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文檔簡介
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測PartI:GeneTransferTransduction,TransfectionandTransformationTransduction-transferofbacterialgenefromonebacteriumtoanotherbyabacteriophage.Transfection-theuptakeofDNAbyaeukaryoticcell,followedbytheincorporationofgeneticmarkerspresentintheDNAintothecell’sgenome.Transformation-geneticalterationofanorganismbroughtaboutbytheincorporationofforeignDNAintocells.基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測Streptococcuspneumoniaestains基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測TypeColonyMorphologyCapsuleVirulenceReactionwithAntiserumPresentedAgainstAppearanceSizeTypeIISTypeIIISIIRRoughSmallAbsentAvirulentNoneNoneIISSmoothLargePresentVirulentAgglutinationNoneIIIRRoughSmallAbsentAvirulentNoneNoneIIISSmoothLargePresentVirulentNoneAgglutinationStreptococcus
pneumoniae基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測TransformationInStreptococcuspneumoniae基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測轉(zhuǎn)化transformation1.制備感受態(tài)細(xì)胞(competentcells)容易吸收外源DNA的細(xì)菌細(xì)胞
Ca2++4℃
甘油(20%)-70℃保存
2.轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞連接的DNA
4℃30mim42℃90sec熱激(heat-shock)
復(fù)蘇(37℃
培養(yǎng))
涂平板(Ampr)基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測CaCl2inducedtransformation基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測PhageDNAandPackaging基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測RecombinantCosmidDNAandPackaging基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測PartII:Selection,screeningand
analysisofrecombinantsSelection:somesortofpressure(e.g.thepressureofanantibiotic)isappliedduringthegrowthofhostcellscontainingrecombinantDNA.Screeningisaprocedurebywhichapopulationofviablecellsissubjectedtosomesortofanalysisthatenablethedesiredsequencestobeidentified.基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測a.Antibioticresistanceselectioninplasmid基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測Insertioninactivationamprtet
sinsertDNAamprtetrpBR322AmpicillinTetracycline影?。≧eplicaplate)基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測AntibioticresistanceandinsertioninactivationinplasmidpBR322基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測AntibioticresistanceandinsertioninactivationinlacZgene基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測b.Complementation:CloneandselectionoflacYgene基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測c.Antibioticresistanceselectionandgeneticcomplementation基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測d.αcomplementationsystem
InsertioninactivationselectioninplasmidpUC18基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測Insertioninactivationinthe
αcomplementationsystempUC119ampr-lacZ/insertDNAAmp+IPTG+X-galampr-lacZ/基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測StructureofX-gal基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測Lactose5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactopyranosideβ-galactosidase5,5’-dibromo-4,4’-dichloroindigoDifferentcoloniesintheuseofX-gal基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測e.Insertioninactivationin
vectorλgt10andCharon16A
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測Insertioninactivationinvectorλgt10
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測CharonRecombinantPackagingandSelection基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測f.SpiSelectionsystemforBacteriophagevectorEMBL4
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測ColoniesofE.coli基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測Coloniesandplaques基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測g.SelectionprinciplefortheTACloning基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測h.Selectionprinciplefortheyeastartificialchromosome
YAC載體的選擇標(biāo)記主要采用營養(yǎng)缺陷型基因,如色氨酸、亮氨酸和組氨酸合成缺陷型基因trp1、leu2和his3、尿嘧啶合成缺陷型基因ura3等,以及赭石突變抑制基因sup4。與YAC載體配套工作的宿主酵母菌(如AB1380)的胸腺嘧啶合成基因帶有一個(gè)赭石突變ade2-1。帶有這個(gè)突變的酵母菌在基本培養(yǎng)基上形成紅色菌落,當(dāng)帶有赭石突變抑制基因sup4的載體存在于細(xì)胞中時(shí),可抑制ade2-1基因的突變效應(yīng),形成正常的白色菌落。利用這一菌落顏色轉(zhuǎn)變的現(xiàn)象,可用于篩選載體中含有外源DNA片段插入的重組子?;虻霓D(zhuǎn)移與重組體的檢測i.Selectionprincipleforthebacterial
artificialchromosome
裝載外源DNA后的重組質(zhì)粒可通過:(1)氯霉素抗性和(2)LacZ基因的α–互補(bǔ)篩選。基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測j.酶切鑒定:插入片段的大小和方向基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測j.酶切鑒定:插入片段的大小和方向EXSHEHEEXABCEHSEXDSHE400020007006000AHES/HBS/HHHE/HCDM基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測k.PurifyingclonedDNA基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測k.
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測l.Identifyingandisolationclonesofinterestsl.
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測m.ScreeningalibraryofclonesbycolonyinsituhybridizationtoalabeledprobeCPSF基因在真核表達(dá)載體上的克隆
研究表明,至少6種蛋白復(fù)合體參與前體mRNA3’端加工即切割與多聚腺苷酸化特異性因子(cleavageandpolyadenylationspecificityfactor,CPSF)poly(A)多聚酶(poly(A)polymerase,PAP)切割刺激因子(cleavagestimulationfactor,CstF)切割因子I和II(cleavagefactorIandII,CFImandCFIIm)核內(nèi)多聚腺苷酸結(jié)合蛋白1(polyadenylatebinding-proteinnuclear1,PABPN1)。
其中,CPSF被認(rèn)為在前體mRNA3’端加工過程中起著核心作用,直接與切割/多聚腺苷酸化信號(hào)AAUAAA結(jié)合,在兩個(gè)反應(yīng)中都是必需的?;虻霓D(zhuǎn)移與重組體的檢測切割和多聚腺苷酸化信號(hào)示意圖
USE:upstreamelementsPAS:poly-AsignalsequenceDSE:downstreamelements基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測C末端與N末端TAP-tagTandemAffinityPurification,TAP基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測TAP技術(shù)純化蛋白質(zhì)復(fù)合體流程示意圖基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測切割復(fù)合體模型
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測多聚腺嘌呤化復(fù)合體模型
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測載體pTRE2hyg的形體結(jié)構(gòu)和多克隆位點(diǎn)基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測載體pTRE2hyg的形體結(jié)構(gòu)和多克隆位點(diǎn)圖
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測載體pTRE2hyg-TAP-tag的形體結(jié)構(gòu)和
多克隆位點(diǎn)圖
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測載體pTRE2hyg-TAP-tag-CPSF30K的形體結(jié)構(gòu)和多克隆位點(diǎn)基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測載體pTRE2hyg-TAP-tag-CPSF73K的形體結(jié)構(gòu)和多克隆位點(diǎn)基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測載體pTRE2hyg-TAP-tag-CPSF100K的形體結(jié)構(gòu)和多克隆位點(diǎn)基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測載體pTRE2hyg-TAP-tag-CPSF160K的形體結(jié)構(gòu)和多克隆位點(diǎn)圖
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測質(zhì)粒pBS1761的形體結(jié)構(gòu)圖
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測質(zhì)粒pUK的形體結(jié)構(gòu)圖
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測TAP-tag片段的PCR擴(kuò)增
Primer1:5’CGGGATCCATGGBamHI切點(diǎn)
CAGGCCTTGCGCAAC3’
Primer2:5’GTCGACGGCTAGNheI切點(diǎn)CTTATCGTCATCATCAAGTGC3’
基因的轉(zhuǎn)移與重組體的檢測CPSF基因的PCR擴(kuò)增
CPSF30kPrimer1:
5’GCTAGCCATGCAGGAAATCATCGCC3’NheI切點(diǎn)CPSF73kPrimer1:
5’GCTAGCCATGTCCGCGATTCCCGC3’NheI切點(diǎn)CPSF100kPrimer1:5’GCTAGCCATGACATCTATTATCAAATTAACTA3’
NheI切點(diǎn)CPSF160kPrimer1:5’GCTAGCCATGTA
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