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專題5DNA和蛋白質技術課題2多聚酶鏈式反應擴增DNA片斷★分子生物學研究中最強大的實驗技術之一★其本質是在體外模擬胞內DNA分子復制的過程美國科學家穆利斯(K.B.Mullis)發(fā)明了PCR技術1993年諾貝爾獎㈠.DNA分子的結構C、H、O、N、P1.元素組成:脫氧核苷酸2.基本單位:一.基礎知識脫氧核苷酸磷酸脫氧核糖含氮堿基嘌呤嘧啶腺嘌呤(A)鳥嘌呤(G)胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T)OOPOHO堿基OOHOOPOHOOH堿基5'3'3'5'多脫氧核苷酸鏈結構簡圖3.多脫氧核苷酸鏈的形成5'5'3'3''4.DNA分子的雙螺旋結構⑴.DNA分子是由

的(即一條鏈為3’-5’,另一條鏈為5’-3’)脫氧核苷酸長鏈盤旋而成的規(guī)則

結構。⑵.

交替連結,排列在外側,構成基本骨架;

排列在鏈的內側。⑶.兩條鏈上的堿基通過

連結起來,形成堿基對。堿基對的組成有特定的規(guī)律:即腺嘌呤一定與

配對,

一定同胞嘧啶配對。雙螺旋兩條反向平行脫氧核糖磷酸堿基氫鍵胸腺嘧啶鳥嘌呤㈢.PCR(多聚酶鏈式反應)2.DNA聚合酶特性不能從頭合成DNA,只能從DNA的3′端開始延伸DNA鏈,因此,DNA復制需要引物。3.DNA聚合酶作用過程當引物與DNA母鏈通過堿基互補配對結合后,DNA聚合酶就能從引物的3′端開始延伸DNA鏈,DNA的合成方向總是從子鏈的5′端向3′端延伸。1.定義:是一種體外迅速擴增DNA片段的技術。能以極少量的DNA為模板,在幾小時內復制出上百萬份的DNA拷貝。復制從3,端開始延伸合成方向5,端向3,端參與的組分在DNA復制中的作用解旋酶DNA母鏈4種脫氧核苷酸DNA聚合酶引物(復制的起點)胞內DNA復制的基本體系打開DNA雙鏈提供DNA復制的模板合成子鏈的原料催化合成DNA子鏈(形成磷酸二酯鍵)使DNA聚合酶能夠從引物的3’端開始連接脫氧核苷酸PCR引物是人工合成的DNA單鏈,不需解旋酶解旋

細胞內復制和PCR不同點?細胞內復制引物是RNA,需解旋酶解旋4.PCR原理⑴.在80-100°C的溫度范圍內,DNA的雙螺旋結構將解體,雙鏈分開,這個過程稱為變性。⑵.當溫度緩慢降低后,兩條彼此分離的DNA鏈又會重新結合成雙鏈。(復性)⑶.PCR利用了DNA的熱變性原理,通過控制溫度來控制雙鏈的解聚與結合,現(xiàn)在使用的PCR儀實質上也是一臺能夠自動調控溫度的儀器。高溫解決了打開雙鏈的問題,但是,又導致DNA聚合酶失活的問題,耐高溫的TaqDNA聚合酶解決了高溫導致DNA聚合酶失活的問題,促成了PCR技術的自動化。5.TaqDNA聚合酶的應用6.需要為PCR反應提供的物質緩沖液(調節(jié)酸堿度維持PH不變)、DNA模板,分別與兩條模板鏈相結合的兩種引物,四種脫氧核苷酸,耐熱的DNA聚合酶,同時通過控制溫度使DNA復制在體外反復進行。ATTCCGTAAGGCCCCGGGGGGCCC3,端5,端3,端5,端TAAGGCCCCGGG引物Ⅰ引物Ⅱ5,端5,端3,端3,端7.PCR技術的特點:PCR技術是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術。它具有特異、敏感、產率高、快速、簡便、重復性好、易自動化等突出。8.PCR的重要應用:廣泛應用于遺傳病的診斷、刑偵破案、古生物學、基因克隆和DNA序列測定等。⑴.變性(模板DNA解旋)模板DNA經加熱至900C以上。一定時間后,使模板DNA雙鏈或經PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使成為單鏈,以便于它與引物結合,為下輪反應作準備。⑵.復性(退火)模板DNA經加熱變性成單鏈后,溫度降到500C左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合。⑶.延伸(72℃)DNA模板-引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下以脫氧核苷酸為原料,以母鏈為模板,按堿基互補配對的原則與半保留復制的原理,合成一條新的DNA鏈。靶序列靶序列PCR循環(huán)第一步:高溫變性靶序列靶序列引物Ⅰ引物Ⅱ5’3’5’5’3’5’3’3’PCR循環(huán)第二步:引物與靶序列退火靶序列靶序列引物Ⅰ引物Ⅱ5’3’5’5’3’5’3’3’TaqDNA聚合酶PCR循環(huán)第三步:引物延伸靶序列靶序列第1個PCR循環(huán)完成后:得到兩個靶序列循環(huán)次數DNA數量122438201,048,576301,073,741,82430次循環(huán)后靶序列擴增的數量1、PCR儀㈠.設備及用具實質上一臺能夠自動調控溫度的儀器。二.PCR的實驗操作2、微量離心管一種薄壁塑料管,總容積為0.5ml3、微量移液器用于定量轉移PCR配方中的液體,其上的一次性吸液槍頭用一次更換一次。1.準備2.移液㈡.實驗操作步驟按照PCR反應體系的配方將所需用的試劑擺放在實驗桌上。用微量移液器按照PCR反應體系配方往微量離心管里面加入各種試劑?;旌虾笊w嚴微量離心管口的蓋子,用手指輕輕彈擊管壁。3.混合⑴過程:將微量離心管放在離心機上,離心約10s。4.離心⑵離心目的:使反應液體集中在離心管底部,提高反應效果。將離心管放入PCR儀上,設置好PCR儀的循環(huán)程序。5.反應循環(huán)數變性復性延伸第一次94℃,10min--30次94℃,30s55℃,30s72℃,1min最后一次94℃,1min55℃,30s72℃,1minPCR一般經歷三十多次循環(huán),每次循環(huán)可以分為三個基本步驟──變性、復性和延伸.PCR技術高度靈敏,為了避免外源DNA等因素的污染而造成干擾實驗,PCR操作時要注意做到:6.注意事項⑴隔離操作區(qū),所用微量離心管、槍頭、緩沖液以及蒸餾水等在使用必須進行高壓滅菌;⑵分裝試劑,簡化操作程序,使用一次性槍頭㈠.理論上DNA擴增數目的計算三.課題成果評價1.一條DNA,復制n次,DNA為2n2.a條DNA,復制n次,DNA為a×2n㈡.實驗中DNA含量的測定1.原理可以通過計算DNA含量來評價擴增的效果,DNA在260nm的紫外線波段有一強烈的吸收峰,峰值的大小與DNA的含量有關。2.過程⑴.稀釋2uL

PCR反應液,加入98uL蒸餾水,即將樣品進行50倍稀釋.⑵.對照調零以蒸餾水作為空白對照,在波長260nm處,將紫外分光光度計的讀數調節(jié)至零。取DNA稀釋液100uL至比色杯中,測定260nm處的光吸收值⑶.計算⑷.計算DNA含量(g)=50×(260nm的讀數)×稀釋倍數50:1g/ml的DNA在厚度為1cm比色杯中的吸光值為0.02光吸收波長/nm2602402202800.10.2比色杯四.課題延伸例如:PCR產物每輪循環(huán)增加一倍,30輪循環(huán)擴增量達230個拷貝(109拷貝)PCR技術是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術。它具有特異、敏感、產率高、快速、簡便、重復性好、易自動化等突出特點五.實驗小結PCR儀加熱使()變性,復性使引物與模板DNA(),延伸需將反應溫度升至中溫(),在()的作用下,以()為原料,以()為復制的起點,合成新鏈。如

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