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微生物遺傳變異與育種第一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

微生物遺傳學(xué)研究意義1)微生物學(xué)的主要分支2)為生命遺傳現(xiàn)象的解釋提供依據(jù)3)是分子生物學(xué)發(fā)展的基礎(chǔ)學(xué)科4)促進(jìn)工業(yè)微生物菌種的選育

第二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日§.1遺傳變異的物質(zhì)基礎(chǔ)

一、證明遺傳物質(zhì)的三個(gè)典型實(shí)驗(yàn)

----細(xì)菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)----噬菌體感染實(shí)驗(yàn)----植物病毒的重建實(shí)驗(yàn)

第三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日1、細(xì)菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)----動(dòng)物試驗(yàn)(Grifith,1928)第四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日----細(xì)菌培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)S(死)+R(活)S(少量活)+R(活)S(無(wú)細(xì)胞提取液)+R(活)S(少量活)+R(活)第五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日----細(xì)菌培養(yǎng)試驗(yàn)(Avery,1944)第六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日第七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2.噬菌體感染實(shí)驗(yàn)(Hershey;Chase,1952)第八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日3.植物病毒的重建實(shí)驗(yàn)(Fraenkel-Conrat,1956)第九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日二、遺傳物質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的存在部位和方式(一)真核與原核微生物遺傳物質(zhì)比較

第十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●原核與真核微生物基因組大小第十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日細(xì)菌染色體數(shù)目與形狀第十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●細(xì)菌染色體結(jié)構(gòu)第十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日真核微生物染色體結(jié)構(gòu)(示核小體)

第十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日真核生物基因結(jié)構(gòu)第十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日真核微生物基因表達(dá)控制第十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(二)原核生物的質(zhì)粒

質(zhì)粒:游離于染色體外,獨(dú)立復(fù)制,環(huán)狀、共價(jià)、閉合dsDNA分子,即cccDNA。第十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●質(zhì)粒的特點(diǎn)1)大?。捍筚|(zhì)粒:>60kb、1/cell小質(zhì)粒:10-20/cell第十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2)自主復(fù)制能力:型復(fù)制、滾環(huán)復(fù)制第十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

數(shù)量控制:嚴(yán)緊型;松弛型第二十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日3)轉(zhuǎn)移性:Tra區(qū)基因:附加體:某些質(zhì)粒既可整合進(jìn)宿主染色體,又可與染色體脫離,稱之~。第二十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日4)質(zhì)粒的消除:

----理化因子----原生質(zhì)體誘導(dǎo)法第二十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日5)不相容性:

兩種親緣關(guān)系相近的質(zhì)粒不能穩(wěn)定地存在于同一個(gè)細(xì)胞中。(G-菌的部分不相容群)第二十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●質(zhì)粒的遺傳表型1) F質(zhì)粒(致育因子)Tra基因:編碼轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白;合成性纖毛

第二十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2)R質(zhì)粒(抗藥因子)----RTF基因(抗性轉(zhuǎn)移因子)----抗性決定子(抗抗生素、抗藥、抗種金屬)第二十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日3)Col質(zhì)粒(大腸桿菌素因子)----產(chǎn)大腸桿菌素細(xì)菌素:由細(xì)菌質(zhì)粒編碼產(chǎn)生的只能抑制或殺滅近緣細(xì)菌或同種不同菌株的蛋白質(zhì)。Col質(zhì)粒類型:----非接合型:松弛型----接合型:嚴(yán)緊型第二十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日4)Ti質(zhì)粒:合成冠癭堿、大型質(zhì)粒5)Ri質(zhì)粒:產(chǎn)生根毛、大型質(zhì)粒第二十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日7)降解質(zhì)粒:降解、接合第二十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日8)致病性質(zhì)粒:溶血素、腸毒素(S.aureus)9)共生固氮質(zhì)粒:----結(jié)瘤基因(nod)----固氮基因(nif)10)隱蔽質(zhì)粒:---未有明確表型第二十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●工程質(zhì)粒----pBR322主要特點(diǎn):1)分子量小2)穩(wěn)定、松弛型復(fù)制3)可大量擴(kuò)增4)容易分離5)可攜帶小于10kb外源DNA 6)帶有2個(gè)選擇標(biāo)記;7)多個(gè)單一酶切位點(diǎn)8)容易轉(zhuǎn)化第三十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●利用選擇標(biāo)記鑒別攜帶外源片段的轉(zhuǎn)化子(雙抗菌素對(duì)照篩選)第三十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日建議讀物第三十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

§.2基因突變和誘變育種

一、基因突變●野生型菌株:從自然界分離獲得的菌株,稱之為~?!窕九囵B(yǎng)基(MM):滿足野生型菌株生長(zhǎng)最低營(yíng)養(yǎng)要求的合成培養(yǎng)基。第三十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(一)突變類型●營(yíng)養(yǎng)缺陷型:野生型菌株由于突變而喪失了某種營(yíng)養(yǎng)合成能力,而無(wú)法在基本培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的變異類型。

表示:基因:his+,his-;表型:His+,His-第三十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●抗性突變型:野生型菌株由于突變而產(chǎn)了對(duì)某些化學(xué)藥物或致死物理因子抗性變異類型。表示:基因:

strr、strs;tetr、tets;

表型:Strr,Strs第三十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

●條件致死突變型:某些菌株或病毒經(jīng)基因突變后,在某種條件可生長(zhǎng)并實(shí)現(xiàn)表型,而在另一條件卻無(wú)法生長(zhǎng)繁殖的突變類型。(如溫度敏感突變株:Ts)●形態(tài)突變株●抗原突變株●產(chǎn)量突變株第三十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●突變株類型劃分:----選擇性突變株:營(yíng)養(yǎng)缺陷型、抗性突變型、條件致死突變型----非選擇突變株:形態(tài)、抗原、產(chǎn)量突變型第三十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(二)突變率及其撿出●突變率:某一細(xì)胞在每一世代中發(fā)生突變的幾率。常用單位群體中每一世代產(chǎn)生的突變株的數(shù)目來(lái)表示。第三十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●突變株的撿出及突變率的計(jì)算撿出方法:1)選擇性突變株----營(yíng)養(yǎng)缺陷型----抗藥性突變回復(fù)突變:第三十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(三)基因突變的自發(fā)性與不對(duì)稱性

●突變的自發(fā)性:基因可自發(fā)產(chǎn)生突變。(輻射、自身有害物質(zhì)、堿基配對(duì)錯(cuò)誤)●突變的不對(duì)應(yīng)性:突變性狀與引起突變的環(huán)境因素?zé)o直接對(duì)應(yīng)關(guān)系。第四十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●平板影印培養(yǎng)試驗(yàn)

(Lederberg)第四十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(四)基因突變及其機(jī)制1、誘發(fā)突變(點(diǎn)突變,畸變)1)點(diǎn)突變(1)堿基置換---轉(zhuǎn)換---顛換第四十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●可能的突變型:錯(cuò)義突變無(wú)義突變同義突變第四十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

●相關(guān)的誘變劑--直接引起置換:

亞硝酸、亞硝基胍、羥胺、烷化劑--間接引起置換:堿基類似物(5-BU,5-AU)第四十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(2)移碼突變DNA序列中插入或缺失少數(shù)核苷酸,從而使該處后面遺傳密碼的閱讀框架發(fā)生改變的突變。第四十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2)染色體畸變

DNA分子的大段損傷,包括缺失、重復(fù)、插入、易位(轉(zhuǎn)座)和倒拉等?!褶D(zhuǎn)座:DNA分子通過(guò)非同源重組方式,從染色體的某一部位轉(zhuǎn)移到另一部位的現(xiàn)象。

第四十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●轉(zhuǎn)座因子凡具有轉(zhuǎn)座作用的DNA序列均稱之~。

特點(diǎn):---轉(zhuǎn)座作用---末端重復(fù)序列---轉(zhuǎn)座酶基因第四十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●轉(zhuǎn)座因子類型插入序列轉(zhuǎn)座子(或稱復(fù)合轉(zhuǎn)座子)轉(zhuǎn)座噬菌體第四十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

a)插入序列(IS)b)轉(zhuǎn)座子(Tn)第四十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●轉(zhuǎn)座機(jī)理第五十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●轉(zhuǎn)座子的遺傳效應(yīng)和生物學(xué)意義(復(fù)制型轉(zhuǎn)座)遺傳效應(yīng)1)插入突變2)DNA重排意義:進(jìn)化,獲得突變株,抗藥性鑒定必須基因第五十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

(五)紫外線對(duì)DNA的損傷及其修復(fù)1.損傷的機(jī)理:

形成胸腺嘧啶二聚體2、修復(fù)作用

1)光復(fù)活作用光解酶-二聚體復(fù)合物為光激活

第五十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2.暗修復(fù)作用:

第五十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日3、重組修復(fù)4、SOS修復(fù)第五十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

二、

突變與育種(一)自發(fā)突變與育種(定向培育)(二)誘變育種第五十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日1、基本原則(應(yīng)考慮的問(wèn)題)1)誘變劑的選擇(有效性,安全性,簡(jiǎn)便性)第五十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●誘變劑誘變效果測(cè)定(回復(fù)突變率的測(cè)定)---艾姆氏試驗(yàn)(檢測(cè)三致物質(zhì))第五十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2)出發(fā)菌株3)誘變菌株的狀態(tài)----處理單胞(孢)懸液----選擇單倍體或單核細(xì)胞4)劑量:低劑量;(表示方法)5)提高檢出效率----利用形態(tài)特征----鑒別培養(yǎng)基第五十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●利用鑒別培養(yǎng)基檢出突變株----蛋白酶高活性菌株的檢出(酪蛋白為N源,加HgCl2觀察透明圈)----淀粉酶高活性菌株的檢出(淀粉為C源,加I2液觀察透明圈)----有機(jī)酸高產(chǎn)菌株的檢出(培養(yǎng)基加CaCO3觀察透明圈)第五十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日6)設(shè)計(jì)高效的篩選方案----初篩(數(shù)量、定性)----復(fù)篩(質(zhì)量、定量)7)創(chuàng)新性的篩選方法第六十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2、營(yíng)缺型的篩選(1)三種基本培養(yǎng)基●基本培養(yǎng)基[-]:滿足野生型菌株生長(zhǎng)最低營(yíng)養(yǎng)要求的組合培養(yǎng)基。●完全培養(yǎng)基[+]:滿足所有營(yíng)缺型菌株生長(zhǎng)營(yíng)養(yǎng)要求的天然或半組合培養(yǎng)基。●補(bǔ)充培養(yǎng)基[A],[B]:滿足相應(yīng)營(yíng)缺型菌株生長(zhǎng)營(yíng)養(yǎng)要求的組合或半組合培養(yǎng)基。第六十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(2)三類遺傳型個(gè)體●野生型:從自然界分離獲得的菌株不論營(yíng)養(yǎng)狀況如何,均稱為~。(A+B+)●營(yíng)缺型:野生型菌株經(jīng)誘變由于代謝障礙,而必須添加某種物質(zhì)才能生長(zhǎng)的突變株。

(A+B-)(A-B+)●原養(yǎng)型:營(yíng)缺型回復(fù)突變后的菌株。

(A+B+)第六十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

基本基完全基補(bǔ)充基野生型+++營(yíng)缺型—++原養(yǎng)型+++第六十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(3)篩選步驟

1)誘變2)淘汰野生型:抗生素法、菌絲過(guò)濾法3)檢出:夾層培養(yǎng)法;限量補(bǔ)充法逐個(gè)檢出法;影印平板法

第六十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●夾層培養(yǎng)法第六十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(4)鑒定缺陷型(生長(zhǎng)譜法)1)制備基本培養(yǎng)基;2)加充分洗滌菌懸液;3)加待測(cè)營(yíng)養(yǎng)物;4)觀察生長(zhǎng)。第六十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●定位(點(diǎn))誘變盒式誘變寡核苷酸引物誘變第六十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日Strainimprovementforfermentationandbiocatalysisprocessesbygeneticengineeringtechnology建議讀物第六十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日§.3基因重組

●基因重組(遺傳重組):兩個(gè)獨(dú)立基因組內(nèi)的遺傳物質(zhì),通過(guò)一定的途徑轉(zhuǎn)移到一起,形成新的穩(wěn)定的基因組過(guò)程。第六十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●遺傳工程

----基因重組技術(shù)經(jīng)典、同源、生物自然屬性、體內(nèi)----DNA重組技術(shù):分子水平、同--異源、體外第七十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日一、原核生物的基因重組(一)轉(zhuǎn)化受體菌直接吸收供體菌游離的DNA片段而獲得部分遺傳性狀的現(xiàn)象。第七十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日1、轉(zhuǎn)化的基本條件(1)感受態(tài):受體菌最容易接受外源DNA片段并能實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化的一種生理狀態(tài)。影響因素:---遺傳因素(感受態(tài)因子;種屬的特異性;)---外部因素(CAMP、聚乙二醇、二價(jià)陽(yáng)離子---低溫低滲CaCl處理、培養(yǎng)條件)

第七十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

●轉(zhuǎn)化頻率:0.1~1%(很低),最高10%,質(zhì)粒

為良好的轉(zhuǎn)化因子。●濃度:10-5ug/ml●結(jié)構(gòu):一般轉(zhuǎn)化因子都是線狀雙鏈DNA,少數(shù)為

線狀單鏈DNA?!翊笮。好恳晦D(zhuǎn)化DNA片段分子量約1×107,約占染色體組0.3%,平均15個(gè)基因。(2)轉(zhuǎn)化因子第七十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●轉(zhuǎn)化因子非交換第七十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2、轉(zhuǎn)化過(guò)程

1)酶解和吸收單鏈2)同源區(qū)配對(duì)、整合3)復(fù)制4)形成轉(zhuǎn)化子第七十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日3.轉(zhuǎn)染(Tranfection)提純的病毒DNA或RNA進(jìn)入宿主細(xì)胞并增殖出正常的病毒后代現(xiàn)象。IfDNAfromavirusisusedasthecloningvector,theprocessiscalledtransfection.

(Introductiontomicrobiology,JohnL.Ingraham)第七十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(二)轉(zhuǎn)導(dǎo)完全缺陷或部分缺陷噬菌體為媒介,使受體細(xì)胞獲得供體細(xì)胞部分遺傳性狀的現(xiàn)象。第七十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日1、普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)

完全缺陷噬菌體對(duì)供體任何DNA小片段進(jìn)行“誤包”,而將其遺傳性狀傳遞給受體菌的現(xiàn)象,包括完全普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)和流產(chǎn)普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)兩種類型。第七十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

●完全轉(zhuǎn)導(dǎo)(形成轉(zhuǎn)導(dǎo)子)感染復(fù)數(shù):感染的噬菌體數(shù)/被感染細(xì)胞數(shù)第七十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo):(僅形成一個(gè)轉(zhuǎn)導(dǎo)子,產(chǎn)生小菌落)●經(jīng)轉(zhuǎn)導(dǎo)進(jìn)入受體菌的供體菌DNA片段,在受體菌內(nèi)不交換、整合、復(fù)制,也不迅速消失,僅進(jìn)行轉(zhuǎn)錄、翻譯、性狀表達(dá)轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象。

第八十頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2、局限轉(zhuǎn)導(dǎo)部分缺陷的溫和噬菌體把供體菌少數(shù)特定的基因攜帶到受體菌中并獲得表達(dá)的轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象。

A、低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)(LFT)1)噬菌體感染2)誘導(dǎo)裂解3)不正常切離(低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)裂解物)(dgal、dbio)4)形成局限轉(zhuǎn)導(dǎo)子第八十一頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日B、高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)(HFT)1)概念●低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)(LFT)裂解物:溶源噬菌體感染后,帶少數(shù)局限轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體的細(xì)胞裂解物?!耠p重溶源菌:同時(shí)感染有正常噬菌體和缺陷噬菌體的受體菌。(來(lái)源:LFT裂解物以高的感染復(fù)數(shù)感染宿主)第八十二頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●雙重溶源菌第八十三頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日2)高頻轉(zhuǎn)導(dǎo):在局限轉(zhuǎn)導(dǎo)中,用雙重溶源菌誘導(dǎo)后產(chǎn)生的高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)裂解物轉(zhuǎn)導(dǎo)受體菌可獲得的高達(dá)50%的轉(zhuǎn)導(dǎo)子,稱之~。3)過(guò)程:1)雙重溶源菌2)誘導(dǎo),獲得高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)裂解物3)高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)裂解物低m.o.i感染受體菌第八十四頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(3)溶源轉(zhuǎn)變

溫和噬菌體感染宿主后,宿主通過(guò)溶源化而獲得免疫性以外新性狀的現(xiàn)象?!癜缀矶舅兀喊缀?xiàng)U菌的?-噬菌體帶有“TOX”基因第八十五頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日(三)接合

●接合:通過(guò)細(xì)胞間的直接接觸,由質(zhì)粒介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象.●接合子:通過(guò)接合而獲得新的遺傳性狀的受體細(xì)胞。第八十六頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●存在方式:四種接合型菌株1、F-第八十七頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日

2、F+菌株Orit:起始子第八十八頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日3、Hfr菌株:高頻重組菌株,F(xiàn)+整合在染色體上成為附加體的狀態(tài),若與F-接合,有很高的重組頻率。1)細(xì)胞接觸2)Hfr斷裂、轉(zhuǎn)移、復(fù)制3)接合中斷4)形成接合子第八十九頁(yè),共一百零二頁(yè),2022年,8月28日●利用接合中斷

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