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文檔簡介
原核生物表達調(diào)控第1頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.1基因表達調(diào)控的現(xiàn)象和概念
一、基因表達調(diào)控是生命的必需
基因表達(geneexpression)細胞在生命過程中,把蘊藏在DNA中的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄和翻譯,轉(zhuǎn)變成為具有功能的蛋白質(zhì)分子的過程。典型的基因表達是基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯,產(chǎn)生有生物活性的蛋白質(zhì)的過程。圍繞基因表達過程中發(fā)生的各種各樣的調(diào)節(jié)方式都通稱為基因表達調(diào)控(generegulation或gene
control)。第2頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四基因表達調(diào)控是生物體內(nèi)基因表達的調(diào)節(jié)控制機制,使細胞中基因表達的過程在時間、空間上處于有序狀態(tài),并對環(huán)境條件的變化做出適當反應的復雜過程?;虮磉_調(diào)控是生物體內(nèi)細胞分化、形態(tài)發(fā)生和個體發(fā)育的分子基礎。要了解動、植物生長發(fā)育的規(guī)律、形態(tài)結構特征和生物學功能,就必須弄清楚基因表達調(diào)控的時間和空間的概念。基因表達調(diào)控是現(xiàn)階段分子生物學研究的中心課題。第3頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四DNA復制RNA轉(zhuǎn)錄蛋白質(zhì)翻譯基因表達機體如何控制遺傳信息的傳遞過程、有何規(guī)律。基因表達調(diào)控第4頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四二、基因表達的時間性和空間性調(diào)控區(qū)結構基因何時表達何處表達基因組(genome)
是指生物有機體的單倍體細胞中的所有DNA,包括核中的染色體DNA和線粒體、葉綠體等亞細胞器中的DNA。但生物基因組的遺傳信息并不是同時全部都表達出來的,大腸桿菌基因組含有約4000個基因,一般情況下只有5-10%在高水平轉(zhuǎn)錄狀態(tài),其它基因有的處于較低水平的表達,有的就暫時不表達。第5頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四(一)時間特異性
在生物體不同的階段,根據(jù)功能的需要,相應基因嚴格按一定的時間順序開啟或關。AB第6頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四細胞分化發(fā)育的不同時期,基因表達的情況是不相同的,這就是基因表達的階段特異性(stagespecificity)。
一個受精卵含有發(fā)育成一個成熟個體的全部遺傳信息,在個體發(fā)育分化的各個階段,各種基因極為有序地表達,一般在胚胎時期基因開放的數(shù)量最多,隨著分化發(fā)展,細胞中某些基因關閉(turnoff)、某些基因轉(zhuǎn)向開放(turnon),例如:與開花有關的基因只有在開花前才表達,而在植物營養(yǎng)體生長時全部被關閉;胚胎發(fā)育不同階段、不同部位的細胞中開放的基因及其開放的程度不一樣,合成蛋白質(zhì)的種類和數(shù)量都不相同,顯示出基因表達調(diào)控在空間和時間上極高的有序性,從而逐步生成形態(tài)與功能各不相同、極為協(xié)調(diào)、巧妙有序的組織臟器。第7頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四(二)空間特異性
生物體中,各種基因在不同的組織、器官中表達的差異性。
ABC第8頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四不同組織細胞中不僅表達的基因數(shù)量不相同,而且基因表達的強度和種類也各不相同,這就是基因表達的組織特異性(tissuespecificity)。
例如肝細胞中涉及編碼鳥氨酸循環(huán)酶類的基因表達水平高于其它組織細胞,合成的某些酶(如精氨酸酶)為肝臟所特有;胰島β細胞合成胰島素;甲狀腺濾泡旁細胞(C細胞)專一分泌降血鈣素等。第9頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
從上所述,不難看出:生物的基因表達不是雜亂無章的,而是受著嚴密、精確調(diào)控的,盡管我們現(xiàn)在對調(diào)控機理的奧妙所知還不多,但已經(jīng)可以認識到,不僅生命的遺傳信息是生物生存所必需的,而且遺傳信息的表達調(diào)控也是生命本質(zhì)所在。
第10頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四生物體內(nèi)的基因調(diào)控各不相同,基因表達隨環(huán)境變化的情況,可以大致把基因表達分成兩類:①組成性表達(constitutiveexpression)指合成速率不受環(huán)境變化而變動的一類基因表達。某些基因表達產(chǎn)物是細胞或生物體整個生命過程中都持續(xù)需要而必不可少的,這類基因可稱為看家基因(housekeepinggene),如:DNA聚合酶、RNA聚合酶等都是代謝過程中十分必需的酶或蛋白質(zhì)。其數(shù)量不受外界環(huán)境影響。組成性基因表達也不是一成不變的,其表達強弱也是受一定機制調(diào)控的。三、基因表達的方式第11頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
組成性表達管家基因
無時間和空間特異性,幾乎在生命的全過程和生物體的所有細胞中持續(xù)表達。第12頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四②適應性表達(adaptiveexpression)指環(huán)境的變化容易使其表達水平變動的一類基因表達。應環(huán)境條件變化基因表達水平增高的現(xiàn)象稱為誘導(induction),這類基因被稱為可誘導的基因(induciblegene);相反,隨環(huán)境條件變化而基因表達水平降低的現(xiàn)象稱為阻遏(repression),相應的基因被稱為可阻遏的基因(repressiblegene)。
第13頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四表達升高的為誘導,表達降低的為阻遏。環(huán)境信號表達增強誘導表達減弱阻遏第14頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四四、基因表達調(diào)控的生物學意義(一)適應環(huán)境、維持生長和增殖(二)維持個體發(fā)育與分化外環(huán)境不斷變化機體相應的適應性反應生物體適應變化著的環(huán)境、維持正常生長
生長發(fā)育的不同階段、不同組織器官蛋白質(zhì)種類和含量不同。第15頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四改變基因表達的情況以適應環(huán)境,在原核生物、單細胞生物中尤其顯得突出和重要,因為細胞的生存環(huán)境經(jīng)常會有劇烈的變化。
例如:周圍有充足的葡萄糖,細菌就可以利用葡萄糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它糖類的酶類,當外界沒有葡萄糖時,細菌就要適應環(huán)境中存在的其它糖類(如乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等),開放能利用這些糖的酶類基因,以滿足生長的需要。即使是內(nèi)環(huán)境保持穩(wěn)定的高等哺乳類,也經(jīng)常要變動基因的表達來適應環(huán)境,例如與適宜溫度下生活相比較,在冷或熱環(huán)境下適應生活的動物,其肝臟合成的蛋白質(zhì)圖譜就有明顯的不同。所以,基因表達調(diào)控是生物適應環(huán)境生存的必需。第16頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四幾個基本概念1、順式作用元件和反式作用因子:基因活性的調(diào)控主要通過反式作用因子(通常是蛋白質(zhì))與順式作用元件(通常在DNA上)相互作用而實現(xiàn)。
順式作用元件是指對基因表達有調(diào)節(jié)活性的DNA序列,其活性只影響與其自身同處在一個DNA分子上的基因;同時,這種DNA序列通常不編碼蛋白質(zhì),多位于基因旁側或內(nèi)含子中,如啟動子和終止子,都是典型的順式作用元件。
反式作用因子是能調(diào)節(jié)與它們接觸的基因的表達的各種擴散分子(通常是蛋白質(zhì)),如RNA聚合酶、轉(zhuǎn)錄因子。第17頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四2、結構基因和調(diào)節(jié)基因:
結構基因(structuralgene)是編碼蛋白質(zhì)或RNA的基因。細菌的結構基因一般成簇排列,多個結構基因受單一啟動子共同控制,使整套基因或都表達或都不表達。調(diào)節(jié)基因(regulatorgene)是編碼合成那些參與其他基因表達調(diào)控的RNA或蛋白質(zhì)的特異DNA序列。
調(diào)節(jié)基因編碼的調(diào)節(jié)物質(zhì)通過與DNA上的特定位點結合控制轉(zhuǎn)錄是調(diào)控的關鍵。比如:它能使結構基因在需要某種酶時就合成某種酶,不需要時,則停止合成,它對不同染色體上的結構基因有調(diào)節(jié)作用。調(diào)節(jié)物與DNA特定位點的相互作用能以正調(diào)控的方式(啟動或增強基因表達活性)調(diào)節(jié)靶基因,也能以負調(diào)控的方式(關閉或降低基因表達活性)調(diào)節(jié)靶基因。DNA位點通常位于受調(diào)節(jié)基因的上游,但也有例外.第18頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四3、操縱基因和阻遏蛋白
操縱基因(operator)是操縱子中的控制基因,在操縱子上一般與啟動子相鄰,通常處于開放狀態(tài),使RNA聚合酶能夠通過并作用于啟動子啟動轉(zhuǎn)錄。但當它與調(diào)節(jié)基因所編碼的阻遏蛋白結合時,就從開放狀態(tài)逐漸轉(zhuǎn)變?yōu)殛P閉狀態(tài),使轉(zhuǎn)錄過程不能發(fā)生。
阻遏蛋白(aporepressor)是負調(diào)控系統(tǒng)中由調(diào)節(jié)基因編碼的調(diào)節(jié)蛋白,它本身或與輔阻遏物(corepressor)一起結合于操縱基因,阻遏操縱子結構基因的轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白可被誘導物變構失活,從而導致不可阻遏或去阻遏。第19頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四4、組成蛋白和調(diào)節(jié)蛋白細胞內(nèi)有許多種蛋白質(zhì)的數(shù)量幾乎不受外界環(huán)境的影響,這些蛋白質(zhì)稱為組成蛋白或持家蛋白。
調(diào)節(jié)蛋白是一類特殊蛋白,它們可以控制和影響一種或多種基因的表達。有兩種類型的調(diào)節(jié)蛋白,即正調(diào)節(jié)蛋白和負調(diào)節(jié)蛋白,前者是激活蛋白,而后者屬于阻遏蛋白。
調(diào)節(jié)本身也可有被調(diào)控,最典型的就是被一些小分子所調(diào)控,面這些小分子的產(chǎn)生是周圍環(huán)境所致。第20頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
5、操縱子(operon):是原核生物在分子水平上基因表達調(diào)控的單位,由調(diào)節(jié)基因、啟動子、操縱基因和結構基因等序列組成。
例如:在細菌基因組中,同一個代謝途徑的酶的基因一般成簇排列。把功能密切相關的一組蛋白質(zhì)編碼的結構基因區(qū)域加上其調(diào)控區(qū)域組成的控制單元就叫操縱子。
第21頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6、小分子效應物的作用
原核生物的操縱子通過調(diào)節(jié)蛋白與小分子物質(zhì)相互作用達到誘導狀態(tài)或阻遏狀態(tài)。某些特定的物質(zhì)能與調(diào)控蛋白結合,使調(diào)控蛋白的空間構像發(fā)生變化,從而改變其對基因轉(zhuǎn)錄的影響,這些特定物質(zhì)可稱為效應物(effector)。細菌細胞有兩種類型的效應物。
(1)誘導物:能引起誘導發(fā)生的分子;有些阻遏蛋白在自然狀態(tài)下結合在操縱基因上,當有誘導物存在時,誘導物與阻遏蛋白結合,促使后者空間構象變化,使阻遏蛋白與操縱基因親和力下降而解離下來,RNA聚合酶能夠進入啟動子區(qū)域,開啟了結構基因的轉(zhuǎn)錄表達。
由誘導物存在而使基因表達開放的調(diào)節(jié)又稱為可誘導調(diào)節(jié)。如大腸桿菌的乳糖操縱子中的乳糖。
第22頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四(2)輔阻遏物:能導致阻遏發(fā)生的分子。有些阻遏蛋白本身不具有結合操縱基因的活性,當細胞中有輔阻遏物存在時,它可以結合到阻遏蛋白分子上,提高阻遏蛋白與操縱基因的親和性。
由輔阻遏物參與引起的調(diào)節(jié)又稱為可阻遏的調(diào)節(jié)。如大腸桿菌的色氨酸操縱子中,色氨酸與阻遏蛋白結合,使后者表現(xiàn)出結合操縱基因的活性,阻止了RNA聚合酶與啟動子結合的結合,使操縱子關閉。第23頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四原核生物和真核生物轉(zhuǎn)錄的差異
原核生物真核生物1、一種RNA聚合酶1、多種RNA聚合酶2、不同啟動子間有相當大的同源性2、各種不同啟動子間的差異較大3、聚合酶直接同啟動子結合3、聚合酶通過同轉(zhuǎn)錄因子的相互作用促進結合4、轉(zhuǎn)錄的終止由在幾個Us前形成莖環(huán)4、轉(zhuǎn)錄的終止機制了解不清楚5、啟動子通常位于基因的上游5、聚合酶Ⅲ的啟動子位于被轉(zhuǎn)錄的序列之中6、轉(zhuǎn)錄單位常常含有多個基因6、轉(zhuǎn)錄單位只含一個基因第24頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四原核與真核生物RNA翻譯的異同
原核生物真核生物
轉(zhuǎn)錄和翻譯在同一地點翻譯在細胞質(zhì),轉(zhuǎn)錄在細胞核核糖體整體70S80S
亞基30S和50S40S和60SmRNA無5′帽子,無poly(A)尾有5′帽子和poly(A)尾多順反子單順反子起始密碼AUG,GUGAUG起始tRNA載體甲酰甲硫氨酸甲硫氨酸起始位點SD序列相關序列起始因子三個IF約有10個eIF延伸因子EF-Ts/Tu/GEF-1/2釋放因子三個RF一個eRF第25頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四基因表達調(diào)控的多層次性,主要表現(xiàn)在:1.轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptionalregulation);2.轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控(post-transcriptionalregulation),包括①
mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differentialprocessingofRNAtranscript);②
翻譯水平上的調(diào)控(differentialtranslationofmRNA)。6.2
原核基因表達調(diào)控總論
第26頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四基因調(diào)控的指揮系統(tǒng)也是多樣的,不同的生物使用不同的信號來指揮基因調(diào)控。原核生物中,營養(yǎng)狀況(nutritionalstatus)和環(huán)境因素(environmentalfactor)對基因表達起著舉足輕重的影響。真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平(hormonelevel)和發(fā)育階段(developmentalstage)是基因表達調(diào)控的最主要手段,營養(yǎng)和環(huán)境因素的影響力大為下降。在轉(zhuǎn)錄水平上對基因表達的調(diào)控決定于DNA的結構、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。第27頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactors)
轉(zhuǎn)錄因子是轉(zhuǎn)錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉(zhuǎn)錄因子時處于不表達狀態(tài),RNA聚合酶自身無法啟動基因轉(zhuǎn)錄,只有當轉(zhuǎn)錄因子(蛋白質(zhì))結合在其識別的DNA序列上后,基因才開始表達。
被稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactors)的DNA結合蛋白與基因調(diào)控區(qū)中特殊的效應元件(responseelements,RE)DNA序列相互作用,調(diào)節(jié)RNA聚合酶活性,達到控制基因轉(zhuǎn)錄的目的。第28頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四轉(zhuǎn)錄因子的功能
常用轉(zhuǎn)錄誘導(transcriptionalinduction)(增加起始速率)和轉(zhuǎn)錄阻遏(transcriptionalrepression)(降低起始速率)等術語來描述轉(zhuǎn)錄因子的功能。誘導轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄因子稱之激活劑(activators),而阻遏轉(zhuǎn)錄的稱之為阻遏物(repressors)。轉(zhuǎn)錄因子起著激活劑作用,還是起著阻遏物的作用取決于細胞的生理狀態(tài)和不同啟動子之間的DNA序列差別。第29頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四第30頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四原核生物的基因調(diào)控主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平上,根據(jù)調(diào)控機制的不同可分為:負轉(zhuǎn)錄調(diào)控(negativetranscriptionregulation)正轉(zhuǎn)錄調(diào)控(positivetranscriptionregulation)6.2.1原核基因調(diào)控機制的類型與特點
第31頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四在負轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是阻遏蛋白(repressor),起著阻止結構基因轉(zhuǎn)錄的作用。根據(jù)其作用特征又可分為負控誘導和負控阻遏二大類。在負控誘導系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應物(誘導物)結合時,結構基因轉(zhuǎn)錄;在負控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應物(輔阻遏物)結合時,結構基因不轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白作用的部位是操縱區(qū)。第32頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四在正轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白(activator)。也可根據(jù)激活蛋白的作用性質(zhì)分為正控誘導系統(tǒng)和正控阻遏系統(tǒng)。在正控誘導系統(tǒng)中,效應物分子(誘導物)的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài);在正控阻遏系統(tǒng)中,效應物分子(輔阻遏物)的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)。第33頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四Controlcircuitsareversatile.
第34頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.2.2
弱化子對基因活性的影響屬于這種調(diào)節(jié)方式的有大腸桿菌中的色氨酸操縱子、苯丙氨酸操縱子、蘇氨酸操縱子、異亮氨酸操縱子等等。概念:弱化子是指當操縱子被阻遏,RNA合成被終止時,起終止轉(zhuǎn)錄信號作用的那一段核苷酸。弱化子對基因活性的影響是通過影響前導序列mRNA的結構而起作用的。起調(diào)節(jié)作用的是某種氨基酰-tRNA的濃度。具體在Trp操縱子中講。第35頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.2.3
降解物對基因活性的調(diào)節(jié)
操縱子學說的核心是使基因從表達抑制狀態(tài)中解脫出來進行轉(zhuǎn)錄,是從負調(diào)節(jié)的角度來考慮基因表達調(diào)控的。那么,有沒有從相反的角度進行正調(diào)節(jié)以提高基因的轉(zhuǎn)錄水平?
有葡萄糖存在的情況下,即使在細菌培養(yǎng)基中加入乳糖、半乳糖、阿拉伯糖或麥芽糖等誘導物,與其相對應的操縱子也不會啟動,產(chǎn)生出代謝這些糖的酶來,這種現(xiàn)象稱為葡萄糖效應或稱為降解物抑制作用。
第36頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
為什么會產(chǎn)生這種效應呢?因為添加葡萄糖后,細菌所需要的能量便可從葡萄糖得到滿足,葡萄糖是最方便的能源,細菌無需開動一些不常用的基因去利用這些稀有的糖類。葡萄糖的存在會抑制細菌的腺苷酸環(huán)化酶活性,減少環(huán)腺苷酸(cAMP)的合成,與它相結合的蛋白質(zhì),即環(huán)腺苷酸受體蛋白CRP又稱分解代謝物激活蛋白CAP,因找不到配體而不能形成復合物.復合物是啟動基因轉(zhuǎn)錄的正調(diào)節(jié)物質(zhì)(CRP與啟動子結合是激活轉(zhuǎn)錄的必要條件,而cAMP與CRP的結合能增強CRP對DNA雙鏈的親和力),從而抑制糖類代謝操縱子的表達。。
降解物抑制作用是通過提高轉(zhuǎn)錄強度來調(diào)節(jié)基因表達的,是一種積極的調(diào)節(jié)方式。第37頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.2.4
細菌的應急反應
細菌有時會碰到緊急狀況,比如氨基酸饑餓時,就不是缺少一二種氨基酸,而是氨基酸的全面匱乏。為了緊縮開支,渡過難關,細菌將會產(chǎn)生一個應急反應,包括生產(chǎn)各種RNA、糖、脂肪和蛋白質(zhì)在內(nèi)的幾乎全部生物化學反應過程均被停止。實施這一應急反應的信號是鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)。產(chǎn)生這兩種物質(zhì)的誘導物是空載tRNA。當氨基酸饑餓時,細胞中便存在大量的不帶氨基酸的tRNA,這種空載的tRNA會激活焦磷酸轉(zhuǎn)移酶,使ppGpp大量合成,其濃度可增加10倍以上。ppGpp的出現(xiàn)會關閉許多基因,當然也會打開一些合成氨基酸的基因,以應付這種緊急狀況。關于ppGpp的作用原理還不大清。ppGpp與pppGpp的作用范圍十分廣泛,它們不是只影響一個或幾個操縱子,而是影響一大批,所以它們是超級調(diào)控因子或稱為魔斑。
第38頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.3操縱子學說(theoryofoperon)
操縱子學說是關于原核生物基因結構及其表達調(diào)控的經(jīng)典學說,由法國巴斯德研究所的FrancoisJacob與JacquesMonod于1961年首先提出的。他們首先提出了操縱子(operon)和操縱基因operator)的概念,他們的操縱子學說(theoryofoperon)使我們得以從分子水平認識基因表達的調(diào)控,是一個劃時代的突破,因此他們二人于1965年榮獲諾貝爾生理學獎。第39頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四大腸桿菌能以乳糖(Lactose)為唯一碳源生長,這是由于它能產(chǎn)生一套利用乳糖的酶。這些酶受乳糖操縱子的控制。大腸桿菌乳糖操縱子是大腸桿菌DNA的一個特定區(qū)段,由調(diào)節(jié)基因I,啟動基因P,操縱基因O和結構基因Z、Y、A組成。P(promoter)區(qū)是轉(zhuǎn)錄起始時RNA聚合酶的結合部位。O(operator)區(qū)是阻遏蛋白的結合部位,其功能是控制結構基因的轉(zhuǎn)錄。平時I基因經(jīng)常進行轉(zhuǎn)錄和翻譯,產(chǎn)生有活性的阻遏蛋白。
(弱啟動子控制的永久性表達)第40頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四lacI基因編碼的阻抑物(repressor)第41頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四Z編碼β-半乳糖苷酶;Y編碼β-半乳糖苷透過酶;A編碼β-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶。β-半乳糖苷酶是一種β-半乳糖苷鍵的專一性酶,除能將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖外,還能水解其他β-半乳糖苷。β-半乳糖苷透過酶的作用是使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細胞壁和原生質(zhì)膜進入細胞內(nèi)。β-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶的作用是把乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。(注:該酶不參與乳糖代謝!在細胞中有許多能被半乳糖苷酶降解的半乳糖苷類物質(zhì),其分解產(chǎn)物不能進一步代謝,積累,抑制細胞生長。半乳糖苷乙酰化后,即無毒.所以lacA雖不在乳糖降解中起作用,但可抑制有害物質(zhì)的積累)
第42頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四乙?;D(zhuǎn)移酶半乳糖苷透性酶?-半乳糖苷酶操縱基因乳糖操縱元結構調(diào)節(jié)基因第43頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四RepressorandRNApolymerasebindatsitesthatoverlaparoundthetranscriptionstartpointofthelacoperon.-5~+21第44頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
乳糖操縱子的控制模型,其主要內(nèi)容如下:
①
Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼。
②這個mRNA分子的啟動子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動子區(qū)(P),不能單獨起動合成β-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。
③操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結合位點。
④當阻遏物與操縱基因結合時,lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。
⑤誘導物通過與阻遏物結合,改變它的三維構象,使之不能與操縱基因結合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。當有誘導物存在時,操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的合成。第45頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.3.1乳糖操縱子的負調(diào)控(negativetranscriptionregulation)第46頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
阻遏狀態(tài)第47頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時阻遏蛋白的負性調(diào)節(jié)阻遏基因第48頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
誘導狀態(tài)第49頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時IDNAZYAOPpol啟動轉(zhuǎn)錄mRNA乳糖別乳糖β-半乳糖苷酶第50頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四A:兩個矛盾是操縱子理論所不能解釋的:
1、誘導物需要穿過細胞膜才能與阻遏物結合,而移動誘導物需要透過酶,后者的合成又需要誘導。第一個誘導物是如何到達細胞內(nèi)的?第51頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四2、研究發(fā)現(xiàn)乳糖(葡萄糖-1,4-半乳糖)并不與阻遏物相結合,真正的誘導物是乳糖的異構體—異構乳糖(葡萄糖-1,6-半乳糖,allolactose),乳糖進入細胞后由β-半乳糖苷酶催化形成異構乳糖(別乳糖)。因此,乳糖誘導β-半乳糖苷酶的合成需要有β-半乳糖苷酶的預先存在。細胞內(nèi)β-半乳糖苷酶來源?第52頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
本底水平表達(backgroundlevelconstitutivesyntyesis):指在非誘導狀態(tài)下有少量的lacmRNA合成(大約每個世代每個細胞只合成1-5個mRNA分子)。
第53頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
B:
誘導物
不是乳糖!生成lac誘導物乳糖代謝Allolactose異構乳糖別乳糖第54頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四C:安慰誘導物
(義務誘導物)gratuitousinducer
可誘導半乳糖苷酶產(chǎn)生,但不是其底物(結構上類似、不能被水解)IPTG,異丙基巰基半乳糖苷TMG,巰甲基半乳糖苷ONPG,O-硝基半乳糖苷在研究誘導作用時,很少使用乳糖(被降解,濃度不斷變化)第55頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
ZYX
I
POCAP阻遏蛋白的負調(diào)節(jié)第56頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四誘導物
ZYX
I
POCAP
ZYX
I
POCAP第57頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.3.2乳糖操縱子正性調(diào)節(jié)(CAP的正調(diào)控)細菌中的cAMP含量與葡萄糖的分解代謝有關當細菌利用葡萄糖分解產(chǎn)生能量時,cAMP生成少而分解多,cAMP含量低;相反,當環(huán)境中無葡萄糖可供利用時,cAMP含量就升高。細菌中有一種能與cAMP特異結合的cAMP受體蛋白CRP(cAMPreceptorprotein),當CRP未與cAMP結合時它是沒有活性的,當cAMP濃度升高時,CRP與cAMP結合并發(fā)生空間構象的變化而活化,稱為CAP(CRP-cAMPactivatedprotein),能以二聚體的方式與特定的DNA序列結合。第58頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四第59頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
在lac操縱子的啟動子Plac上游端有一段序列與Plac部分重疊的序列,能與CAP特異結合,稱為CAP結合位點(CAPbindingsite)。
CAP與這段序列結合時,可增強RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄活性,使轉(zhuǎn)錄提高50倍。相反,當有葡萄糖可供分解利用時,cAMP濃度降低,CRP不能被活化,lac操縱子的結構基因表達下降。第60頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四第61頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
由于Plac是弱啟動子,單純因乳糖的存在發(fā)生去阻遏使lac操縱子轉(zhuǎn)錄開放,還不能使細菌很好利用乳糖,必需同時有CAP來加強轉(zhuǎn)錄活性,細菌才能合成足夠的酶來利用乳糖。
lac操縱子的強誘導既需要有乳糖的存在又需要沒有葡萄糖可供利用。通過這機制,細菌是優(yōu)先利用環(huán)境中的葡萄糖,只有無葡萄糖而又有乳糖時,細菌才去充分利用乳糖。第62頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
細菌對葡萄糖以外的其他糖(如阿拉伯糖、半乳糖、麥芽糖等)的利用上也有類似對乳糖利用的情況,在含有編碼利用阿拉伯糖的酶類基因群的阿拉伯糖操縱子(araoperon)、半乳糖操縱子(galoperon)中也有CAP結合位點,CAP也起類似的正性調(diào)控作用。所以CAP的通用名稱是分解代謝基因激活蛋白(catabolicgeneactivatorprotein)。第63頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
CAP的結合對DNA構型的影響CRP在它的結合位點可使DNA成>90℃彎曲。彎曲使CAP能與啟動子上的RNApol接觸第64頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四CAPBindingBendsDNAThisDNAbendingresultsinmoreefficientRNApolymerasebinding第65頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四乳糖操縱子正性調(diào)節(jié)IPO
ZYACAPsiteCAPcAMP第66頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
阻遏基因轉(zhuǎn)錄翻譯阻遏蛋白R,R與操縱基因結合,阻止結合在啟動子上的DDRP前移,結構基因不被轉(zhuǎn)錄
1)無乳糖也無葡萄糖存在時:OO2)當無乳糖,有葡萄糖時:由于葡萄糖不能使阻遏蛋白失活,乳糖操縱子關閉,另外,由于有葡萄糖,cAMP含量低,CAP的正性調(diào)節(jié)不起作用總結:所以:無乳糖時,無論有無葡萄糖,操縱子關閉第67頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
由于有葡萄糖,cAMP含量低,CAP的正性調(diào)節(jié)不起作用,抑制乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄,使細菌只能利用葡萄糖。
3)既有乳糖,又有葡萄糖時:O
乳糖與阻遏蛋白結合,使阻遏蛋白變構,失去與操縱基因結合的能力而脫落第68頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
由于不含葡萄糖,細胞內(nèi)cAMP含量高,cAMP與CAP結合成復合物,與DNA結合,并推動DDRP向前移動,促進轉(zhuǎn)錄。4)有乳糖,無葡萄糖時:mRNARNA-polO
乳糖與阻遏蛋白結合,使阻遏蛋白變構,失去與操縱基因結合的能力而脫落,結合在啟動子上的DDRP向前移動,結構基因被轉(zhuǎn)錄翻譯,合成與乳糖代謝有關的酶類從而利用乳糖所以:有乳糖時,只有沒有葡萄糖,操縱子才開放有葡萄糖存在,操縱子關閉第69頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四※
當阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時,CAP對該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用;※
如無CAP存在,即使沒有阻遏蛋白與操縱序列結合,操縱子仍無轉(zhuǎn)錄活性?!鶈渭?nèi)樘谴嬖跁r,細菌利用乳糖作碳源;※若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時,細菌首先利用葡萄糖。
第70頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四TheLacOperon:
WhenGlucoseIsPresentButNotLactoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRNAPol.RepressorRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveComeon,letmethroughNowayJose!CAPSummary第71頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四TheLacOperon:
WhenGlucoseAndLactoseArePresentRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveCAPLacRepressorRepressorXRNAPol.RNAPol.Great,Icantranscribe!Sometranscriptionoccurs,butataslowrateThislactosehasbentmeoutofshape第72頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四TheLacOperon:
WhenLactoseIsPresentButNotGlucoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveCAPcAMPLacRepressorRepressorXThislactosehasbentmeoutofshapeCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RNAPol.Yippee…!第73頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四TheLacOperon:
WhenNeitherLactoseNorGlucoseIsPresentRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingCAPcAMPCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveRepressorSTOPRighttherePolymeraseAlright,I’mofftotheraces...Comeon,letmethrough!第74頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.4色氨酸操縱子(tryptophanoperon)的表達調(diào)控
第75頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
色氨酸是構成蛋白質(zhì)的組分,一般的環(huán)境難以給細菌提供足夠的色氨酸,細菌要生存繁殖通常需要自己經(jīng)過許多步驟合成色氨酸,但是一旦環(huán)境能夠提供色氨酸時,細菌就會充分利用外界的色氨酸、減少或停止合成色氨酸,以減輕自己的負擔。細菌所以能做到這點是因為有色氨酸操縱子(trpoperon)的調(diào)控。第76頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四trpR,阻遏蛋白P,-40~+18O,-21~+1L(leadingsequence),+1~+162(a(attenuation),+123~+150)結構基因6.4.1色氨酸操縱子的結構第77頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.4.2阻遏蛋白的負調(diào)控
合成色氨酸所需要酶類的基因E、D、C、B、A等頭尾相接串連排列組成結構基因群,受其上游的啟動子Ptrp和操縱子o的調(diào)控,調(diào)控基因trpR的位置遠離P-o-結構基因群,在其自身的啟動子作用下,以組成性方式低水平表達其編碼分子量為47000的調(diào)控蛋白R,R并沒有與o結合的活性,當環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時,R與色氨酸結合后構象變化而活化,就能夠與o特異性親和結合,阻遏結構基因的轉(zhuǎn)錄。第78頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
因此色氨酸操縱子屬于一種負性調(diào)控的、可阻遏的操縱子(repressibleoperon),即這操縱子通常是開放轉(zhuǎn)錄的,有效應物(色氨酸為阻遏劑)作用時則阻遏關閉轉(zhuǎn)錄。細菌不少生物合成系統(tǒng)的操縱子都屬于這種類型,其調(diào)控可使細菌處在生存繁殖最經(jīng)濟最節(jié)省的狀態(tài)。
第79頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四6.4.3衰減子及其作用
深入研究發(fā)現(xiàn),有些現(xiàn)象與以阻遏作為唯一調(diào)節(jié)機制的觀點不一致,例如:在色氨酸高濃度和低濃度下觀察到trp操縱子的表達水平相差約600倍,然而阻遏作用僅使轉(zhuǎn)錄降低70倍.
此外,使阻遏物失活突變不能完全消除色氨酸對trp操縱子表達的影響.
顯然,trp操縱子的這種調(diào)控與阻遏物的控制無關,必然還有其他調(diào)控機制.這就是弱化作用(attenuation).
第80頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
在色氨酸操縱子Ptrp-o與第一個結構基因trpE之間有162bp的一段前導序列(leadingsequence,L),實驗證明當色氨酸有一定濃度時,RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄會終止在這里。這段序列中含有編碼由14個氨基酸組成的短肽的開放閱讀框,其序列中有2個色氨酸相連,在此開放閱讀框前有核糖體識別結合位點(RBS)序列,提示這段短開放閱讀框在轉(zhuǎn)錄后是能被翻譯的。色氨酸操縱子的特殊結構:第81頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四第82頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四弱化子,衰減子,α第83頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
mRNA前導區(qū)序列分析
trp前導區(qū)的堿基序列已經(jīng)全部測定,發(fā)現(xiàn)完整的前導序列可分為1、2、3、4區(qū)域,這四個區(qū)域的片段能以兩種不同的方式進行堿基配對,第84頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四第85頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四第86頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四UUUU……UUUU……調(diào)節(jié)區(qū)結構基因trpROP前導序列衰減子區(qū)域UUUU……前導mRNA1234衰減子結構
第10、11密碼子為trp密碼子終止密碼子14aa前導肽編碼區(qū):
包含序列1形成發(fā)夾結構能力強弱:序列1/2>序列2/3>序列3/4
trp密碼子
UUUU……第87頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
有時以1-2和3-4配對,有時只以2-3方式互補配對。核糖體經(jīng)過前導區(qū)繼續(xù)翻譯的能力控制著這兩種結構的轉(zhuǎn)換,它決定mRNA是否形成終止所需的結構。前導序列的終止區(qū)與一般的轉(zhuǎn)錄終止位點特點相同,具有成串的U和潛在的能形成莖環(huán)的二重對稱結構。實驗表明:3-4配對區(qū)正好位于終止密碼子識別區(qū),當這個區(qū)域發(fā)生破壞自我堿基突變,有利于轉(zhuǎn)錄的繼續(xù)進行。
第88頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
弱化作用(衰減作用):
轉(zhuǎn)錄的弱化理論認為,mRNA轉(zhuǎn)錄的終止是通過前導肽基因的翻譯來調(diào)節(jié)的,在前導肽基因中有兩個相鄰的色氨酸密碼子,在翻譯時對tRNATrp的濃度十分敏感。
第89頁,共100頁,2023年,2月20日,星期四
當培養(yǎng)基中色氨酸的濃度低時,負載有色氨酸的tRNATrp也少,由此推斷,翻譯通過兩個相鄰色氨酸密碼子的速度就會很慢,當4區(qū)被轉(zhuǎn)錄完成時,核糖體才進行到1區(qū)(或停留在兩個相鄰的色氨酸密碼子處),這時的前導區(qū)結構是2-3配對,不形成3-4配對的終止結構,所以轉(zhuǎn)錄可繼續(xù)進行,直到將色氨酸操縱子中的結構基因全部轉(zhuǎn)錄完畢為止。第90頁,共100頁,2023年,2月20日
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