肉羊育種數(shù)據(jù)管理技術編制說明DB1x

《肉羊育種數(shù)據(jù)管理技術規(guī)范》編制說明一、工作簡況根據(jù)2019年10月10日由自治區(qū)市場監(jiān)管局下達019年第2批內蒙古自治區(qū)地方標準制修訂項目計劃的通知（內市監(jiān)標準至019〕300號），《肉羊育種數(shù)據(jù)管理技術規(guī)范》立項地方標準;提出單位為內蒙古自治區(qū)農牧業(yè)科學歸;口單位為內蒙古自治區(qū)畜牧業(yè)標準化技術委員會；起草單位為內蒙古自治區(qū)農牧業(yè)科學院、內蒙古農業(yè)大學，起草人包括：何小龍、劉永斌、付紹印、張文廣、祁云霞、馬躍軍、王標、達賴、郝宸昉、何江峰、王力偉、孫素珍、特日格勒、陳欣、方勤圓。二、制定標準的必要性和意義我區(qū)肉羊養(yǎng)殖場普遍缺乏對肉羊育種的長遠規(guī)劃記錄和保存肉羊育種資料缺乏足夠重視，羊場管理方式粗放羊只檔案缺失、系譜混亂，相關育種數(shù)據(jù)采集和利用效率不詢知育種資料的收集整理和分析是肉羊育種的根攤統(tǒng)的手工記錄方式容易記錄錯誤或者記錄遺失，而且人工計算分析數(shù)據(jù)非常復雜育種效率低下。另一方面，傳統(tǒng)的肉羊育種數(shù)據(jù)分析和管理具有一定的局限性表現(xiàn)在數(shù)據(jù)零散和記錄不規(guī)范不完全、不系統(tǒng)，不能準確快捷地運用現(xiàn)代遺傳育種理論進行育種分這就直接導致肉羊育種數(shù)據(jù)資料的延遲利用和肉羊種用價值評定的準確性差以及羊場育種目標和生產決策的盲使性，羊育種生產表現(xiàn)為低質量和低效率。本文件規(guī)定了肉羊育種數(shù)據(jù)采集的內徽據(jù)庫管理方法及數(shù)據(jù)分析技術要,相的在于實現(xiàn)我區(qū)肉羊育種數(shù)據(jù)資料管理的規(guī)范科學化和提高種羊選種選配的準確熟種羊場和育種專家提供科學快捷的育種信息，實現(xiàn)現(xiàn)代遺傳育種理論與計算機技術的有機結合。三、主要起草過程，包括地方標準草案、征求意見稿、送審稿、報批稿形成過程等2019年3月提交了《肉羊育種數(shù)據(jù)管理技術規(guī)范》內蒙古地方標準項目建議書，并起草標準草案；2019年4月至2020年12月對標準草案進行了修改完善，開展了肉羊性能測定數(shù)據(jù)記錄表格設計、數(shù)據(jù)庫管理的分析實驗021年1月起草小組召開“肉羊育種數(shù)據(jù)管理技術”研討會，征求有關專家意見起草小組對與會專家的意見和建議進行分析總采納相關意見，形成“征求意見稿”2021年4月根據(jù)內蒙古自治區(qū)畜牧業(yè)標準化技術委員會專家老師意見進行修改，形成送審稿。四、制定標準的原則和依據(jù)，與現(xiàn)行法律、法規(guī)、標準的關系本文件制定根撤Y/T388畜禽場環(huán)境質量標準NY/T1167畜禽場環(huán)境質量及衛(wèi)生控制規(guī)范、NY/T1236綿山羊生產性能測定技術規(guī)頰Y/T3469畜禽屠宰操作規(guī)程羊、NY/T1872種羊遺傳評估技術規(guī)范的規(guī)則起草。標準格式依據(jù)T1.1-202標準化工作導則第部分：標準化文件的結構和起草規(guī)則起草。五、主要條款的說明，主要技術指標、參數(shù)、試驗驗證的論述1名詞術語對“日增重”、“背膘厚”、GR值”、“眼肌面積”、“滴水損失”、“熟肉率”、“剪切力”進行了名詞解釋說明。2主要技術指標、參數(shù)根據(jù)肉羊育種的實際需要育種數(shù)據(jù)管理流程主要包括以下四項內容據(jù)收集、數(shù)據(jù)管理、數(shù)據(jù)分析、遺傳評估。數(shù)據(jù)收集：肉羊育種所有數(shù)據(jù)都來自性能測定主要包括:配種數(shù)據(jù)、出生數(shù)據(jù)、斷奶數(shù)據(jù)、生長數(shù)據(jù)和屠宰數(shù)據(jù)指標。數(shù)據(jù)管理:利用計算機或者育種軟件對采集數(shù)據(jù)的唯一完整性和準確性進行核驗核驗結束后及時將數(shù)據(jù)上傳國家或省級種羊遺傳評估中心開展種羊遺傳評估工作還要對原始測定數(shù)據(jù)進行建檔長期保存。數(shù)據(jù)分析：主要對采集的數(shù)據(jù)開展描述統(tǒng)計常規(guī)分析、系譜分析、方差組分分析，并形成統(tǒng)計分析報告反饋肉羊養(yǎng)殖場，指導育種工作。遺傳評估：數(shù)據(jù)管理及分析的最終目的，形成育種報告，指導肉羊養(yǎng)殖場制定育種規(guī)劃，合理的開展選種選配工作。3試驗驗證數(shù)據(jù)收集肉羊性能測定是指對待選肉羊個體性狀表型值進行評定的一種育種措施羊只體型外貌符合品種標準個體本身及其父母系譜清晰準確，個體本身及其同胞均無遺傳缺陷生長發(fā)育正常，健康狀況良好；免疫注射符合免疫規(guī)程的要求，且記錄完整。測定場地環(huán)境及其衛(wèi)生條件符梅/T388和NY/T1167中的規(guī)定。羊的生長數(shù)據(jù)測定標準按）W/T1236規(guī)定執(zhí)行。羊的屠宰標準按時Y/T3469規(guī)定執(zhí)行。配種數(shù)據(jù)配種數(shù)據(jù)包括：序號，受配母羊耳號、品種、等級；公羊耳號、品種、等級；配種日期，配種方式，預產期數(shù)據(jù)。配種數(shù)據(jù)記錄格式見表

表1母羊配種記錄表羊場名稱: 分場（群體）： 年度： 記錄入： No序號受配母羊配種公羊配種日期配種方式預產期備注耳號品種等級耳號品種等級第一次第二次第三次123…注：配種斌為人工授精或本交，配種方式為本交時配種公磊息可不填寫3.1.2出生數(shù)據(jù)出生數(shù)據(jù)包括:序號，產羔母羊耳號年齡、分娩日期、胎次、產羔數(shù)量;出生羔羊編號、耳號、性別、初生重、出生類型和主要特征數(shù)據(jù)。出生數(shù)據(jù)記錄格龍見表表2母羊產羔記錄表羊場名稱:分場（群體）：年度：記錄人：No序號產羔母羊出生羔羊備注耳號年齡分娩日期胎次產羔數(shù)羔羊編號性別初生重kg初生鑒定臨時耳號出生類型主要特征123…注:出生類型指順產或難產斷奶數(shù)據(jù)斷奶數(shù)據(jù)包括:序號，羔羊耳號，斷奶日期，斷奶體重，日增重數(shù)據(jù)。斷奶數(shù)據(jù)記錄格式見表3。生長數(shù)據(jù)生長數(shù)據(jù)包括：6月齡、12月齡、18月齡的體高、體長、胸圍和體重數(shù)據(jù)。生長數(shù)據(jù)記錄格式見表4。表4生長性狀測定記錄表羊場名稱:分場（群體）：日期：記錄入：No序號耳號月齡性別體高cm體長cm胸圍cm體重kg備注123???注：月齡包括6月齡、12月齡和8月齡，分別測定屠宰數(shù)據(jù)屠宰數(shù)據(jù)包括屠宰、胴體和肉質三個部分。采）窠?4℃排酸24h的左側胴體背最長肌或者其他部位肌肉樣進行肉品質相關指標測數(shù)據(jù)類型包括宰前活重洞體重、屠宰率、胴體凈肉率、肉骨比、背膘厚^值、眼肌面積、尾脂重、肉你H、滴水損失、熟肉率和剪切力。數(shù)據(jù)記錄格式見表表5屠宰性狀測定記錄表羊場名稱: 分場（群體）： 日期： 記錄入： No序號耳號月齡屠宰與胴體性狀肉質性狀宰前活重kg胴體重kg屠宰率%胴體凈肉率%肉骨比背膘厚mmGR值mm眼肌面積cm2尾脂重g肉色PH滴水損失%熟肉率%剪切力N備注123…數(shù)據(jù)管理數(shù)據(jù)庫管理將性能測定數(shù)據(jù)應及時錄入計算機或育種軟建立格式統(tǒng)一的育種數(shù)據(jù)庫每只種羊都有一個全區(qū)唯一的個體號每個個體的編號一旦確定后就不再變動當該個體轉入其他場時，仍沿用此個體號，不得改動。個體編號實行全國統(tǒng)一的種羊編號系緘系統(tǒng)由24位字母和數(shù)字構成即：場代碼（15位）+品種代碼2位）+出生年度代碼2位）+場內順序號代碼（位）。場代碼：采用按照《畜禽標識和養(yǎng)殖檔案管理辦法》（農業(yè)部部令第）規(guī)定，并在全國畜禽規(guī)模養(yǎng)殖信息服務云平臺備案的畜禽養(yǎng)殖代編碼形式為：3-XXXXXX（縣級行政區(qū)域代碼-xxxxxxxM標識順序號。由系統(tǒng)自動給出。品種代碼：采用與羊只品種（遺傳資源）名稱（英文名稱或漢語拼音有關的兩位大寫英文字母組成，品種代碼規(guī)定參見表。對新培育或引進的品種可以增補但品種縮寫代碼不得與原有的品種代碼重復。由系統(tǒng)自動給出。表6內蒙古羊品種（遺傳資源）代碼表序號品種名稱代碼序號品種名稱代碼1蒙古羊MY17呼倫貝爾^田毛羊HX2烏珠穆沁羊WZ18內蒙古半^田毛羊NM3呼倫財羊HL19巴美解BM4蘇尼特羊ST20昭烏達肉羊ZR5烏冉克羊WR21察哈爾羊CY6灘羊TA22戈壁短尾羊GA7湖羊HY23草原短尾羊CA8小尾寒羊XW24中國美利奴羊（科爾遜）ZM9內蒙古絨山羊NR25罕山白絨山羊HB10烏珠穆沁白山羊WB26德國肉用美利奴羊DM11內蒙古細毛羊NX27澳洲白綿羊AB12敖漢細毛羊AH28澳洲美利奴羊AM13鄂爾多斯^田毛羊EX29杜泊羊DO14科爾沁細^羊KX30薩?？搜騍F15興安毛肉兼用細毛羊XM31德克賽爾羊TE16烏蘭察布^田毛羊WL32無角雌特羊WT出生年度代碼：用實際出生自然年度的后兩位數(shù)字表示。由系統(tǒng)自動給出。場內順序號代碼按照本場編號原則給每只羊確定順序號碼從00001~99999之間不得重復。公羊順序號尾數(shù)用奇數(shù)1,（3,5,7,9）表示，母羊順序號用偶數(shù)2,4,6,8,0）表示。場內編號具體做法：在本場內登記管理時，羊只耳標編號可以儲位數(shù)（年度尾數(shù)五位順序號）。種羊編號必須寫在個體耳標上，佩戴在左耳上。育種數(shù)據(jù)采集過程中應盡量記錄完建立育種數(shù)據(jù)庫時應該對原始數(shù)據(jù)完整性進行核驗，對于記錄不全、關鍵數(shù)據(jù)缺失時，數(shù)據(jù)庫報警并及時給出提醒，完善數(shù)據(jù)。育種數(shù)據(jù)必須準確精確，建立育種數(shù)據(jù)庫時應該對原始數(shù)據(jù)準確性進行核驗于明顯超出合理范圍的數(shù)據(jù)及時給出提醒，核對數(shù)據(jù)。育種數(shù)據(jù)應根據(jù)肉羊育種需要，定期上傳國家或省級種羊遺傳評估中心。檔案管理紙質檔案：對于所有原始測定記錄的紙質檔案，應設專人專柜分年度妥善保存。電子檔案:對于所有原始測定數(shù)據(jù)每個肉羊育種場應將原始數(shù)據(jù)及時錄入專用電腦或者育種管理軟件，硬盤備份，長期保存。數(shù)據(jù)分析描述統(tǒng)計對于每次測定數(shù)據(jù)或者選定數(shù)概展描述統(tǒng)計分析包括:平均值、標準誤差、標準差、方差、最大值、最小值、中位數(shù)、和、數(shù)據(jù)量，并生成統(tǒng)計分析報告。統(tǒng)計軟件為Excel或SAS或SPSS軟件。常規(guī)統(tǒng)計根據(jù)性狀數(shù)據(jù)不同以及性狀間的關系和育種需要包擇不同的統(tǒng)計方法來進行統(tǒng)計分析。包括t檢驗、卡方檢驗、方差分析、回歸分析等。統(tǒng)計軟件為SAS/STAT統(tǒng)計分析模塊或PSS軟件的統(tǒng)計包。系譜分析系譜數(shù)據(jù)文件包括個體號父親號和母親號然后再把父母個體號再往上追溯直至追溯不到為止，其中大多數(shù)個體均可追溯到三代及以上。統(tǒng)計軟件為R語言的pedigree軟件包。方差組分估計統(tǒng)計模型中隨機效應的方差協(xié)方差分析是育種值估計的前提包用約束最大似然REML)法求解混合模型方程組分，是遺傳評估的基礎性工腌ML方法的基本原理為：設有如下線性混合模型j=Xb+Zu+eu?N(0,A02),e?N(0,1a2)j?N(Xb,ZAZO2+1o2)u e對于j，總可找到一個它的線性函數(shù)J，它滿歡X=0，使得E(Ky)=K'Xb=0亦即ky不受固定效應的影響。若y服從正態(tài)分布，則Ky也服從正態(tài)分布其期望為)，協(xié)方差矩陣為KVK,Ky的似然函數(shù)為f(Ky,V)= 1-———expf-1y'K(K'VK)-Ky；(2人)s-“X)/2|K^VK|1/2 12 J其中n為向量y的長度，r(X)為矩陣X的秩。通過求該函數(shù)的關于2和02的最大值，即可得2和。2的REML的估計值。估計軟件為DFREML軟件、WOMBAT軟件、MTDFREML軟件、DMU軟件、ASREML軟件等。遺傳評估遺傳評估是肉羊育種的核心，也是數(shù)據(jù)處理的最終目的。遺傳評估包括性狀遺傳力計算、育種值的估計，評估方法包括綜合選擇指數(shù)法和最佳線性無偏預測法UP法)等，目前BLUP法是最常用的遺傳評估方法。評估軟