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關(guān)于實(shí)驗(yàn)植物提取及檢測(cè)第一頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一植物基因組DNA的提取瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)第二頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康膶W(xué)習(xí)提取和純化高等植物總DNA的方法,理解其原理。第三頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一脫氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)

與蛋白質(zhì)結(jié)合在一起以核蛋白(DNP)的形式存在。在制備核酸時(shí)通常破壞細(xì)胞壁及細(xì)胞膜來(lái)使核蛋白釋放出來(lái)。植物總DNA包括細(xì)胞核DNA和細(xì)胞核外DNA,前者存在于細(xì)胞核內(nèi),后者存在于細(xì)胞質(zhì)中有半自主性復(fù)制活性的細(xì)胞器內(nèi),例如線粒體DNA(mtDNA)和葉綠體DNA(ctDNA)。二、實(shí)驗(yàn)原理第四頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一第五頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一細(xì)胞破碎抽提去蛋白質(zhì)沉淀核酸基本過(guò)程第六頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一①機(jī)械方法:超聲波處理法、研磨法、勻漿法;②化學(xué)試劑法:用SDS處理細(xì)胞;③酶解法:加入溶菌酶或蝸牛酶,破壞細(xì)胞壁。

細(xì)胞破碎

第七頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一SDS法SDS是有效的陰離子去垢劑,細(xì)胞中DNA與蛋白質(zhì)之間常借靜電引力或配位鍵結(jié)合,SDS能夠破壞這種價(jià)鍵。CTAB法CTAB是一種陽(yáng)離子去垢劑,它可以溶解膜與脂膜,使細(xì)胞中的DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物釋放出來(lái),并使蛋白質(zhì)變性,使DNA與蛋白質(zhì)分離。DNA提取第八頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一蛋白質(zhì)

常用苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)或氯仿:異戊醇(24:1)抽提。RNA常選用RNase消化,或是用LiCl來(lái)消除大分子的RNA。酚類(lèi)物質(zhì)

提取液中加少量巰基乙醇,選取幼嫩的材料。DNA純化(去雜質(zhì))第九頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一實(shí)驗(yàn)材料植物葉片(去葉脈)試劑2×CTAB抽提液(CTAB、Tris-HCL、EDTA、Nacl)TE緩沖液(pH=8.0)氯仿:異戊醇(24:1)巰基乙醇異丙醇70%乙醇

三、材料與試劑第十頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一①離心機(jī)②水浴鍋③研缽④微量移液器儀器用具第十一頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一移液器-量程的選擇第十二頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一1.取2g清洗涼干的植物幼嫩葉片于研缽中,加入液氮,迅速研磨。將2×CTAB抽提液與2ml巰基乙醇在提取前混合后于65℃水浴中加熱30分鐘。2.將0.5mL研磨液轉(zhuǎn)入1.5mL離心管中,加入1mlCTAB提取液,置于65℃水浴中保溫30min,其間顛倒混勻2-3次。破碎細(xì)胞3.加入等體積氯仿:異戊醇(24:1)混合液,充分顛倒混勻20分鐘,防止成團(tuán)。8000r/min,離心5min,取上清。抽提去蛋白4.將上清液移入新的1.5mL離心管內(nèi),加等體積異丙醇(預(yù)冷)。顛倒混勻,可見(jiàn)DNA絮狀沉淀。沉淀核酸5.8000r/min,離心1min,倒掉上清液,將離心管倒置干燥。

將沉淀回溶于無(wú)菌水或TE緩沖液待測(cè)。四、操作步驟第十三頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一1)選取新鮮材料,研磨迅速?gòu)氐?,研磨好的材料?yīng)與CTAB抽提液充分混勻;2)若提取產(chǎn)物有顏色,可能是材料中含有較多的多酚類(lèi)物質(zhì),添加巰基乙醇(2-5%),盡可能選取幼嫩的材料;3)收集CTAB與核酸形成的復(fù)合物時(shí)不要離心過(guò)度,否則沉淀再溶解難;4)為了獲得具有生物活性的天然核酸,在分離制備過(guò)程中必須采用溫和的條件,避免過(guò)酸過(guò)堿、劇烈地?cái)嚢?,防止熱變性,同時(shí)還要避免核酸降解酶類(lèi)的降解。五、注意事項(xiàng)第十四頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一六、作業(yè)為了獲得高質(zhì)量的植物總DNA,在分離提取過(guò)程中應(yīng)注意那些問(wèn)題?第十五頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康膶W(xué)習(xí)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的方法和技術(shù)。第十六頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一DNA分子在高于等電點(diǎn)的PH溶液中帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中向正極移動(dòng)。在一定電場(chǎng)強(qiáng)度下,DNA分子的遷移速度與相對(duì)分子質(zhì)量的對(duì)數(shù)成反比。二、實(shí)驗(yàn)原理第十七頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一瓊脂糖是一種線性多糖聚合物。濃度越高,孔隙越小,其分辨能力就越強(qiáng)。瓊脂糖濃度(%)線型DNA分子的分離范圍(Kb)0.35~600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2第十八頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一三、實(shí)驗(yàn)儀器和試劑儀器電泳儀電泳槽灌膠模具等第十九頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一Tris-硼酸(TBE)Tris-乙酸(TAE)Tris-磷酸(TPE)常用電泳緩沖液第二十頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一電泳指示劑溴酚蘭在堿性液體中呈紫蘭色,一般與蔗糖、甘油或聚蔗糖400組成上樣緩沖液。

作用:①增加樣品比重,以確保DNA均勻沉入加樣孔內(nèi)。②形成肉眼可見(jiàn)的指示帶,預(yù)測(cè)核酸電泳的速度和位置。③使樣品呈色,使加樣操作更方便。上樣緩沖液第二十一頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一溴化乙錠(EB)是一種熒光染料,EB分子可嵌入核酸雙鏈的堿基對(duì)之間,在紫外線激發(fā)下,發(fā)出紅色熒光。其熒光強(qiáng)度與DNA的含量成正比。據(jù)此可粗略估計(jì)樣品DNA濃度。瓊脂糖凝膠EB染色,肉眼可見(jiàn)核酸電泳帶,其DNA量一般>5ng。EB是致癌物質(zhì),切勿用手接觸,更不要污染環(huán)境。GoldViewTM:

是一種可代替溴化乙錠(EB)的新型核酸染料,采用瓊脂糖電泳檢測(cè)DNA時(shí),GoldViewTM與核酸結(jié)合后能產(chǎn)生很強(qiáng)的熒光信號(hào),其靈敏度與EB相當(dāng),使用方法與之完全相同。在紫外透射光下雙鏈DNA呈現(xiàn)綠色熒光,而單鏈DNA呈紅色熒光。GoldView不僅能染DNA,也可用于染RNA。

核酸染色劑第二十二頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)第二十三頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一不同種類(lèi)DNAMarker第二十四頁(yè),共三十頁(yè),編輯于2023年,星期一1.凝膠制備制備1%瓊脂糖凝膠。稱(chēng)取0.8g瓊脂糖加入80mL1×TAE,加熱至瓊脂糖全部熔化,冷卻至50-60℃時(shí),加入EB或GoldViewTM

10ul。緩慢倒入膠板,待膠凝固后拔出梳子。2.加樣取15μlDNA樣液與2μl上樣buffeer混勻,用微量移液器小心加入樣品槽。3.電泳接通電源,切記靠近加樣孔的一端為負(fù),電壓為1~5V/cm(長(zhǎng)度以?xún)蓚€(gè)電極之間的距離計(jì)算),待溴酚蘭移動(dòng)到一定位置,停止

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