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第十二的生物合成轉(zhuǎn)錄第一頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的區(qū)別

A-U,T-A,G-CA-T,G-C配對(duì)mRNA,tRNA,rRNA子代雙鏈DNA(半保留復(fù)制)產(chǎn)物RNA聚合酶-polDNA聚合酶酶NTPdNTP原料兩股鏈均復(fù)制模板轉(zhuǎn)錄復(fù)制A-U,T-A,G-CA-T,G-CmRNA,tRNA,rRNA子代雙鏈DNA(半保留復(fù)制)產(chǎn)物RNA(RNA-pol)DNA聚合酶酶NTPdNTP原料模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄)兩股鏈均復(fù)制模板轉(zhuǎn)錄復(fù)制第二頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日第一節(jié)轉(zhuǎn)錄基本規(guī)律與體系一、不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄1.DNA分子上轉(zhuǎn)錄出RNA的區(qū)段,稱為結(jié)構(gòu)基因(structuralgene)。結(jié)構(gòu)基因中能轉(zhuǎn)錄生成RNA的一股單鏈,稱為模板鏈(templatestrand),也稱作有意義鏈或Watson鏈。另一股單鏈?zhǔn)蔷幋a鏈(codingstrand),也稱為反義鏈或Crick鏈。(一)轉(zhuǎn)錄的模板(BasicRulesandSystem

of

Transcription)2.在包含多個(gè)基因的DNA分子中,各基因的模板鏈并不總在同一條鏈上,在某個(gè)基因節(jié)段以其中某一條鏈為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,而在另一個(gè)基因節(jié)段上則以其對(duì)應(yīng)單鏈為模板,這種選擇性稱不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄。

第三頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日5335模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向5′···GCAGTACATGTC···3′3′···cgtgatgtacag···5′5′···GCAGUACAUGUC···3′N(xiāo)······Ala·Val·His·Val······C編碼鏈模板鏈mRNA蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄翻譯(二)轉(zhuǎn)錄的特點(diǎn)1.轉(zhuǎn)錄的不對(duì)稱性2.轉(zhuǎn)錄方向的單向性3.轉(zhuǎn)錄不需要引物形成連續(xù)性4.轉(zhuǎn)錄過(guò)程有特定起始和終止點(diǎn)第四頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日二、

RNA轉(zhuǎn)錄的體系(一)模板結(jié)構(gòu)基因雙鏈中的一股鏈。(二)原料4種核糖核苷酸:ATP、UTP、GTP、CTP。(三)RNA聚合酶1.原核生物的RNA聚合酶核心酶全酶第五頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合

TATAATATATTA+1-55TTGACAAACTGA+20DNAa36512決定哪些基因被轉(zhuǎn)錄b150618催化功能b¢155613結(jié)合DNA模板s70263辨認(rèn)起始點(diǎn)亞基分子量功能原核生物的RNA聚合酶第六頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日2.真核生物的RNA聚合酶種類ⅠⅡⅢ對(duì)鵝膏蕈堿的反應(yīng)45S-rRNAhnRNA5S-rRNAtRNAsnRNA耐受極敏感中度敏感轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA轉(zhuǎn)錄時(shí)除需以上物質(zhì)外,還需要一些蛋白因子參與。如原核生物使轉(zhuǎn)錄過(guò)程終止ρ因子。真核生物聚合酶Ⅱ啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄時(shí)的轉(zhuǎn)錄因子。

(四)蛋白因子第七頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日第二節(jié)RNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程(一)轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題

(1)RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域。

(2)DNA雙鏈解開(kāi),使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板。一、原核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程(TheProcessofTranscription)第八頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日(2)DNA雙鏈解開(kāi)。(1)RNA聚合酶全酶(2)與模板保守序列結(jié)合。(3)在RNA-pol作用下形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH3(4)轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:2.轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程TGTTGACATATAAT5/5/3/3/-35區(qū)-10區(qū)轉(zhuǎn)錄方向基因轉(zhuǎn)錄區(qū)啟動(dòng)子+1編碼鏈模板鏈原核生物啟動(dòng)子的保守序列

第九頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日(二)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)1.亞基脫落,RNA–pol核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板推進(jìn),NTP不斷聚合RNA鏈不斷延長(zhǎng)。(NMP)n+NTP(NMP)n+1

+PPi轉(zhuǎn)錄空泡(transcriptionbubble):RNA-pol(核心酶)

····DNA

····RNA第十頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日2.原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的羽毛狀現(xiàn)象53DNA核糖體RNARNA聚合酶轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)第十一頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日1.依賴ρ(Rho)因子的轉(zhuǎn)錄終止

ρ因子以六聚體形式存在,協(xié)助RNA-pol識(shí)別終止信號(hào),與轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物結(jié)合,RNA和RNA-pol一起從模板上脫落。(三)轉(zhuǎn)錄終止ATPrho5/3/5/3/rho第十二頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日2.非依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止

DNA模板上靠近終止處,有些特殊的堿基序列,可轉(zhuǎn)錄出具有莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA,來(lái)終止轉(zhuǎn)錄。5/3/5/3/3/5/轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA聚合酶DNA3/5/3/5/DNA5/U-U-U-U-U-U-U-U-3/RNA聚合酶第十三頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日二、真核生物的轉(zhuǎn)錄起始(一)轉(zhuǎn)錄起始1.

轉(zhuǎn)錄因子

(1)能直接、間接辨認(rèn)和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋白質(zhì),現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)數(shù)百種,統(tǒng)稱為反式作用因子(trans-actingfactors)。(2)反式作用因子中,直接或間接結(jié)合RNA聚合酶的,則稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionalfactors,TF)。

真核生物的轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)有不同DNA序列的順式作用元件,轉(zhuǎn)錄起始時(shí),RNA-pol不直接結(jié)合模板,由轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別起始部位。第十四頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日參與RNA-polⅡ轉(zhuǎn)錄的TFⅡ

蛋白激酶活性,使CTD酸化TFⅡHATPase57(α)34TFⅡE解螺旋酶30,74TFⅡF促進(jìn)RNA-polⅡ結(jié)合及作為其他因子結(jié)合的橋梁33TFⅡB穩(wěn)定TFⅡD-DNA復(fù)合物12,19,35TFⅡA輔助TBP-DNA結(jié)合TAF**結(jié)合TATA盒TBP*38TFⅡD功能亞基組成,分子量(kD)轉(zhuǎn)錄因子蛋白激酶活性,使CTD***磷TFⅡHATPase5734TFⅡE解螺旋酶30,74TFⅡF促進(jìn)RNA-polⅡ結(jié)合及作為其他因子結(jié)合的橋梁33TFⅡB穩(wěn)定TFⅡD-DNA復(fù)合物12,19,35TFⅡA輔助TBP-DNA結(jié)合TAF**結(jié)合TATA盒TBP*38TFⅡD功能亞基組成,分子量(kD)(β)***CTD(carboxylterminaldomain):RNA-polⅡ大亞基羧基末端結(jié)構(gòu)域。**TAF(TBPassociatedfactors):TBP輔助因子。在不同的基因轉(zhuǎn)錄中有不同的TAF輔助。*TBP(TATAbindingprotein):TATA結(jié)合蛋白。第十五頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒

增強(qiáng)子順式作用元件(cis-actingelement)2.

轉(zhuǎn)錄起始前的上游區(qū)段

AATAAA切離加尾轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)修飾點(diǎn)外顯子翻譯起始點(diǎn)內(nèi)含子第十六頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日3.轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物(pre-initiationcomplex,PIC)

POL-ⅡTFⅡFⅡAⅡBTFⅡFⅡHⅡETBPTAFTFⅡD-ⅡA-ⅡB-DNA復(fù)合物TATAⅡAⅡBTBPTAFTATAⅡHⅡECTD-PPOL-Ⅱ第十七頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日(二)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程與原核生物大致相似,但因有核膜相隔,沒(méi)有轉(zhuǎn)錄與翻譯同步的現(xiàn)象。(三)轉(zhuǎn)錄終止和轉(zhuǎn)錄后修飾密切相關(guān)。三、轉(zhuǎn)錄后的加工修飾主要的修飾方式有剪接、剪切、修飾、添加。

剪切(cleavage)剪接(splicing)第十八頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日(一)真核生物mRNA的轉(zhuǎn)錄后加工1.5端形成帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppNm—)。2.3端加上多聚腺苷酸尾巴(polyAtail)。7-甲基鳥(niǎo)苷三磷酸帽子結(jié)構(gòu)多聚A尾結(jié)構(gòu)OOCH2OOH+NHNNOH2NNCH3OOHH2CO-OPOOPO-OP鳥(niǎo)嘌呤OO-OPOOAAA-OH3/第十九頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日3.mRNA的剪接真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開(kāi)但又連續(xù)鑲嵌而成,稱為斷裂基因。

(1)斷裂基因(splitegene)編碼區(qū)A、B、D、F非編碼區(qū)C、EABCDEF(2)外顯子(exon)在斷裂基因及其初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上出現(xiàn),并表達(dá)為成熟RNA的核酸序列。(3)內(nèi)含子(intron)隔斷基因的線性表達(dá)而在剪接過(guò)程中被除去的核酸序列。第二十頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日雞卵清蛋白基因hnRNA首、尾修飾hnRNA剪接成熟的mRNA雞卵清蛋白基因及其轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后修飾7.7kbL1234567ABCDEFG47185511291181431561043轉(zhuǎn)錄GpppGAA···AAAGpppGAA···AAAGpppGAA···AAA第二十一頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日

內(nèi)切酶tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶、連接酶ATPADPtRNA前體(二)tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工1.轉(zhuǎn)錄后剪切tRNA第二十二頁(yè),共二十三頁(yè),2022年,8月28日2.堿基修飾(2)還原反應(yīng)如:UDHU(3

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