樣品緩沖液混合后,用微量取樣器慢慢將混合物加至樣品孔中。蓋上電泳槽并通電,使DNA向陽極移動。當(dāng)溴酚藍在凝膠中移出適當(dāng)距離(根據(jù)DNA的大小、1kb和3kb左右的指示劑來判斷)后,切斷電源,取出玻璃板,在紫外燈下觀察,并拍照記錄結(jié)果,估測質(zhì)粒分子量的大小。第十三頁,共二十七頁,2022年,8月28日第十四頁,共二十七頁,2022年,8月28日實驗要求每組同學(xué)看到質(zhì)粒條帶估算出質(zhì)粒條帶的分子量大小第十五頁,共二十七頁,2022年,8月28日實驗報告實驗?zāi)康膶嶒炘韺嶒灢襟E結(jié)果與分析思考題P145(1),(2),(3)下次實驗病毒的培養(yǎng)(雞胚接種)第十六頁,共二十七頁,2022年,8月28日病毒的分離與培養(yǎng)第十七頁,共二十七頁,2022年,8月28日實驗?zāi)康睦斫獬R?guī)的病毒培養(yǎng)的基本方法掌握利用雞胚培養(yǎng)病毒的原理掌握雞胚接種的基本路徑學(xué)會雞胚的鑒別第十八頁,共二十七頁,2022年,8月28日病毒的種類專性活細胞寄生動物病毒雞胚接種細胞培養(yǎng)植物病毒細菌病毒第十九頁,共二十七頁,2022年,8月28日從病料中分離病毒一、樣本的采集與處理1、一般原則:合適的時間,合適的病變部位,合適的處理和保存方法

一般都要4℃保存第二十頁,共二十七頁,2022年,8月28日2、病料的種類動物樣本:(1)心、肝、肺、脾、腎臟和淋巴結(jié)等實質(zhì)性器官(2)各種液體病料(3)腸內(nèi)容物和腸壁(4)皮膚病料(5)骨(6)腦、脊髓植物樣本:發(fā)病植株的根、莖、葉、花、果等;第二十一頁,共二十七頁,2022年,8月28日采集病料應(yīng)具有針對性:在采集病料時應(yīng)有重點地采集有關(guān)臟器、內(nèi)容物、分泌物、排泄物或其他材料。在無法估計病因時,可全面采集病料。進行流行病學(xué)調(diào)查、抗體檢測、群體健康評估或環(huán)境衛(wèi)生檢測時,樣品的采集數(shù)量不能太少,應(yīng)具統(tǒng)計學(xué)意義。B.無菌采樣:采集所用的器械、樣品管等均應(yīng)消毒滅菌,采集過程應(yīng)保持無菌操作,不同個體、不同組織樣品應(yīng)作好標(biāo)。C.采集新鮮病料:動物發(fā)病后應(yīng)立即采集病料,否則,尸體腐敗會影響采樣和檢測效果,特別是用于病理學(xué)檢查的病料更應(yīng)及時采集。第二十二頁,共二十七頁,2022年,8月28日3、送檢病料樣本的標(biāo)記(1)送檢病料的物種、年齡、性別、發(fā)病日期、死亡時間等。(2)流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)、病理剖檢等等初步診斷材料。(3)免疫接種和用藥治療情況。(4)病料中是否加有一些特殊的保護劑。(5)送檢的目的和要求。(6)姓名和聯(lián)系方式。第二十三頁,共二十七頁,2022年,8月28日4、待檢病毒材料的處理:(1)組織材料需經(jīng)剪碎、研磨后,以漢克氏液作1:10稀釋,每毫升加入青、鏈霉素各1000IU,再反復(fù)凍融3次,使病毒從細胞中釋放出來,3000-4000轉(zhuǎn)/分鐘離心20分鐘,取上清液微孔濾膜過濾后作為接種物。(2)分泌物、糞便等材料則可直接以漢克氏液作1:10稀釋,每毫升加入青、鏈霉素各1000IU,4℃放置過夜,3000-4000轉(zhuǎn)/分鐘離心20分鐘,取上清液作為接種物。(3)接種物在接種前需做細菌培養(yǎng)試驗,只有無菌接種物才可進一步使用。(4)植物樣本經(jīng)剪碎、研磨、離心、過濾后接種植株第二十四頁,共二十七頁,2022年,8月28日雞胚接種基本原理雞胚培養(yǎng)的優(yōu)點:雞胚作為病毒的敏感細胞,能支持病毒完成從吸附到基因組復(fù)制,轉(zhuǎn)錄,蛋白質(zhì)合成,裝配,裂解的整個生命過程,從而使得病毒得以

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