醫(yī)學(xué)統(tǒng)計學(xué):實用醫(yī)學(xué)信息檢索與利用1492_第1頁
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文檔簡介

醫(yī)學(xué)信息檢索特色和專業(yè)數(shù)據(jù)庫實用醫(yī)學(xué)信息檢索與利用2醫(yī)學(xué)信息檢索特色

---醫(yī)學(xué)信息組織語言信息組織利用一定的規(guī)則、方法和技術(shù)對信息的外部特征和內(nèi)容特征進(jìn)行揭示和描述信息從無序集合轉(zhuǎn)換到有序集合信息轉(zhuǎn)為信息資源潛在信息資源轉(zhuǎn)為顯在信息資源信息的外部特征信息的物理載體直接反映的信息對象題名、作者、出版或發(fā)表日期、載體的物理形態(tài)等反映信息的外在的、形式的特征。信息的內(nèi)容特征信息包含的內(nèi)容,關(guān)鍵詞、主題詞或其他知識單元表達(dá)信息組織語言信息檢索語言(文獻(xiàn)語言、標(biāo)引語言、索引語言、標(biāo)識系統(tǒng))根據(jù)信息組織和信息檢索的需要而創(chuàng)制的人工語言實質(zhì):受控語言表達(dá)一系列概念及其相互關(guān)系的概念標(biāo)識系統(tǒng)或是自然語言中選擇出來并加以規(guī)范化的一套詞匯功能:簡單明了描述文獻(xiàn)的主題概念對概念進(jìn)行系統(tǒng)排列顯示概念間的關(guān)系排除一詞多義、多次一義和詞義含糊現(xiàn)象自然語言與受控語言優(yōu)勢劣勢自然語言(書面語言)減少概念間轉(zhuǎn)換產(chǎn)生的誤差操作簡單、方便、靈活,適用范圍廣查準(zhǔn)率降低:選詞不規(guī)范,詞量過大,影響主題的集中。查全率降低:不能控制多義詞,使相關(guān)主題內(nèi)容的文獻(xiàn)分散。不能反映概念間的各種對應(yīng)關(guān)系與隱含關(guān)系。受控語言(分類號、主題詞)提高查準(zhǔn)率:文獻(xiàn)描述和表達(dá)概念具有唯一性、專指性提高查全率:標(biāo)引時可以集中相關(guān)文獻(xiàn)顯示概念間的各種關(guān)系,有利于及時調(diào)整檢索策略。標(biāo)引難度大、速度慢、詞匯更新滯后、對標(biāo)引和檢索人員要求過高。信息組織語言的兩個主要大類體系分類組織語言建立在科學(xué)分類體系基礎(chǔ)上,用分類號表達(dá)各種概念并將其按學(xué)科性質(zhì)進(jìn)行系統(tǒng)排列的組織語言?!吨袊鴪D書館分類法》(中圖法)、《美國國會圖書館圖書分類法》(國會法,LCC)、國際專利分類表(InternationalPatentClassification,IPC)主題組織語言一種描述性語言,用語詞直接表達(dá)文獻(xiàn)的主題。這些語詞按字順排列成主題詞表,以此作為標(biāo)引檢索的工具?!睹绹t(yī)學(xué)主題詞表》(MedicalSubjectHeadings,MESH)、《中醫(yī)藥學(xué)主題詞表》、《漢語主題詞表》《中國圖書館分類法》(《中圖法》)建國后編制出版的大型綜合性分類法。自1999年第四版起更名為《中國圖書館分類法》(ChineseLibraryClassification)。既可以組織藏書排架又可以分類檢索的列舉式等級式體系組配分類法按照知識門類的邏輯次序從抽象到具體、從一般到特殊、從簡單到復(fù)雜對知識進(jìn)行科學(xué)劃分,從而產(chǎn)生不同級別且存在隸屬關(guān)系、體現(xiàn)知識等級體系的類目。每一類目分別以不同分類號做標(biāo)識,分類號由字母和數(shù)字組合而成。主要特點:按學(xué)科、專業(yè)集中文獻(xiàn),并從知識分類角度揭示各類文獻(xiàn)在內(nèi)容上的區(qū)別和聯(lián)系,提供從學(xué)科分類檢索信息的途徑。全表把知識體系分五大部類二十二大類。中圖法分類體系基本部類一級大類三級類目二級類目馬列主義、毛澤東思想哲學(xué)社會科學(xué)自然科學(xué)綜合性圖書B哲學(xué)、宗教A馬克思主義、列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論C社會科學(xué)總論D政治、法律E軍事F經(jīng)濟G文化、科學(xué)、教育、體育H語言、文字I文學(xué)J藝術(shù)K歷史、地理N自然科學(xué)總論O數(shù)理科學(xué)和化學(xué)P天文學(xué)、地球科學(xué)Q生物科學(xué)R醫(yī)藥、衛(wèi)生S農(nóng)業(yè)科學(xué)T工業(yè)技術(shù)U交通運輸V航空航天X環(huán)境科學(xué)、安全科學(xué)Z綜合性圖書C社會科學(xué)總論…K歷史、地理N自然科學(xué)總論O數(shù)理科學(xué)和化學(xué)P天文學(xué)、地球科學(xué)Q生物科學(xué)R醫(yī)藥、衛(wèi)生…X環(huán)境科學(xué)、安全科學(xué)R1預(yù)防醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生學(xué)R2中國醫(yī)學(xué)R3基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)R4臨床醫(yī)學(xué)R5內(nèi)科學(xué)R6外科學(xué)R71婦產(chǎn)科學(xué)R72兒科學(xué)R73腫瘤學(xué)R74神經(jīng)病學(xué)與精神病學(xué)R75皮膚病學(xué)與性病學(xué)R76耳鼻咽喉科學(xué)R77眼科學(xué)R78口腔科學(xué)R79外國民族醫(yī)學(xué)R8特種醫(yī)學(xué)R9藥學(xué)

R51傳染病

R52結(jié)核病

R53寄生蟲病

R54心臟、血管(循環(huán)系)疾病

R55血液及淋巴系疾病

R56呼吸系及胸部疾病

R57消化系及腹部疾病

R58內(nèi)分泌腺疾病及代謝病

R59全身性疾病

其他級類目R59R591營養(yǎng)缺乏癥(四級)

R591.1無機鹽缺乏癥

R591.2蛋白質(zhì)及氨基酸缺乏癥

R591.3不飽和脂酸缺乏癥

R591.4維生素缺乏癥(五級)

R591.41維生素A缺乏癥(六級)

R591.42維生素B缺乏癥

R591.43維生素C缺乏癥

R591.44維生素D缺乏癥

R591.45維生素E缺乏癥

R591.49維生素K缺乏癥

R591.5內(nèi)源性營養(yǎng)缺乏癥R592老年病學(xué)

R593免疫性疾病R594物理性損害

R595中毒及化學(xué)性損害

R596遺傳性疾病

R597原因未明的疾病R598職業(yè)性疾病R599地方病學(xué)

分類法在圖書分類中的應(yīng)用醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索與利用/主編梅誼

G252.7/M288醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索/主編郭繼軍

G252.7/G769分類法在CBM數(shù)據(jù)庫中的體現(xiàn)《美國醫(yī)學(xué)主題詞表》(MedicalSubjectHeadings,MeSH)

/mesh/meshhome.html美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)編輯出版的用于儲存、檢索文獻(xiàn)的受控詞匯表。用2萬多個規(guī)范術(shù)語通過各種參照系統(tǒng)表達(dá)數(shù)十萬個醫(yī)學(xué)專業(yè)術(shù)語。(Thereareare27,149descriptorsin2014MeSH.)對生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析和標(biāo)引的權(quán)威性工具,是指導(dǎo)使用主題詞途徑進(jìn)行文獻(xiàn)檢索的權(quán)威性工具。AboutMeSHMeSHistheNationalLibraryofMedicine'scontrolledvocabularythesaurus.Itconsistsofsetsoftermsnamingdescriptorsinahierarchicalstructurethatpermitssearchingatvariouslevelsofspecificity.ThefirstofficiallistofsubjectheadingspublishedbytheNationalLibraryofMedicineappearedin1954.In1960,anewandthoroughlyrevisedMedicalSubjectHeadingswaspublished.Thereare27,149descriptorsin2014MeSH.Therearealsoover218,000entryterms(ortextwords)thatassistinfindingthemostappropriateMeSHHeading.TheMeSHthesaurusisusedbyNLMforindexingarticlesfrom5,400oftheworld'sleadingbiomedicaljournalsfortheMEDLINE/PubMEDdatabase.ItisalsousedfortheNLM-produceddatabasethatincludescatalogingofbooks,documents,andaudiovisualsacquiredbytheLibrary.EachbibliographicreferenceisassociatedwithasetofMeSHtermsthatdescribethecontentoftheitem.Similarly,searchqueriesuseMeSHvocabularytofinditemsonadesiredtopic.MESH結(jié)構(gòu)1主題詞變更表(MeSHVocabularyChanges):分別列出每年新增和刪去的主題詞。2主題詞字順表(MeSH):將所有主題詞、副主題詞、與之有關(guān)系的非規(guī)范用詞全部按字順排列。每一主題詞下列出該主題詞建立的年代、樹狀結(jié)構(gòu)號、歷史注釋和各種參照系統(tǒng)。3樹狀結(jié)構(gòu)表(TreeStructures):將所有主題詞按學(xué)科門類系統(tǒng)分為16個大類。每個大類又細(xì)分為不同級別的小類,最多至12級類目。MESH標(biāo)引詞類型敘詞(Descriptors):也稱主題詞(MainHeadings)。描述文獻(xiàn)實質(zhì)概念的名詞術(shù)語。同樣用于PubMed的檢索。每年更新。出版特征詞:即出版物類型(PublicationTypes)。如綜述、臨床試驗、編輯部社論等。可檢索形式:PT地理名詞(Geographics):描述文獻(xiàn)中出現(xiàn)的地區(qū)區(qū)域的名詞術(shù)語。修飾詞(Qualifiers):也稱副主題詞(Subheadings)。與主題詞組配使用,表示所描述主題概念的某一特殊方面??蓹z索形式:SH輔助概念詞(SupplementaryConceptRecords):用于標(biāo)引化學(xué)物質(zhì)、藥物、或其他概念如罕見病的名詞術(shù)語。可用于PubMed的檢索。MESH主題詞間的關(guān)系:層級關(guān)系表明各術(shù)語間的邏輯關(guān)系。即展現(xiàn)整部詞表的結(jié)構(gòu),又可提高檢索效率。體現(xiàn)在樹形結(jié)構(gòu)表中。Hierarchical:termsthatarebroaderornarrower.Itnotonlyprovidesanoverviewofthestructureofathesaurusbutalsocanbeusedtoenhancesearching.MeSHisorganizedhierarchicallyinto16trees.Eachcategoryisfurtherdividedintosubcategories.Withineachsubcategory,descriptorsarearrayedhierarchicallyfrommostgeneraltomostspecificinuptotwelvehierarchicallevels.樹形結(jié)構(gòu)示意圖1樹狀結(jié)構(gòu)示意圖2頭部耳面部耳(感覺器官)外耳中耳迷路頰頦眼額口腔鼻唇眼瞼(感覺器官)睫毛瞼板腺眼瞼眉毛睫毛MESH樹形結(jié)構(gòu)類目表1.Anatomy[A]2.Organisms[B]3.DiseasesDiseases[C]4.ChemicalsandDrugs[D]5.Analytical,DiagnosticandTherapeuticTechniquesandEquipment[E]6.PsychiatryandPsychology[F]7.PhenomenaandProcesses[G]8.DisciplinesandOccupations[H]9.Anthropology,Education,SociologyandSocialPhenomena[I]10.Technology,Industry,Agriculture[J]11.Humanities[K]12.InformationScience[L]13.NamedGroups[M]14.HealthCare[N]15.PublicationCharacteristics[V]16.Geographicals[Z]Diseases[C]分類

Neoplasms[C04]

分類Neoplasms[C04]

NeoplasmsbySite[C04.588]

AbdominalNeoplasms[C04.588.033]

+

AnalGlandNeoplasms[C04.588.083]

BoneNeoplasms[C04.588.149]

+

BreastNeoplasms[C04.588.180]

BreastNeoplasms,Male[C04.588.180.260]

MammaryNeoplasms[C04.588.180.520]

MammaryNeoplasms,Experimental[C04.588.180.525]

PhyllodesTumor[C04.588.180.762]

DigestiveSystemNeoplasms[C04.588.274]

+“糖尿病”樹形結(jié)構(gòu)內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病

糖尿病

糖尿病并發(fā)癥

糖尿病血管病變(+2)

糖尿病足

糖尿病視網(wǎng)膜病變

糖尿病昏迷(+1)

高血糖高滲性非酮性昏迷糖尿病酮癥酸中毒

糖尿病腎病

糖尿病神經(jīng)病變(+1)

糖尿病足巨大胎兒“糖尿病并發(fā)癥”樹形結(jié)構(gòu)MESH主題詞間的關(guān)系:同義詞用不同的術(shù)語表達(dá)同一個概念。體現(xiàn)在“entryterms”中。同義詞、近義詞或密切相關(guān)詞均被收錄在“entryterms”中,幫助用戶發(fā)現(xiàn)相關(guān)的檢索術(shù)語。Synonymous:termsthataresynonyms,allowingtheindexerorsearchertoexpressaconceptindifferentwords.Manysynonyms,near-synonyms,andcloselyrelatedconceptsareincludedasentrytermstohelpusersfindthemostrelevantMeSHdescriptorfortheconcepttheyareseeking.Thereareover218,000entryterms.Entrytermsarealsotextwordsingeneral.forexample:"VitaminC"isanentrytermto"AscorbicAcid“.

“genetherapy”isanentrytermto“genetictherapy”.Thismeanswhenyouusegenetherapytofindrelatedliteraturesbymesh,theMedicalsubjectheadingis“genetictherapy”,notgenetherapy.MeSHDescriptorData:ascorbicacid

entryterm:vitaminc(2013)Entryterm:cancer

MeSHDescriptorData:neoplasmsMESH主題詞間的關(guān)系:相關(guān)關(guān)系既不是同義詞也不存在層級關(guān)系,但詞語間的確存在某種關(guān)系。提醒用戶利用不同的檢索詞檢索以提高檢索效率。Related:termsthatarenotsynonymousorhierarchicalbutaresomehowotherwiserelated.Theseusuallyremindthesearcherofdifferentbutrelatedtermsthatmayenhanceasearch.“Seealso”inmeshdescriptordata.MeSHDescriptorData:genetictherapy

entryterm:genetherapy(2013)

MESH規(guī)范形式:參照系統(tǒng)用代參照:Asee(見)BA:非規(guī)范化用詞

B:規(guī)范用詞(主題詞)即:用B檢索文獻(xiàn)。如:cancerseeneoplasms

癌癥見腫瘤膀胱癌見膀胱腫瘤羥基吡哆辛酸見吡哆酸

MESH規(guī)范形式:主題詞倒置Acuteabdomenabdomen,acute急性腎功能衰竭腎功能衰竭,急性局限性癲癇癲癇,局限性見癲癇,部分型重組DNA疫苗疫苗,DNA

MESH規(guī)范形式:主題詞、副主題詞組配副主題詞(Subheadings)又稱限定詞,與主題詞進(jìn)行組配,對某一主題詞的概念進(jìn)行限定或復(fù)分,使主題詞具有更高的專指性。MESH目前有83個副主題詞。副主題詞的使用有嚴(yán)格的限制。如:診斷(Diagnosis,DI)、藥物治療(DrugTherapy,DT)中醫(yī)的副主題詞有:按摩療法,氣功療法,穴位療法,針灸療法,中西醫(yī)結(jié)合療法,中醫(yī)病機,中醫(yī)藥療法,中藥療法,中醫(yī)療法。在檢索中,主題詞與副主題詞的組配(主題詞/副主題詞)須有邏輯關(guān)系。

如:阿司匹林治療感冒阿司匹林/治療應(yīng)用;感冒/藥物療法。

SubheadingsThediagnosisofhypertensionsearchengines:diagnosisandhypertensionMeSH:Hypertension/diagnosisSubheadings:arequalifierstoheadingsthatcanbeattachedtonarrowthefocusofaterm.Thereare83subheadingsinMeSHin2013.Eachtreecategorycanberestrictedtheattachmentofcertainsubheadings.eg.drugtherapycannotbeattachedtoananatomicsite,suchasthefemur.Bloodcannotbeattachedtoplantcategories,suchasplantweeds,treesandsoon.SubheadingsHierarchies(1)

classificationdrugeffectsHistoryinjuries

instrumentationmethodspathogenicitypsychologyradiationeffectsveterinarySubheadingsHierarchies(2)TopicalSubheadingswithScopeNotes,

Abbreviations,andAllowableCategories(forexample)

/mesh/topsubscope.htmlabnormalities(A1-5,A7-10,A13,A14,A17,B2)AB,abnormUsedwithorgansforcongenitaldefectsproducingchangesinthemorphologyoftheorgan.Itisusedalsoforabnormalitiesinanimals.administration&dosage(D1-3,D3-27)AD,adminUsedwithdrugsfordosageforms,routesofadministration,frequencyanddurationofadministration,quantityofmedication,andtheeffectsofthesefactors.therapy(C,F3)TH,therUsedwithdiseasesfortherapeuticinterventionsexceptdrugtherapy,diettherapy,radiotherapy,andsurgery,forwhichspecificsubheadingsexist.Theconceptisalsousedforarticlesandbooksdealingwithmultipletherapies.ScopenotesAllowablecategories(treestructurenumber)abbreviationsA6,A11,A12,A15,A16,A18-21cannotbeobviouslyattachedtosubheadingabnormalitiesintheory.Thereexistscloselylogicrelationshipbetweenheadingsandsubheadings.主題詞、副主題詞組配示例1某種疾病的藥物治療:

疾病名稱(主題詞)/藥物療法(副主題詞)

藥物名稱(主題詞)/治療應(yīng)用(副主題詞)

例:阿司匹林治療心臟病阿司匹林/治療應(yīng)用心臟病/藥物療法drugtherapy(DT)與疾病主題詞組配,表明通過投給藥品、化學(xué)品或抗生素治療疾病。至于膳食療法和放射療法,則分別用“膳食療法”和“放射療法”。而免疫療法及生物制品治療則用“治療”。therapeuticuse(TU)與藥品、生物制品及物理因素主題詞組配,表明將其用于預(yù)防或治療疾病,包括獸醫(yī)用藥。治療應(yīng)用的下位詞包括:投藥和劑量、副作用、禁忌證、中毒。某種疾病的診斷

乳腺癌的超聲診斷diagnosis(DI)與疾病主題詞組配,表明診斷的各個方面,包括檢查、鑒別診斷及預(yù)后;但不包括普查,此時應(yīng)用“預(yù)防和控制”;也不包括放射學(xué)診斷、放射性核素掃描診斷和超聲診斷,應(yīng)分別用“放射攝影術(shù)”、“放射性核素顯像”和“超聲檢查”。診斷的下位詞包括:病理學(xué)、放射攝影術(shù)、放射性核素顯像、超聲檢查。乳腺癌普查:乳腺腫瘤/預(yù)防和控制主題詞、副主題詞組配示例2藥物引發(fā)某種疾病:疾病/化學(xué)誘導(dǎo)藥物/

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