上海市臨檢中心 分子診斷技術(shù)規(guī)范解讀

分子診斷技術(shù)臨床應(yīng)用政策解讀上海市臨床檢驗中心肖艷群Outline分子檢測項目規(guī)范及內(nèi)容分子檢測技術(shù)規(guī)范及內(nèi)容分子檢測實驗室規(guī)范及內(nèi)容申請注意事項分子檢測項目開展技術(shù)規(guī)范《醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用管理辦法》

衛(wèi)醫(yī)政發(fā)〔2009〕18號第十二條

醫(yī)療機(jī)構(gòu)開展的臨床檢驗項目必須是衛(wèi)生部公布的準(zhǔn)予開展的臨床檢驗項目臨床分子生物學(xué)及細(xì)胞遺傳學(xué)《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床檢驗項目目錄2013年版

》分子檢測技術(shù)開展規(guī)范臨床基因擴(kuò)增檢驗技術(shù)、基因芯片診斷技術(shù)國家衛(wèi)生計生委關(guān)于取消第三類醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用準(zhǔn)入審批有關(guān)工作的通知國衛(wèi)醫(yī)發(fā)（2015）71號

（2015.7.2）一、根據(jù)國務(wù)院《關(guān)于取消非行政許可審批事項的決定》，取消第三類醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用準(zhǔn)入審批。九、各省級衛(wèi)生計生行政部門應(yīng)當(dāng)按照國務(wù)院行政審批改革精神和有關(guān)工作部署，研究取消第二類醫(yī)療技術(shù)非行政許可審批后加強(qiáng)事中事后監(jiān)管的工作措施，保證醫(yī)療質(zhì)量和患者安全。主要內(nèi)容?

厘清相關(guān)醫(yī)療技術(shù)范圍，突出管理重點(diǎn)?

強(qiáng)化醫(yī)療機(jī)構(gòu)在醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用和管理的主體責(zé)任?

強(qiáng)化行政臨床應(yīng)用事中事后監(jiān)管責(zé)任?

明確對涉及使用藥品、醫(yī)療器械或具有相似屬性的相關(guān)產(chǎn)品、制劑等的醫(yī)療技術(shù)的管理主要內(nèi)容?

關(guān)于第三類、第二類醫(yī)療技術(shù)管理工作?

關(guān)于醫(yī)療機(jī)構(gòu)技術(shù)管理工作?

關(guān)于事中事后監(jiān)督管理工作一、關(guān)于第三類、第二類醫(yī)療技術(shù)管理工作（一）取消第三類和本市第二類醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用準(zhǔn)入審批。（二）已開展《上海市限制臨床應(yīng)用醫(yī)療技術(shù)目錄（2015版）》在列醫(yī)療技術(shù)，且經(jīng)審批的醫(yī)療機(jī)構(gòu)，應(yīng)向衛(wèi)生計生行政部門備案并提交《上海市醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用備案表》。原已在《醫(yī)療機(jī)構(gòu)執(zhí)業(yè)許可證》相應(yīng)診療科目下辦理登記的醫(yī)療機(jī)構(gòu)無需再次辦理。（三）擬開展《上海市限制臨床應(yīng)用醫(yī)療技術(shù)目錄（2015版）》在列醫(yī)療技術(shù)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)，經(jīng)自我對照評估符合規(guī)定條件并由具備臨床應(yīng)用能力評估資質(zhì)的第三方評價機(jī)構(gòu)出具臨床應(yīng)用能力評估報告后進(jìn)行備案。衛(wèi)生計生行政部門在《醫(yī)療機(jī)構(gòu)執(zhí)業(yè)許可證》副本備注欄注明后，方可在臨床應(yīng)用相關(guān)醫(yī)療技術(shù)。（四）本市首次開展（未納入國家和上海限制臨床應(yīng)用醫(yī)療技術(shù)目錄）的醫(yī)療技術(shù)，應(yīng)按照《關(guān)于印發(fā)醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)開展臨床研究項目管理辦法的通知》要求進(jìn)行臨床研究項目管理，完成臨床研究后且條件成熟的，可按照開展目錄在列醫(yī)療技術(shù)方式，實施備案管理后進(jìn)入臨床應(yīng)用。（五）我委將根據(jù)本市實際情況，對本市限制臨床應(yīng)用醫(yī)療技術(shù)目錄清單進(jìn)行調(diào)整并制定二、關(guān)于醫(yī)療機(jī)構(gòu)技術(shù)管理工作（一）醫(yī)療機(jī)構(gòu)對本機(jī)構(gòu)醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用和管理承擔(dān)主體責(zé)任，醫(yī)療機(jī)構(gòu)主要負(fù)責(zé)人是第一責(zé)任人。各級各類醫(yī)療機(jī)構(gòu)應(yīng)當(dāng)建立完善本機(jī)構(gòu)醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用管理制度并建立健全醫(yī)療技術(shù)評估與管理檔案制度。（二）醫(yī)療機(jī)構(gòu)必須嚴(yán)格按照相關(guān)醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用管理規(guī)范進(jìn)行自我對照評估，醫(yī)療機(jī)構(gòu)基本條件、人員條件、技術(shù)管理等不符合相關(guān)規(guī)范要求的，不得開展相應(yīng)技術(shù)。（三）醫(yī)療機(jī)構(gòu)必須嚴(yán)格按照醫(yī)療技術(shù)規(guī)范開展診療活動，加強(qiáng)醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用質(zhì)量和安全管理。與醫(yī)療技術(shù)有關(guān)的專業(yè)技術(shù)人員或者設(shè)備、設(shè)施、輔助條件發(fā)生變化，可能對醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用帶來不確定后果或者存在醫(yī)療質(zhì)量和醫(yī)療安全隱患的技術(shù)，應(yīng)立即停止臨床應(yīng)用，并向衛(wèi)生計生行政部門報告。衛(wèi)生計生行政部門應(yīng)當(dāng)及時取消《醫(yī)療機(jī)構(gòu)執(zhí)業(yè)許可證》副本備注欄注明。（四）醫(yī)療機(jī)構(gòu)應(yīng)當(dāng)自備案手續(xù)完成之日起，每年2月底前向衛(wèi)生計生行政部門和相關(guān)專業(yè)質(zhì)量控制中心報告上一年度醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用情況，包括診療病例數(shù)、適應(yīng)癥掌握情況、臨床應(yīng)用效果、并發(fā)癥、合并癥、不良反應(yīng)、隨訪情況等。三、關(guān)于事中事后監(jiān)督管理工作（一）醫(yī)療機(jī)構(gòu)完成備案手續(xù)，衛(wèi)生計生行政部門要及時將醫(yī)療機(jī)構(gòu)名單向社會公布。市衛(wèi)生計生行政部門依托各相關(guān)專業(yè)質(zhì)量控制中心對醫(yī)療機(jī)構(gòu)進(jìn)行質(zhì)控管理。（二）各相關(guān)專業(yè)質(zhì)量控制中心要加強(qiáng)醫(yī)療機(jī)構(gòu)的醫(yī)療質(zhì)量控制和動態(tài)管理工作。各相關(guān)專業(yè)質(zhì)量控制中心接備案醫(yī)療機(jī)構(gòu)信息后應(yīng)立即建立醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用技術(shù)管理檔案，并對醫(yī)療機(jī)構(gòu)醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用情況加強(qiáng)日常監(jiān)測，及時向醫(yī)療機(jī)構(gòu)和衛(wèi)生計生監(jiān)督部門反饋質(zhì)控結(jié)果，質(zhì)控結(jié)果作為衛(wèi)生計生監(jiān)督部門參考依據(jù)。（三）各辦醫(yī)主體要加強(qiáng)日常管理，加大對醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用情況監(jiān)督檢查力度。各級衛(wèi)生計生監(jiān)督部門要加大對未進(jìn)行備案、開展禁止臨床應(yīng)用醫(yī)療技術(shù)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)、備案后但未按照技術(shù)管理規(guī)范開展診療活動的醫(yī)療機(jī)構(gòu)的監(jiān)督執(zhí)法力度。醫(yī)療機(jī)構(gòu)未進(jìn)行備案或開展禁止臨床應(yīng)用醫(yī)療技術(shù)的，由衛(wèi)生計生行政部門按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)管理條例》第四十七條和《醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用管理辦法》第五十條的規(guī)定給予處罰。醫(yī)療機(jī)構(gòu)備案后，醫(yī)師未按照技術(shù)管理規(guī)范開展診療活動的，由衛(wèi)生計生行政部門按照《執(zhí)業(yè)醫(yī)師法》第三十七條的規(guī)定給予處罰。（四）建立醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用定期抽查評估制度。經(jīng)評估不合格的醫(yī)療機(jī)構(gòu)，禁止開展相關(guān)醫(yī)療技術(shù)。附件2:上海市限制臨床應(yīng)用醫(yī)療技術(shù)目錄（2015版）序號醫(yī)療技術(shù)名稱臨床基因擴(kuò)增檢驗及分子診斷相關(guān)技術(shù)基因芯片診斷技術(shù)3435評估流程醫(yī)療機(jī)構(gòu)提出技術(shù)評估申請（）臨檢中心文件初審專家評估（評審會或現(xiàn)場評估）臨檢中心出具評估報告?

申請材料中不需主管部門蓋章?

無復(fù)審環(huán)節(jié)?

再申請時無時間周期限制?

臨檢中心為第三方評估機(jī)構(gòu)（/

分子診斷技術(shù)臨床應(yīng)用管理/臨床基因擴(kuò)增檢驗及分子診斷技術(shù)、基因芯片診斷技術(shù)、檢驗新技術(shù)

/

臨床基因擴(kuò)增檢驗技術(shù)評估辦法、基因芯片診斷技術(shù)評估辦法、檢驗新技術(shù)評估流程、技術(shù)評估申請書）技術(shù)評估需遞交的材料《上海市醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用能力評估申請書》醫(yī)療機(jī)構(gòu)基本情況申請單位相關(guān)學(xué)科基本情況.

項目負(fù)責(zé)人基本情況.

學(xué)科人員基本情況.

項目所在地實驗室的專用設(shè)備、設(shè)施及工作基礎(chǔ).

擬開展檢驗項目開展該技術(shù)的目的、意義和實施方案該項醫(yī)療技術(shù)的基本概況.

技術(shù)路線.

國內(nèi)外應(yīng)用情況.

與同種疾病的其他檢測技術(shù)的特點(diǎn)及費(fèi)用比較.

質(zhì)量控制措施技術(shù)評估需遞交的材料

醫(yī)療機(jī)構(gòu)執(zhí)業(yè)許可證副本復(fù)印件

技術(shù)人員相關(guān)資格證書復(fù)印件

與該技術(shù)有關(guān)的實驗室平面圖

醫(yī)療機(jī)構(gòu)醫(yī)學(xué)倫理審查報告（產(chǎn)前篩查、遺傳性疾病）

儀器、試劑三證復(fù)印件

方法學(xué)性能驗證報告

室間質(zhì)評成績

質(zhì)量手冊、程序文件、操作規(guī)程

申請在本市首次開展的醫(yī)療技術(shù)還需遞交：國內(nèi)外有關(guān)該技術(shù)研究和使用情況的檢索報告及技術(shù)資料新一代測序技術(shù)食品藥品監(jiān)管總局辦公廳

國家衛(wèi)生計生委辦公廳關(guān)于加強(qiáng)臨床使用基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)管理的通知

2014.2.14二、自本通知發(fā)布之日起，包括產(chǎn)前基因檢測在內(nèi)的所有醫(yī)療技術(shù)需要應(yīng)用的檢測儀器、診斷試劑和相關(guān)醫(yī)用軟件等產(chǎn)品，如用于疾病的預(yù)防、診斷、監(jiān)護(hù)、治療監(jiān)測、健康狀態(tài)評價和遺傳性疾病的預(yù)測，需經(jīng)食品藥品監(jiān)管部門審批注冊，并經(jīng)衛(wèi)生計生行政部門批準(zhǔn)技術(shù)準(zhǔn)入方可應(yīng)用。已經(jīng)應(yīng)用的，必須立即停止。四、國家衛(wèi)生計生委負(fù)責(zé)基因測序技術(shù)的臨床應(yīng)用管理。國家衛(wèi)生計生委確定的基因測序臨床應(yīng)用試點(diǎn)單位，可以按照醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用管理的相關(guān)規(guī)定試用基因測序產(chǎn)品，并做好相應(yīng)技術(shù)的驗證與評價。高通量測序試點(diǎn)單位第一批：2015.1.4遺傳病診斷專業(yè)：上海兒科醫(yī)院、上海兒童醫(yī)院產(chǎn)前篩查與診斷專業(yè)、植入前胚胎遺傳學(xué)診斷專業(yè)：國婦嬰、一婦嬰、新華醫(yī)院、仁濟(jì)醫(yī)院第二批：2015.4.10腫瘤：腫瘤醫(yī)院、中山醫(yī)院、瑞金醫(yī)院、長海醫(yī)院、東方肝膽醫(yī)院高通量測序試點(diǎn)單位運(yùn)行情況體會?

高通量測序技術(shù)敏感性高，操作復(fù)雜，對環(huán)境和人員要求高?

如采用商品化panel設(shè)計，需充分認(rèn)識到設(shè)計的缺陷?

生物信息學(xué)分析對高通量測序結(jié)果分析至關(guān)重要?

須對檢測各環(huán)節(jié)進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)量控制?

NIPT應(yīng)嚴(yán)格控制適用人群指征高通量測序試點(diǎn)單位運(yùn)行情況困惑?

遺傳病及腫瘤高通量測序LDT，如何完成性能確認(rèn)？?

陽性結(jié)果用Sanger測序或其他方法驗證，如何保證陰性結(jié)果無假陰性？?

生物信息分析軟件多種，如何降低分析軟件原因?qū)е陆Y(jié)果不一致風(fēng)險？?

檢測位點(diǎn)多，步驟繁瑣，如何選擇合適的室內(nèi)質(zhì)控品及質(zhì)控頻率？?

各單位檢測項目不同，如何通過EQA或室間比對保證結(jié)果準(zhǔn)確或一致？?

檢測數(shù)據(jù)多，信息量大，如何篩選有臨床價值的數(shù)據(jù)和信息？?

如何規(guī)范結(jié)果報告內(nèi)容及與臨床的溝通？?

產(chǎn)前篩查試點(diǎn)單位如何實現(xiàn)實驗室本地化？?

如何解決高通量測序臨床收費(fèi)問題，讓其合理合規(guī)？技術(shù)指南測序技術(shù)的個體化醫(yī)學(xué)檢測應(yīng)用技術(shù)指南（試行)腫瘤個體化治療檢測技術(shù)指南（試行）藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因檢測技術(shù)指南(試行)遺傳病相關(guān)個體化醫(yī)學(xué)檢測技術(shù)指南（試行）NGS臨床腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)診斷共識臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室規(guī)范《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室管理辦法》衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā)〔2010〕194號

總則第二條

臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室是指通過擴(kuò)增檢測特定的DNA或RNA，進(jìn)行疾病診斷、治療監(jiān)測和預(yù)后判定等的實驗室，醫(yī)療機(jī)構(gòu)應(yīng)當(dāng)集中設(shè)置，統(tǒng)一管理。第三條

本辦法適用于開展臨床基因擴(kuò)增檢驗技術(shù)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)。第五條

以科研為目的的基因擴(kuò)增檢驗項目不得向臨床出具檢驗報告，不得向患者收取任何費(fèi)用。

第二章

實驗室審核和設(shè)置第三章

實驗室質(zhì)量管理第十四條

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室人員應(yīng)當(dāng)經(jīng)省級以上衛(wèi)生行政部門指定機(jī)構(gòu)技術(shù)培訓(xùn)合格后，方可從事臨床基因擴(kuò)增檢驗工作。第十五條

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室應(yīng)當(dāng)按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗工作導(dǎo)則》開展實驗室室內(nèi)質(zhì)量控制，參加衛(wèi)生部臨床檢驗中心或指定機(jī)構(gòu)組織的實驗室室間質(zhì)量評價。衛(wèi)生部臨床檢驗中心或指定機(jī)構(gòu)應(yīng)當(dāng)將室間質(zhì)量評價結(jié)果及時通報醫(yī)療機(jī)構(gòu)和相應(yīng)省級衛(wèi)生行政部門。第四章

實驗室監(jiān)督管理第十八條

省級以上衛(wèi)生行政部門指定機(jī)構(gòu)對室間質(zhì)量評價不合格的醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室提出警告。對于連續(xù)2次或者3次中有2次發(fā)現(xiàn)臨床基因擴(kuò)增檢驗結(jié)果不合格的醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室，省級衛(wèi)生行政部門應(yīng)當(dāng)責(zé)令其暫停有關(guān)臨床基因擴(kuò)增檢驗項目，限期整改。整改結(jié)束后，經(jīng)指定機(jī)構(gòu)組織的再次技術(shù)審核合格后，方可重新開展臨床基因擴(kuò)增檢驗項目。

第四章

實驗室監(jiān)督管理第二十條

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室出現(xiàn)以下情形之一的，由省級衛(wèi)生行政部門責(zé)令其停止開展臨床基因擴(kuò)增檢驗項目，并予以公告：（一）開展的臨床基因擴(kuò)增檢驗項目超出省級衛(wèi)生行政部門核定范圍的；（二）使用未經(jīng)國家食品藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的臨床檢驗試劑開展臨床基因擴(kuò)增檢驗的；（三）在臨床基因擴(kuò)增檢驗中未開展實驗室室內(nèi)質(zhì)量控制的；（四）在臨床基因擴(kuò)增檢驗中未參加實驗室室間質(zhì)量評價的；（五）在臨床基因擴(kuò)增檢驗中弄虛作假的；（六）以科研為目的的基因擴(kuò)增檢驗項目向患者收取費(fèi)用的；（七）使用未經(jīng)培訓(xùn)合格的專業(yè)技術(shù)人員從事臨床基因擴(kuò)增檢驗工作的。（八）嚴(yán)重違反國家實驗室生物安全有關(guān)規(guī)定或不具備實驗室生物安全保障條件的。申請注意事項驗證的最低要求?

定量檢測

至少應(yīng)驗證精密度、正確度、測量區(qū)間（線性），參考范圍（檢測下限）⒈

精密度

選取2個濃度，其中一個應(yīng)盡可能選擇臨床決定水平的濃度?？擅刻鞙y定3次，連續(xù)5天。結(jié)果應(yīng)符合廠商聲稱的指標(biāo)。⒉

正確度

可采用下列方式之一a、與參考方法比對b、測定參考物質(zhì)

c、與公認(rèn)或主流方法比對⒊

測量區(qū)間

至少采用廠商聲明測量區(qū)間內(nèi)的5個濃度進(jìn)行檢測。⒋

參考范圍

至少檢測20例表觀正常人。檢測下限

將一份已知定值的標(biāo)準(zhǔn)品，用陰性標(biāo)本稀釋到檢測下限以下為止，平行檢測10管，10管全部檢出的最低稀釋濃度即為該方法的檢測下限（可根據(jù)實際情況在最低稀釋濃度附近進(jìn)行10倍以下的稀釋）驗證的最低要求?

定性檢測

至少應(yīng)驗證重復(fù)性和符合率，必要時驗證檢測下限⒈

重復(fù)性

采用弱陽性和陰性樣本各一份（陽性樣本獲取有困難時可使用質(zhì)控品），每天檢測3次，連續(xù)測量5天，符合率>90%⒉

符合率

可采用下列方法之一a、標(biāo)準(zhǔn)血清盤b、臨床診斷明確的陰性和陽性樣本各10份c、與公認(rèn)或主流方法比對3.

檢測下限

將一份已知定值的標(biāo)準(zhǔn)品，用野生型的基因組稀釋突變型基因組，設(shè)定不同的突變含量，一直稀釋到檢測下限以下為止，平行檢測3管，3管全部檢出且其線性∣r∣≥0.98的最低稀釋濃度即為該方法的檢測下限SCCL開展項目模塊項目樣本數(shù)頻次HBVDNA、HCV

RNA、EB

DNA、HCMV

DNA52病毒核酸非病毒核酸

CT

DNA、NG

DNA555222HPV高危HPVDNA

HPV、

基因分型分子病理EGFR突變、KRAS突變、BRAF突變白血病融合基因

AML1-ETC、BCR-ABL、PML-RARA5522華法林：CYP2C9、VKORC1氯吡格雷：CYP2C19他克莫司：CYP3A5藥物代謝及藥物作用靶點(diǎn)葉酸：MTHFRC677T遺傳性疾病

PKU基因檢測：PHA5512遺傳性耳聾基因檢測SAT技術(shù)CT

RNA、UU

RNA、NG

RNA、MPRNA質(zhì)控品類型質(zhì)評項目臨床標(biāo)本HBV

DNA、HCV

RNA、CT

DNA、NG

DNAEGFR突變、KRAS突變、BRAF突變AML1-ETC、BCR-ABL、PML-RARACT

RNA、NN

RNA、NG

RNA、MP

RNA高危HPVDNA、HPV基因分型細(xì)胞系EB

DNA、高危HPV

DNA、HPV基因分型人工合成華法林：CYP2C9、VKORC