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核酸生物合成詳解演示文稿當(dāng)前1頁(yè),總共123頁(yè)。優(yōu)選核酸生物合成當(dāng)前2頁(yè),總共123頁(yè)。第一節(jié)DNA生物合成的方式
一、DNA生物合成的概念
DNA的生物合成是指在生物體內(nèi)通過酶促聚合反應(yīng)合成DNA分子。DNA的生物合成有DNA指導(dǎo)的DNA合成、RNA指導(dǎo)的DNA合成以及修復(fù)合成。當(dāng)前3頁(yè),總共123頁(yè)。
DNA指導(dǎo)的DNA合成是指以親代DNA為模板,合成新的、與親代模板完全一樣的子代DNA分子的過程,故這種合成也稱為DNA復(fù)制,它是細(xì)胞內(nèi)DNA合成的最主要方式。
RNA指導(dǎo)的DNA合成是指以RNA為模板,合成與RNA核苷酸序列相對(duì)應(yīng)的DNA分子的過程。因在其過程中,遺傳信息的流動(dòng)方向與轉(zhuǎn)錄過程的方向相反,故稱RNA指導(dǎo)的DNA合成為逆轉(zhuǎn)錄合成。逆轉(zhuǎn)錄作用廣泛存在于生物界,在RNA病毒感染宿主的致病過程有重要意義。
此外,某些物理、化學(xué)或生物學(xué)(病毒)因素可導(dǎo)致DNA分子的損傷,生物體細(xì)胞內(nèi)存在DNA修復(fù)合成體系,可使損傷的DNA分子得以修復(fù),也稱修復(fù)合成。當(dāng)前4頁(yè),總共123頁(yè)。二、DNA復(fù)制合成的基本規(guī)律當(dāng)前5頁(yè),總共123頁(yè)。(一)DNA的半保留復(fù)制1.定義以親代DNA雙鏈為模板以堿基互補(bǔ)方式合成子代DNA,這樣新形成的子代DNA中,一條鏈來(lái)自親代DNA,而另一條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式叫半保留復(fù)制。當(dāng)前6頁(yè),總共123頁(yè)。DNA復(fù)制的可能方式全保留與全新復(fù)制分散復(fù)制半保留復(fù)制當(dāng)前7頁(yè),總共123頁(yè)。DNA半保留復(fù)制圖示:當(dāng)前8頁(yè),總共123頁(yè)。2.半保留復(fù)制的實(shí)驗(yàn)證據(jù)
1958年Meselson和Stahl用同位素15N標(biāo)記大腸桿菌DNA,首先證明了DNA的半保留復(fù)制。當(dāng)前9頁(yè),總共123頁(yè)。(二)DNA的雙向復(fù)制DNA的復(fù)制是雙向復(fù)制。復(fù)制時(shí),DNA從起始點(diǎn)(origin)向兩個(gè)方向解旋,形成兩個(gè)延伸方向相反的復(fù)制叉,稱為雙向復(fù)制(bidirectionalreplication)。習(xí)慣上把兩個(gè)相鄰起始點(diǎn)之間的距離定為一個(gè)復(fù)制子(replicon)。復(fù)制子是獨(dú)立完成復(fù)制的功能單位。當(dāng)前10頁(yè),總共123頁(yè)。雙向復(fù)制單向復(fù)制當(dāng)前11頁(yè),總共123頁(yè)。復(fù)制中的DNA
復(fù)制原點(diǎn)復(fù)制叉當(dāng)前12頁(yè),總共123頁(yè)。(三)DNA的半不連續(xù)復(fù)制DNA雙螺旋的兩條鏈?zhǔn)欠雌叫械?,?fù)制時(shí)DNA的兩條鏈均作為模板,分別合成兩條子代DNA鏈,而DNA合成的方向只能是5’→3’。在DNA復(fù)制時(shí),一條子代DNA鏈的合成方向和復(fù)制叉的前進(jìn)方向相同,可以連續(xù)復(fù)制,稱為前導(dǎo)鏈(leadingstrand);而另一條子代DNA鏈的合成方向和復(fù)制叉的前進(jìn)方向正好相反,不能連續(xù)復(fù)制,只能分成幾個(gè)片段合成,稱之為后隨鏈(laggingstrand)。后隨鏈?zhǔn)紫群铣傻氖遣贿B續(xù)的短DNA片段,叫岡崎片段。前導(dǎo)鏈連續(xù)復(fù)制而后隨鏈不連續(xù)復(fù)制,就是DNA的半不連續(xù)復(fù)制。當(dāng)前13頁(yè),總共123頁(yè)。
DNA的復(fù)制叉與半不連續(xù)復(fù)制
當(dāng)前14頁(yè),總共123頁(yè)。(四)DNA復(fù)制的高保真性
DNA復(fù)制的精確度極高,誤差率很低,DNA復(fù)制的高度忠實(shí)性至少要依賴三種機(jī)制:1、遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律;2、DNA聚合酶在復(fù)制延長(zhǎng)中對(duì)堿基的選擇功能;3、復(fù)制出錯(cuò)時(shí),DNA聚合酶的即時(shí)校讀功能。DNA復(fù)制高保真性的意義在于使親代的遺傳信息準(zhǔn)確地傳遞給子代,從而使親代和子代間保持遺傳的穩(wěn)定性。DNA的復(fù)制一旦出現(xiàn)差錯(cuò),將會(huì)引起遺傳信息的改變,可能引起生物的變異。當(dāng)前15頁(yè),總共123頁(yè)。DNA復(fù)制的主要方式大腸桿菌雙鏈環(huán)狀DNA的復(fù)制(一個(gè)復(fù)制起點(diǎn),雙向復(fù)制)真核細(xì)胞線狀染色體DNA的復(fù)制方式(多個(gè)復(fù)制起點(diǎn),雙向復(fù)制)當(dāng)前16頁(yè),總共123頁(yè)。DNA復(fù)制的主要方式3不同位置D-環(huán)式復(fù)制方式(線粒體雙鏈環(huán)狀DNA:兩條鏈的復(fù)制起點(diǎn)不同位置,且復(fù)制不同步)單向滾環(huán)式復(fù)制(噬菌體X174DNA—單鏈環(huán)狀)當(dāng)前17頁(yè),總共123頁(yè)。第二節(jié)DNA復(fù)制所需的酶類和蛋白質(zhì)DNA復(fù)制的本質(zhì)是脫氧核苷酸之間通過生成3’,5’磷酸二酯鍵,發(fā)生鏈?zhǔn)骄酆戏磻?yīng)的過程。DNA復(fù)制的反應(yīng)體系包括:底物、聚合酶、模板、引物和其它酶及蛋白質(zhì)因子。四種底物是指dNTP,即dATP、dTTP、dGTP和dCTP。聚合酶是指依賴DNA的DNA聚合酶,簡(jiǎn)稱DNA-pol。模板指解開成單鏈的DNA母鏈。引物是指提供3‘-OH末端,使dNTP可以通過生成3’,5’磷酸二酯鍵而發(fā)生依次聚合的短鏈RNA分子。在這一過程中,DNA聚合酶起主要催化作用,還有其它多種起不同的作用酶和蛋白質(zhì)因子參與。當(dāng)前18頁(yè),總共123頁(yè)。一、DNA聚合酶:DNA指導(dǎo)下的DNA合成原料:四種脫氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)需要模板:以DNA為模板鏈,合成子代DNA,模板可以是雙鏈,也可以是單鏈DNA。合成產(chǎn)物與模板互補(bǔ)。3’-OH.
需要引物:一小段RNA(或DNA)為引物,在大腸桿菌中,DNA的合成需要一段RNA鏈作為引物,引物含3’-OH.
合成方向:53屬于多功能酶,它們?cè)贒NA復(fù)制和修復(fù)過程的不同階段發(fā)揮作用。
酶的催化性質(zhì):當(dāng)前19頁(yè),總共123頁(yè)。DNA聚合酶
當(dāng)前20頁(yè),總共123頁(yè)。(一)原核生物DNA聚合酶
在原核生物大腸桿菌中DNA聚合酶Ⅰ、DNA聚合酶Ⅱ和DNA聚合酶Ⅲ。(簡(jiǎn)寫DNApolⅠ,DNApolⅡ和DNApolⅢ)。實(shí)驗(yàn)證明大腸桿菌中DNA復(fù)制的主要過程靠DNApolⅢ起作用,而DNApolⅠ和DNApolⅡ在DNA錯(cuò)配的校正和修復(fù)中起作用。當(dāng)前21頁(yè),總共123頁(yè)。1、1956年Kornberg首先從大腸桿菌中分離。該酶為單體酶,含一個(gè)鋅原子。為多功能酶,具有:
(1)53聚合酶功能(但持續(xù)合成DNA的能力差);(2)3
5’外切酶活性(對(duì)雙鏈無(wú)作用,在正常聚合條件下,此活性不能作用于生長(zhǎng)鏈,只作用于生長(zhǎng)中不配對(duì)的單鏈,校對(duì)功能。);(3)還具有53’外切酶活性(雙鏈有效);該酶缺失時(shí)大腸桿菌仍具有DNA合成酶活性,只是對(duì)DNA損傷的修復(fù)能力下降,容易導(dǎo)致變異和死亡。推測(cè)該酶主要是對(duì)DNA損傷的修復(fù),以及在DNA復(fù)制時(shí)RNA引物切除及其缺口的填補(bǔ)。1、DNA聚合酶Ⅰ:當(dāng)前22頁(yè),總共123頁(yè)。2、DNA聚合酶Ⅱ和DNA聚合酶ⅢDNA聚合酶Ⅱ:多亞基酶,聚合作用,聚合活力比DNA聚合酶Ⅰ高;持續(xù)合成DNA的能力差。該酶缺失時(shí)大腸桿菌仍具有DNA合成能力,推測(cè)該酶仍然不是真正的DNA聚合酶。該酶具有3’5’外切酶活性。其功能可能在修復(fù)紫外光引起的DNA損傷中起作用。當(dāng)前23頁(yè),總共123頁(yè)。
DNA聚合酶Ⅲ多亞基酶,含十種亞基:(αβγθτδδ’χΨε),其中(αεθ)稱為核心酶,β2稱為夾子,(γ2δδ’χΨ)組成γ復(fù)合物,其主要功能是幫助β亞基夾住DNA,故稱為夾子裝配器,該酶DNA合成的持續(xù)能力強(qiáng),主要與該結(jié)構(gòu)有關(guān)。另外,該酶合成速度大,活性高,缺失時(shí)大腸桿菌因DNA復(fù)制抑制而致死。因此認(rèn)為該酶DNA的真正復(fù)制酶。DNA聚合酶Ⅲ當(dāng)前24頁(yè),總共123頁(yè)。DNA聚合酶Ⅲ的β-鉗子俯視圖DNA雙螺旋當(dāng)前25頁(yè),總共123頁(yè)。DNA聚合酶ⅠDNA聚合酶ⅡDNA聚合酶Ⅲ結(jié)構(gòu)基因*不同種類的亞基數(shù)目相對(duì)分子質(zhì)量3’→5’外切酶5’→3’外切酶聚合速度(核苷酸/分)持續(xù)合成能力功能PolA1103,000++1,000-1,2003-200切除引物,修復(fù)PolB≥788,000+-2,4001,500修復(fù)PolC≥10830,000+-15,000-60,000≥500,000復(fù)制
大腸桿菌三種DNA聚合酶比較當(dāng)前26頁(yè),總共123頁(yè)。(二)、真核生物DNA聚合酶
真核生物DNA聚合酶有α、β、γ、δ及ε。它們的基本特性相似于大腸桿菌DNA聚合酶,其主要活性是催化dNTP的5′→3′聚合活性。當(dāng)前27頁(yè),總共123頁(yè)。真核生物的DNA聚合酶
αβγδε亞基數(shù)4>2504425分子量(KD)36-38160-300170256細(xì)胞內(nèi)定位核核線粒體核核5′→3′聚合活性+++++3′→5′外切活性-----
功能復(fù)制、引發(fā)修復(fù)復(fù)制復(fù)制復(fù)制當(dāng)前28頁(yè),總共123頁(yè)。真核細(xì)胞DNA復(fù)制
DNApolα主要負(fù)責(zé)染色體DNA的復(fù)制。 DNApolβ的模板特異性是具有缺口的DNA分子,被認(rèn)為它與DNA修復(fù)有關(guān)。 DNApolγ在線粒體DNA的復(fù)制中起作用。 DNApolδ不但有5′→3′聚合活性,而且還具有3′→5′外切酶活性。 真核生物DNA復(fù)制是在DNApolα和DNApolδ協(xié)同作用下進(jìn)行的, 前導(dǎo)鏈的合成靠DNApolδ催化,并且還需要一種細(xì)胞周期調(diào)節(jié)因子增殖細(xì)胞核抗原(proliferatingcellnucleusantigen,PCNA)參與。 而后隨鏈的合成時(shí),岡崎片段和引物合成分別由DNApolδ和DNApolα酶完成。當(dāng)前29頁(yè),總共123頁(yè)。二、參與復(fù)制的其他酶和蛋白質(zhì)因子
DNA復(fù)制過程是極其復(fù)雜的過程。除了DNA聚合酶,還有其它酶和蛋白質(zhì)因子參與DNA復(fù)制。
當(dāng)前30頁(yè),總共123頁(yè)。(一)解旋酶
DNA開始復(fù)制時(shí)首先在起始點(diǎn)處解開雙鏈,反應(yīng)是在一種解旋酶(helicase)的催化下進(jìn)行的。解旋酶需要ATP分解供給能量。大腸桿菌中DnaB蛋白就有解旋酶活性,與后隨鏈的模板DNA結(jié)合,沿5′→3′方向移動(dòng),還有一種Rep蛋白和前導(dǎo)鏈的模板DNA結(jié)合沿3′→5′方向移動(dòng)。解旋酶的作用就是打開DNA雙鏈之間的氫鍵。當(dāng)前31頁(yè),總共123頁(yè)。(二)單鏈結(jié)合蛋白
單鏈結(jié)合蛋白(singlestrandbindingproteins,SSBP)的作用是與解開的單鏈DNA結(jié)合,使其穩(wěn)定,不會(huì)再度螺旋化并且避免核酸內(nèi)切酶對(duì)單鏈DNA的水解,保證單鏈DNA做為模板時(shí)的伸展?fàn)顟B(tài)。單鏈結(jié)合蛋白可以重復(fù)利用。當(dāng)前32頁(yè),總共123頁(yè)。(三)拓?fù)洚悩?gòu)酶
拓?fù)涫侵肝矬w或圖像作彈性位移而保持物體原有的性質(zhì)。在DNA復(fù)制過程中,需要部分DNA呈現(xiàn)松弛狀態(tài),這使其它部分的DNA由于呈現(xiàn)正、負(fù)超螺旋狀態(tài)而出現(xiàn)打結(jié)或纏繞等拓?fù)鋵W(xué)性質(zhì)的改變。DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase)是一類通過催化DNA鏈的斷裂、旋轉(zhuǎn)和重新連接而直接改變DNA拓?fù)鋵W(xué)性質(zhì)的酶。在DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、重組和染色質(zhì)重塑等過程中,DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶的作用是調(diào)整DNA的超螺旋程度,促進(jìn)DNA和蛋白質(zhì)相互作用,防止DNA形成不利的過度超螺旋。當(dāng)前33頁(yè),總共123頁(yè)。DNA超螺旋與DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶
當(dāng)前34頁(yè),總共123頁(yè)。人類DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶分為Ⅰ型和Ⅱ型兩種Ⅰ型拓?fù)洚悩?gòu)酶不需要ATP,能切斷DNA雙鏈中的一股,它使DNA解旋中不打結(jié),并在適當(dāng)?shù)臅r(shí)候連接切口。Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶能切斷DNA的雙鏈,它在無(wú)ATP時(shí),能夠切斷及時(shí)清除復(fù)制叉前進(jìn)中的正超螺旋;在有ATP供能時(shí),由于不具有旋轉(zhuǎn)酶活性,不能使松弛狀態(tài)的DNA進(jìn)入負(fù)超螺旋,斷端在同一酶催化下連接恢復(fù)。Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶主要參與DNA復(fù)制。當(dāng)前35頁(yè),總共123頁(yè)。當(dāng)前36頁(yè),總共123頁(yè)。(四)引物酶
引物酶(primase)是一種特殊的RNA聚合酶,可催化短片段RNA的合成。這種短片段RNA一般由十幾個(gè)至數(shù)十個(gè)核苷酸組成,它們?cè)贒NA復(fù)制起始處做為引物。RNA引物的3′-OH末端提供了由DNA聚合酶催化形成DNA分子第一個(gè)磷酸二酯鍵的位置。當(dāng)前37頁(yè),總共123頁(yè)。(五)連接酶
連接酶(ligase)的作用是催化相鄰的DNA片段以3’,5’-磷酸二酯鍵相連接。連接反應(yīng)中的能量來(lái)自ATP(或NAD+)。在DNA復(fù)制中,連接酶連接后隨鏈相鄰DNA片段的缺口,形成完整的DNA鏈。此外,在DNA修復(fù)、重組和剪接中,DNA連接酶起連接缺口的作用。當(dāng)前38頁(yè),總共123頁(yè)。DNA連接酶
當(dāng)前39頁(yè),總共123頁(yè)。參與DNA復(fù)制的酶與蛋白因子總覽圖當(dāng)前40頁(yè),總共123頁(yè)。第三節(jié)DNA生物合成(復(fù)制)過程真核生物的DNA復(fù)制過程與原核生物的基本相似。DNA復(fù)制是以復(fù)制子為單位進(jìn)行的。復(fù)制過程分成三個(gè)階段,
第一個(gè)階段為DNA復(fù)制的起始階段,這個(gè)階段包括起始點(diǎn),復(fù)制方向以及引發(fā)體的形成,
第二階段為DNA鏈的延長(zhǎng),包括前導(dǎo)鏈及后隨鏈的形成和切除RNA引物后填補(bǔ)空缺及連接崗崎片段。
第三階段為DNA復(fù)制的終止階段。當(dāng)前41頁(yè),總共123頁(yè)。DNA的復(fù)制過程:(以大腸桿菌為例)
復(fù)制的終止:
復(fù)制的起始起始復(fù)合物的形成:稱為引發(fā)RNA引物的合成
鏈的延伸:當(dāng)前42頁(yè),總共123頁(yè)。一、起始大腸桿菌的固定復(fù)制起始點(diǎn)稱為OriC,它由245bp的堿基組成,其中含有3組13bp的串聯(lián)重復(fù)序列(富含AT)以及2對(duì)9bp反向重復(fù)序列。13bp的重復(fù)序列因?yàn)楦缓珹T而容易解鏈。大腸桿菌DNA的復(fù)制起始點(diǎn)OriC結(jié)構(gòu)當(dāng)前43頁(yè),總共123頁(yè)。復(fù)制起始1、拓?fù)洚悩?gòu)酶解開超螺旋。2、DnaA蛋白識(shí)別并在ATP存在下結(jié)合于四個(gè)9bp的重復(fù)序列。3、在類組蛋白(HU、ATP參與下,DanA蛋白變性13個(gè)bp的重復(fù)序列,形成開鏈復(fù)合物。4、DnaB借助于水解ATP產(chǎn)生的能量在DnaC的幫助下沿5’
→3’方向移動(dòng),解開DNA雙鏈,形成前引發(fā)復(fù)合物。5、單鏈結(jié)合蛋白結(jié)合于單鏈。6、引物合成酶(DnaG蛋白)開始合成RNA引物。當(dāng)前44頁(yè),總共123頁(yè)。二、延長(zhǎng)大腸桿菌DNA復(fù)制的延長(zhǎng)
當(dāng)前45頁(yè),總共123頁(yè)。鏈的延長(zhǎng)(岡崎片段的合成)
真核生物的岡崎片段為:100-200bp原核生物的岡崎片段為:1000-2000bp當(dāng)前46頁(yè),總共123頁(yè)。
DNA鏈的延伸在DNA聚合酶Ш的催化下,以四種5’-脫氧核苷三磷酸為底物,在RNA引物的3’端以磷酸二酯鍵連接上脫氧核糖核苷酸并釋放出焦磷酸。DNA鏈的延伸同時(shí)進(jìn)行前導(dǎo)鏈和滯后鏈的合成。兩條鏈方向相反。
前導(dǎo)鏈滯后鏈岡崎片段半不連續(xù)復(fù)制岡崎模型當(dāng)前47頁(yè),總共123頁(yè)。岡崎片段引物的切除、缺口的填補(bǔ)和切口的連接:當(dāng)前48頁(yè),總共123頁(yè)。前導(dǎo)鏈和滯后鏈的合成(DNA聚合酶的異二聚體催化)當(dāng)前49頁(yè),總共123頁(yè)。三、復(fù)制的終止Ter,引起復(fù)制終止的特定區(qū)域,20bp的序列,終止利用物質(zhì)Tus可識(shí)別并結(jié)合,從而導(dǎo)致DNA復(fù)制的終止。當(dāng)前50頁(yè),總共123頁(yè)。三、復(fù)制的終止在大腸桿菌中,染色體DNA復(fù)制終止于終止區(qū)(terminus)。在該區(qū)域的兩側(cè)存在兩組由23bp組成的終止子位點(diǎn),即Ter位點(diǎn)。Ter位點(diǎn)富含GT,能特異性地結(jié)合Tus蛋白。Tus蛋白被稱為終止區(qū)利用物質(zhì)(terminatiorutilizationsubstance,Tus蛋白),是解旋酶(DnaB蛋白)的抑制劑。當(dāng)Tus蛋白Ter位點(diǎn)結(jié)合以后,復(fù)制叉的前進(jìn)被阻止。因此,當(dāng)一個(gè)復(fù)制子中的兩個(gè)復(fù)制叉在終止區(qū)相遇后,DNA復(fù)制即停止。當(dāng)前51頁(yè),總共123頁(yè)。四、真核生物DNA復(fù)制的特點(diǎn)1、真核生物染色體有多個(gè)復(fù)制起點(diǎn),稱為自主復(fù)制序列(ARS)或復(fù)制基因(replicator);多復(fù)制眼,呈雙向復(fù)制,多復(fù)制子。2、岡崎片段長(zhǎng)約100-200bp。當(dāng)前52頁(yè),總共123頁(yè)。4、真核生物染色體在全部復(fù)制完之前起點(diǎn)不再重新開始復(fù)制;而在快速生長(zhǎng)的原核生物染色體DNA復(fù)制中,起點(diǎn)可以連續(xù)發(fā)動(dòng)復(fù)制。真核生物快速生長(zhǎng)時(shí),往往采用更多的復(fù)制起點(diǎn)使總體復(fù)制速度比原核生物更快。3、真核生物DNA復(fù)制速度比原核慢,速度為1000~3000bp/min(僅為原核生物的1/20~1/50)。四、真核生物DNA復(fù)制的特點(diǎn)當(dāng)前53頁(yè),總共123頁(yè)。四、真核DNA復(fù)制特點(diǎn)5、真核生物線性染色體兩端有端粒結(jié)構(gòu),它是由許多成串的重短復(fù)序列組成,端粒功能是穩(wěn)定染色體末段結(jié)構(gòu),防止染色體間的末端連接,并可補(bǔ)償滯后鏈5’-末段在消除RNA引物后造成的空缺,使染色體保持一定長(zhǎng)度。端粒酶是含一段RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶.當(dāng)前54頁(yè),總共123頁(yè)。端粒真核生物染色體是線性DNA,它的兩端叫做端粒(telomeres),端粒是由重復(fù)的寡核苷酸序列構(gòu)成的。由于所有生物DNA聚合酶都只能催化DNA從5′→3′的方向合成,因此當(dāng)真核生物DNA復(fù)制終止時(shí),復(fù)制叉到達(dá)真核生物線性染色體末端,前導(dǎo)鏈可以連續(xù)合成到頭,而由于后隨鏈?zhǔn)且砸环N不連續(xù)的形式合成崗崎片段,除去最后的RNA引物后,留下空隙,所以不能完成線性染色體末端的復(fù)制。剩下單鏈DNA母鏈,如果不填補(bǔ)成雙鏈,就會(huì)被核內(nèi)核糖核酸酶降解,確有可能引起染色體線性DNA的末端縮短。但是,通過端粒酶的催化合成可以補(bǔ)償這種染色體末端的縮短,從而維持DNA復(fù)制的完整性。當(dāng)前55頁(yè),總共123頁(yè)。端粒酶(telomerase)端粒酶(telomerase)是真核生物體內(nèi)存在的一種酶。人類端粒酶由三部分組成: 具有逆轉(zhuǎn)錄酶活性的蛋白質(zhì)部分端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(humantelomerasereversetranscriptase,hTRT)、 具有模板作用的端粒酶RNA(humantelomeraseRNA,hTR)和 端粒酶協(xié)同蛋白(humantelomeraseassociatedprotein1,hTP1)的。當(dāng)前56頁(yè),總共123頁(yè)。端粒酶與端粒人類端粒酶的作用是通過端粒酶RNA識(shí)別并結(jié)合DNA母鏈,以自身的RNA為模板,在DNA的3′OH末端以逆轉(zhuǎn)錄方式復(fù)制延長(zhǎng)單鏈DNA母鏈;當(dāng)單鏈DNA母鏈復(fù)制延長(zhǎng)足夠長(zhǎng)度后,延長(zhǎng)的DNA母鏈可以發(fā)生反折,而端粒酶脫離母鏈;然后,以這種延長(zhǎng)的DNA母鏈為模板,以反折的DNA母鏈為引物,在DNA聚合酶作用下,從3′-OH末端繼續(xù)合成后隨鏈,填補(bǔ)空隙。因此,端粒酶在保證染色體復(fù)制的完整性上有重要意義。當(dāng)前57頁(yè),總共123頁(yè)。端粒酶的生物學(xué)功能研究表明,端粒酶活性的下降與細(xì)胞的老化有關(guān);某些增殖活躍的腫瘤細(xì)胞中,端粒酶活性增高。對(duì)端粒和端粒酶的研究,有可能揭示細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、衰老以及腫瘤發(fā)生的新機(jī)制,對(duì)尋找腫瘤治療的新靶點(diǎn)有意義。當(dāng)前58頁(yè),總共123頁(yè)。7、RPA:真核生物的單鏈結(jié)合蛋白;RNaseH1和MF-1切除RNA引物,DNA聚合酶ε填補(bǔ)缺口。6、真核生物有多種DNA聚合酶,DNA聚合酶Ⅲ(δ)是真正的復(fù)制酶,在PCNA存在下有持續(xù)的合成能力。PCNA稱為增殖細(xì)胞核抗原,相當(dāng)于大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ的β-夾子,RFC蛋白相當(dāng)于夾子裝配器。四、真核生物DNA復(fù)制的特點(diǎn)當(dāng)前59頁(yè),總共123頁(yè)。真核細(xì)胞內(nèi)有五種DNA聚合酶DNA聚合酶αDNA聚合酶β
DNA聚合酶γ
DNA聚合酶δDNA聚合酶ε定位亞基數(shù)目外切酶活性引物合成酶活性持續(xù)合成能力抑制劑功能細(xì)胞核4-+中等蚜腸霉素引物合成細(xì)胞核1--低雙脫氧TTP修復(fù)線粒體23’→5’外切酶-高雙脫氧TTP線粒體DNA合成細(xì)胞核23’→5’外切酶-有PCNA時(shí)高蚜腸霉素核DNA合成細(xì)胞核>15’→3’外切酶-高蚜腸霉素修復(fù)當(dāng)前60頁(yè),總共123頁(yè)。當(dāng)前61頁(yè),總共123頁(yè)。第四節(jié)逆轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)是以RNA為模板合成DNA的過程。在逆轉(zhuǎn)錄過程中,遺傳信息從RNA流向DNA,這與通常轉(zhuǎn)錄過程遺傳信息流動(dòng)的方向相反。當(dāng)前62頁(yè),總共123頁(yè)。
用特異抑制物(放線菌素D)能抑制致癌RNA病毒的復(fù)制,而對(duì)一般RNA病毒的復(fù)制無(wú)影響。已知放線菌素D專門抑制以DNA為模板的反應(yīng),可見致癌RNA病毒的復(fù)制過程必然涉及到DNA。所以Temin于1964年提出前病毒的假說(shuō)。
1970年,Temin和Baltimore分別從致癌RNA病毒(勞氏肉瘤病毒和鼠白血病病毒)中發(fā)現(xiàn)了逆轉(zhuǎn)錄酶。當(dāng)前63頁(yè),總共123頁(yè)。一、逆轉(zhuǎn)錄酶
逆轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase)由一個(gè)α亞基和一個(gè)β亞基組成,含有Zn2+,需要RNA或DNA作引物。逆轉(zhuǎn)錄酶具有三種酶活性: 一是RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性(以RNA為模板,合成一條互補(bǔ)的DNA,形成RNA—DNA雜種分子); 二是RNaseH酶活性,水解RNA—DNA雜交體分子中的RNA,可沿3’→5’和5’→3’兩個(gè)方向起外切酶作用; 三是DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性。 無(wú)校對(duì)功能,錯(cuò)誤率高,易產(chǎn)生變異。當(dāng)前64頁(yè),總共123頁(yè)。二、逆轉(zhuǎn)錄過程
當(dāng)前65頁(yè),總共123頁(yè)。cDNA在基因操作中,以某一特殊mRNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶催化下合成的DNA稱為互補(bǔ)DNA(complementaryDNA,cDNA)。通過cDNA克隆測(cè)序,可以推測(cè)mRNA的序列及其編碼的蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。當(dāng)前66頁(yè),總共123頁(yè)。三、逆轉(zhuǎn)錄的生物學(xué)意義
逆轉(zhuǎn)錄酶和逆轉(zhuǎn)錄過程的發(fā)現(xiàn),是對(duì)遺傳信息傳遞中心法則的補(bǔ)充,揭示遺傳信息不僅可以從DNA流向RNA,也可以相反,至少在某些生物,RNA與DNA同樣具有遺傳信息傳遞和表達(dá)的功能。同時(shí),加深了對(duì)RNA病毒致癌、致病的認(rèn)識(shí)。逆轉(zhuǎn)錄酶已經(jīng)成為制備cDNA,進(jìn)行基因操作的工具酶。當(dāng)前67頁(yè),總共123頁(yè)。逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活史當(dāng)前68頁(yè),總共123頁(yè)。第五節(jié)DNA的損傷與修復(fù)DNA存儲(chǔ)著生物體賴以生存和繁衍的遺傳信息,外界環(huán)境和生物體內(nèi)部的因素經(jīng)常會(huì)導(dǎo)致DNA分子的改變。組成DNA分子的脫氧核苷酸或者DNA片段在構(gòu)成、復(fù)制或表型功能的異常變化,稱為DNA突變也是DNA損傷(DNAdamage)。有的DNA損傷或突變是致死性的,可以導(dǎo)致個(gè)體、細(xì)胞的死亡。因此修復(fù)DNA損傷、維護(hù)DNA分子的完整性對(duì)生物能保持遺傳穩(wěn)定性至關(guān)重要。另一方面,突變又是生物進(jìn)化的分子基礎(chǔ),是與遺傳相對(duì)立統(tǒng)一而普遍存在的現(xiàn)象。當(dāng)前69頁(yè),總共123頁(yè)。一、造成DNA損傷的因素
造成DNA損傷的因素有生物體內(nèi)自發(fā)的、亦有外界物理和化學(xué)等因素。 (一)自發(fā)的因素 (二)物理因素 (三)化學(xué)因素當(dāng)前70頁(yè),總共123頁(yè)。(一)自發(fā)的因素 由于DNA分子受到周圍環(huán)境溶劑分子的隨機(jī)熱碰撞,腺嘌呤或鳥嘌呤與脫氧核糖間的N-糖苷鍵可以斷裂,使A或G脫落。人體細(xì)胞中DNA每天每個(gè)細(xì)胞要脫落5000個(gè)嘌呤堿,每天每個(gè)細(xì)胞也有100個(gè)胞嘧啶自發(fā)脫氨而成尿嘧啶。當(dāng)前71頁(yè),總共123頁(yè)。(二)物理因素
紫外線造成DNA損傷。由于嘌呤環(huán)與嘧啶環(huán)都含有共軛雙鍵,能吸收紫外線而引起DNA損傷。嘧啶堿引起的損傷比嘌呤堿大10倍。紫外線損傷是由于2個(gè)相鄰嘧啶堿的C5和C6共價(jià)交聯(lián),產(chǎn)生嘧啶二聚體。
當(dāng)前72頁(yè),總共123頁(yè)。(三)化學(xué)因素烷化劑對(duì)DNA的損傷烷化劑是一類親電子的化合物,很容易與生物體中大分子的親核位點(diǎn)起反應(yīng)。烷化劑的作用可使DNA發(fā)生堿基烷基化、堿基脫落、斷鏈、交聯(lián)等各種類型的損傷?;瘜W(xué)物質(zhì)修飾DNA鏈上的堿基或通過影響DNA復(fù)制而改變堿基序列,例如亞硝酸鹽能使C脫氨變成U,黃曲霉素B也能專一攻擊DNA上的堿基導(dǎo)致序列的變化,這些都是誘發(fā)突變的化學(xué)物質(zhì)或致癌劑。當(dāng)前73頁(yè),總共123頁(yè)。二、DNA損傷的類型
根據(jù)DNA分子的改變,可把突變分為下面幾種主要類型。錯(cuò)配缺失、插入重排當(dāng)前74頁(yè),總共123頁(yè)。三、DNA損傷的修復(fù)
DNA修復(fù)(DNArepairing)是細(xì)胞對(duì)DNA受損傷后的一種反應(yīng),這種反應(yīng)可能使DNA結(jié)構(gòu)恢復(fù)原樣,重新能執(zhí)行它原來(lái)的功能;但有時(shí)并非能完全消除DNA的損傷,只是使細(xì)胞能夠耐受這種DNA的損傷而能繼續(xù)生存。DNA修復(fù)包括直接修復(fù)、切除修復(fù)、重組修復(fù)和SOS修復(fù)等。當(dāng)前75頁(yè),總共123頁(yè)。(一)錯(cuò)配錯(cuò)配(mismatch)也稱點(diǎn)突變(pointmutation),是DNA分子上一個(gè)堿基的變異,可分為:①轉(zhuǎn)換(transition)同型堿基,如一種嘌呤代替另一種嘌呤或一種嘧啶代替另一嘧啶。②顛換(transversation)異型堿基,即嘌呤變嘧啶,或嘧啶變嘌呤。 點(diǎn)突變?nèi)绨l(fā)生在啟動(dòng)子或剪接信號(hào)部位可以影響整個(gè)基因的功能;如發(fā)生在編碼序列,有的可以改變蛋白質(zhì)的功能,如引起鐮形紅細(xì)胞貧血;有的則為中性變化,即編碼氨基酸雖然變化,但功能不受影響;有的甚至是靜止突變,堿基雖變但編碼氨基酸種類不變。當(dāng)前76頁(yè),總共123頁(yè)。點(diǎn)突變引起鐮形紅細(xì)胞貧血
當(dāng)前77頁(yè),總共123頁(yè)。(二)缺失、插入缺失(deletion)是一個(gè)堿基或一段核苷酸鏈乃至整個(gè)基因,從DNA大分子上丟失。插入(insertion)是一個(gè)原來(lái)沒有的堿基或一段原來(lái)沒有的核苷酸序列插入到DNA大分子中去,或有些芳香族分子如吖啶(acridine)嵌入DNA雙螺旋堿基對(duì)中。缺失或插入可以引起框移突變(frame-shift-mutation),影響三聯(lián)體密碼的閱讀方式,如有些地中海貧血、生長(zhǎng)激素基因缺失。當(dāng)前78頁(yè),總共123頁(yè)。(三)重排
重排(rearragement)DNA鏈內(nèi)部重組使其中一段核苷酸鏈方向倒置或者一段DNA從一處遷移到另一處。由于血紅蛋白β鏈和δ鏈兩種類型的基因重排而引起的地中海貧血。當(dāng)前79頁(yè),總共123頁(yè)。突變或誘變對(duì)生物可能產(chǎn)生的后果 ①致死性; ②喪失某些功能; ③改變基因型(genotype)而不改變表現(xiàn)型(phenotype); ④發(fā)生了有利于物種生存的結(jié)果,使生物進(jìn)化。當(dāng)前80頁(yè),總共123頁(yè)。DNA突變可能導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生:
沉默突變:突變影響非必需的DNA或突變對(duì)一個(gè)基因的功能的影響可忽略,稱為沉默突變?;貜?fù)突變:一些突變可以克服第一次突變?cè)斐傻挠绊懀@類突變稱為回復(fù)突變。動(dòng)物細(xì)胞的突變與癌的發(fā)生有強(qiáng)烈的相關(guān)性。當(dāng)前81頁(yè),總共123頁(yè)。三、DNA損傷的修復(fù)
DNA修復(fù)(DNArepairing)是細(xì)胞對(duì)DNA受損傷后的一種反應(yīng),這種反應(yīng)可能使DNA結(jié)構(gòu)恢復(fù)原樣,重新能執(zhí)行它原來(lái)的功能;但有時(shí)并非能完全消除DNA的損傷,只是使細(xì)胞能夠耐受這種DNA的損傷而能繼續(xù)生存。DNA修復(fù)包括直接修復(fù)、切除修復(fù)、重組修復(fù)和SOS修復(fù)等。當(dāng)前82頁(yè),總共123頁(yè)。(一)直接修復(fù)光修復(fù)是直接修復(fù)(directrepair)的一種形式。光修復(fù)主要存在于低等生物。幾乎所有細(xì)胞都含有光復(fù)活酶(photoreactivatingenzyme),也稱為DNA光修復(fù)酶(photolyase)。當(dāng)紫外線280nm照射時(shí),DNA產(chǎn)生的嘧啶二聚體。但在可見光300-600nm照射下,光復(fù)活酶能夠被激活,從而解聚嘧啶二聚體。當(dāng)前83頁(yè),總共123頁(yè)。(二)切除修復(fù)切除修復(fù)(excisionrepair)是指在一系列酶的作用下,切除損傷的DNA部分,以完整的另一條鏈為模板,填補(bǔ)切除部分的空隙并連接,使損傷的DNA部分恢復(fù)正常。切除修復(fù)途徑對(duì)所有生物的生存至關(guān)重要。當(dāng)前84頁(yè),總共123頁(yè)。切除修復(fù)是真核細(xì)胞的重要修復(fù)形式。人類遺傳性疾病著色性干皮病(xerodermapigmentosum),是常染色體隱性遺傳性疾病。純合子患者的皮膚對(duì)陽(yáng)光或紫外線極度敏感,皮膚變干、真皮萎縮、角化、眼瞼結(jié)疤、角膜潰瘍,易患皮膚癌。此病是由于缺乏紫外特異內(nèi)切核酸酶而無(wú)法修復(fù)造成的。當(dāng)前85頁(yè),總共123頁(yè)。(三)重組修復(fù)
切除修復(fù)發(fā)生在DNA復(fù)制之前。如果DNA復(fù)制要越過尚未修復(fù)的損傷部位,或者因?yàn)閾p傷的DNA片段較長(zhǎng)不能在復(fù)制前完全修復(fù)時(shí),可以先進(jìn)行復(fù)制,然后再進(jìn)行重組修復(fù)。重組修復(fù)(recombinationrepair)是指DNA復(fù)制后,子代DNA在損傷的對(duì)應(yīng)部位出現(xiàn)空隙時(shí),可以通過分子間的重組,從完整的母鏈上將相應(yīng)的DNA片段轉(zhuǎn)移到子代DNA的空隙處,母鏈留下的空隙處通過以另一條完好的母鏈DNA鏈為模板在DNA聚合酶作用下進(jìn)行修復(fù),最后由DNA連接酶連接而封口(圖)。重組修復(fù)過程中,子代DNA損傷的空隙被補(bǔ)上了,但是DNA鏈的損傷并未除去。當(dāng)前86頁(yè),總共123頁(yè)。重組修復(fù)至少需要4種酶組分。重組基因recA編碼一種分子量為40kDa的蛋白質(zhì),它具有交換DNA鏈的活力。RecA蛋白被認(rèn)為在DNA重組和重組修復(fù)中均起關(guān)鍵作用。recB、recC基因分別編碼核酸外切酶V的兩個(gè)亞基。當(dāng)前87頁(yè),總共123頁(yè)。(四)SOS修復(fù)
SOS修復(fù)(SOSresponse)是一類應(yīng)急性的修復(fù)方式。由于DNA損傷廣泛至難以繼續(xù)復(fù)制,由此而誘發(fā)出一系列復(fù)雜的反應(yīng)。SOS修復(fù)特點(diǎn)是反應(yīng)特異性低,對(duì)堿基的識(shí)別、選擇能力差。通過SOS修復(fù),復(fù)制如能繼續(xù),細(xì)胞是可存活的。然而,DNA保留的錯(cuò)誤會(huì)較多,引起較廣泛、長(zhǎng)期的突變。當(dāng)前88頁(yè),總共123頁(yè)。SOS反應(yīng)和誘導(dǎo)修復(fù)(易錯(cuò)修復(fù))SOS反應(yīng):細(xì)胞DNA受到嚴(yán)重?fù)p傷或DNA復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的緊急狀態(tài)下,為求生存而出現(xiàn)的應(yīng)急反應(yīng)。SOS反應(yīng)包括:避免差錯(cuò)的修復(fù)能力增強(qiáng)誘導(dǎo)產(chǎn)生無(wú)校正功能的DNA聚合酶合成抑制細(xì)胞分裂當(dāng)前89頁(yè),總共123頁(yè)。SOS修復(fù)Irradiationofbacteriabeforevirusinfectionenhancedrepairofdamagedviralgenesbutledtomutations.UVUV’dT4phage
E.coliFewsurvivingphageUV’dT4phage
E.coliHigherfrequencyofsurviving
phage,butmanymutants.當(dāng)前90頁(yè),總共123頁(yè)。SOS修復(fù)誘導(dǎo)DNA聚合酶活性LexA
(一種DNA結(jié)合抑制蛋白),
umuC
和umuD,編碼DNA聚合酶活性,允許復(fù)制跨過損傷位點(diǎn),常插入一個(gè)或幾個(gè)A堿基.AGCTAGTCAT/TCAGTCAGCTAGTCAT/TCAGTCTCGATCANNNNGTCAGReplicationstopsatT/TdimerError-pronepolymeraseallowsreplicationtoproceed,albeitinaccuratelySOSresponse:當(dāng)前91頁(yè),總共123頁(yè)。RecA-P的三種功能a、DNA重組活性b、與S.S.DNA結(jié)合活性c、少數(shù)蛋白的proteinase活性當(dāng)DNA正常復(fù)制時(shí)(無(wú)復(fù)制受阻,無(wú)DNA損傷,無(wú)TTdimer)
RecA-p不表現(xiàn)proteinase活性當(dāng)前92頁(yè),總共123頁(yè)。當(dāng)DNA復(fù)制受阻/DNAdamaged細(xì)胞內(nèi)原少量表達(dá)的RecA-p與S.S,DNA結(jié)合激活RecA-p的proteinase活性修復(fù)損傷LexA-p降解RecA-p高效表達(dá)SOSopen當(dāng)DNA復(fù)制度過難關(guān)后RecA-p很快消失LexAgeneonSOSoff當(dāng)前93頁(yè),總共123頁(yè)。SOS修復(fù)
DNA復(fù)制不很嚴(yán)格,新合成的DNA容易造成錯(cuò)誤產(chǎn)生突變。當(dāng)前94頁(yè),總共123頁(yè)。線粒體損傷和修復(fù)線粒體的氧化損傷:
單鏈斷裂、雙鏈斷裂、堿基修飾、DNA交聯(lián)、烷化損傷線粒體的損傷修復(fù):
堿基切除修復(fù)、錯(cuò)配修復(fù)當(dāng)前95頁(yè),總共123頁(yè)。DNA修復(fù)維持DNA序列的保真性;可在復(fù)制前后進(jìn)行;有多種修復(fù)機(jī)制來(lái)糾正DNA損傷;DNA修復(fù)失敗可能導(dǎo)致突變和腫瘤。當(dāng)前96頁(yè),總共123頁(yè)。細(xì)胞周期檢查點(diǎn)控制
真核生物細(xì)胞DNA受到損傷時(shí)細(xì)胞除了誘導(dǎo)修復(fù)基因的轉(zhuǎn)錄外,還可暫時(shí)阻斷細(xì)胞周期,防止受損DNA繼續(xù)復(fù)制,如無(wú)法修復(fù),則可誘導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)入凋亡。這些都是細(xì)胞通過細(xì)胞周期檢查點(diǎn)控制(checkpointcontrol,又稱關(guān)卡控制)對(duì)DNA損傷的應(yīng)答反應(yīng)。當(dāng)前97頁(yè),總共123頁(yè)。酵母細(xì)胞的細(xì)胞周期檢查點(diǎn)控制機(jī)制DNA損傷在S期DNA損傷在G1
和G2
期G1SG2MPOL2RFC5DPB11RAD9RAD17RAD24MEC3MEC1,TEL1RAD53當(dāng)前98頁(yè),總共123頁(yè)。哺乳類動(dòng)物的細(xì)胞周期檢查點(diǎn)控制機(jī)制DNA損傷P21Gadd45BaxP53CDK/cyclinGadd45Gadd45-PCNABlockingcellcycleExcisionrepairingCellapoptosis當(dāng)前99頁(yè),總共123頁(yè)。第三節(jié)
DNA損傷和修復(fù)的生物參考標(biāo)志當(dāng)前100頁(yè),總共123頁(yè)。一、甲基化損傷修復(fù)相關(guān)基因
甲基轉(zhuǎn)移酶(MGMT)把O6-甲基鳥嘌呤的甲基轉(zhuǎn)移到自身的半胱氨酸殘基上,修復(fù)甲基化的DNA。MGMT突變可作為甲基化損傷的基因型標(biāo)記物。當(dāng)前101頁(yè),總共123頁(yè)。二、切除修復(fù)相關(guān)的酶和基因尿嘧啶糖基化酶為主要的始動(dòng)因素,可作為DNA損傷的生物標(biāo)記物。大腸桿菌Uvr基因家族、人ecrr基因和切除修復(fù)基因等當(dāng)前102頁(yè),總共123頁(yè)。三、錯(cuò)配修復(fù)相關(guān)基因MSH2、MLH1等蛋白參與錯(cuò)配修復(fù),而錯(cuò)配修復(fù)的缺陷往往是癌變的第一步。錯(cuò)配修復(fù)基因:Muthls系統(tǒng)、人類的hmsh2/3、hpmsl1/2、Mutsa、msh6。錯(cuò)配修復(fù)基因的微衛(wèi)星序列的不穩(wěn)定性(microsatelliteinstability,MI)當(dāng)前103頁(yè),總共123頁(yè)。四、DNA聚合酶β
DNA聚合酶β參與輻射損傷和化學(xué)損傷的修復(fù),并對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)具有調(diào)節(jié)作用。
DNA聚合酶β
的突變可導(dǎo)致堿基切除修復(fù)功能的缺陷。當(dāng)前104頁(yè),總共123頁(yè)。五、DNA加合物也可作為修復(fù)功能的生物標(biāo)記物
DNA加合物可作為DNA損傷的暴露標(biāo)記物和效應(yīng)標(biāo)記物,其去除的速度也可作為DNA修復(fù)功能的生物標(biāo)記物。當(dāng)前105頁(yè),總共123頁(yè)。DNA損傷和修復(fù)的生物學(xué)意義避免基因組的不穩(wěn)定性、癌癥和細(xì)胞死亡是至關(guān)重要的。DNA修復(fù)途徑可以識(shí)別和修復(fù)特異的DNA損傷,保證生物物種的遺傳穩(wěn)定性。當(dāng)前106頁(yè),總共123頁(yè)。與DNA
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