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文檔簡介
I.中性演化論 1一 自然界中的遺傳變自然選擇的基礎:遺傳變異
2 突變:單3 Dobzhansky的果蠅實驗(1938-1940年) 4 Watson&CrickDNA雙螺旋結構(double5 G6組(一般 中的
最終形成7
舉例:編碼蛋白質
搬運 RNA上的三聯(lián) 相應的氨基 豌豆天冬氨酸氨基轉移酶(AAT)的多態(tài)AATAAT AAT2與AAT3: MotooKimura(11.13.1924–假設一個哺乳動物有個獨立分離的loci,2alleles/locus;雜合子有選擇優(yōu)勢,純合子的選擇系數(shù)(s)為 若要維持原來種群的大小,每 結論:不可能! 變率和遺傳漂變(geneticdrift)而定。1968年Kimura Evolutionaryrateatthemolecularlevel.Nature(1968)217:624-中性理論中sutrs= 基本的公式:p2+2pq+q2= 0,selected 0,selectNearly|s|
1/(2Ne),或|s|定義:一個種群中能將其連續(xù)傳遞到下一代的平均數(shù)。實際上相當于理想狀態(tài)下(種群大小穩(wěn)定,世代之間沒有,所有個人以相同的 Ne=4NmNf/Nm:雄 Nf:雌 (Elaphurusdavidianus原產亞洲東部,1898年僅剩18 (江蘇省大豐市:N=819/Ne=50)種群恢復很快,2003年從國際“紅皮書”中“除名”從“瀕 群(7只)kN:population中的 每代Population中新的突變=u:單個突變在Population每代被固定在Population中的中性突變的概率=因此,當skv)(1/2N)v,與Population三 中性或近中性突變,隨機選擇(遺傳漂變承認負選擇(negativeselection) King&Science(1969)164:788- 兼并性Neutral偏愛性——水 NaturalselectionTomokoOhta(太田朋子,1933-NearlyNeutralTheoryofEvolution 提出了一個slightlydeleteriousmodel,Slightlydeleteriousmutantsubstitutionsinevolution.Nature(1973)246:96-五.分子演化的主要研究
DNA、RNA、蛋白質分長短(核苷酸和氨基酸的數(shù)目序列(核苷酸和氨基酸的排列順序),MERPWKCCDNI
一致性(identity)相似性(Similarity) 或蛋白質的序列一致性或相似性很鐘南山 并系同源paralogous:由
直系同 a2,a2,a3,a4,a2’,a2’,a4’,
a2
a2’,a4’,a2’,a4’,a2,a3,a4,物種 物種中性演化理 分子演化的一些術語:相似性,同源性(直系、并系MotooKimura,1983,TheNeutralTheoryofMolecularEvolution,CambridgeUniversityPressWen-HsiungLi,1997,MolecularEvolution,SinauerAssociatesInc.,,OhtaT,2010,
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