培訓(xùn)周五上午-srna zhangyu

SmallRNAIntroductionysisSmallRNA微小RNAPiwi蛋白相作用的SmallRNA通過多種途徑（包括mRNA降解、翻譯抑制、 sRNA的生物合成及調(diào)控sRNA

KnownPredict

OthersiRNA KnownpiRNAPredictmiRDeep2useRNAfoldby>cel-let-7MI Caenorhabditiseleganslet-7stem-loop 預(yù)大部分的siRNA、ntmiRNA以及少部分的動物 預(yù)測軟件列通過miRNA成熟體序列因之間的互補(bǔ)配對

脊椎動

打分矩陣，多對多

27.8/DianaTooHyeyongMinetal.線蟲苷酸(被稱為 ”序列)完全互補(bǔ)的序列RNAFold軟件計(jì)算結(jié)合位點(diǎn)的熱力學(xué)穩(wěn)定性,

riffiths-Jonesetal.2008rightetal.,2003riakidouetal.,2004

到評分最高的mRNA序列

unetal.,2005Kreket新版本TargetScanS采用了改進(jìn)的算法:以腺苷酸psR后的長度為6個核苷酸的序列作為 ”進(jìn)行描,并且要求這段序列定位到保g守區(qū)內(nèi),而其旁序的保守性相對較低.不需計(jì)算配對區(qū)的

nbinDaietal,

分析服務(wù)器；

Kerteszetal.

反向互補(bǔ)配對，根據(jù)非

Lewisetal.,2003,已被實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的，預(yù)測的RN靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫；人、小鼠、果蠅、蠕

度

MarcRehmsmeieretal. 人

ThanasisVergouliset

mRNA靶標(biāo)整pp

.115/MMIA/iNephewKPetal.miRNA?miRNA-mRNA關(guān)聯(lián)分前提：miRNA通過其 發(fā)揮作證明靶向調(diào)控關(guān)發(fā)現(xiàn)調(diào)控通發(fā)現(xiàn)重點(diǎn)靶：網(wǎng)miRNA-mRNANat-siRNA(NaturalAntisenseTranscriptssiRNA(transactingsiRNAs)ta-siRNA是在植物中發(fā)現(xiàn)的一類（TAS），依賴于miRNA、長度為21個堿基 NAT是指跟它的互補(bǔ)序列來自 上不同位置的轉(zhuǎn)錄ToexaminehowsiRNAsaredistributed,weassignedaclusteredsiRNAlocustoagenomicregionthatcontainsoverlap orcloselylinkedsiRNAs(<=250bp)withtwoormore 組上的分布情WhenapiRNAoverlappedwithanotherpiRNA,thesewererecognizedasasingle .piRNAslocatedwith