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文檔簡介
上海海洋大學(xué)Shanghai
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University概述個體發(fā)育的中心問題是細(xì)胞分化,研究細(xì)胞分化的分子機(jī)制是探索發(fā)育機(jī)制的基礎(chǔ)。細(xì)胞分化是指多細(xì)胞有機(jī)體的細(xì)胞從簡單、原始的狀態(tài)到復(fù)雜和異樣化的方向發(fā)展的過程,是通過細(xì)胞分裂產(chǎn)生結(jié)構(gòu)和功能有穩(wěn)定差異的過程。細(xì)胞表型
cell
phenotype:是細(xì)胞特定基因型在一定的環(huán)境條件的表現(xiàn),是細(xì)胞的特定性狀。全能細(xì)胞:能產(chǎn)生完整有機(jī)體,并且機(jī)體所需要的全部基因信息都被表達(dá)的細(xì)胞多潛能細(xì)胞:含有的基因信息被限制表達(dá)的細(xì)胞分化細(xì)胞:多潛能細(xì)胞通過分離和分化發(fā)育成的特殊細(xì)胞表型個體發(fā)育過程:全能性細(xì)胞→多潛能性細(xì)胞→分化細(xì)胞Shanghai
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University上海海洋大學(xué)概述概述多潛能細(xì)胞:表現(xiàn)出發(fā)育潛能的一定局限性,僅能分化成為特定范圍內(nèi)的細(xì)胞。如多潛能生血干細(xì)胞僅能分化成為淋巴細(xì)胞、單核細(xì)胞、粒細(xì)胞等。①多潛能細(xì)胞后代的發(fā)育命運(yùn)在一定的程度上已被限定;②在不同的環(huán)境條件下也能表現(xiàn)出某些相同的細(xì)胞表型,而且這種決定不能通過形態(tài)或生物化學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)(無特殊的亞顯微結(jié)構(gòu)變化,不含特異性蛋白質(zhì))來識別;③多潛能細(xì)胞的基因表達(dá)受到一定的限制。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)細(xì)胞分化Shanghai
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University上海海洋大學(xué)概述分化細(xì)胞:由多潛能細(xì)胞通過一系列分裂和分化發(fā)育成的特殊細(xì)胞表型。①合成特異性蛋白或具有特殊功能性的細(xì)胞器;②有絲分裂的頻率明顯降低,有的甚至完全停止細(xì)胞分型。細(xì)胞分化的過程是從全能性細(xì)胞→多潛能性細(xì)胞→分化細(xì)胞的發(fā)展過程,也是基因選擇性表達(dá)的結(jié)果。分化細(xì)胞一般僅有5%-10%的基因表達(dá),除了合成細(xì)胞生長、代謝必需的產(chǎn)物之外,主要是特異性產(chǎn)物的合成。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)DNA水平Shanghai
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University上海海洋大學(xué)轉(zhuǎn)錄水平翻譯水平基因表達(dá)的多級調(diào)控基因激活轉(zhuǎn)錄起始
轉(zhuǎn)錄后加工
mRNA降解蛋白質(zhì)翻譯翻譯后加工修飾蛋白質(zhì)降解等Shanghai
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University上海海洋大學(xué)概述Shanghai
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University上海海洋大學(xué)細(xì)胞分化是基因差異性表達(dá)的結(jié)果,差異性基因表達(dá)產(chǎn)生的原因主要來自于兩方面。①細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的差異影響核基因的表達(dá)。在早期胚胎發(fā)育的卵裂階段,由于卵質(zhì)的不均勻分布,卵裂的結(jié)果所產(chǎn)生的分裂球(細(xì)胞)存在不同的細(xì)胞內(nèi)環(huán)境,引起胚胎細(xì)胞核基因的差異表達(dá)。②細(xì)胞外環(huán)境的影響。⑴在胚胎發(fā)育早期不同的胚胎細(xì)胞位于不同的區(qū)域,受到不同的外界環(huán)境的影響,接受不同的位置信息。⑵特別是鄰近細(xì)胞的相互關(guān)系,如胚胎誘導(dǎo)對于胚胎細(xì)胞分化具有重要意義。⑶各種細(xì)胞外信號分子
(細(xì)胞因子、激素等信號分子),通過細(xì)胞間的通訊,特別是信號傳導(dǎo)間接影響細(xì)胞核基因的表達(dá)。概述Shanghai
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University上海海洋大學(xué)差異基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制主要是在以下幾個水平完成:①差異基因轉(zhuǎn)錄:調(diào)節(jié)哪些核基因轉(zhuǎn)錄成RNA。?核RNA的選擇性加工:調(diào)節(jié)哪些核RNA進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)并加工成為mRNA,構(gòu)成特殊的轉(zhuǎn)錄子組。?mRNA的選擇性翻譯:調(diào)節(jié)哪些mRNA翻譯成蛋白質(zhì)。④差別蛋白質(zhì)加工:選擇哪些蛋白質(zhì)加工成為功能性蛋白質(zhì),即基因功能的實(shí)施者。第一節(jié)
基因組相同和基因差異表達(dá)Shanghai
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University上海海洋大學(xué)多細(xì)胞有機(jī)體具有許多形態(tài)、功能和生物化學(xué)組成不同的細(xì)胞。這些不同的細(xì)胞都來自于一個共同的始祖細(xì)胞——受精卵。這些不同的組織細(xì)胞雖然具有相同的基因結(jié)構(gòu),但由于基因表達(dá)受到復(fù)雜的調(diào)控,發(fā)生差別基因轉(zhuǎn)錄,繼而合成組織專一性蛋白質(zhì),出現(xiàn)細(xì)胞形態(tài)和功能的分化。換句話說就是這些細(xì)胞的基因組相同,只是在發(fā)育過程中不同的細(xì)胞利用了基因組中不同的基因,結(jié)果導(dǎo)致各類細(xì)胞合成其特有的蛋白質(zhì)。1、在發(fā)育中核潛能被限定移核試驗(豹蛙):發(fā)育時期越晚,細(xì)胞核潛能的受限性越大去核受精卵囊胚核原腸胚早期內(nèi)胚層核神經(jīng)胚內(nèi)胚層核50%蝌蚪,異常個體以內(nèi)胚層細(xì)胞形成較其他胚層細(xì)胞更容易□10%蝌蚪80%以上蝌蚪結(jié)論:隨著發(fā)育,體細(xì)胞的核潛能存在普遍的受限現(xiàn)象,且具有供體核的特異性Shanghai
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University上海海洋大學(xué)二、核潛能的限定豹蛙核移植實(shí)驗Shanghai
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University上海海洋大學(xué)(一)在發(fā)育中核潛能被限定Shanghai
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University上海海洋大學(xué)細(xì)胞核潛能的限定是穩(wěn)定的且具有一定的組織特異性。三胚層細(xì)胞核移植實(shí)驗:①采用具有組織特異性的原腸胚后期內(nèi)胚層細(xì)胞核為供體時,易于形成內(nèi)胚層細(xì)胞,指導(dǎo)發(fā)育成為外胚層和中胚層細(xì)胞的能力已受到限制。②外胚層細(xì)胞核為供體進(jìn)行移核實(shí)驗,產(chǎn)生發(fā)育異常的蝌蚪,可具有正常的神經(jīng)分化但是缺乏內(nèi)胚層結(jié)構(gòu)。在發(fā)育過程中體細(xì)胞核潛能的限定是一個普遍的規(guī)律。(二)細(xì)胞核具有潛在全能性的研究Shanghai
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University上海海洋大學(xué)關(guān)于分化細(xì)胞核潛能限定的觀點(diǎn)長期以來存在著爭議。有些學(xué)者認(rèn)為用已分化細(xì)胞核進(jìn)行的移植實(shí)驗在很多情況下不能獲得正常發(fā)育胚胎的原因,主要是由于核移植的方法使已分化細(xì)胞核突然進(jìn)入了一個高頻率分裂的陌生胞質(zhì)環(huán)境,容易引起染色體斷裂。為真正評價細(xì)胞核的潛能,人們采用核克隆技術(shù)(連續(xù)克?。挂浦驳墓w核逐漸地適應(yīng)這種環(huán)境,結(jié)果也可以獲得發(fā)育正常的蝌蚪。核克隆技術(shù)Shanghai
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University上海海洋大學(xué)將供體細(xì)胞核先移植進(jìn)激活的去核卵中,再將發(fā)育產(chǎn)生的大量卵裂期或囊胚期細(xì)胞核為供體,再次進(jìn)行移植,移植到更多的去核卵中,通過多次核移植可制備出原來供體核的許多拷貝。已分化細(xì)胞的核經(jīng)歷這一系列的移植后,其中有些細(xì)胞核變得可以指導(dǎo)整個有機(jī)體的發(fā)育。如原腸胚后期內(nèi)胚層細(xì)胞核可以指導(dǎo)胚胎發(fā)育成為正常的蝌蚪。甚至將已分化的小腸上皮細(xì)胞核或紅細(xì)胞的細(xì)胞核作為供體移植到去核卵中,也可以獲得少數(shù)發(fā)育正常的蝌蚪或成體。一般核移植過程Shanghai
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University上海海洋大學(xué)核克隆過程Shanghai
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University上海海洋大學(xué)Dolly的誕生克隆羊Dolly的誕生(1997)對于說明體細(xì)胞核發(fā)育的全能性具有特別重要的意義。這是人類首次成功的用哺乳動物體細(xì)胞-成年母羊乳腺上皮細(xì)胞核為供體,經(jīng)過多次核移植而獲得的后代。隨后,克隆猴、克隆牛等一系列動物的研究獲得了成功。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)Dolly的標(biāo)本和伊恩博士Dolly:1996.7.5.世界上第一只克隆羊Dolly由英國愛丁堡大學(xué)的伊恩博士研制成功,2003.2.14.由于肺結(jié)核而被安樂死,它的標(biāo)本于2003年4月9日陳列于蘇格蘭首都愛丁堡國家博物館。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)1、基因刪除:原生動物、線蟲、昆蟲、甲殼動物。2、基因擴(kuò)增:爪蟾的rDNA、果蠅多線染色體。3、基因重排:免疫球蛋白基因(106~108種抗體)。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)三、基因組相同的例外——基因組的改變副蛔蟲
染色體消減癭蠅等
卵裂時,部分染色體丟失,丟失的→體細(xì)胞; 不丟失的→生殖細(xì)胞。如:癭蠅
40
→8;搖蚊
40→38哺乳類(除駱駝)的紅細(xì)胞、皮膚的羽毛、毛發(fā)角化細(xì)胞中 整個細(xì)胞核丟失1、染色體消減Shanghai
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University上海海洋大學(xué)Shanghai
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University2、基因擴(kuò)增A、基因的選擇擴(kuò)增(gene
selective
amplification):某些特殊基因被選擇性復(fù)制出許多拷貝的現(xiàn)象非洲爪蟾rDNA擴(kuò)增,從變態(tài)期開始,一直到卵母細(xì)胞成熟之前;初級卵母細(xì)胞末期,其rDNA為體細(xì)胞的2×105倍果蠅卵殼蛋白基因——濾泡細(xì)胞中超量DNA合成(16倍)B、基因組擴(kuò)增(genomeamplification):通過多倍體和多線染色體擴(kuò)增完整基因組哺乳動物肝細(xì)胞(營養(yǎng)原細(xì)胞)——多倍體擴(kuò)增果蠅卵巢中營養(yǎng)細(xì)胞——多線染色體擴(kuò)增rDNA——核糖體RNA基因5’前導(dǎo)序列上海海轉(zhuǎn)錄洋間大隔學(xué)3、基因重排免疫球蛋白的基因重組淋巴母細(xì)胞在為抗體制備作準(zhǔn)備
時,組合多個獨(dú)立的遺傳程序(體細(xì)胞重組),其間,它總是試
圖將抗體輕鏈或重鏈的DNA序列隨機(jī)編排成受體或抗體的可變區(qū),以增加識別和結(jié)合未知外來抗原
的機(jī)會Shanghai
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University上海海洋大學(xué)B淋巴細(xì)胞:C區(qū)編碼恒定區(qū)
V,D,J編碼可變區(qū)剪切Shanghai
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University上海海洋大學(xué)免疫球蛋白基因重排第二節(jié) 轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控Shanghai
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University上海海洋大學(xué)差異基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是最重要的調(diào)控機(jī)制。一、基因表達(dá)的時間和空間特異性基因表達(dá)的時間特異性:有些特異性的基因,只有在發(fā)育的某個特定時期或某些時期才具有活性,而在其他時期則是無功能的基因?;虮磉_(dá)的空問特異性:主要指基因表達(dá)的組織細(xì)胞特異性。斑馬魚早期發(fā)育中vasa
mRNA的時空表達(dá)(原位雜交)Shanghai
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University上海海洋大學(xué)一、差異基因表達(dá)的研究方法(一)珠蛋白基因的轉(zhuǎn)錄Shanghai
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University上海海洋大學(xué)血紅蛋白=珠蛋白+血紅素利用珠蛋白mRNA的探針,對雞胚紅細(xì)胞發(fā)育中血紅蛋白最初的轉(zhuǎn)錄進(jìn)行監(jiān)控。①分離孵化20-23h的雞胚后部明區(qū)血島時,可以觀察到紅
細(xì)胞的前體細(xì)胞,但并未檢測到血紅蛋白基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。②到雞胚孵化35h,紅細(xì)胞的前體細(xì)胞分化為幼紅細(xì)胞,血紅蛋白迅速合成。這表明血紅蛋白基因是在這一段發(fā)育時期中轉(zhuǎn)錄的。血紅蛋白血紅蛋白是一個四聚體蛋
白質(zhì),在人和許多動物中,胚胎、胎兒和成體紅細(xì)胞
的血紅蛋白分子的組成都
不相同。人胚胎血紅蛋白:由2個ζ-珠蛋白鏈、2個ε-珠蛋白鏈和4個血紅素分子組成。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)血紅蛋白妊娠第2個月:ζ–和ε
-珠蛋白鏈的合成突然停止,而α-和γ-珠蛋白鏈合成量增加。由兩個α-和兩個γ-珠蛋白鏈組成胎兒的血紅蛋白分子。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)血紅蛋白妊娠第3個月:γ-珠蛋白基因表達(dá)逐漸停止,同時β-和δ-基因開始表達(dá),產(chǎn)量逐漸增加。出生后:血紅蛋白分子的組成迅速轉(zhuǎn)換,由胎兒型代之為成體型,即α2β2。正常成體的血紅蛋白分子中α2β2占97%,α2δ2為2%-3%,α2γ2為1%。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)血紅蛋白人的ζ-和α-珠蛋白基因位于第16號染色體上,而ε
-、γ-、δ-和β-珠蛋白基因相連,在第一號染色體上依次排列。β-珠蛋白基因家族的表達(dá)顯示了一種調(diào)控機(jī)制,即指導(dǎo)其從胚胎型→胎兒型→成體型轉(zhuǎn)變的順序開關(guān)。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)(二)轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白5S核糖體RNA基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控Shanghai
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University上海海洋大學(xué)1.中心啟動子元件在整個發(fā)育過程中5SrRNA基因表達(dá)的調(diào)控都是在轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行的。非洲爪蟾基因組具有2個編碼5SrRNA的多基因家族,即卵母細(xì)胞型和體細(xì)胞型。卵母細(xì)胞型:20
000個,轉(zhuǎn)錄水平很低,卵發(fā)生早期開始囊胚中期可被檢測到。體細(xì)胞型:400個,合成體細(xì)胞的95%以上5SrRNA,卵發(fā)生早期開始一直可以檢測到。5SrRNA的基因的轉(zhuǎn)錄是由RNA聚合酶Ⅲ所調(diào)控的2.TFⅢA的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)Shanghai
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University上海海洋大學(xué)轉(zhuǎn)錄因子TFⅢA參與RNA聚合酶Ⅲ對非洲爪蟾5SrRNA轉(zhuǎn)錄的控制。TFⅢA既是RNA聚合酶Ⅲ控制中的第一個轉(zhuǎn)錄因子,也是5SrRNA的基因的專一性轉(zhuǎn)錄因子。但是TFⅢA分子與5SrRNA的基因中間啟動子的結(jié)合力很弱,相比之下非特異性轉(zhuǎn)錄因子TFⅢC能夠更牢固地與
5SrRNA的基因中間啟動子相結(jié)合,所以TFⅢA分子與TFⅢC結(jié)合形成TFⅢA-TFⅢC
復(fù)合物。當(dāng)RNA聚合酶Ⅲ與該復(fù)合物結(jié)合時5SrRNA的基因的轉(zhuǎn)錄即發(fā)生。Switch
gene:發(fā)育中可以決定細(xì)胞向兩種不同命運(yùn)分化的基因(主基因的表達(dá)決定)果蠅腹中線外胚層細(xì)胞具有分化成為上皮細(xì)胞或神經(jīng)母細(xì)胞的雙重潛能;notch轉(zhuǎn)錄缺乏時,腹中線所有細(xì)胞都分化成神經(jīng)母細(xì)胞,胚胎不能正常發(fā)育;notch控制分化成皮膚細(xì)胞和神經(jīng)母細(xì)胞myod1轉(zhuǎn)錄子是肌細(xì)胞分化的主要開關(guān)基因,也是肌母細(xì)
胞決定子。將其通過病毒載體轉(zhuǎn)染其它細(xì)胞(如色素細(xì)胞、神經(jīng)細(xì)胞、脂肪細(xì)胞、肝細(xì)胞等),可使它們轉(zhuǎn)分化為肌
細(xì)胞。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)(三)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的“開關(guān)基因”(switch
gene)三、差異基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控機(jī)制Shanghai
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University上海海洋大學(xué)真核生物基因的結(jié)構(gòu):(一)外顯子與內(nèi)含子真核生物的基因主要由兩種DNA序列組成:一種是蛋白質(zhì)編碼序列稱為外顯子(exon),另一種是非蛋白質(zhì)編碼序列稱為內(nèi)含子(intron)。編碼一個蛋白質(zhì)的序列常以外顯子和內(nèi)含子鑲嵌排列的方式存在。不同基因具有內(nèi)含子的數(shù)目和內(nèi)含子的長度差異很大。真核生物的基因還包括5’和3’末端長度不等的特異性序列,這些序列雖然不編碼氨基酸,但在基因表達(dá)的過程中起重要作用。人β-珠蛋白基因的10個區(qū)域①啟動子區(qū):啟動子區(qū)位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-95--26bp,由兩個上游啟動子成分和TATA盒組成。這個區(qū)域負(fù)責(zé)與
RNA聚合酶結(jié)合,同時與以后的轉(zhuǎn)錄起始有關(guān)。②ACATTG序列:該序列位于RNA的5’末端,又稱為帽子序列,是轉(zhuǎn)錄的起始點(diǎn),在轉(zhuǎn)錄后帽子序列將被修飾,這段序列在不同的基因中有差異。③翻譯起始密碼ATG:該密碼子位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)后50bp處,在轉(zhuǎn)錄的起始點(diǎn)和翻譯起始點(diǎn)間的這段序列稱為前導(dǎo)序列,其長度在不同基因中差異很大。由前導(dǎo)序列決定翻譯的速
率。②
③①①①Shanghai
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University上海海洋大學(xué)人β-珠蛋白基因的10個區(qū)域④第一外顯子:長90bp,編碼人β-珠蛋白的1-30個氨基酸。⑤第一內(nèi)含子:長130bp,是人β-珠蛋白的非編碼序列,但對于RNA加工成為mRNA并轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞核外具有重要作用。⑥第二外顯子:長222bp,編碼人β-珠蛋白的31-104個氨基酸。④Shanghai
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University上海海洋大學(xué)⑤⑥人β-珠蛋白基因的10個區(qū)域⑦第二內(nèi)含子:長850bp,也是人β-珠蛋白的非編碼序列。⑧第三外顯子:長126bp,編碼人β-珠蛋白的105-146個氨基酸。⑨翻譯終止密碼子TAA⑨⑧⑦Shanghai
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University上海海洋大學(xué)人β-珠蛋白基因的10個區(qū)域⑩3’末端非翻譯區(qū):這段序列雖然轉(zhuǎn)錄但是并不參與蛋白質(zhì)的翻譯。該區(qū)域包括AATAAAA序列,此序列為轉(zhuǎn)錄的
RNA產(chǎn)物在3’末端增加200-300多聚核苷酸[poly(A)]尾所必需。
poly(A)尾插入進(jìn)RNA的位置?在AAUAA下游約20bp處,但是轉(zhuǎn)錄繼續(xù)進(jìn)行超過AATAAAA序列的位置,終止在大約1000bp處。在3’末端非翻譯區(qū)序列中,從
AATAAAA位點(diǎn)后600-900bp具有增強(qiáng)子功能,對于成體紅細(xì)胞前體β-珠蛋白基因適時的和組織特異性的表達(dá)是必需的。⑩Shanghai
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University上海海洋大學(xué)(二)啟動子和增強(qiáng)子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)真核生物基因的轉(zhuǎn)錄起始和表達(dá)的調(diào)控依賴于兩類調(diào)控元件的相互作用,一類是順式調(diào)節(jié)子,另一類是反式調(diào)節(jié)蛋白。啟動子和增強(qiáng)子都是順式調(diào)節(jié)子,它們能與特定功能基因連鎖,作用于鄰近基因的表達(dá)。反式調(diào)節(jié)蛋白是可溶性的分子,包括具有調(diào)控作用的蛋白因子和RNA,它們可作用于鄰近基因或其他基因。1.啟動子的結(jié)構(gòu)與功能Shanghai
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University上海海洋大學(xué)啟動子:是位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游的特殊DNA序列。能被RNA聚合酶Ⅱ識別和結(jié)合,對于決定基因轉(zhuǎn)錄起始和保證
DNA精確,有效地轉(zhuǎn)錄具有極其重要作用。轉(zhuǎn)錄量相對較大的基因,啟動子都具有相似的結(jié)構(gòu)。一個保守性較高且富含TA的序列,又稱為TATA框,位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游大約30bp處。另外在TATA框的上游還有一個或多個上游啟動子元件,如:CCAAT(CAAT框)、GGGCGGG(GC序列)、GGGAGAGGG和ATGCAAAT序列。TATA框的主要作用:?使轉(zhuǎn)錄精確地從起始位點(diǎn)開始,其他的上游啟動子元件:主要調(diào)控轉(zhuǎn)錄起始頻率和維持基因轉(zhuǎn)錄,特別是CAAT框的作用相對較大。2.與啟動子結(jié)合的反式作用因子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)基因轉(zhuǎn)錄還需要RNA聚合酶與啟動子的相互作用。在轉(zhuǎn)錄開始之前,首先要形成RNA聚合酶和啟動子的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。絕大多數(shù)真核生物的細(xì)胞有3種類型RNA聚合酶,即
RNA聚合酶Ⅰ、RNA聚合酶Ⅱ和RNA聚合酶Ⅲ。其中RNA聚合酶Ⅱ負(fù)責(zé)作用于多種基因的轉(zhuǎn)錄。在細(xì)胞核中存在一些轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白因子為RNA聚合酶與啟動子結(jié)合所必需,如果缺乏這些因子,純化的RNA聚合酶Ⅱ并不能識別啟動子序列,轉(zhuǎn)錄只能起始于任意位置。從不同動物細(xì)胞,甚至從酵母細(xì)胞分離的基本轉(zhuǎn)錄因子具有相似的活性。基本轉(zhuǎn)錄因子負(fù)責(zé)識別啟動子序列中TATA框,并與RNA聚合酶Ⅱ一起形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物,進(jìn)而起始轉(zhuǎn)錄。已經(jīng)經(jīng)過鑒定的普通轉(zhuǎn)錄因子有TFⅡD、TFⅡB、TFⅡF、TFⅡA等。按一定順序參與形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。Shanghai
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University上海海洋大學(xué)2.與啟動子結(jié)合的反式作用因子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)RNA聚合酶Ⅰ和RNA聚合酶Ⅲ分別負(fù)責(zé)18S、28S核糖體RNA和5S核糖體RNA,tRNA基因的轉(zhuǎn)錄,也需要多種蛋白因子參與,這些轉(zhuǎn)錄因子也必須與啟動子結(jié)合。3.增強(qiáng)子的結(jié)構(gòu)和功能Shanghai
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University上海海洋大學(xué)增強(qiáng)子(enhancer)指增加同它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率的DNA序列。增強(qiáng)子是通過啟動子來增加轉(zhuǎn)錄的。有效的增強(qiáng)子可以位于基因的5’端,也可位于基因的3’端,有的還可位于基因的內(nèi)含子中。增強(qiáng)子的效應(yīng)很明顯,一般能使基因轉(zhuǎn)錄頻率增加10~200倍,有的甚至可以高達(dá)上千倍。增強(qiáng)子的作用同增強(qiáng)子的取向(5’-3’或3’-5’)無關(guān),甚至遠(yuǎn)離靶基因達(dá)幾千kb也仍有增強(qiáng)作用。有一類增強(qiáng)子對基因的轉(zhuǎn)錄起抑制作用,稱為沉默子
(suencer)。當(dāng)轉(zhuǎn)錄因子與沉默子結(jié)合時可抑制順式調(diào)控元件相連的啟動子的轉(zhuǎn)錄。增強(qiáng)子的分類Shanghai
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University上海海洋大學(xué)同一增強(qiáng)子在有的細(xì)胞中是順式調(diào)控元件,但在其他細(xì)胞中可能是沉默子,這是由細(xì)胞中其他轉(zhuǎn)錄因子決定的。由于增強(qiáng)子中有的能夠調(diào)節(jié)基因表達(dá)的時間;有的能夠調(diào)節(jié)基因表達(dá)的組織和細(xì)胞特異性;有的具有前述兩種功能;還有的增強(qiáng)子與激素或其他分子相關(guān)。根據(jù)增強(qiáng)子的功能特征可以將其分為以下幾類。(1)時間特異性增強(qiáng)子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)在胚胎發(fā)育中存在一種時間特異性增強(qiáng)子。在兩棲類胚胎發(fā)育中存在最典型的基因活性的時間開關(guān),即囊胚中期轉(zhuǎn)換(MBT)。MBT類型的基因由于含有一種時間特異性增強(qiáng)子,在囊胚中期被特異性激活。兩棲類的這種增強(qiáng)子位于MBT基因閱讀框5’末端上游約700bp。人β-珠蛋白基因的時間特異性增強(qiáng)子,位于3’末端,AATAAAA序列下游600-900bp之間。通常γ-珠蛋白基因在人胚胎時期轉(zhuǎn)錄,如果把含有β-珠蛋白基因的時間特異性增強(qiáng)子的DNA片段移到γ-珠蛋白基因的附近,在β-珠蛋白基因的時間特異性增強(qiáng)子的作用下,γ-珠蛋白基因可在成體中表達(dá)。(2)組織特異性增強(qiáng)子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)調(diào)節(jié)β-珠蛋白基因表達(dá)的增強(qiáng)子,除了3’末端的臨時性特異性增強(qiáng)子之外,還有其他兩種增強(qiáng)子,由它們調(diào)節(jié)β-珠蛋白基因表達(dá)的組織特異性。其中一種增強(qiáng)子位子β-珠蛋白基因的第三個內(nèi)含子序列內(nèi),其作用使β-珠蛋白基因的轉(zhuǎn)錄只能在紅細(xì)跑發(fā)生。另一種增強(qiáng)子事實(shí)上是“主”增強(qiáng)子,所有位于第11號染色體上的人β-珠蛋白基因家族的轉(zhuǎn)錄都由它調(diào)控。如果缺失此增強(qiáng)子區(qū)將引起所有β-珠蛋白基因家族的基因沉默?!爸鳌痹鰪?qiáng)子的功能可能是使整個轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子區(qū)域打開。(3)胰腺增強(qiáng)子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)有時基因的活性在不同類型的相鄰細(xì)胞中由不同的增強(qiáng)子所調(diào)控。如胰腺外分泌蛋白胰凝乳蛋白酶、淀粉酶、胰蛋白酶基因的增強(qiáng)子,與內(nèi)分泌蛋白胰島素基因的增強(qiáng)子,雖然都位于各自基因5’末端旁的序列中,卻是不相同的兩類增強(qiáng)子。利用報道基因可對某一特定增強(qiáng)子的功能進(jìn)行研究。氯霉素乙配轉(zhuǎn)移酶(CAT)的基因活性很容易檢測,同時在哺乳動物中不表達(dá),可作為哺乳動物的報道基因。(3)胰腺增強(qiáng)子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)Walker等(1983)分別構(gòu)建這些基因5’末端旁序列和cat的重組基因,再將不同的重組基因分別轉(zhuǎn)人3種受體細(xì)胞:①不產(chǎn)生胰島素和胰凝乳蛋白酶的卵巢細(xì)胞;②分泌胰島素的胰腺細(xì)胞系;③一種產(chǎn)生外分泌蛋白的胰腺細(xì)胞系。說明胰腺外分泌細(xì)胞和內(nèi)分泌細(xì)胞的基因表達(dá)由不同的增強(qiáng)子調(diào)控。受體細(xì)胞外分泌蛋白基因5’末端旁序列+cat內(nèi)分泌蛋白基因5’末端旁序列+cat卵巢細(xì)胞不表達(dá)不表達(dá)分泌胰島素的胰腺細(xì)胞系不表達(dá)表達(dá)產(chǎn)生外分泌蛋白的胰腺細(xì)胞系表達(dá)不表達(dá)(4)卵黃蛋白增強(qiáng)子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)果蠅卵黃蛋白是在雌性成體果蠅的特殊細(xì)胞中才大量合成的一種蛋白。果蠅有兩種卵黃蛋白基因,yp1和yp2,他們在DNA上的位置鄰近但是轉(zhuǎn)錄的方向相反。在卵巢和脂肪體中卵黃蛋白基因都轉(zhuǎn)錄,但是他們能用限制性內(nèi)切酶分解,在共同的5’末端分開。如果將這兩種基因分別與報道基因一起構(gòu)建表達(dá)質(zhì)粒,再導(dǎo)入果蠅DNA,可以檢測他們轉(zhuǎn)錄的性別和時間特異性。卵黃蛋白基因僅在成體的雌性果蠅中表達(dá)。同時yp2的mRNA僅在卵巢組織中檢測到,而yp1得mRNA僅在脂肪體中表達(dá)。說明卵黃蛋白基因有兩個增強(qiáng)子,而且都位于5’末端,分別負(fù)責(zé)在卵巢和在脂肪體中的轉(zhuǎn)錄,使兩個基因在兩種細(xì)胞中正常轉(zhuǎn)錄。增強(qiáng)子對于基因表達(dá)的特異性有決定性作用。脂肪體Shanghai
Ocean
University上海海洋大學(xué)卵巢組織(三)轉(zhuǎn)錄因子Shanghai
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University上海海洋大學(xué)轉(zhuǎn)錄因子是基因調(diào)控的反式作用因子,是能與啟動子和增強(qiáng)子結(jié)合的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄因子既含有特異性DNA結(jié)合域,又含有能與啟動子或增強(qiáng)子結(jié)合并刺激基因轉(zhuǎn)錄的結(jié)構(gòu)域。通過相互作用使任何一種細(xì)胞中只有很少的一部分啟動子發(fā)生轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄因子可分為通用轉(zhuǎn)錄因子和特殊轉(zhuǎn)錄因子,即兩類基因調(diào)節(jié)蛋白。通用轉(zhuǎn)錄因子:指與啟動子TATA框序列結(jié)合的蛋白質(zhì),他們與RNA聚合酶II共同裝配成為轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物,以啟動轉(zhuǎn)錄。特殊轉(zhuǎn)錄因子:能識別特殊的DNA調(diào)節(jié)序列并與其結(jié)合,或與RNA聚合酶和其他轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合以行駛功能。(四)激素應(yīng)答成分Shanghai
Ocean
University上海海洋大學(xué)在發(fā)育過程中經(jīng)常出現(xiàn)基因表達(dá)的協(xié)同調(diào)節(jié)現(xiàn)象。當(dāng)一種類型的細(xì)胞同時表達(dá)幾種細(xì)胞特異性蛋白,或者在不向類型的細(xì)胞中由同一種激素誘導(dǎo)幾種基因表達(dá)時,這種基因表達(dá)的協(xié)同調(diào)節(jié)現(xiàn)象即發(fā)生。具有轉(zhuǎn)錄因子活性的類固醇激素特異性受體以非活性狀態(tài)存在時與一種熱體克蛋白結(jié)合,當(dāng)激素與受體蛋白結(jié)合后熱體克蛋白脫離,同時受體構(gòu)象發(fā)生改變。形成的激素-受體復(fù)合物進(jìn)入細(xì)胞核并與特異性DNA序列結(jié)合,激活啟動子調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄。能夠與激素受體蛋白特異性結(jié)合的DNA序列稱為激素效應(yīng)元件,它們既可以是增強(qiáng)子,也可以是啟動子。(五)免疫球蛋白輕鏈基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控Shanghai
Ocean
University上海海洋大學(xué)在每一個有機(jī)體中,絕大多數(shù)類型的細(xì)胞都具有相同的基因組,但是淋巴細(xì)胞例外。在與抗原接觸之前,處于休止期的B淋巴細(xì)胞就合成免疫球蛋白分子,但并不分泌。每一種B淋巴細(xì)胞本身具有產(chǎn)生107種以上不同的抗體分子的能力,但由于基因重排,每個細(xì)胞僅僅只合成一種抗體分子,并且將其置于細(xì)胞膜表面作為抗原受體。當(dāng)外來抗原與淋巴結(jié)或脾中的淋巴細(xì)胞膜上抗原受體結(jié)合后通過信號傳導(dǎo)調(diào)控基因表達(dá),使細(xì)胞分裂和進(jìn)一步分化。細(xì)胞分化的分子機(jī)制Shanghai
Ocean
University上海海洋大學(xué)——
轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控57第一節(jié)
RNA加工水平的調(diào)控Shanghai
Ocean
University上海海洋大學(xué)第二節(jié) 翻譯和翻譯后的調(diào)控(一)、同一基因的初始轉(zhuǎn)錄物(nRNA)經(jīng)選擇性拼接可產(chǎn)生不同的成熟RNA原肌球蛋白基因Shanghai
Ocean
University上海海洋大學(xué)一、RNA加工水平的調(diào)控α-原肌球蛋白基因上海海洋大學(xué)上海海洋大學(xué) ShanghaShanghaii
OceOceanan
UnUniivvererssiitytymRNA生殖細(xì)胞的
DNAB淋巴細(xì)胞的DNA,發(fā)生重排nRNA重鏈可變區(qū)(抗原結(jié)合區(qū))在淋巴細(xì)胞形成過程中,發(fā)生基因重排(DNA水平)前體RNAμ區(qū)δ區(qū)重鏈恒定區(qū)發(fā)生分子轉(zhuǎn)換,該模式通過RNA加工完成IgMIgD上海海洋大學(xué)Shanghai
Ocean
University相同基因在不同發(fā)育時期或不同組織細(xì)胞中拼接不同,合成不同的蛋白質(zhì)降鈣素/神經(jīng)多肽CGRP
mRNA前體61上海海洋大學(xué)上海海洋大學(xué) ShanghaShanghaii
OceOceanan
UnUniivvererssiityty果蠅性別表型的決定事件,通過3個主要性別決定基因RNA的不同拼接模式,引起差異基因表達(dá)選擇性RNA加工與性別決定上海海洋大學(xué)上海海洋大學(xué) ShanghaShanghaii
OceOceanan
UnUniivvererssiitytymRNA壽命的不同對蛋白質(zhì)合成的調(diào)控——通過mRNA的選擇性降解和mRNA穩(wěn)定性不同調(diào)控蛋白質(zhì)的合成不同基因的mRNA的半衰期不同,主要受其3`UTR控制。短壽命mRNA的3’UTR通常含有一個或多個AU富集區(qū),其作用是促進(jìn)Poly(A)降解。β-珠蛋白RNA的3’UTR中含有3個C富集區(qū),穩(wěn)定,半衰期17h一種生長因子mRNA的半壽期不超過30min第二節(jié) 翻譯和翻譯后的調(diào)控mRNA降解性能的差異可以影響細(xì)胞的功能C-fosmRNA5’UTRcoding
sequence3’UTR成纖維細(xì)胞AU富集區(qū)腫瘤細(xì)胞c-fos基因編碼正常成纖維細(xì)胞分裂必需的一種蛋白質(zhì)上海海洋大學(xué)
Shanghai
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University上海海洋大學(xué)上海海洋大學(xué) ShanghaShanghaii
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UnUniiversity早期發(fā)育中母體效應(yīng)因子的影響1、卵母細(xì)胞中合成并貯藏大量的發(fā)育信息(mRNA和蛋白質(zhì)),這些信息在排卵以前至早期發(fā)育過程中逐漸被利用;2、每個卵母細(xì)胞中貯藏20
000
–50
000種不同的mRNA,每種mRNA大約1600個拷貝;3、貯藏的信息在卵細(xì)胞中梯度分布或者均勻分布上海海洋大學(xué)上海海洋大學(xué) ShanghaShanghaii
OceOceanan
UnUniivvererssiityty激素對特定mRNA穩(wěn)定性的影響如Prolactin(泌乳刺激素)僅提高牛的casein( 蛋白)基因轉(zhuǎn)錄水平2倍,提高其mRNA壽命25倍,使mRNA更多次的翻譯。1、卵母細(xì)胞中翻譯調(diào)控機(jī)制的假說
mRNA
masking(掩蔽):mRNA與其它蛋白結(jié)合成ribonucleoprotein(RNP)
complex,阻止與核糖體結(jié)合;卵成熟或受精后,離子強(qiáng)度改變或蛋白磷酸化等導(dǎo)致RNP不穩(wěn)定/解體,翻譯得以進(jìn)行。
5’
Cap(7-甲基鳥苷酸)的調(diào)控:如某些種類(蛾),其卵中的部分mRNA的5`-鳥苷酸在受精后才甲基化,然后開始翻譯。
mRNA
sequester(隱蔽):指mRNA被阻隔于蛋白合成裝置。如海膽未受精卵的組蛋白mRNA定位于原核中,受精后原核破裂
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